Protein–RNA interactions for Protein: Q8NCT1

ARRDC4, Arrestin domain-containing protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 418 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ARRDC4Q8NCT1 UBE2E1-AS1-201ENST00000426702 778 ntTSL 3 BASIC21.98■■□□□ 1.11
ARRDC4Q8NCT1 KRT18P48-201ENST00000434763 852 ntBASIC21.98■■□□□ 1.11
ARRDC4Q8NCT1 TPM4P1-201ENST00000436100 807 ntBASIC21.98■■□□□ 1.11
ARRDC4Q8NCT1 SGO1-208ENST00000437051 1187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
ARRDC4Q8NCT1 ASH1L-AS1-202ENST00000456633 911 ntTSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
ARRDC4Q8NCT1 KLHL21-204ENST00000467612 1056 ntTSL 3 BASIC21.98■■□□□ 1.11
ARRDC4Q8NCT1 NPM2-204ENST00000518119 1190 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
ARRDC4Q8NCT1 AL031432.5-201ENST00000641059 760 ntBASIC21.98■■□□□ 1.11
ARRDC4Q8NCT1 H1FNT-201ENST00000335017 1300 ntAPPRIS P1 BASIC21.98■■□□□ 1.11
ARRDC4Q8NCT1 RNF170-205ENST00000526349 1338 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
ARRDC4Q8NCT1 HSD11B1L-221ENST00000583928 1319 ntTSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
ARRDC4Q8NCT1 PDS5A-202ENST00000503396 2685 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
ARRDC4Q8NCT1 NFYC-204ENST00000372653 1862 ntTSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
ARRDC4Q8NCT1 GNB1-210ENST00000615252 3048 ntTSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
ARRDC4Q8NCT1 AC018553.1-201ENST00000616682 1458 ntBASIC21.97■■□□□ 1.11
ARRDC4Q8NCT1 ZC3HAV1L-201ENST00000275766 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
ARRDC4Q8NCT1 UBA5-211ENST00000493720 2058 ntTSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
ARRDC4Q8NCT1 CAMK2B-207ENST00000358707 1895 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
ARRDC4Q8NCT1 SLC43A3-225ENST00000533524 1879 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
ARRDC4Q8NCT1 SH2B1-204ENST00000395532 2529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
ARRDC4Q8NCT1 KLK14-201ENST00000156499 1060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
ARRDC4Q8NCT1 FGF8-202ENST00000344255 707 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
ARRDC4Q8NCT1 SNCB-205ENST00000510387 730 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
ARRDC4Q8NCT1 TMEM249-203ENST00000565365 975 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC21.97■■□□□ 1.11
ARRDC4Q8NCT1 PDCD2L-203ENST00000587065 492 ntTSL 3 BASIC21.97■■□□□ 1.11
ARRDC4Q8NCT1 AC243829.1-201ENST00000615128 1059 ntTSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
ARRDC4Q8NCT1 AL121956.5-201ENST00000625261 221 ntBASIC21.97■■□□□ 1.11
ARRDC4Q8NCT1 TMEM200B-201ENST00000420504 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
ARRDC4Q8NCT1 ACTR8-202ENST00000482349 2091 ntTSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
ARRDC4Q8NCT1 KCNAB3-201ENST00000303790 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
ARRDC4Q8NCT1 PPHLN1-213ENST00000549190 1777 ntTSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
ARRDC4Q8NCT1 CCAR2-214ENST00000613179 1421 ntTSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
ARRDC4Q8NCT1 TIGD5-201ENST00000504548 5390 ntAPPRIS P1 BASIC21.97■■□□□ 1.11
ARRDC4Q8NCT1 SOX10-201ENST00000360880 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
ARRDC4Q8NCT1 SOX10-202ENST00000396884 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
ARRDC4Q8NCT1 RLBP1-201ENST00000268125 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
ARRDC4Q8NCT1 TRABD2A-201ENST00000335459 1844 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
ARRDC4Q8NCT1 SEPT5-209ENST00000438754 2241 ntTSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
ARRDC4Q8NCT1 FAM129C-207ENST00000599124 1918 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
ARRDC4Q8NCT1 AC010616.1-201ENST00000597630 2078 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
ARRDC4Q8NCT1 GOLGA6L3-201ENST00000507199 1679 ntBASIC21.96■■□□□ 1.11
ARRDC4Q8NCT1 ABCD1-202ENST00000370129 1016 ntTSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
ARRDC4Q8NCT1 COPS8-203ENST00000409334 794 ntTSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
ARRDC4Q8NCT1 AC007663.1-201ENST00000438948 1240 ntBASIC21.96■■□□□ 1.11
ARRDC4Q8NCT1 LINC01385-201ENST00000512310 780 ntTSL 4 BASIC21.96■■□□□ 1.11
ARRDC4Q8NCT1 AC004080.2-201ENST00000523331 556 ntTSL 4 BASIC21.96■■□□□ 1.11
ARRDC4Q8NCT1 IFI27L2-206ENST00000556727 556 ntTSL 3 BASIC21.96■■□□□ 1.11
ARRDC4Q8NCT1 AL512604.3-201ENST00000569583 964 ntBASIC21.96■■□□□ 1.11
ARRDC4Q8NCT1 AC087498.1-201ENST00000572493 945 ntAPPRIS P1 BASIC21.96■■□□□ 1.11
ARRDC4Q8NCT1 ELAC2-212ENST00000578071 579 ntTSL 4 BASIC21.96■■□□□ 1.11
ARRDC4Q8NCT1 AC011498.2-201ENST00000588798 540 ntTSL 3 BASIC21.96■■□□□ 1.11
ARRDC4Q8NCT1 AC141257.4-201ENST00000634557 245 ntBASIC21.96■■□□□ 1.11
ARRDC4Q8NCT1 AC136944.6-201ENST00000634818 245 ntBASIC21.96■■□□□ 1.11
ARRDC4Q8NCT1 AC009542.2-201ENST00000637483 1189 ntTSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
ARRDC4Q8NCT1 ASAP2-201ENST00000281419 5712 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
ARRDC4Q8NCT1 SYT15-205ENST00000503753 1331 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
ARRDC4Q8NCT1 ZDHHC14-204ENST00000414563 3134 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
ARRDC4Q8NCT1 ANKRD2-202ENST00000307518 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
ARRDC4Q8NCT1 IFNLR1-202ENST00000327575 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
ARRDC4Q8NCT1 MXRA7-201ENST00000355797 5661 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.11
ARRDC4Q8NCT1 CAMKK2-206ENST00000402834 2051 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.11
ARRDC4Q8NCT1 ALG1-201ENST00000262374 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.11
ARRDC4Q8NCT1 ACOT2-205ENST00000622407 1604 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
ARRDC4Q8NCT1 SYTL1-211ENST00000618673 1712 ntTSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
ARRDC4Q8NCT1 P2RX5-201ENST00000225328 2309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
ARRDC4Q8NCT1 ADCK2-201ENST00000072869 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
ARRDC4Q8NCT1 CPEB1-218ENST00000620182 2422 ntTSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
ARRDC4Q8NCT1 ISCA1-202ENST00000326094 1264 ntTSL 3 BASIC21.95■■□□□ 1.1
ARRDC4Q8NCT1 AIF1L-203ENST00000372298 849 ntTSL 3 BASIC21.95■■□□□ 1.1
ARRDC4Q8NCT1 UQCRQ-201ENST00000378665 586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
ARRDC4Q8NCT1 SHBG-203ENST00000416273 1042 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.95■■□□□ 1.1
ARRDC4Q8NCT1 PCED1CP-201ENST00000419887 785 ntBASIC21.95■■□□□ 1.1
ARRDC4Q8NCT1 AL596442.1-201ENST00000429305 429 ntTSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
ARRDC4Q8NCT1 PTPA-216ENST00000432651 857 ntTSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
ARRDC4Q8NCT1 CCDC124-201ENST00000445755 938 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
ARRDC4Q8NCT1 AC008040.2-201ENST00000461049 708 ntBASIC21.95■■□□□ 1.1
ARRDC4Q8NCT1 CCNG1-211ENST00000512163 919 ntTSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
ARRDC4Q8NCT1 AP003501.2-201ENST00000524433 477 ntTSL 4 BASIC21.95■■□□□ 1.1
ARRDC4Q8NCT1 CD320-202ENST00000537716 1119 ntTSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
ARRDC4Q8NCT1 DUX4-205ENST00000570263 768 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
ARRDC4Q8NCT1 SHBG-215ENST00000575903 1196 ntTSL 3 BASIC21.95■■□□□ 1.1
ARRDC4Q8NCT1 CCDC124-203ENST00000597436 1055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
ARRDC4Q8NCT1 AL121894.2-201ENST00000602977 491 ntBASIC21.95■■□□□ 1.1
ARRDC4Q8NCT1 C1QTNF8-202ENST00000621771 897 ntTSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
ARRDC4Q8NCT1 SLC25A29-215ENST00000556505 1540 ntTSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
ARRDC4Q8NCT1 ERMP1-202ENST00000339450 5376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
ARRDC4Q8NCT1 TMEM204-202ENST00000566264 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
ARRDC4Q8NCT1 NEURL4-201ENST00000315614 5182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
ARRDC4Q8NCT1 FAM66C-208ENST00000541558 2087 ntTSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
ARRDC4Q8NCT1 ELOB-202ENST00000409477 997 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
ARRDC4Q8NCT1 CD70-202ENST00000423145 881 ntTSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
ARRDC4Q8NCT1 AC004540.1-201ENST00000439120 891 ntTSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
ARRDC4Q8NCT1 TSPY17P-201ENST00000450329 467 ntBASIC21.94■■□□□ 1.1
ARRDC4Q8NCT1 MUC1-212ENST00000457295 1161 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
ARRDC4Q8NCT1 RNASET2-213ENST00000611959 1124 ntTSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
ARRDC4Q8NCT1 PTENP1-AS-201ENST00000627688 873 ntTSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
ARRDC4Q8NCT1 NOL3-211ENST00000568146 1351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
ARRDC4Q8NCT1 SLC35A2-217ENST00000635589 1424 ntTSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
ARRDC4Q8NCT1 HNRNPLL-206ENST00000410076 1687 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
ARRDC4Q8NCT1 HOXA10-201ENST00000283921 2541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 61.7 ms