Protein–RNA interactions for Protein: Q8NBN3

TMEM87A, Transmembrane protein 87A, humanhuman

Predictions only

Length 555 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMEM87AQ8NBN3 OGFOD2-201ENST00000228922 1780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
TMEM87AQ8NBN3 P2RX5-202ENST00000345901 2031 ntTSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
TMEM87AQ8NBN3 MUTYH-203ENST00000372098 1839 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
TMEM87AQ8NBN3 MUTYH-204ENST00000372104 1823 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
TMEM87AQ8NBN3 MUTYH-205ENST00000372110 1809 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
TMEM87AQ8NBN3 FAM217A-208ENST00000639338 1929 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
TMEM87AQ8NBN3 KRT16P6-202ENST00000425692 1426 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
TMEM87AQ8NBN3 CNNM4-201ENST00000377075 4800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
TMEM87AQ8NBN3 KRT78-201ENST00000304620 1778 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
TMEM87AQ8NBN3 FAM189B-204ENST00000368368 2609 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
TMEM87AQ8NBN3 ZNF821-221ENST00000611294 1833 ntTSL 3 BASIC22.74■■□□□ 1.23
TMEM87AQ8NBN3 MGST3-205ENST00000367889 1015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
TMEM87AQ8NBN3 AP000282.1-201ENST00000454622 682 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
TMEM87AQ8NBN3 AC034102.6-201ENST00000550947 559 ntTSL 4 BASIC22.74■■□□□ 1.23
TMEM87AQ8NBN3 DHRS4-207ENST00000559632 1003 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
TMEM87AQ8NBN3 AC133552.2-202ENST00000575694 574 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
TMEM87AQ8NBN3 LIMD2-202ENST00000578061 756 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
TMEM87AQ8NBN3 SLC27A3-204ENST00000368661 2410 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
TMEM87AQ8NBN3 KRT19-201ENST00000361566 1390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
TMEM87AQ8NBN3 TLK2-202ENST00000343388 3227 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
TMEM87AQ8NBN3 SCYL2-201ENST00000360820 5779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
TMEM87AQ8NBN3 AGTR1-201ENST00000349243 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
TMEM87AQ8NBN3 RNF146-213ENST00000610153 2070 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
TMEM87AQ8NBN3 TEAD2-202ENST00000377214 2440 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
TMEM87AQ8NBN3 CBX1-202ENST00000393408 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
TMEM87AQ8NBN3 LAPTM4B-204ENST00000619747 2758 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
TMEM87AQ8NBN3 FAM160A2-201ENST00000265978 3481 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
TMEM87AQ8NBN3 SLC25A41-201ENST00000321510 1532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
TMEM87AQ8NBN3 KRT6C-201ENST00000252250 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
TMEM87AQ8NBN3 KRT6B-201ENST00000252252 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
TMEM87AQ8NBN3 ADGRA2-201ENST00000315215 6270 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
TMEM87AQ8NBN3 C5orf17-202ENST00000512559 1984 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
TMEM87AQ8NBN3 SNRPA-201ENST00000243563 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
TMEM87AQ8NBN3 BHLHA15-201ENST00000314018 706 ntAPPRIS P1 BASIC22.73■■□□□ 1.23
TMEM87AQ8NBN3 BET1L-204ENST00000410108 637 ntTSL 3 BASIC22.73■■□□□ 1.23
TMEM87AQ8NBN3 GUSBP6-202ENST00000438529 1198 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
TMEM87AQ8NBN3 ZNF436-AS1-206ENST00000518821 461 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
TMEM87AQ8NBN3 BHLHA15-202ENST00000609256 796 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.73■■□□□ 1.23
TMEM87AQ8NBN3 AC013268.1-206ENST00000638368 961 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
TMEM87AQ8NBN3 AC112229.1-201ENST00000639295 961 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
TMEM87AQ8NBN3 FAM198A-202ENST00000430121 3121 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
TMEM87AQ8NBN3 MCC-208ENST00000514701 2855 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
TMEM87AQ8NBN3 UBE2K-201ENST00000261427 5245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
TMEM87AQ8NBN3 MEN1-208ENST00000394374 3155 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
TMEM87AQ8NBN3 FAM83E-201ENST00000263266 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
TMEM87AQ8NBN3 GGT2-201ENST00000401924 2366 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
TMEM87AQ8NBN3 TRIM7-205ENST00000422067 1954 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
TMEM87AQ8NBN3 ZNF211-204ENST00000347302 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
TMEM87AQ8NBN3 TXNRD2-202ENST00000400518 2025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
TMEM87AQ8NBN3 FXYD6-211ENST00000539526 2132 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
TMEM87AQ8NBN3 CYTH1-209ENST00000589296 2159 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
TMEM87AQ8NBN3 SENP6-201ENST00000327284 2700 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
TMEM87AQ8NBN3 HCCS-201ENST00000321143 2277 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
TMEM87AQ8NBN3 XXYLT1-202ENST00000356740 564 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
TMEM87AQ8NBN3 LINC01659-202ENST00000449711 917 ntTSL 3 BASIC22.72■■□□□ 1.23
TMEM87AQ8NBN3 AL162412.1-201ENST00000567129 965 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
TMEM87AQ8NBN3 AC008694.1-202ENST00000636953 945 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
TMEM87AQ8NBN3 SNX4-201ENST00000251775 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
TMEM87AQ8NBN3 RAPSN-205ENST00000529341 1408 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
TMEM87AQ8NBN3 RPH3A-203ENST00000543106 2581 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
TMEM87AQ8NBN3 FUZ-212ENST00000528094 1479 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
TMEM87AQ8NBN3 ALDOA-212ENST00000564546 2104 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
TMEM87AQ8NBN3 MEF2A-202ENST00000354410 5824 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
TMEM87AQ8NBN3 CASP16P-202ENST00000575497 2161 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
TMEM87AQ8NBN3 UBE2Q2-204ENST00000561851 1582 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
TMEM87AQ8NBN3 GRK2-201ENST00000308595 3466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
TMEM87AQ8NBN3 CASTOR1-202ENST00000407689 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
TMEM87AQ8NBN3 CD55-203ENST00000367063 1691 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
TMEM87AQ8NBN3 WIPF2-202ENST00000394103 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
TMEM87AQ8NBN3 NRM-203ENST00000376421 1734 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
TMEM87AQ8NBN3 RNF167-205ENST00000571816 1728 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
TMEM87AQ8NBN3 CHRNB1-201ENST00000306071 2557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
TMEM87AQ8NBN3 CCT5-214ENST00000515676 1997 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
TMEM87AQ8NBN3 GRAMD2B-219ENST00000544396 2822 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
TMEM87AQ8NBN3 RBP4-201ENST00000371464 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
TMEM87AQ8NBN3 IFRD2-202ENST00000417626 2109 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
TMEM87AQ8NBN3 CNN2P6-201ENST00000439038 900 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
TMEM87AQ8NBN3 RPL29-204ENST00000479017 670 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.71■■□□□ 1.23
TMEM87AQ8NBN3 MIR4758-201ENST00000577688 71 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
TMEM87AQ8NBN3 TNNI3-207ENST00000588882 669 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
TMEM87AQ8NBN3 AC018730.2-201ENST00000598623 443 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
TMEM87AQ8NBN3 AL591742.1-201ENST00000604433 565 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
TMEM87AQ8NBN3 CD99-212ENST00000624481 1089 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
TMEM87AQ8NBN3 PHF2-202ENST00000375376 3045 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
TMEM87AQ8NBN3 CTSH-201ENST00000220166 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
TMEM87AQ8NBN3 UBE2K-203ENST00000445950 2175 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
TMEM87AQ8NBN3 TMEM8A-201ENST00000250930 2346 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
TMEM87AQ8NBN3 TRMT2A-203ENST00000404751 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
TMEM87AQ8NBN3 PVRIG-201ENST00000317271 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
TMEM87AQ8NBN3 AC013268.5-201ENST00000454928 1959 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.23
TMEM87AQ8NBN3 TBC1D19-201ENST00000264866 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
TMEM87AQ8NBN3 WNT10B-201ENST00000301061 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
TMEM87AQ8NBN3 FAM72C-202ENST00000584486 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
TMEM87AQ8NBN3 TBXA2R-201ENST00000375190 2608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
TMEM87AQ8NBN3 PRPF39-201ENST00000355765 2868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
TMEM87AQ8NBN3 EIF3B-202ENST00000397011 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
TMEM87AQ8NBN3 ZNF316-201ENST00000382252 5392 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
TMEM87AQ8NBN3 TPSAB1-201ENST00000338844 1175 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
TMEM87AQ8NBN3 COA6-202ENST00000366613 641 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
TMEM87AQ8NBN3 CT47A12-201ENST00000419982 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.1 ms