Protein–RNA interactions for Protein: Q8NB14

USP38, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 38, humanhuman

Predictions only

Length 1,042 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USP38Q8NB14 AF186192.3-201ENST00000583427 947 ntBASIC21.97■■□□□ 1.11
USP38Q8NB14 SMAGP-204ENST00000603838 816 ntTSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
USP38Q8NB14 BRICD5-201ENST00000328540 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
USP38Q8NB14 TPCN2-205ENST00000542467 2000 ntTSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
USP38Q8NB14 LTBP3-201ENST00000301873 4443 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
USP38Q8NB14 SAP30L-201ENST00000297109 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
USP38Q8NB14 BRSK2-208ENST00000528841 3586 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
USP38Q8NB14 FSTL3-201ENST00000166139 2542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
USP38Q8NB14 CYP1B1-207ENST00000614273 2174 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
USP38Q8NB14 CATSPER2-201ENST00000321596 1820 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
USP38Q8NB14 HCK-203ENST00000375862 1806 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
USP38Q8NB14 RCN3-201ENST00000270645 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
USP38Q8NB14 PHLDA3-202ENST00000367311 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
USP38Q8NB14 TDRD10-202ENST00000368482 2331 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
USP38Q8NB14 ATF5-202ENST00000595125 1637 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
USP38Q8NB14 TIGD5-201ENST00000504548 5390 ntAPPRIS P1 BASIC21.96■■□□□ 1.11
USP38Q8NB14 METTL5-201ENST00000260953 1010 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
USP38Q8NB14 NUDT8-201ENST00000301490 809 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
USP38Q8NB14 MRGPRG-201ENST00000332314 870 ntAPPRIS P1 BASIC21.96■■□□□ 1.11
USP38Q8NB14 FAM26F-202ENST00000368605 1117 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
USP38Q8NB14 LEF1-AS1-203ENST00000507799 459 ntTSL 3 BASIC21.96■■□□□ 1.11
USP38Q8NB14 NPM2-204ENST00000518119 1190 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
USP38Q8NB14 MMP25-AS1-204ENST00000572574 794 ntTSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
USP38Q8NB14 MRPL4-204ENST00000588502 827 ntTSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
USP38Q8NB14 AC018445.1-201ENST00000621571 568 ntTSL 4 BASIC21.96■■□□□ 1.11
USP38Q8NB14 HTR7P1-201ENST00000538670 1336 ntBASIC21.96■■□□□ 1.11
USP38Q8NB14 MGAT5B-209ENST00000569840 4492 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
USP38Q8NB14 PIF1-202ENST00000333425 2278 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
USP38Q8NB14 TPBGL-201ENST00000562197 2793 ntAPPRIS P1 BASIC21.96■■□□□ 1.11
USP38Q8NB14 RXFP3-201ENST00000330120 1852 ntAPPRIS P1 BASIC21.96■■□□□ 1.11
USP38Q8NB14 SLC43A3-225ENST00000533524 1879 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
USP38Q8NB14 DBNDD2-203ENST00000372710 1417 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
USP38Q8NB14 REM2-201ENST00000267396 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
USP38Q8NB14 DTX3-201ENST00000337737 2029 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
USP38Q8NB14 FAM43B-201ENST00000332947 2572 ntAPPRIS P1 BASIC21.95■■□□□ 1.11
USP38Q8NB14 ETV2-202ENST00000379026 1571 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.11
USP38Q8NB14 PHF2-201ENST00000359246 5569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
USP38Q8NB14 B3GALNT1-212ENST00000488170 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
USP38Q8NB14 TMED4-203ENST00000457408 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
USP38Q8NB14 AC109460.3-201ENST00000569969 5296 ntTSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
USP38Q8NB14 PHOSPHO1-201ENST00000310544 1816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
USP38Q8NB14 PAQR9-201ENST00000340634 2452 ntAPPRIS P1 BASIC21.95■■□□□ 1.1
USP38Q8NB14 SAPCD2P4-201ENST00000424595 1171 ntBASIC21.95■■□□□ 1.1
USP38Q8NB14 BX890604.1-205ENST00000425492 856 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
USP38Q8NB14 ABCC5-211ENST00000446941 883 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
USP38Q8NB14 LIME1-205ENST00000480139 819 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.95■■□□□ 1.1
USP38Q8NB14 DUX4L26-201ENST00000489078 1255 ntBASIC21.95■■□□□ 1.1
USP38Q8NB14 SUMO2-203ENST00000578238 490 ntTSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
USP38Q8NB14 GEMIN7-203ENST00000591607 848 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.95■■□□□ 1.1
USP38Q8NB14 RPL23AP53-202ENST00000606507 370 ntTSL 3 BASIC21.95■■□□□ 1.1
USP38Q8NB14 AC004264.1-201ENST00000608354 794 ntBASIC21.95■■□□□ 1.1
USP38Q8NB14 TRIM4-202ENST00000354241 1942 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
USP38Q8NB14 VGF-201ENST00000249330 2575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
USP38Q8NB14 EZH2-201ENST00000320356 2639 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
USP38Q8NB14 PRELID3B-201ENST00000355937 2626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
USP38Q8NB14 ESPN-202ENST00000416731 1338 ntTSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
USP38Q8NB14 ROPN1-209ENST00000495093 1376 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
USP38Q8NB14 SLC44A3-203ENST00000446120 2094 ntTSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
USP38Q8NB14 PLCD1-201ENST00000334661 2769 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
USP38Q8NB14 HSD17B1-202ENST00000585807 4982 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
USP38Q8NB14 NRN1-203ENST00000616243 1556 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC21.95■■□□□ 1.1
USP38Q8NB14 IQCJ-SCHIP1-204ENST00000485419 2445 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
USP38Q8NB14 MAEA-213ENST00000510794 1607 ntTSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
USP38Q8NB14 PABPC4-204ENST00000372862 2470 ntTSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
USP38Q8NB14 EGFL7-201ENST00000308874 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
USP38Q8NB14 MATK-215ENST00000619596 1740 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
USP38Q8NB14 WEE1-202ENST00000450114 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
USP38Q8NB14 NISCH-201ENST00000345716 5238 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
USP38Q8NB14 SLC46A3-202ENST00000380814 2121 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
USP38Q8NB14 TOLLIP-201ENST00000263646 2283 ntTSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
USP38Q8NB14 ONECUT3-201ENST00000382349 8318 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
USP38Q8NB14 CCDC91-207ENST00000539107 2440 ntTSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
USP38Q8NB14 ZNF282-204ENST00000610704 3722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
USP38Q8NB14 SULT1A1-202ENST00000350842 1282 ntTSL 3 BASIC21.94■■□□□ 1.1
USP38Q8NB14 AL513320.1-201ENST00000435049 622 ntTSL 3 BASIC21.94■■□□□ 1.1
USP38Q8NB14 LINC01184-202ENST00000501173 949 ntTSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
USP38Q8NB14 ISOC2-201ENST00000085068 1122 ntTSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
USP38Q8NB14 GATA5-201ENST00000252997 2595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
USP38Q8NB14 COMMD7-202ENST00000446419 1343 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
USP38Q8NB14 POU5F1-201ENST00000259915 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
USP38Q8NB14 ASPHD1-201ENST00000308748 1584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
USP38Q8NB14 ZNF282-203ENST00000479907 1815 ntTSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
USP38Q8NB14 AC124283.5-201ENST00000624661 1809 ntBASIC21.94■■□□□ 1.1
USP38Q8NB14 TMCO3-201ENST00000375391 2132 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
USP38Q8NB14 BRD9-202ENST00000467963 2156 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
USP38Q8NB14 UAP1-201ENST00000271469 2377 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
USP38Q8NB14 TERF1P1-201ENST00000311003 1181 ntBASIC21.93■■□□□ 1.1
USP38Q8NB14 GNA14-201ENST00000341700 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
USP38Q8NB14 WDR4-202ENST00000398208 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
USP38Q8NB14 AC004540.1-203ENST00000421862 907 ntTSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
USP38Q8NB14 PRDM11-201ENST00000424263 1858 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.93■■□□□ 1.1
USP38Q8NB14 MEF2B-204ENST00000424583 1405 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
USP38Q8NB14 GOLGA4-208ENST00000444882 1451 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
USP38Q8NB14 PACRGL-207ENST00000502938 810 ntTSL 4 BASIC21.93■■□□□ 1.1
USP38Q8NB14 F2R-202ENST00000505600 442 ntTSL 2 BASIC21.93■■□□□ 1.1
USP38Q8NB14 PTBP1P-201ENST00000554374 1601 ntBASIC21.93■■□□□ 1.1
USP38Q8NB14 ESR2-212ENST00000556275 2695 ntTSL 2 BASIC21.93■■□□□ 1.1
USP38Q8NB14 PNN-205ENST00000556530 601 ntTSL 2 BASIC21.93■■□□□ 1.1
USP38Q8NB14 RPS15-203ENST00000586096 570 ntTSL 2 BASIC21.93■■□□□ 1.1
USP38Q8NB14 AC002094.1-201ENST00000591482 1050 ntTSL 2 BASIC21.93■■□□□ 1.1
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