Protein–RNA interactions for Protein: Q8NA03

FSIP1, Fibrous sheath-interacting protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 581 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FSIP1Q8NA03 ANAPC11-212ENST00000577425 603 ntTSL 3 BASIC22.39■■□□□ 1.17
FSIP1Q8NA03 SAMD11-211ENST00000616125 2230 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
FSIP1Q8NA03 SLC27A3-214ENST00000624995 2413 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
FSIP1Q8NA03 SRRM3-204ENST00000611745 3612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
FSIP1Q8NA03 FAM206A-201ENST00000322940 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
FSIP1Q8NA03 APAF1-210ENST00000551964 5444 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
FSIP1Q8NA03 GRTP1-203ENST00000375431 1384 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
FSIP1Q8NA03 RWDD4-206ENST00000512740 1393 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
FSIP1Q8NA03 NECTIN1-201ENST00000264025 5840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
FSIP1Q8NA03 FENDRR-203ENST00000595886 3095 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
FSIP1Q8NA03 CLDN3-201ENST00000395145 1274 ntAPPRIS P1 BASIC22.38■■□□□ 1.17
FSIP1Q8NA03 IL15RA-207ENST00000397250 584 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
FSIP1Q8NA03 C19orf73-201ENST00000408991 744 ntAPPRIS P1 BASIC22.38■■□□□ 1.17
FSIP1Q8NA03 CDCA4P2-201ENST00000441182 718 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
FSIP1Q8NA03 AC026185.1-201ENST00000445748 174 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
FSIP1Q8NA03 ABHD14A-202ENST00000458031 1113 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
FSIP1Q8NA03 IL15RA-215ENST00000528354 1037 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
FSIP1Q8NA03 MDK-213ENST00000617138 635 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
FSIP1Q8NA03 IL15RA-220ENST00000620345 1115 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
FSIP1Q8NA03 PTCD3-220ENST00000627371 210 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
FSIP1Q8NA03 MON1A-202ENST00000417270 2527 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
FSIP1Q8NA03 NPAS1-207ENST00000602189 1643 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
FSIP1Q8NA03 ARHGAP22-210ENST00000477708 1951 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
FSIP1Q8NA03 FAM198A-202ENST00000430121 3121 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
FSIP1Q8NA03 RSAD1-201ENST00000258955 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
FSIP1Q8NA03 TMEM53-202ENST00000372237 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
FSIP1Q8NA03 CTBP2-202ENST00000334808 2130 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
FSIP1Q8NA03 EGFL7-203ENST00000371699 2125 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
FSIP1Q8NA03 CFP-201ENST00000247153 1713 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
FSIP1Q8NA03 TSPAN3-207ENST00000559494 1326 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
FSIP1Q8NA03 FGF16-201ENST00000439435 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
FSIP1Q8NA03 ZKSCAN7-205ENST00000426540 2791 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
FSIP1Q8NA03 TRA2A-201ENST00000297071 1845 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
FSIP1Q8NA03 ARMC6-220ENST00000546344 1814 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
FSIP1Q8NA03 ID1-201ENST00000376105 1233 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
FSIP1Q8NA03 YIF1A-205ENST00000471387 854 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
FSIP1Q8NA03 ANAPC11-208ENST00000572851 686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
FSIP1Q8NA03 C11orf49-201ENST00000278460 1645 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
FSIP1Q8NA03 KIF22-203ENST00000561482 2505 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
FSIP1Q8NA03 FAM170B-201ENST00000311787 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
FSIP1Q8NA03 TSSC4-207ENST00000451491 1423 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
FSIP1Q8NA03 CRACR2B-207ENST00000528542 1792 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
FSIP1Q8NA03 TMEM214-203ENST00000404032 2830 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
FSIP1Q8NA03 FAM83E-201ENST00000263266 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
FSIP1Q8NA03 RPUSD2-202ENST00000559271 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
FSIP1Q8NA03 NAGPA-AS1-202ENST00000632058 2265 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
FSIP1Q8NA03 SLC34A3-202ENST00000538474 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
FSIP1Q8NA03 ANXA8L1-201ENST00000584982 2174 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
FSIP1Q8NA03 WDR37-203ENST00000381329 1307 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
FSIP1Q8NA03 FBXO31-201ENST00000311635 5934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
FSIP1Q8NA03 NOTCH2NL-204ENST00000579793 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
FSIP1Q8NA03 SPEG-203ENST00000396688 1457 ntTSL 3 BASIC22.36■■□□□ 1.17
FSIP1Q8NA03 BTD-202ENST00000383778 2261 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
FSIP1Q8NA03 MTSS1L-201ENST00000338779 4992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
FSIP1Q8NA03 BEAN1-AS1-201ENST00000564618 533 ntTSL 4 BASIC22.36■■□□□ 1.17
FSIP1Q8NA03 POU5F1-209ENST00000638788 369 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
FSIP1Q8NA03 MBD3-207ENST00000590550 2782 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
FSIP1Q8NA03 PQLC2-202ENST00000375155 1805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
FSIP1Q8NA03 TMEM218-213ENST00000531909 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
FSIP1Q8NA03 ALDOA-212ENST00000564546 2104 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
FSIP1Q8NA03 IKBKG-207ENST00000611071 2103 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
FSIP1Q8NA03 MIB2-203ENST00000378712 2890 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
FSIP1Q8NA03 ADGRG2-210ENST00000379878 4803 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
FSIP1Q8NA03 CCDC71-201ENST00000321895 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
FSIP1Q8NA03 ZNF771-202ENST00000434417 1454 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
FSIP1Q8NA03 PIK3R1-201ENST00000320694 2625 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
FSIP1Q8NA03 PHF2-202ENST00000375376 3045 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
FSIP1Q8NA03 SEPT6-202ENST00000354228 1576 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
FSIP1Q8NA03 ARHGDIA-202ENST00000400721 1568 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
FSIP1Q8NA03 KLHL29-203ENST00000486442 5287 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
FSIP1Q8NA03 MZB1-201ENST00000302125 825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
FSIP1Q8NA03 UNC50-201ENST00000357765 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
FSIP1Q8NA03 ZCCHC9-204ENST00000438268 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
FSIP1Q8NA03 FBXL8-203ENST00000518148 1054 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
FSIP1Q8NA03 LOXL1-AS1-208ENST00000565756 885 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
FSIP1Q8NA03 Z97986.1-201ENST00000565879 476 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
FSIP1Q8NA03 ZNF263-205ENST00000574253 1139 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
FSIP1Q8NA03 LIMD2-202ENST00000578061 756 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
FSIP1Q8NA03 AC012313.6-201ENST00000599889 790 ntTSL 3 BASIC22.35■■□□□ 1.17
FSIP1Q8NA03 AC000035.1-201ENST00000634116 343 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
FSIP1Q8NA03 ZDHHC3-205ENST00000424952 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
FSIP1Q8NA03 WIPF1-205ENST00000409415 1772 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
FSIP1Q8NA03 PFKFB3-204ENST00000379785 2181 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
FSIP1Q8NA03 LEMD2-201ENST00000293760 2958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
FSIP1Q8NA03 P2RY6-212ENST00000618468 2431 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.35■■□□□ 1.17
FSIP1Q8NA03 ZDHHC16-202ENST00000352634 1718 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
FSIP1Q8NA03 EVL-202ENST00000402714 2353 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
FSIP1Q8NA03 HIBADH-201ENST00000265395 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
FSIP1Q8NA03 EPOR-208ENST00000592375 2086 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
FSIP1Q8NA03 SPESP1-201ENST00000310673 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
FSIP1Q8NA03 DBNDD2-203ENST00000372710 1417 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
FSIP1Q8NA03 BACE1-204ENST00000445823 1408 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
FSIP1Q8NA03 RTN4-201ENST00000317610 2333 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
FSIP1Q8NA03 AC120498.9-201ENST00000339021 3867 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
FSIP1Q8NA03 CDHR5-201ENST00000349570 2318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
FSIP1Q8NA03 ANKDD1B-204ENST00000601380 2569 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
FSIP1Q8NA03 FA2H-201ENST00000219368 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
FSIP1Q8NA03 MOB2-201ENST00000329957 1207 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
FSIP1Q8NA03 C19orf81-201ENST00000425202 765 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
FSIP1Q8NA03 HES2-205ENST00000487437 968 ntTSL 3 BASIC22.34■■□□□ 1.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.2 ms