Protein–RNA interactions for Protein: Q8N9L1

ZIC4, Zinc finger protein ZIC 4, humanhuman

Predictions only

Length 334 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZIC4Q8N9L1 VGF-201ENST00000249330 2575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
ZIC4Q8N9L1 AC107959.1-202ENST00000502083 1945 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
ZIC4Q8N9L1 CBR1-205ENST00000530908 1924 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
ZIC4Q8N9L1 ART5-203ENST00000397068 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
ZIC4Q8N9L1 CABLES1-201ENST00000256925 5002 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
ZIC4Q8N9L1 PQLC2-202ENST00000375155 1805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
ZIC4Q8N9L1 FMR1-202ENST00000334557 1295 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
ZIC4Q8N9L1 C5orf56-203ENST00000378953 942 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
ZIC4Q8N9L1 KRASP1-201ENST00000407852 552 ntBASIC17.43■□□□□ 0.38
ZIC4Q8N9L1 CDH18-AS1-201ENST00000513573 424 ntTSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
ZIC4Q8N9L1 RPPH1-201ENST00000516869 333 ntBASIC17.43■□□□□ 0.38
ZIC4Q8N9L1 IRX5-204ENST00000560154 879 ntTSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
ZIC4Q8N9L1 LRRC75A-AS1-225ENST00000581913 1091 ntTSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
ZIC4Q8N9L1 SYNGR4-202ENST00000595322 533 ntTSL 3 BASIC17.43■□□□□ 0.38
ZIC4Q8N9L1 SMAGP-206ENST00000604188 433 ntTSL 3 BASIC17.43■□□□□ 0.38
ZIC4Q8N9L1 IRX5-205ENST00000620085 881 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
ZIC4Q8N9L1 FP475955.1-201ENST00000624937 553 ntTSL 4 BASIC17.43■□□□□ 0.38
ZIC4Q8N9L1 POU5F1-201ENST00000259915 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
ZIC4Q8N9L1 PSMD6-201ENST00000295901 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
ZIC4Q8N9L1 HNRNPA3-204ENST00000435711 1731 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
ZIC4Q8N9L1 ASMTL-206ENST00000534940 2048 ntTSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
ZIC4Q8N9L1 CCDC62-204ENST00000392441 2936 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
ZIC4Q8N9L1 ESPN-202ENST00000416731 1338 ntTSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
ZIC4Q8N9L1 CENPH-206ENST00000515001 1305 ntTSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
ZIC4Q8N9L1 KXD1-202ENST00000539106 1496 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.43■□□□□ 0.38
ZIC4Q8N9L1 RNF135-205ENST00000535306 2098 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
ZIC4Q8N9L1 PCDHB11-202ENST00000624887 1973 ntTSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
ZIC4Q8N9L1 SAAL1-204ENST00000529318 1503 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
ZIC4Q8N9L1 HSPB2-C11orf52-202ENST00000534100 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
ZIC4Q8N9L1 SYT7-209ENST00000542836 1362 ntTSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
ZIC4Q8N9L1 DYRK2-202ENST00000344096 8912 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
ZIC4Q8N9L1 FMR1-201ENST00000218200 4333 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
ZIC4Q8N9L1 KCNMA1-252ENST00000639120 2308 ntTSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
ZIC4Q8N9L1 ZNF346-209ENST00000512315 1575 ntTSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
ZIC4Q8N9L1 CAPN10-202ENST00000270364 1267 ntTSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
ZIC4Q8N9L1 GPSM1-203ENST00000392944 1111 ntTSL 3 BASIC17.42■□□□□ 0.38
ZIC4Q8N9L1 AC239809.2-201ENST00000415381 517 ntBASIC17.42■□□□□ 0.38
ZIC4Q8N9L1 ZNF436-AS1-202ENST00000437367 606 ntTSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
ZIC4Q8N9L1 MAGI2-AS3-211ENST00000451809 707 ntTSL 3 BASIC17.42■□□□□ 0.38
ZIC4Q8N9L1 AC098590.1-201ENST00000468126 897 ntBASIC17.42■□□□□ 0.38
ZIC4Q8N9L1 AC073111.3-201ENST00000478789 635 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.42■□□□□ 0.38
ZIC4Q8N9L1 SPINK2-202ENST00000504762 659 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
ZIC4Q8N9L1 C1QBPP2-201ENST00000528754 825 ntBASIC17.42■□□□□ 0.38
ZIC4Q8N9L1 SIVA1-203ENST00000535554 1244 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
ZIC4Q8N9L1 CHEK2P2-202ENST00000555186 864 ntTSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
ZIC4Q8N9L1 CORO1B-210ENST00000627576 960 ntTSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
ZIC4Q8N9L1 MOK-201ENST00000361847 1940 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
ZIC4Q8N9L1 TREX1-205ENST00000625293 1783 ntBASIC17.42■□□□□ 0.38
ZIC4Q8N9L1 ASCL4-201ENST00000342331 2260 ntAPPRIS P1 BASIC17.42■□□□□ 0.38
ZIC4Q8N9L1 UBE2F-205ENST00000414443 2100 ntTSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
ZIC4Q8N9L1 LETM2-208ENST00000524874 1459 ntTSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
ZIC4Q8N9L1 WFIKKN1-201ENST00000319070 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
ZIC4Q8N9L1 POLR1D-203ENST00000399697 2036 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
ZIC4Q8N9L1 MEGF6-202ENST00000356575 5455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
ZIC4Q8N9L1 LAYN-203ENST00000436913 2590 ntTSL 2 BASIC17.41■□□□□ 0.38
ZIC4Q8N9L1 ODF3L2-202ENST00000382696 1393 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
ZIC4Q8N9L1 CTDSP2-204ENST00000548823 1368 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
ZIC4Q8N9L1 SLC16A5-202ENST00000450736 2051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
ZIC4Q8N9L1 BCAM-201ENST00000270233 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
ZIC4Q8N9L1 C19orf25-202ENST00000436106 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
ZIC4Q8N9L1 KLHL21-206ENST00000610898 1945 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
ZIC4Q8N9L1 IGFALS-201ENST00000215539 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
ZIC4Q8N9L1 HOXC13-AS-201ENST00000512916 1408 ntTSL 3 BASIC17.41■□□□□ 0.38
ZIC4Q8N9L1 SPATA2L-202ENST00000335360 1001 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
ZIC4Q8N9L1 YBEY-205ENST00000397694 534 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
ZIC4Q8N9L1 METTL21A-204ENST00000425132 869 ntTSL 2 BASIC17.41■□□□□ 0.38
ZIC4Q8N9L1 HOTAIRM1-203ENST00000429611 722 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
ZIC4Q8N9L1 NT5C3B-203ENST00000435506 975 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
ZIC4Q8N9L1 NDUFAF3-204ENST00000451378 774 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
ZIC4Q8N9L1 KRT18P16-201ENST00000510337 1294 ntBASIC17.41■□□□□ 0.38
ZIC4Q8N9L1 COX6C-208ENST00000522940 694 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.41■□□□□ 0.38
ZIC4Q8N9L1 OPA3-203ENST00000544371 1146 ntTSL 2 BASIC17.41■□□□□ 0.38
ZIC4Q8N9L1 DHRS4-206ENST00000558581 1143 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
ZIC4Q8N9L1 AC009090.2-201ENST00000565829 472 ntTSL 3 BASIC17.41■□□□□ 0.38
ZIC4Q8N9L1 TMEM191A-211ENST00000637163 1067 ntBASIC17.41■□□□□ 0.38
ZIC4Q8N9L1 GPR162-201ENST00000311268 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
ZIC4Q8N9L1 TMEFF1-201ENST00000374879 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
ZIC4Q8N9L1 DEDD2-204ENST00000595337 1894 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC17.41■□□□□ 0.38
ZIC4Q8N9L1 LEFTY2-202ENST00000420304 2085 ntTSL 2 BASIC17.41■□□□□ 0.38
ZIC4Q8N9L1 LSR-214ENST00000621372 2274 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
ZIC4Q8N9L1 LHX6-201ENST00000340587 3457 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
ZIC4Q8N9L1 TBL1Y-201ENST00000346432 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
ZIC4Q8N9L1 SAAL1-202ENST00000524803 1582 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
ZIC4Q8N9L1 SP9-201ENST00000394967 2554 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
ZIC4Q8N9L1 BCS1L-201ENST00000359273 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
ZIC4Q8N9L1 CHAC1-205ENST00000617961 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
ZIC4Q8N9L1 ARHGAP22-204ENST00000417247 2340 ntTSL 2 BASIC17.4■□□□□ 0.38
ZIC4Q8N9L1 SMARCD2-212ENST00000613943 2342 ntTSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
ZIC4Q8N9L1 CMTM7-202ENST00000349718 1214 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
ZIC4Q8N9L1 PFN3-201ENST00000358571 530 ntAPPRIS P1 BASIC17.4■□□□□ 0.38
ZIC4Q8N9L1 CAPN5-206ENST00000531028 534 ntTSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
ZIC4Q8N9L1 RNF121-214ENST00000533380 870 ntTSL 3 BASIC17.4■□□□□ 0.38
ZIC4Q8N9L1 FAM213B-215ENST00000537325 1096 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.4■□□□□ 0.38
ZIC4Q8N9L1 AL359736.2-201ENST00000621992 437 ntBASIC17.4■□□□□ 0.38
ZIC4Q8N9L1 SLC35A2-213ENST00000635015 1008 ntTSL 2 BASIC17.4■□□□□ 0.38
ZIC4Q8N9L1 TOR1B-201ENST00000259339 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
ZIC4Q8N9L1 CELF6-202ENST00000395258 1741 ntTSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
ZIC4Q8N9L1 RBFOX1-215ENST00000553186 2196 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
ZIC4Q8N9L1 SPOCK3-215ENST00000510741 1963 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
ZIC4Q8N9L1 MGARP-201ENST00000398955 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.6 ms