Protein–RNA interactions for Protein: Q8N5C6

SRBD1, S1 RNA-binding domain-containing protein 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 995 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SRBD1Q8N5C6 FAM43B-201ENST00000332947 2572 ntAPPRIS P1 BASIC22.77■■□□□ 1.24
SRBD1Q8N5C6 BRSK2-212ENST00000531197 3163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.23
SRBD1Q8N5C6 SAAL1-202ENST00000524803 1582 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
SRBD1Q8N5C6 ZNF561-AS1-201ENST00000585797 1593 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
SRBD1Q8N5C6 MEF2B-204ENST00000424583 1405 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
SRBD1Q8N5C6 FYN-204ENST00000368678 2573 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
SRBD1Q8N5C6 PQLC2-202ENST00000375155 1805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
SRBD1Q8N5C6 SMC5-AS1-201ENST00000594708 1818 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
SRBD1Q8N5C6 MRPL15-201ENST00000260102 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
SRBD1Q8N5C6 C6orf132-202ENST00000356542 894 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
SRBD1Q8N5C6 AVP-201ENST00000380293 619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
SRBD1Q8N5C6 SMIM19-201ENST00000414154 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
SRBD1Q8N5C6 SFXN1-203ENST00000502393 637 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
SRBD1Q8N5C6 KRT18P16-201ENST00000510337 1294 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
SRBD1Q8N5C6 AC091564.2-201ENST00000527191 399 ntTSL 3 BASIC22.76■■□□□ 1.23
SRBD1Q8N5C6 CAPN5-206ENST00000531028 534 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
SRBD1Q8N5C6 ARMC4P1-202ENST00000576034 643 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
SRBD1Q8N5C6 AC018521.5-202ENST00000577279 374 ntTSL 3 BASIC22.76■■□□□ 1.23
SRBD1Q8N5C6 AC018521.5-201ENST00000582787 496 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
SRBD1Q8N5C6 ELAC1-203ENST00000588577 694 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
SRBD1Q8N5C6 AC011446.2-202ENST00000592882 756 ntTSL 3 BASIC22.76■■□□□ 1.23
SRBD1Q8N5C6 DNAH17-AS1-202ENST00000591373 1453 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
SRBD1Q8N5C6 MXRA7-201ENST00000355797 5661 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
SRBD1Q8N5C6 SLC35B2-205ENST00000538577 1909 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
SRBD1Q8N5C6 EPS8L1-203ENST00000540810 2360 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
SRBD1Q8N5C6 PBX1-222ENST00000627490 1769 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
SRBD1Q8N5C6 ACOT2-204ENST00000613168 1553 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
SRBD1Q8N5C6 NEU4-201ENST00000325935 2288 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
SRBD1Q8N5C6 DUT-201ENST00000331200 2147 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
SRBD1Q8N5C6 SIVA1-201ENST00000329967 802 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
SRBD1Q8N5C6 AKR1A1-201ENST00000351829 1166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
SRBD1Q8N5C6 LGALS7-201ENST00000378626 466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
SRBD1Q8N5C6 POLR2J-202ENST00000393794 784 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
SRBD1Q8N5C6 HGNC:18790-208ENST00000506380 798 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.75■■□□□ 1.23
SRBD1Q8N5C6 AC005786.3-201ENST00000589360 565 ntTSL 3 BASIC22.75■■□□□ 1.23
SRBD1Q8N5C6 PI4KB-213ENST00000529142 2603 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
SRBD1Q8N5C6 CCDC62-204ENST00000392441 2936 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
SRBD1Q8N5C6 KCNC2-204ENST00000540018 2168 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
SRBD1Q8N5C6 CBR1-205ENST00000530908 1924 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
SRBD1Q8N5C6 E4F1-204ENST00000564139 2493 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
SRBD1Q8N5C6 PAIP1-203ENST00000436644 1734 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
SRBD1Q8N5C6 MMP11-201ENST00000215743 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
SRBD1Q8N5C6 CYB561-204ENST00000448884 1496 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
SRBD1Q8N5C6 SNX3-201ENST00000230085 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
SRBD1Q8N5C6 CHP2-201ENST00000300113 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
SRBD1Q8N5C6 NDOR1-204ENST00000458322 1829 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
SRBD1Q8N5C6 RPP25L-201ENST00000297613 1092 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
SRBD1Q8N5C6 METTL5-206ENST00000409965 880 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
SRBD1Q8N5C6 AC110769.1-201ENST00000420161 815 ntTSL 3 BASIC22.74■■□□□ 1.23
SRBD1Q8N5C6 UBE2SP1-201ENST00000450587 669 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
SRBD1Q8N5C6 KRT16P5-201ENST00000455284 522 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
SRBD1Q8N5C6 TNFRSF18-204ENST00000486728 727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
SRBD1Q8N5C6 KHDRBS1-204ENST00000492989 1215 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
SRBD1Q8N5C6 ARF3-208ENST00000541959 807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
SRBD1Q8N5C6 BX649632.1-201ENST00000610187 819 ntTSL 3 BASIC22.74■■□□□ 1.23
SRBD1Q8N5C6 ST3GAL3-219ENST00000372374 2170 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
SRBD1Q8N5C6 WHAMM-201ENST00000286760 5101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
SRBD1Q8N5C6 COMMD7-202ENST00000446419 1343 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
SRBD1Q8N5C6 CENPH-206ENST00000515001 1305 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
SRBD1Q8N5C6 TRMU-201ENST00000290846 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
SRBD1Q8N5C6 NRXN1-226ENST00000626899 2543 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
SRBD1Q8N5C6 THOC6-209ENST00000575576 1360 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
SRBD1Q8N5C6 TBL1Y-201ENST00000346432 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
SRBD1Q8N5C6 ESR2-212ENST00000556275 2695 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
SRBD1Q8N5C6 DCAKD-208ENST00000614054 2054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
SRBD1Q8N5C6 TATDN2-201ENST00000287652 5342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
SRBD1Q8N5C6 BCS1L-201ENST00000359273 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
SRBD1Q8N5C6 PRR16-201ENST00000379551 1826 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
SRBD1Q8N5C6 PYCR1-204ENST00000403172 1811 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
SRBD1Q8N5C6 GLT1D1-204ENST00000442111 2995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
SRBD1Q8N5C6 ARHGAP22-204ENST00000417247 2340 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
SRBD1Q8N5C6 AC089999.2-201ENST00000552525 248 ntTSL 3 BASIC22.73■■□□□ 1.23
SRBD1Q8N5C6 AC140479.4-201ENST00000561715 463 ntTSL 4 BASIC22.73■■□□□ 1.23
SRBD1Q8N5C6 KCNN2-207ENST00000610748 2091 ntTSL 3 BASIC22.73■■□□□ 1.23
SRBD1Q8N5C6 MRM1-204ENST00000614766 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
SRBD1Q8N5C6 MSANTD2-202ENST00000374979 2349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
SRBD1Q8N5C6 AUP1-201ENST00000377526 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
SRBD1Q8N5C6 MFSD10-201ENST00000329687 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
SRBD1Q8N5C6 ASAP2-201ENST00000281419 5712 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
SRBD1Q8N5C6 KRT78-201ENST00000304620 1778 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
SRBD1Q8N5C6 ACOT8-201ENST00000217455 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
SRBD1Q8N5C6 FAM98C-201ENST00000252530 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
SRBD1Q8N5C6 GPR35-203ENST00000407714 1258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
SRBD1Q8N5C6 AC007040.1-201ENST00000416229 477 ntTSL 3 BASIC22.72■■□□□ 1.23
SRBD1Q8N5C6 NCF1B-202ENST00000432102 930 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
SRBD1Q8N5C6 SMG1P1-207ENST00000446662 852 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
SRBD1Q8N5C6 DLEU7-203ENST00000504404 1122 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
SRBD1Q8N5C6 CNOT8-224ENST00000523698 862 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
SRBD1Q8N5C6 GRAMD1B-209ENST00000533341 707 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
SRBD1Q8N5C6 TMEM72-203ENST00000544540 1018 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
SRBD1Q8N5C6 C17orf62-238ENST00000585064 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
SRBD1Q8N5C6 FAM3A-203ENST00000369641 1359 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
SRBD1Q8N5C6 ROPN1-209ENST00000495093 1376 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
SRBD1Q8N5C6 GIPR-202ENST00000304207 1432 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
SRBD1Q8N5C6 LINC02361-201ENST00000538731 1484 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
SRBD1Q8N5C6 GPR20-201ENST00000377741 1515 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.72■■□□□ 1.23
SRBD1Q8N5C6 GABBR2-201ENST00000259455 5788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
SRBD1Q8N5C6 DBNL-210ENST00000448521 1808 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
SRBD1Q8N5C6 MRGPRG-201ENST00000332314 870 ntAPPRIS P1 BASIC22.71■■□□□ 1.23
SRBD1Q8N5C6 AC004264.1-201ENST00000608354 794 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 45.2 ms