Protein–RNA interactions for Protein: Q8IU54

IFNL1, Interferon lambda-1, humanhuman

Predictions only

Length 200 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IFNL1Q8IU54 JUNB-201ENST00000302754 1820 ntAPPRIS P1 BASIC22.61■■□□□ 1.21
IFNL1Q8IU54 WDSUB1-203ENST00000392796 1812 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
IFNL1Q8IU54 RBKS-201ENST00000302188 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
IFNL1Q8IU54 SMN1-209ENST00000514951 1308 ntTSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
IFNL1Q8IU54 ESX1-201ENST00000372588 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
IFNL1Q8IU54 AL049796.1-201ENST00000565336 1766 ntBASIC22.61■■□□□ 1.21
IFNL1Q8IU54 LINGO3-201ENST00000585527 2241 ntAPPRIS P1 BASIC22.61■■□□□ 1.21
IFNL1Q8IU54 DMPK-220ENST00000618091 2503 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
IFNL1Q8IU54 PAFAH1B3-201ENST00000262890 1003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
IFNL1Q8IU54 SUMF2-203ENST00000395435 1287 ntTSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
IFNL1Q8IU54 KRTAP5-10-201ENST00000398531 1176 ntAPPRIS P1 BASIC22.61■■□□□ 1.21
IFNL1Q8IU54 C21orf91-202ENST00000400558 1090 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
IFNL1Q8IU54 TSPY21P-201ENST00000433481 731 ntBASIC22.61■■□□□ 1.21
IFNL1Q8IU54 TSPY23P-201ENST00000440136 739 ntBASIC22.61■■□□□ 1.21
IFNL1Q8IU54 AC016582.2-201ENST00000591908 446 ntTSL 3 BASIC22.61■■□□□ 1.21
IFNL1Q8IU54 SLF2-205ENST00000609386 891 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
IFNL1Q8IU54 RNF187-203ENST00000639044 708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
IFNL1Q8IU54 PAQR6-202ENST00000335852 2117 ntTSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
IFNL1Q8IU54 ACY1-215ENST00000636358 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
IFNL1Q8IU54 MANEAL-203ENST00000397631 2327 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
IFNL1Q8IU54 ZNF76-203ENST00000373953 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
IFNL1Q8IU54 SYT7-208ENST00000542670 1887 ntTSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
IFNL1Q8IU54 SYTL1-211ENST00000618673 1712 ntTSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
IFNL1Q8IU54 MAP1LC3A-203ENST00000397709 698 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.6■■□□□ 1.21
IFNL1Q8IU54 AL451069.1-201ENST00000455414 634 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
IFNL1Q8IU54 HOXB-AS3-203ENST00000465846 434 ntTSL 3 BASIC22.6■■□□□ 1.21
IFNL1Q8IU54 LY6E-213ENST00000522528 606 ntTSL 3 BASIC22.6■■□□□ 1.21
IFNL1Q8IU54 OSCAR-208ENST00000611261 2061 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
IFNL1Q8IU54 C3orf80-201ENST00000326474 2718 ntAPPRIS P1 BASIC22.6■■□□□ 1.21
IFNL1Q8IU54 NAE1-203ENST00000379463 1909 ntTSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
IFNL1Q8IU54 PPP2R3B-202ENST00000390665 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
IFNL1Q8IU54 TMEM235-205ENST00000586400 2272 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
IFNL1Q8IU54 NRN1-203ENST00000616243 1556 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.59■■□□□ 1.21
IFNL1Q8IU54 TMEM230-206ENST00000379283 1660 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.59■■□□□ 1.21
IFNL1Q8IU54 SNHG10-201ENST00000500370 1531 ntTSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
IFNL1Q8IU54 CDHR4-201ENST00000343366 1188 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
IFNL1Q8IU54 TLCD1-202ENST00000394933 784 ntTSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
IFNL1Q8IU54 AC012618.3-203ENST00000426044 917 ntTSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
IFNL1Q8IU54 PGAP2-206ENST00000459679 795 ntTSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
IFNL1Q8IU54 AP003041.3-201ENST00000527151 707 ntBASIC22.59■■□□□ 1.21
IFNL1Q8IU54 FAM104A-205ENST00000581110 512 ntTSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
IFNL1Q8IU54 KLK8-205ENST00000593490 267 ntTSL 3 BASIC22.59■■□□□ 1.21
IFNL1Q8IU54 HYMAI.1-201ENST00000620949 238 ntBASIC22.59■■□□□ 1.21
IFNL1Q8IU54 CAMK2B-207ENST00000358707 1895 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
IFNL1Q8IU54 CLN3-205ENST00000359984 1876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
IFNL1Q8IU54 FGF7P6-201ENST00000377614 1890 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
IFNL1Q8IU54 SLC43A3-225ENST00000533524 1879 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
IFNL1Q8IU54 BX664615.2-202ENST00000639056 1888 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
IFNL1Q8IU54 ZNF584-201ENST00000306910 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
IFNL1Q8IU54 B3GNT6-202ENST00000622824 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
IFNL1Q8IU54 VRK2-207ENST00000440705 1676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
IFNL1Q8IU54 NPAS3-201ENST00000346562 5847 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
IFNL1Q8IU54 CENPH-206ENST00000515001 1305 ntTSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
IFNL1Q8IU54 ALDH3B1-206ENST00000615463 1300 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
IFNL1Q8IU54 PLPP5-203ENST00000424479 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
IFNL1Q8IU54 SKOR2-203ENST00000620245 3048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
IFNL1Q8IU54 KRT8P45-201ENST00000414328 1447 ntBASIC22.58■■□□□ 1.21
IFNL1Q8IU54 ALX3-201ENST00000369792 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
IFNL1Q8IU54 IGLL1-201ENST00000249053 716 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
IFNL1Q8IU54 CENPX-201ENST00000306704 751 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
IFNL1Q8IU54 RPUSD3-201ENST00000383820 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
IFNL1Q8IU54 MCFD2-203ENST00000409147 671 ntTSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
IFNL1Q8IU54 ST6GALNAC4P1-201ENST00000435385 499 ntBASIC22.58■■□□□ 1.21
IFNL1Q8IU54 FAM86C2P-201ENST00000525180 435 ntTSL 4 BASIC22.58■■□□□ 1.21
IFNL1Q8IU54 AC125616.1-201ENST00000540369 1015 ntTSL 3 BASIC22.58■■□□□ 1.21
IFNL1Q8IU54 BCL10-202ENST00000620248 774 ntTSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
IFNL1Q8IU54 RASSF1-203ENST00000359365 1923 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
IFNL1Q8IU54 EDEM1-204ENST00000445686 1363 ntTSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
IFNL1Q8IU54 DPP3P2-201ENST00000416030 1696 ntBASIC22.58■■□□□ 1.2
IFNL1Q8IU54 SLC18A3-201ENST00000374115 2420 ntAPPRIS P1 BASIC22.58■■□□□ 1.2
IFNL1Q8IU54 SNX3-201ENST00000230085 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
IFNL1Q8IU54 Z98882.1-201ENST00000622160 2253 ntBASIC22.57■■□□□ 1.2
IFNL1Q8IU54 RANBP10-206ENST00000602677 2374 ntTSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
IFNL1Q8IU54 FICD-201ENST00000361549 1816 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
IFNL1Q8IU54 TMEM88-201ENST00000301599 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
IFNL1Q8IU54 PLPP5-202ENST00000422581 853 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
IFNL1Q8IU54 FDX1P1-201ENST00000449115 551 ntBASIC22.57■■□□□ 1.2
IFNL1Q8IU54 TRMT112-203ENST00000535750 823 ntTSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
IFNL1Q8IU54 NIFKP4-201ENST00000567275 1192 ntBASIC22.57■■□□□ 1.2
IFNL1Q8IU54 GDI1-204ENST00000447750 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
IFNL1Q8IU54 UBE2B-201ENST00000265339 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
IFNL1Q8IU54 NAPEPLD-208ENST00000427257 1822 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
IFNL1Q8IU54 WASH6P-203ENST00000460206 1826 ntTSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
IFNL1Q8IU54 CLN8-208ENST00000635751 1807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
IFNL1Q8IU54 LY6E-203ENST00000517503 1335 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.57■■□□□ 1.2
IFNL1Q8IU54 NKX2-3-201ENST00000344586 2097 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
IFNL1Q8IU54 UNC119-201ENST00000301032 1653 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
IFNL1Q8IU54 WWOX-202ENST00000402655 1594 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
IFNL1Q8IU54 MAP2K2-202ENST00000394867 1471 ntTSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
IFNL1Q8IU54 BSCL2-201ENST00000278893 1364 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
IFNL1Q8IU54 YBEY-201ENST00000329319 1019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
IFNL1Q8IU54 Telomerase-vert.1-201ENST00000363312 438 ntBASIC22.56■■□□□ 1.2
IFNL1Q8IU54 TIMM17B-201ENST00000376582 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
IFNL1Q8IU54 YBEY-206ENST00000397701 744 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
IFNL1Q8IU54 CCNJL-205ENST00000519673 940 ntTSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
IFNL1Q8IU54 ETS1-207ENST00000531611 2134 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
IFNL1Q8IU54 C1QTNF1-205ENST00000578229 1294 ntTSL 4 BASIC22.56■■□□□ 1.2
IFNL1Q8IU54 CENPS-CORT-205ENST00000602787 571 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.56■■□□□ 1.2
IFNL1Q8IU54 KLHDC4-203ENST00000347925 1821 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
IFNL1Q8IU54 PHGDH-210ENST00000641115 1638 ntBASIC22.56■■□□□ 1.2
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23 ms