Protein–RNA interactions for Protein: Q86XT2

VPS37D, Vacuolar protein sorting-associated protein 37D, humanhuman

Predictions only

Length 251 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VPS37DQ86XT2 GDAP1L1-202ENST00000372952 722 ntTSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
VPS37DQ86XT2 ANK1-211ENST00000522231 1060 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
VPS37DQ86XT2 ANK1-212ENST00000522543 1160 ntTSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
VPS37DQ86XT2 KDM2B-217ENST00000543852 1188 ntTSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
VPS37DQ86XT2 AC010531.1-201ENST00000568879 953 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC24.05■■□□□ 1.44
VPS37DQ86XT2 AC004816.2-201ENST00000622856 284 ntTSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
VPS37DQ86XT2 SLAIN1-206ENST00000418532 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
VPS37DQ86XT2 TBX6-201ENST00000279386 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
VPS37DQ86XT2 TBX6-205ENST00000627355 1796 ntTSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
VPS37DQ86XT2 STRADB-201ENST00000194530 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
VPS37DQ86XT2 GOLGA6L3-201ENST00000507199 1679 ntBASIC24.05■■□□□ 1.44
VPS37DQ86XT2 WISP2-202ENST00000372865 1518 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
VPS37DQ86XT2 ART5-203ENST00000397068 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
VPS37DQ86XT2 GGPS1-206ENST00000488594 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
VPS37DQ86XT2 SAAL1-202ENST00000524803 1582 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
VPS37DQ86XT2 ITPKC-201ENST00000263370 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
VPS37DQ86XT2 MPC2-201ENST00000271373 798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
VPS37DQ86XT2 NCF1B-202ENST00000432102 930 ntTSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
VPS37DQ86XT2 KRT18P21-201ENST00000515767 1272 ntBASIC24.04■■□□□ 1.44
VPS37DQ86XT2 CBLN1-202ENST00000536749 718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
VPS37DQ86XT2 AP005263.1-201ENST00000579126 914 ntTSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
VPS37DQ86XT2 CLDND2-203ENST00000601435 575 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.04■■□□□ 1.44
VPS37DQ86XT2 INTS11-202ENST00000411962 1832 ntTSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
VPS37DQ86XT2 HTRA3-202ENST00000382512 2023 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
VPS37DQ86XT2 ME3-202ENST00000393324 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
VPS37DQ86XT2 PNCK-201ENST00000340888 1508 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
VPS37DQ86XT2 HSPB2-C11orf52-202ENST00000534100 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
VPS37DQ86XT2 AKR7A3-201ENST00000361640 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
VPS37DQ86XT2 TAF6L-201ENST00000294168 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
VPS37DQ86XT2 MSLN-201ENST00000382862 2116 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
VPS37DQ86XT2 INPP4A-201ENST00000074304 6752 ntTSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
VPS37DQ86XT2 MAG-202ENST00000392213 2390 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
VPS37DQ86XT2 DUSP5-201ENST00000369583 2557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
VPS37DQ86XT2 SUSD1-203ENST00000374264 2754 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
VPS37DQ86XT2 KRT83-201ENST00000293670 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
VPS37DQ86XT2 SOBP-201ENST00000317357 5245 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
VPS37DQ86XT2 SMYD2-201ENST00000366957 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
VPS37DQ86XT2 METTL21A-201ENST00000272839 1210 ntTSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
VPS37DQ86XT2 VSIG2-202ENST00000403470 1191 ntTSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
VPS37DQ86XT2 PDCD6-206ENST00000507528 1088 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
VPS37DQ86XT2 KRT18P16-201ENST00000510337 1294 ntBASIC24.03■■□□□ 1.44
VPS37DQ86XT2 MIXL1-202ENST00000542034 839 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
VPS37DQ86XT2 AP000525.1-201ENST00000608286 694 ntBASIC24.03■■□□□ 1.44
VPS37DQ86XT2 AC097493.4-201ENST00000641197 219 ntBASIC24.03■■□□□ 1.44
VPS37DQ86XT2 IRX4-206ENST00000513692 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
VPS37DQ86XT2 ACHE-207ENST00000428317 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
VPS37DQ86XT2 BSCL2-207ENST00000407022 1516 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
VPS37DQ86XT2 SMC5-AS1-201ENST00000594708 1818 ntTSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
VPS37DQ86XT2 FBXL17-205ENST00000542267 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
VPS37DQ86XT2 CCAR2-214ENST00000613179 1421 ntTSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
VPS37DQ86XT2 MAFF-204ENST00000426621 2216 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC24.02■■□□□ 1.44
VPS37DQ86XT2 DCK-201ENST00000286648 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
VPS37DQ86XT2 SHISA7-201ENST00000376325 6033 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
VPS37DQ86XT2 EIF2B1-204ENST00000537073 1768 ntTSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
VPS37DQ86XT2 C7orf50-201ENST00000357429 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
VPS37DQ86XT2 AC007161.3-201ENST00000469183 637 ntTSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
VPS37DQ86XT2 AL031985.4-201ENST00000642138 673 ntBASIC24.02■■□□□ 1.44
VPS37DQ86XT2 MEDAG-201ENST00000380482 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
VPS37DQ86XT2 ZNF48-201ENST00000320159 3234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
VPS37DQ86XT2 MYL5-206ENST00000506838 2956 ntTSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
VPS37DQ86XT2 NDRG2-215ENST00000553503 2162 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
VPS37DQ86XT2 TRIM3-202ENST00000359518 3042 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
VPS37DQ86XT2 GTF3A-201ENST00000381140 1383 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
VPS37DQ86XT2 BCKDK-203ENST00000394950 1997 ntTSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.43
VPS37DQ86XT2 SLC35E2-201ENST00000246421 1430 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
VPS37DQ86XT2 TWF2-203ENST00000499914 1440 ntTSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
VPS37DQ86XT2 IRX3-201ENST00000329734 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
VPS37DQ86XT2 SNX27-204ENST00000458013 6403 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
VPS37DQ86XT2 AC079598.2-202ENST00000546624 1451 ntBASIC24.01■■□□□ 1.43
VPS37DQ86XT2 TRIP13-201ENST00000166345 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
VPS37DQ86XT2 CLN8-208ENST00000635751 1807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
VPS37DQ86XT2 RGS3-232ENST00000620489 1503 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
VPS37DQ86XT2 C1orf50-201ENST00000372525 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
VPS37DQ86XT2 ZNF599-203ENST00000588760 948 ntTSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
VPS37DQ86XT2 PDCD5-207ENST00000590247 699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
VPS37DQ86XT2 CUTC-202ENST00000370476 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
VPS37DQ86XT2 PCGF3-208ENST00000470161 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
VPS37DQ86XT2 ALG9-215ENST00000616540 2069 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
VPS37DQ86XT2 MED26-207ENST00000611692 1444 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
VPS37DQ86XT2 SCYL2-201ENST00000360820 5779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
VPS37DQ86XT2 LENG9-203ENST00000611161 1916 ntAPPRIS P1 BASIC24■■□□□ 1.43
VPS37DQ86XT2 AC020907.5-201ENST00000624372 1936 ntBASIC24■■□□□ 1.43
VPS37DQ86XT2 BX119927.1-201ENST00000636596 1552 ntBASIC24■■□□□ 1.43
VPS37DQ86XT2 GTF3C5-203ENST00000372099 1999 ntTSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
VPS37DQ86XT2 GYG1-202ENST00000345003 2052 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
VPS37DQ86XT2 KRAS-201ENST00000256078 1119 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
VPS37DQ86XT2 MIR1238-201ENST00000408483 83 ntBASIC24■■□□□ 1.43
VPS37DQ86XT2 LINC01184-202ENST00000501173 949 ntTSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
VPS37DQ86XT2 AC116562.2-201ENST00000507042 360 ntBASIC24■■□□□ 1.43
VPS37DQ86XT2 BAALC-AS1-207ENST00000522856 594 ntTSL 3 BASIC24■■□□□ 1.43
VPS37DQ86XT2 AC103855.2-201ENST00000533315 573 ntTSL 4 BASIC24■■□□□ 1.43
VPS37DQ86XT2 SMTN-204ENST00000404574 1735 ntTSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
VPS37DQ86XT2 BIRC7-202ENST00000342412 1302 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
VPS37DQ86XT2 CSF1-203ENST00000369801 1364 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
VPS37DQ86XT2 GIPR-202ENST00000304207 1432 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
VPS37DQ86XT2 KLHL31-202ENST00000407079 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
VPS37DQ86XT2 NES-201ENST00000368223 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
VPS37DQ86XT2 SETD7-202ENST00000404104 1590 ntTSL 2 BASIC23.99■■□□□ 1.43
VPS37DQ86XT2 PNKP-214ENST00000600573 1602 ntTSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
VPS37DQ86XT2 GRB10-206ENST00000402497 2289 ntTSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.3 ms