Protein–RNA interactions for Protein: Q7Z3Y8

KRT27, Keratin, type I cytoskeletal 27, humanhuman

Predictions only

Length 459 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KRT27Q7Z3Y8 GAS2L1-206ENST00000610653 2238 ntTSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
KRT27Q7Z3Y8 BCAP29-202ENST00000379117 1946 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.67■■□□□ 1.7
KRT27Q7Z3Y8 ACOT2-205ENST00000622407 1604 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
KRT27Q7Z3Y8 ETS1-207ENST00000531611 2134 ntTSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
KRT27Q7Z3Y8 ZNF282-203ENST00000479907 1815 ntTSL 2 BASIC25.66■■□□□ 1.7
KRT27Q7Z3Y8 MAGED2-213ENST00000627068 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.66■■□□□ 1.7
KRT27Q7Z3Y8 TLCD1-202ENST00000394933 784 ntTSL 2 BASIC25.66■■□□□ 1.7
KRT27Q7Z3Y8 NUS1P1-201ENST00000446295 882 ntBASIC25.66■■□□□ 1.7
KRT27Q7Z3Y8 AC104532.1-201ENST00000588891 580 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC25.66■■□□□ 1.7
KRT27Q7Z3Y8 USF2-202ENST00000343550 1523 ntTSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
KRT27Q7Z3Y8 CADM1-201ENST00000331581 1766 ntTSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
KRT27Q7Z3Y8 H19-201ENST00000411754 1788 ntTSL 5 BASIC25.66■■□□□ 1.7
KRT27Q7Z3Y8 ZDHHC20-201ENST00000320220 1351 ntTSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
KRT27Q7Z3Y8 HADH-209ENST00000603302 2032 ntTSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
KRT27Q7Z3Y8 APBB1-210ENST00000530885 1626 ntTSL 2 BASIC25.66■■□□□ 1.7
KRT27Q7Z3Y8 AC018553.1-201ENST00000616682 1458 ntBASIC25.66■■□□□ 1.7
KRT27Q7Z3Y8 NTMT1-203ENST00000372483 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
KRT27Q7Z3Y8 ZNF219-201ENST00000360947 3071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
KRT27Q7Z3Y8 TEX45-201ENST00000361664 1679 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
KRT27Q7Z3Y8 CLEC14A-201ENST00000342213 2267 ntAPPRIS P1 BASIC25.65■■□□□ 1.7
KRT27Q7Z3Y8 CNTD2-203ENST00000513948 787 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.65■■□□□ 1.7
KRT27Q7Z3Y8 IGFLR1-209ENST00000592537 1195 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
KRT27Q7Z3Y8 KCNH1-214ENST00000640566 1365 ntTSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
KRT27Q7Z3Y8 CCNC-207ENST00000518714 1426 ntTSL 5 BASIC25.64■■□□□ 1.7
KRT27Q7Z3Y8 C1orf229-201ENST00000623686 2258 ntBASIC25.64■■□□□ 1.7
KRT27Q7Z3Y8 CD70-201ENST00000245903 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
KRT27Q7Z3Y8 ART5-201ENST00000359918 1241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
KRT27Q7Z3Y8 PHPT1-202ENST00000371661 985 ntTSL 5 BASIC25.64■■□□□ 1.7
KRT27Q7Z3Y8 MVB12A-204ENST00000528515 686 ntTSL 5 BASIC25.64■■□□□ 1.7
KRT27Q7Z3Y8 AC008878.2-201ENST00000601870 942 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC25.64■■□□□ 1.7
KRT27Q7Z3Y8 AC008567.3-202ENST00000619671 859 ntTSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
KRT27Q7Z3Y8 CERS1-202ENST00000542296 1947 ntTSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.69
KRT27Q7Z3Y8 GOLGA2P6-201ENST00000340929 2049 ntBASIC25.64■■□□□ 1.69
KRT27Q7Z3Y8 CD7-207ENST00000584284 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.69
KRT27Q7Z3Y8 CEBPB-201ENST00000303004 1956 ntAPPRIS P1 BASIC25.64■■□□□ 1.69
KRT27Q7Z3Y8 RAB29-205ENST00000446390 1441 ntTSL 2 BASIC25.63■■□□□ 1.69
KRT27Q7Z3Y8 CCM2-206ENST00000474617 1532 ntTSL 5 BASIC25.63■■□□□ 1.69
KRT27Q7Z3Y8 C12orf42-205ENST00000548048 1532 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.63■■□□□ 1.69
KRT27Q7Z3Y8 CDK18-203ENST00000429964 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
KRT27Q7Z3Y8 PYCR1-204ENST00000403172 1811 ntTSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
KRT27Q7Z3Y8 ARRDC1-AS1-203ENST00000623970 2210 ntTSL 5 BASIC25.63■■□□□ 1.69
KRT27Q7Z3Y8 STRA8-201ENST00000275764 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
KRT27Q7Z3Y8 HBZP1-201ENST00000354915 429 ntBASIC25.63■■□□□ 1.69
KRT27Q7Z3Y8 PHB2-202ENST00000440277 996 ntTSL 5 BASIC25.63■■□□□ 1.69
KRT27Q7Z3Y8 AC007834.1-201ENST00000446473 728 ntTSL 3 BASIC25.63■■□□□ 1.69
KRT27Q7Z3Y8 AC079781.3-201ENST00000449110 356 ntBASIC25.63■■□□□ 1.69
KRT27Q7Z3Y8 AC007161.3-201ENST00000469183 637 ntTSL 5 BASIC25.63■■□□□ 1.69
KRT27Q7Z3Y8 NDUFB9-202ENST00000517367 636 ntTSL 3 BASIC25.63■■□□□ 1.69
KRT27Q7Z3Y8 NEK7-207ENST00000538004 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
KRT27Q7Z3Y8 CHRDL2-203ENST00000376332 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
KRT27Q7Z3Y8 CHSY1-201ENST00000254190 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
KRT27Q7Z3Y8 DMAP1-202ENST00000361745 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
KRT27Q7Z3Y8 ZACN-201ENST00000334586 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
KRT27Q7Z3Y8 TRAP1-202ENST00000538171 2052 ntTSL 2 BASIC25.62■■□□□ 1.69
KRT27Q7Z3Y8 ITGB1BP1-202ENST00000355346 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
KRT27Q7Z3Y8 KXD1-203ENST00000540691 1592 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.62■■□□□ 1.69
KRT27Q7Z3Y8 CENPA-202ENST00000335756 1452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
KRT27Q7Z3Y8 AC016734.2-201ENST00000624325 1377 ntBASIC25.62■■□□□ 1.69
KRT27Q7Z3Y8 COPE-201ENST00000262812 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
KRT27Q7Z3Y8 LINC02237-202ENST00000521904 477 ntTSL 3 BASIC25.62■■□□□ 1.69
KRT27Q7Z3Y8 MTHFS-202ENST00000559722 948 ntTSL 2 BASIC25.62■■□□□ 1.69
KRT27Q7Z3Y8 AL671883.3-201ENST00000603274 991 ntBASIC25.62■■□□□ 1.69
KRT27Q7Z3Y8 AC124016.1-202ENST00000609575 619 ntTSL 2 BASIC25.62■■□□□ 1.69
KRT27Q7Z3Y8 MUC1-224ENST00000611577 1023 ntTSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
KRT27Q7Z3Y8 DHRS4L2-211ENST00000621761 1049 ntTSL 5 BASIC25.62■■□□□ 1.69
KRT27Q7Z3Y8 RAPGEF1-203ENST00000372195 6256 ntTSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
KRT27Q7Z3Y8 CXCR3-202ENST00000373693 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
KRT27Q7Z3Y8 PRSS33-202ENST00000570702 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
KRT27Q7Z3Y8 TERF2IP-201ENST00000300086 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
KRT27Q7Z3Y8 CPLX1-203ENST00000505203 2011 ntTSL 2 BASIC25.61■■□□□ 1.69
KRT27Q7Z3Y8 PTGER3-212ENST00000628037 1815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
KRT27Q7Z3Y8 HMBS-221ENST00000544387 1351 ntTSL 2 BASIC25.61■■□□□ 1.69
KRT27Q7Z3Y8 PAIP1-203ENST00000436644 1734 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
KRT27Q7Z3Y8 UPK3B-201ENST00000257632 1296 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC25.61■■□□□ 1.69
KRT27Q7Z3Y8 GJC3-201ENST00000312891 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
KRT27Q7Z3Y8 AP002383.4-201ENST00000442518 975 ntBASIC25.61■■□□□ 1.69
KRT27Q7Z3Y8 AP003396.3-201ENST00000530918 778 ntTSL 5 BASIC25.61■■□□□ 1.69
KRT27Q7Z3Y8 CCDC61-201ENST00000536603 1282 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
KRT27Q7Z3Y8 LINC00454-206ENST00000609861 841 ntTSL 5 BASIC25.61■■□□□ 1.69
KRT27Q7Z3Y8 IZUMO4-213ENST00000620263 947 ntTSL 3 BASIC25.61■■□□□ 1.69
KRT27Q7Z3Y8 SQSTM1-216ENST00000626660 274 ntTSL 5 BASIC25.61■■□□□ 1.69
KRT27Q7Z3Y8 BSCL2-207ENST00000407022 1516 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
KRT27Q7Z3Y8 DYM-203ENST00000442713 2147 ntTSL 2 BASIC25.61■■□□□ 1.69
KRT27Q7Z3Y8 EPOR-208ENST00000592375 2086 ntTSL 2 BASIC25.6■■□□□ 1.69
KRT27Q7Z3Y8 CPNE2-202ENST00000535318 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
KRT27Q7Z3Y8 SNX3-201ENST00000230085 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
KRT27Q7Z3Y8 TMEM89-201ENST00000330862 662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
KRT27Q7Z3Y8 DYDC2-206ENST00000444807 1173 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC25.6■■□□□ 1.69
KRT27Q7Z3Y8 BX276092.5-203ENST00000456199 560 ntBASIC25.6■■□□□ 1.69
KRT27Q7Z3Y8 LY6E-209ENST00000521003 740 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.6■■□□□ 1.69
KRT27Q7Z3Y8 NAPSB-203ENST00000531692 561 ntTSL 2 BASIC25.6■■□□□ 1.69
KRT27Q7Z3Y8 AL121672.3-201ENST00000608644 468 ntBASIC25.6■■□□□ 1.69
KRT27Q7Z3Y8 AL732292.2-201ENST00000609649 430 ntBASIC25.6■■□□□ 1.69
KRT27Q7Z3Y8 ZFPM1-201ENST00000319555 5380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
KRT27Q7Z3Y8 MATK-215ENST00000619596 1740 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC25.6■■□□□ 1.69
KRT27Q7Z3Y8 IER2-201ENST00000292433 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
KRT27Q7Z3Y8 NUP160-203ENST00000526870 1537 ntTSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
KRT27Q7Z3Y8 TMEM230-206ENST00000379283 1660 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.59■■□□□ 1.69
KRT27Q7Z3Y8 AC079776.4-201ENST00000511039 504 ntBASIC25.59■■□□□ 1.69
KRT27Q7Z3Y8 AC106795.1-205ENST00000512851 1056 ntBASIC25.59■■□□□ 1.69
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.1 ms