Protein–RNA interactions for Protein: Q7Z3B4

NUP54, Nucleoporin p54, humanhuman

Predictions only

Length 507 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NUP54Q7Z3B4 PAIP1-203ENST00000436644 1734 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
NUP54Q7Z3B4 CEACAM3-202ENST00000357396 1316 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
NUP54Q7Z3B4 C19orf84-202ENST00000574814 1318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
NUP54Q7Z3B4 FAM91A1-201ENST00000334705 5511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
NUP54Q7Z3B4 MARK2-203ENST00000377810 4560 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
NUP54Q7Z3B4 NFKBIE-204ENST00000619360 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
NUP54Q7Z3B4 KCNMA1-252ENST00000639120 2308 ntTSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
NUP54Q7Z3B4 WDR45-207ENST00000376372 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
NUP54Q7Z3B4 ME2-202ENST00000382927 2492 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
NUP54Q7Z3B4 HMOX2-218ENST00000619913 1908 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
NUP54Q7Z3B4 KCTD13-207ENST00000568000 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
NUP54Q7Z3B4 C5orf17-202ENST00000512559 1984 ntTSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
NUP54Q7Z3B4 AC245041.2-204ENST00000610809 1962 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
NUP54Q7Z3B4 SPG7-202ENST00000341316 2288 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
NUP54Q7Z3B4 CLTA-202ENST00000345519 1073 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
NUP54Q7Z3B4 TREX2-204ENST00000370212 861 ntTSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
NUP54Q7Z3B4 TREX2-205ENST00000370231 1255 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
NUP54Q7Z3B4 MTFR1L-203ENST00000374303 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
NUP54Q7Z3B4 PQLC2-201ENST00000375153 2153 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
NUP54Q7Z3B4 PUSL1-201ENST00000379031 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
NUP54Q7Z3B4 TREX2-207ENST00000393862 907 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
NUP54Q7Z3B4 FKBP2-202ENST00000394540 1002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
NUP54Q7Z3B4 FLYWCH2-202ENST00000396958 1036 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
NUP54Q7Z3B4 HOTAIRM1-203ENST00000429611 722 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
NUP54Q7Z3B4 PYCR3-207ENST00000495276 2332 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
NUP54Q7Z3B4 CDH18-AS1-201ENST00000513573 424 ntTSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
NUP54Q7Z3B4 PNN-205ENST00000556530 601 ntTSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
NUP54Q7Z3B4 CLN6-206ENST00000565471 1075 ntTSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
NUP54Q7Z3B4 AC022211.2-202ENST00000582668 546 ntTSL 4 BASIC18.19■□□□□ 0.5
NUP54Q7Z3B4 MMP28-201ENST00000605424 1928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
NUP54Q7Z3B4 ACOT2-205ENST00000622407 1604 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
NUP54Q7Z3B4 AC018553.1-201ENST00000616682 1458 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
NUP54Q7Z3B4 CDKN2B-AS1-217ENST00000585267 1337 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
NUP54Q7Z3B4 ACBD4-203ENST00000398322 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
NUP54Q7Z3B4 MARK3-206ENST00000440884 2643 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
NUP54Q7Z3B4 EGLN2-202ENST00000406058 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
NUP54Q7Z3B4 AR-204ENST00000504326 3615 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
NUP54Q7Z3B4 TLE3-226ENST00000627388 5742 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
NUP54Q7Z3B4 TRMU-202ENST00000381019 1381 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
NUP54Q7Z3B4 WWC3-201ENST00000380861 6647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
NUP54Q7Z3B4 RTN1-202ENST00000342503 1703 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
NUP54Q7Z3B4 POMGNT1-201ENST00000371984 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
NUP54Q7Z3B4 NRG2-204ENST00000358522 2559 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
NUP54Q7Z3B4 PRORSD1P-201ENST00000295112 541 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
NUP54Q7Z3B4 IFI6-203ENST00000362020 828 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
NUP54Q7Z3B4 AC007405.3-201ENST00000429172 561 ntTSL 3 BASIC18.18■□□□□ 0.5
NUP54Q7Z3B4 MAGI2-AS3-211ENST00000451809 707 ntTSL 3 BASIC18.18■□□□□ 0.5
NUP54Q7Z3B4 CA3-AS1-201ENST00000517697 559 ntTSL 4 BASIC18.18■□□□□ 0.5
NUP54Q7Z3B4 JPT2-204ENST00000561516 1065 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
NUP54Q7Z3B4 PRORSD1P-203ENST00000579162 626 ntTSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
NUP54Q7Z3B4 ICAM2-207ENST00000579687 1154 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.18■□□□□ 0.5
NUP54Q7Z3B4 AC007786.1-201ENST00000587859 709 ntTSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
NUP54Q7Z3B4 CD24-208ENST00000622315 825 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
NUP54Q7Z3B4 TAF7-201ENST00000313368 2334 ntAPPRIS P1 BASIC18.18■□□□□ 0.5
NUP54Q7Z3B4 HYLS1-203ENST00000526028 1803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
NUP54Q7Z3B4 WIPF1-203ENST00000392546 2180 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
NUP54Q7Z3B4 NDRG2-215ENST00000553503 2162 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
NUP54Q7Z3B4 ABHD5-205ENST00000458276 1690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
NUP54Q7Z3B4 DHRS4-204ENST00000543741 1340 ntTSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
NUP54Q7Z3B4 CXCL16-201ENST00000293778 2222 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
NUP54Q7Z3B4 C17orf58-201ENST00000334461 1535 ntTSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
NUP54Q7Z3B4 DAG1-221ENST00000541308 5676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
NUP54Q7Z3B4 ACTR8-202ENST00000482349 2091 ntTSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
NUP54Q7Z3B4 TMEM91-203ENST00000392002 1389 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
NUP54Q7Z3B4 SENP5-204ENST00000445299 2491 ntTSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
NUP54Q7Z3B4 METRNL-203ENST00000571814 1900 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
NUP54Q7Z3B4 PCDHA2-203ENST00000526136 5254 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
NUP54Q7Z3B4 STAU2-229ENST00000524300 3065 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
NUP54Q7Z3B4 PMS1-222ENST00000639501 2506 ntTSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
NUP54Q7Z3B4 ISCA1-203ENST00000375991 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
NUP54Q7Z3B4 MPV17L2-204ENST00000599612 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
NUP54Q7Z3B4 NDOR1-204ENST00000458322 1829 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
NUP54Q7Z3B4 ABHD13-201ENST00000375898 5338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
NUP54Q7Z3B4 HOXA6-201ENST00000222728 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
NUP54Q7Z3B4 CAPN10-202ENST00000270364 1267 ntTSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
NUP54Q7Z3B4 ABHD14A-201ENST00000273596 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
NUP54Q7Z3B4 ZNF436-AS1-202ENST00000437367 606 ntTSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
NUP54Q7Z3B4 LIME1-205ENST00000480139 819 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.17■□□□□ 0.5
NUP54Q7Z3B4 AL162258.1-201ENST00000497086 753 ntTSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
NUP54Q7Z3B4 LEF1-AS1-203ENST00000507799 459 ntTSL 3 BASIC18.17■□□□□ 0.5
NUP54Q7Z3B4 EXOSC4-202ENST00000525936 606 ntTSL 3 BASIC18.17■□□□□ 0.5
NUP54Q7Z3B4 AC069185.1-201ENST00000531395 811 ntTSL 3 BASIC18.17■□□□□ 0.5
NUP54Q7Z3B4 OPA3-203ENST00000544371 1146 ntTSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
NUP54Q7Z3B4 BCL2L10-202ENST00000561198 825 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
NUP54Q7Z3B4 AC009052.1-201ENST00000567090 298 ntTSL 3 BASIC18.17■□□□□ 0.5
NUP54Q7Z3B4 SPAST-203ENST00000615843 5212 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
NUP54Q7Z3B4 MOK-225ENST00000522867 1883 ntTSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
NUP54Q7Z3B4 USP25-204ENST00000400183 5341 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
NUP54Q7Z3B4 PPP5C-202ENST00000391919 1929 ntTSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
NUP54Q7Z3B4 OSR2-202ENST00000435298 1736 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
NUP54Q7Z3B4 MRPL4-202ENST00000307422 1320 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
NUP54Q7Z3B4 SNAP91-211ENST00000520213 2168 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
NUP54Q7Z3B4 ASPG-201ENST00000546892 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
NUP54Q7Z3B4 LINC01011-201ENST00000445000 2811 ntTSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
NUP54Q7Z3B4 TFP1-202ENST00000475455 1573 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
NUP54Q7Z3B4 AP001271.2-201ENST00000624018 1556 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
NUP54Q7Z3B4 RNASET2-214ENST00000620173 1391 ntTSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
NUP54Q7Z3B4 BRSK2-215ENST00000544817 1842 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
NUP54Q7Z3B4 CHD1L-201ENST00000361293 2484 ntTSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
NUP54Q7Z3B4 CHST1-201ENST00000308064 2718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36 ms