Protein–RNA interactions for Protein: Q7RTU4

BHLHA9, Class A basic helix-loop-helix protein 9, humanhuman

Predictions only

Length 235 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BHLHA9Q7RTU4 C16orf90-202ENST00000437192 907 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
BHLHA9Q7RTU4 LINC01786-202ENST00000453732 389 ntTSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
BHLHA9Q7RTU4 ISG20-210ENST00000560741 800 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
BHLHA9Q7RTU4 AL354712.1-201ENST00000563570 477 ntTSL 3 BASIC20.5■□□□□ 0.87
BHLHA9Q7RTU4 AC018521.5-202ENST00000577279 374 ntTSL 3 BASIC20.5■□□□□ 0.87
BHLHA9Q7RTU4 AC018521.5-201ENST00000582787 496 ntTSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
BHLHA9Q7RTU4 FAM110A-204ENST00000381941 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
BHLHA9Q7RTU4 ZIM2-206ENST00000599935 2226 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
BHLHA9Q7RTU4 GRB14-201ENST00000263915 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
BHLHA9Q7RTU4 CENPH-206ENST00000515001 1305 ntTSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
BHLHA9Q7RTU4 EPS8L1-201ENST00000201647 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
BHLHA9Q7RTU4 CYB561-204ENST00000448884 1496 ntTSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
BHLHA9Q7RTU4 SPOCK3-204ENST00000502330 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
BHLHA9Q7RTU4 GLB1-201ENST00000307363 2616 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
BHLHA9Q7RTU4 NPNT-214ENST00000514622 2362 ntTSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
BHLHA9Q7RTU4 HAS3-201ENST00000219322 1163 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
BHLHA9Q7RTU4 CMTM8-201ENST00000307526 1174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
BHLHA9Q7RTU4 ANKRD10-202ENST00000310847 1193 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
BHLHA9Q7RTU4 DNPH1-202ENST00000393987 796 ntTSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
BHLHA9Q7RTU4 TUBB8P6-201ENST00000436895 1288 ntBASIC20.49■□□□□ 0.87
BHLHA9Q7RTU4 RPS2P4-201ENST00000476944 856 ntBASIC20.49■□□□□ 0.87
BHLHA9Q7RTU4 ANKRD13D-216ENST00000514166 2138 ntTSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
BHLHA9Q7RTU4 AF186192.3-201ENST00000583427 947 ntBASIC20.49■□□□□ 0.87
BHLHA9Q7RTU4 AC113410.3-201ENST00000623366 203 ntBASIC20.49■□□□□ 0.87
BHLHA9Q7RTU4 MAEA-208ENST00000505839 1444 ntTSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
BHLHA9Q7RTU4 SAE1-201ENST00000270225 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
BHLHA9Q7RTU4 ITPKC-201ENST00000263370 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
BHLHA9Q7RTU4 C20orf27-201ENST00000217195 1302 ntTSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
BHLHA9Q7RTU4 CSPG5-203ENST00000456150 2089 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
BHLHA9Q7RTU4 OLFM1-204ENST00000371793 2444 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.48■□□□□ 0.87
BHLHA9Q7RTU4 DPF1-217ENST00000614244 2356 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
BHLHA9Q7RTU4 AOC3-207ENST00000617500 2392 ntTSL 4 BASIC20.48■□□□□ 0.87
BHLHA9Q7RTU4 RTN4RL2-201ENST00000335099 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
BHLHA9Q7RTU4 CALML5-201ENST00000380332 859 ntAPPRIS P1 BASIC20.48■□□□□ 0.87
BHLHA9Q7RTU4 POMC-202ENST00000380794 1295 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
BHLHA9Q7RTU4 AL596275.1-201ENST00000423464 877 ntBASIC20.48■□□□□ 0.87
BHLHA9Q7RTU4 AL590666.2-201ENST00000448869 758 ntTSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
BHLHA9Q7RTU4 RNASEK-202ENST00000548577 810 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
BHLHA9Q7RTU4 EFTUD1P1-201ENST00000558187 596 ntTSL 4 BASIC20.48■□□□□ 0.87
BHLHA9Q7RTU4 AC015712.2-203ENST00000560461 688 ntTSL 3 BASIC20.48■□□□□ 0.87
BHLHA9Q7RTU4 AC097641.1-201ENST00000580671 588 ntTSL 4 BASIC20.48■□□□□ 0.87
BHLHA9Q7RTU4 AL353708.3-201ENST00000610272 989 ntBASIC20.48■□□□□ 0.87
BHLHA9Q7RTU4 LHX8-202ENST00000356261 1764 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
BHLHA9Q7RTU4 RAB34-204ENST00000395245 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
BHLHA9Q7RTU4 RBPJL-203ENST00000372743 1623 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
BHLHA9Q7RTU4 PQLC2-202ENST00000375155 1805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
BHLHA9Q7RTU4 SIMC1-203ENST00000429602 2694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
BHLHA9Q7RTU4 TSPAN15-201ENST00000373290 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
BHLHA9Q7RTU4 MRPS2-201ENST00000241600 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
BHLHA9Q7RTU4 FAM72B-202ENST00000369390 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
BHLHA9Q7RTU4 TTBK1-202ENST00000304139 2449 ntTSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
BHLHA9Q7RTU4 AL035252.2-201ENST00000454676 3168 ntTSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
BHLHA9Q7RTU4 DUT-201ENST00000331200 2147 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
BHLHA9Q7RTU4 KANK4-202ENST00000354381 2103 ntTSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
BHLHA9Q7RTU4 SLC1A6-202ENST00000430939 1794 ntTSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
BHLHA9Q7RTU4 MED17-221ENST00000639724 2317 ntTSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
BHLHA9Q7RTU4 POC1A-202ENST00000394970 1999 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
BHLHA9Q7RTU4 KRT16-201ENST00000301653 1644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
BHLHA9Q7RTU4 CTAG2-201ENST00000247306 993 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
BHLHA9Q7RTU4 UPK3B-203ENST00000394849 1041 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
BHLHA9Q7RTU4 MAP1LC3A-203ENST00000397709 698 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.47■□□□□ 0.87
BHLHA9Q7RTU4 AC108693.2-201ENST00000492981 303 ntTSL 3 BASIC20.47■□□□□ 0.87
BHLHA9Q7RTU4 CXCL2-202ENST00000508487 1218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
BHLHA9Q7RTU4 PAIP2-208ENST00000511706 468 ntTSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
BHLHA9Q7RTU4 AC004706.3-201ENST00000634558 1009 ntTSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
BHLHA9Q7RTU4 AL049637.2-201ENST00000641778 930 ntBASIC20.47■□□□□ 0.87
BHLHA9Q7RTU4 ILKAP-201ENST00000254654 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
BHLHA9Q7RTU4 DMKN-207ENST00000419602 1496 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
BHLHA9Q7RTU4 TMED4-201ENST00000289577 2203 ntTSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
BHLHA9Q7RTU4 MRM1-204ENST00000614766 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
BHLHA9Q7RTU4 P2RX3-204ENST00000616487 1346 ntTSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
BHLHA9Q7RTU4 MMP28-201ENST00000605424 1928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
BHLHA9Q7RTU4 FBXO27-201ENST00000292853 2330 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
BHLHA9Q7RTU4 FAM193A-211ENST00000637812 4885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
BHLHA9Q7RTU4 NEU4-201ENST00000325935 2288 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
BHLHA9Q7RTU4 PATZ1-201ENST00000215919 2516 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
BHLHA9Q7RTU4 CHAC1-205ENST00000617961 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
BHLHA9Q7RTU4 RHOC-203ENST00000369632 1026 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.46■□□□□ 0.87
BHLHA9Q7RTU4 SAPCD2P4-201ENST00000424595 1171 ntBASIC20.46■□□□□ 0.87
BHLHA9Q7RTU4 Z98884.1-201ENST00000451646 830 ntTSL 3 BASIC20.46■□□□□ 0.87
BHLHA9Q7RTU4 TGIF1-219ENST00000551541 990 ntTSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
BHLHA9Q7RTU4 GRAP-204ENST00000573099 846 ntTSL 3 BASIC20.46■□□□□ 0.87
BHLHA9Q7RTU4 FAM98C-205ENST00000588262 826 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
BHLHA9Q7RTU4 SNAPC2-201ENST00000221573 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
BHLHA9Q7RTU4 NPAS1-201ENST00000439365 1341 ntTSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
BHLHA9Q7RTU4 DKK3-203ENST00000525493 1326 ntTSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
BHLHA9Q7RTU4 SGCE-207ENST00000447873 1597 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
BHLHA9Q7RTU4 KXD1-203ENST00000540691 1592 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.46■□□□□ 0.87
BHLHA9Q7RTU4 MSANTD1-203ENST00000507492 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
BHLHA9Q7RTU4 PRR16-201ENST00000379551 1826 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
BHLHA9Q7RTU4 ENGASE-205ENST00000579016 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
BHLHA9Q7RTU4 AC092835.1-201ENST00000425953 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
BHLHA9Q7RTU4 TWF2-203ENST00000499914 1440 ntTSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
BHLHA9Q7RTU4 DVL3-201ENST00000313143 5254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
BHLHA9Q7RTU4 MAP2K2-202ENST00000394867 1471 ntTSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
BHLHA9Q7RTU4 GABRD-201ENST00000378585 1961 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
BHLHA9Q7RTU4 PLSCR3-212ENST00000576201 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
BHLHA9Q7RTU4 LINC01743-201ENST00000366308 964 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
BHLHA9Q7RTU4 RTL8A-201ENST00000370775 1244 ntAPPRIS P1 BASIC20.45■□□□□ 0.86
BHLHA9Q7RTU4 TCEAL6-202ENST00000372774 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.9 ms