Protein–RNA interactions for Protein: Q7L0J3

SV2A, Synaptic vesicle glycoprotein 2A, humanhuman

Predictions only

Length 742 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SV2AQ7L0J3 NMRK1-201ENST00000361092 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
SV2AQ7L0J3 AC128676.1-201ENST00000454392 318 ntBASIC21.23■□□□□ 0.99
SV2AQ7L0J3 CENPS-CORT-202ENST00000465026 494 ntTSL 3 BASIC21.23■□□□□ 0.99
SV2AQ7L0J3 CENPS-CORT-203ENST00000470413 626 ntTSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
SV2AQ7L0J3 Six3os1_6.1-201ENST00000620790 196 ntBASIC21.23■□□□□ 0.99
SV2AQ7L0J3 IL15RA-222ENST00000622442 1160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
SV2AQ7L0J3 HEMK1-206ENST00000455834 1499 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
SV2AQ7L0J3 PWWP2AP1-201ENST00000429776 2273 ntBASIC21.23■□□□□ 0.99
SV2AQ7L0J3 USP21-203ENST00000368002 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
SV2AQ7L0J3 METRNL-203ENST00000571814 1900 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
SV2AQ7L0J3 MBD1-216ENST00000587605 1945 ntTSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
SV2AQ7L0J3 KLHL21-206ENST00000610898 1945 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
SV2AQ7L0J3 PSKH2-201ENST00000276616 1322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
SV2AQ7L0J3 CPEB1-214ENST00000617522 2220 ntTSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
SV2AQ7L0J3 MRGPRF-201ENST00000309099 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
SV2AQ7L0J3 LRIG1-201ENST00000273261 5273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
SV2AQ7L0J3 AC104581.1-201ENST00000324348 2852 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.22■□□□□ 0.99
SV2AQ7L0J3 IFI6-203ENST00000362020 828 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
SV2AQ7L0J3 IL15RA-208ENST00000397251 1046 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
SV2AQ7L0J3 YWHAZ-209ENST00000419477 891 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.22■□□□□ 0.99
SV2AQ7L0J3 AC096537.1-201ENST00000437416 684 ntTSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
SV2AQ7L0J3 CA3-AS1-201ENST00000517697 559 ntTSL 4 BASIC21.22■□□□□ 0.99
SV2AQ7L0J3 AC016065.1-203ENST00000523225 1017 ntTSL 3 BASIC21.22■□□□□ 0.99
SV2AQ7L0J3 CMTM3-207ENST00000564060 824 ntTSL 2 BASIC21.22■□□□□ 0.99
SV2AQ7L0J3 CMTM3-211ENST00000565922 615 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
SV2AQ7L0J3 FXYD1-204ENST00000588081 645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
SV2AQ7L0J3 IL15RA-221ENST00000620865 1037 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
SV2AQ7L0J3 ZNF346-209ENST00000512315 1575 ntTSL 2 BASIC21.22■□□□□ 0.99
SV2AQ7L0J3 DHRS7-201ENST00000216500 2322 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
SV2AQ7L0J3 SLC35B1-201ENST00000240333 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
SV2AQ7L0J3 PHLDA3-202ENST00000367311 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
SV2AQ7L0J3 NFIB-207ENST00000397579 3129 ntTSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
SV2AQ7L0J3 CTDSP2-204ENST00000548823 1368 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
SV2AQ7L0J3 GOLGA6L3-201ENST00000507199 1679 ntBASIC21.21■□□□□ 0.99
SV2AQ7L0J3 KRT18-202ENST00000388837 1420 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
SV2AQ7L0J3 CACNA1H-202ENST00000358590 8069 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
SV2AQ7L0J3 CELF6-202ENST00000395258 1741 ntTSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
SV2AQ7L0J3 EARS2-206ENST00000563232 1709 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
SV2AQ7L0J3 SOX2-201ENST00000325404 2513 ntAPPRIS P1 BASIC21.21■□□□□ 0.99
SV2AQ7L0J3 SARDH-201ENST00000298628 1484 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
SV2AQ7L0J3 AGER-207ENST00000375076 1492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
SV2AQ7L0J3 SPNS2-201ENST00000329078 3447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
SV2AQ7L0J3 FAM120A-201ENST00000277165 5118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
SV2AQ7L0J3 PNCK-201ENST00000340888 1508 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
SV2AQ7L0J3 CIRBP-215ENST00000588030 1509 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
SV2AQ7L0J3 AC068831.2-201ENST00000448987 367 ntTSL 2 BASIC21.21■□□□□ 0.99
SV2AQ7L0J3 FAM201B-201ENST00000458407 597 ntBASIC21.21■□□□□ 0.99
SV2AQ7L0J3 RTBDN-203ENST00000458671 1066 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
SV2AQ7L0J3 AL162258.1-201ENST00000497086 753 ntTSL 2 BASIC21.21■□□□□ 0.99
SV2AQ7L0J3 AC069185.1-201ENST00000531395 811 ntTSL 3 BASIC21.21■□□□□ 0.99
SV2AQ7L0J3 WWOX-202ENST00000402655 1594 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
SV2AQ7L0J3 DTWD1-202ENST00000403028 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
SV2AQ7L0J3 RBFOX1-215ENST00000553186 2196 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
SV2AQ7L0J3 ETFA-202ENST00000433983 1346 ntTSL 2 BASIC21.21■□□□□ 0.99
SV2AQ7L0J3 CENPH-206ENST00000515001 1305 ntTSL 2 BASIC21.21■□□□□ 0.99
SV2AQ7L0J3 TMPRSS6-207ENST00000442782 1695 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
SV2AQ7L0J3 CAMKV-205ENST00000467248 1688 ntTSL 2 BASIC21.21■□□□□ 0.99
SV2AQ7L0J3 CARD9-201ENST00000371732 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
SV2AQ7L0J3 LGI3-202ENST00000424267 3114 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
SV2AQ7L0J3 AC092835.1-201ENST00000425953 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
SV2AQ7L0J3 GNAI1-201ENST00000351004 3347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
SV2AQ7L0J3 ARMC9-201ENST00000349938 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
SV2AQ7L0J3 LGALS9C-212ENST00000583322 1602 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
SV2AQ7L0J3 PUSL1-201ENST00000379031 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
SV2AQ7L0J3 PRKY-204ENST00000533551 1019 ntBASIC21.2■□□□□ 0.98
SV2AQ7L0J3 RN7SL471P-201ENST00000580476 299 ntBASIC21.2■□□□□ 0.98
SV2AQ7L0J3 AC022211.2-202ENST00000582668 546 ntTSL 4 BASIC21.2■□□□□ 0.98
SV2AQ7L0J3 NRP2-206ENST00000417189 2386 ntTSL 2 BASIC21.2■□□□□ 0.98
SV2AQ7L0J3 TMC6-201ENST00000306591 1681 ntTSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
SV2AQ7L0J3 BX005266.2-202ENST00000446626 2245 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
SV2AQ7L0J3 CCNO-201ENST00000282572 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
SV2AQ7L0J3 GNB1-201ENST00000378609 3132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
SV2AQ7L0J3 Z83844.2-201ENST00000456099 1945 ntTSL 2 BASIC21.19■□□□□ 0.98
SV2AQ7L0J3 ZNF316-201ENST00000382252 5392 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
SV2AQ7L0J3 EML2-220ENST00000589876 2364 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
SV2AQ7L0J3 CRLF3-201ENST00000324238 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
SV2AQ7L0J3 HDAC1-201ENST00000373548 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
SV2AQ7L0J3 SLC11A2-208ENST00000546743 1740 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
SV2AQ7L0J3 RPS6KA2-201ENST00000265678 5824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
SV2AQ7L0J3 GDAP1L1-202ENST00000372952 722 ntTSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
SV2AQ7L0J3 INS-203ENST00000397262 639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
SV2AQ7L0J3 F2R-202ENST00000505600 442 ntTSL 2 BASIC21.19■□□□□ 0.98
SV2AQ7L0J3 UBTD2-201ENST00000393792 3301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
SV2AQ7L0J3 TRABD2A-201ENST00000335459 1844 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
SV2AQ7L0J3 DGKZ-203ENST00000421244 2862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
SV2AQ7L0J3 CEACAM3-202ENST00000357396 1316 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
SV2AQ7L0J3 MAP3K3-201ENST00000361357 4818 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
SV2AQ7L0J3 PSMD6-201ENST00000295901 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
SV2AQ7L0J3 CSNK1D-203ENST00000392334 2047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
SV2AQ7L0J3 ZBTB7B-201ENST00000292176 2129 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
SV2AQ7L0J3 ART5-203ENST00000397068 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
SV2AQ7L0J3 FAM216A-201ENST00000377673 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
SV2AQ7L0J3 SLC22A17-211ENST00000637426 1563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
SV2AQ7L0J3 LHX8-202ENST00000356261 1764 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
SV2AQ7L0J3 CA11-201ENST00000084798 1844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
SV2AQ7L0J3 BRSK2-201ENST00000308219 4089 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
SV2AQ7L0J3 TMEFF1-201ENST00000374879 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
SV2AQ7L0J3 ACBD4-204ENST00000431281 2026 ntTSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
SV2AQ7L0J3 COX7A2L-201ENST00000234301 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
SV2AQ7L0J3 PDZRN3-202ENST00000308537 1136 ntTSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.4 ms