Protein–RNA interactions for Protein: Q70CQ4

USP31, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 31, humanhuman

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Length 1,352 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USP31Q70CQ4 KLHDC4-201ENST00000270583 1886 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
USP31Q70CQ4 FAM228A-201ENST00000295150 1774 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
USP31Q70CQ4 EDARADD-201ENST00000334232 858 ntTSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
USP31Q70CQ4 MDK-201ENST00000359803 985 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC26.48■■□□□ 1.83
USP31Q70CQ4 FAM207BP-201ENST00000447172 505 ntBASIC26.48■■□□□ 1.83
USP31Q70CQ4 ZNF706-204ENST00000518336 501 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC26.48■■□□□ 1.83
USP31Q70CQ4 WWOX-216ENST00000569818 525 ntBASIC26.48■■□□□ 1.83
USP31Q70CQ4 NTF6B-201ENST00000591913 560 ntBASIC26.48■■□□□ 1.83
USP31Q70CQ4 ACBD4-203ENST00000398322 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
USP31Q70CQ4 RLBP1-201ENST00000268125 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
USP31Q70CQ4 XBP1-203ENST00000403532 1824 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC26.48■■□□□ 1.83
USP31Q70CQ4 POU2F2-215ENST00000560398 1788 ntTSL 5 BASIC26.48■■□□□ 1.83
USP31Q70CQ4 EPHX1-201ENST00000272167 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
USP31Q70CQ4 EIF5A-204ENST00000416016 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
USP31Q70CQ4 PRICKLE4-202ENST00000394260 1035 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.47■■□□□ 1.83
USP31Q70CQ4 PRICKLE4-203ENST00000394263 1155 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.47■■□□□ 1.83
USP31Q70CQ4 AP002807.1-202ENST00000526897 791 ntTSL 2 BASIC26.47■■□□□ 1.83
USP31Q70CQ4 PSMD9-208ENST00000542602 516 ntTSL 3 BASIC26.47■■□□□ 1.83
USP31Q70CQ4 AL929554.1-201ENST00000568665 460 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.47■■□□□ 1.83
USP31Q70CQ4 TMED4-203ENST00000457408 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
USP31Q70CQ4 BCAP29-202ENST00000379117 1946 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.47■■□□□ 1.83
USP31Q70CQ4 KRT87P-201ENST00000529785 1700 ntTSL 2 BASIC26.47■■□□□ 1.83
USP31Q70CQ4 PRKAR1B-211ENST00000537384 2533 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.47■■□□□ 1.83
USP31Q70CQ4 AP001271.2-201ENST00000624018 1556 ntBASIC26.47■■□□□ 1.83
USP31Q70CQ4 DPF1-206ENST00000420980 2227 ntTSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
USP31Q70CQ4 BID-215ENST00000622694 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
USP31Q70CQ4 TRIM73-205ENST00000450434 1425 ntTSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
USP31Q70CQ4 TAF6L-201ENST00000294168 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
USP31Q70CQ4 CAMK2B-216ENST00000440254 2097 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
USP31Q70CQ4 BOLA3-202ENST00000327428 639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
USP31Q70CQ4 UBL5-201ENST00000358666 513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
USP31Q70CQ4 PSEN1-203ENST00000394157 1249 ntTSL 2 BASIC26.46■■□□□ 1.83
USP31Q70CQ4 HOXA9-202ENST00000396345 797 ntTSL 2 BASIC26.46■■□□□ 1.83
USP31Q70CQ4 HMGA1P5-201ENST00000412453 271 ntBASIC26.46■■□□□ 1.83
USP31Q70CQ4 ZNF667-AS1-208ENST00000594783 475 ntTSL 3 BASIC26.46■■□□□ 1.83
USP31Q70CQ4 OAZ1-211ENST00000602676 1148 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC26.46■■□□□ 1.83
USP31Q70CQ4 BDKRB1-204ENST00000611804 1085 ntAPPRIS P1 BASIC26.46■■□□□ 1.83
USP31Q70CQ4 AL138966.2-201ENST00000621997 464 ntBASIC26.46■■□□□ 1.83
USP31Q70CQ4 SLC25A42-201ENST00000318596 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
USP31Q70CQ4 GSX2-201ENST00000326902 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
USP31Q70CQ4 IL11RA-201ENST00000318041 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
USP31Q70CQ4 SLC36A1-209ENST00000521925 1621 ntTSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
USP31Q70CQ4 C1QL4-201ENST00000334221 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
USP31Q70CQ4 GYG1-202ENST00000345003 2052 ntTSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
USP31Q70CQ4 GPR35-202ENST00000403859 2032 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC26.46■■□□□ 1.83
USP31Q70CQ4 KIAA1456-201ENST00000400069 1982 ntTSL 2 BASIC26.46■■□□□ 1.83
USP31Q70CQ4 B4GALNT1-208ENST00000550764 1967 ntTSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
USP31Q70CQ4 ARL2-SNX15-201ENST00000301886 2392 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.46■■□□□ 1.83
USP31Q70CQ4 CYP2D6-201ENST00000359033 1433 ntTSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
USP31Q70CQ4 EPHX4-201ENST00000370383 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
USP31Q70CQ4 INTS11-202ENST00000411962 1832 ntTSL 5 BASIC26.46■■□□□ 1.83
USP31Q70CQ4 PDS5A-202ENST00000503396 2685 ntTSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
USP31Q70CQ4 KCNQ1-202ENST00000335475 2159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
USP31Q70CQ4 PEX11G-201ENST00000221480 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
USP31Q70CQ4 PAX3-201ENST00000258387 958 ntTSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
USP31Q70CQ4 GNA15-201ENST00000262958 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
USP31Q70CQ4 IZUMO2-201ENST00000293405 728 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
USP31Q70CQ4 AC003982.1-201ENST00000477404 484 ntTSL 2 BASIC26.46■■□□□ 1.83
USP31Q70CQ4 AC010422.3-201ENST00000597692 838 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.46■■□□□ 1.83
USP31Q70CQ4 FP565260.3-205ENST00000620481 816 ntTSL 5 BASIC26.46■■□□□ 1.83
USP31Q70CQ4 FUZ-201ENST00000313777 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.83
USP31Q70CQ4 SPON2-201ENST00000290902 1869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
USP31Q70CQ4 KCNAB3-201ENST00000303790 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
USP31Q70CQ4 HLX-201ENST00000366903 2280 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
USP31Q70CQ4 SLC25A1P2-201ENST00000430693 912 ntBASIC26.45■■□□□ 1.82
USP31Q70CQ4 AL359399.1-201ENST00000557610 462 ntTSL 3 BASIC26.45■■□□□ 1.82
USP31Q70CQ4 AC018521.5-202ENST00000577279 374 ntTSL 3 BASIC26.45■■□□□ 1.82
USP31Q70CQ4 AC018521.5-201ENST00000582787 496 ntTSL 2 BASIC26.45■■□□□ 1.82
USP31Q70CQ4 AC008763.3-201ENST00000597959 777 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC26.45■■□□□ 1.82
USP31Q70CQ4 IMPDH1-208ENST00000470772 1888 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.45■■□□□ 1.82
USP31Q70CQ4 TMEM64-201ENST00000418210 4663 ntTSL 2 BASIC26.45■■□□□ 1.82
USP31Q70CQ4 ZNF668-209ENST00000539836 2469 ntTSL 5 BASIC26.44■■□□□ 1.82
USP31Q70CQ4 INTS11-209ENST00000450926 1839 ntTSL 5 BASIC26.44■■□□□ 1.82
USP31Q70CQ4 FBXO17-201ENST00000292852 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
USP31Q70CQ4 MINOS1-NBL1-204ENST00000602662 1623 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.44■■□□□ 1.82
USP31Q70CQ4 EEF1D-204ENST00000423316 2378 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC26.44■■□□□ 1.82
USP31Q70CQ4 RASGRP2-205ENST00000377489 583 ntTSL 3 BASIC26.44■■□□□ 1.82
USP31Q70CQ4 MIEN1-201ENST00000394231 1006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
USP31Q70CQ4 BX890604.1-205ENST00000425492 856 ntTSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
USP31Q70CQ4 C7orf25-201ENST00000350427 2451 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.44■■□□□ 1.82
USP31Q70CQ4 ARHGDIA-201ENST00000269321 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
USP31Q70CQ4 AC092338.2-201ENST00000568827 1415 ntBASIC26.43■■□□□ 1.82
USP31Q70CQ4 PPP1R12C-201ENST00000263433 2924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
USP31Q70CQ4 ST7-OT4-201ENST00000397750 1576 ntTSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
USP31Q70CQ4 CLDN14-202ENST00000399135 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
USP31Q70CQ4 RTBDN-201ENST00000322912 1328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
USP31Q70CQ4 SMN1-209ENST00000514951 1308 ntTSL 2 BASIC26.43■■□□□ 1.82
USP31Q70CQ4 ARNTL2-204ENST00000395901 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
USP31Q70CQ4 DACT1-201ENST00000335867 2571 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
USP31Q70CQ4 HIST1H2APS4-201ENST00000362070 348 ntBASIC26.43■■□□□ 1.82
USP31Q70CQ4 GUK1-204ENST00000366721 689 ntTSL 3 BASIC26.43■■□□□ 1.82
USP31Q70CQ4 AL023803.3-201ENST00000615559 522 ntBASIC26.43■■□□□ 1.82
USP31Q70CQ4 AC010653.2-201ENST00000623505 997 ntBASIC26.43■■□□□ 1.82
USP31Q70CQ4 MYC-208ENST00000641036 567 ntBASIC26.43■■□□□ 1.82
USP31Q70CQ4 BCS1L-201ENST00000359273 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
USP31Q70CQ4 ACTR3B-203ENST00000397282 1692 ntTSL 2 BASIC26.43■■□□□ 1.82
USP31Q70CQ4 FAM83D-201ENST00000619304 2475 ntTSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
USP31Q70CQ4 KCNIP4-206ENST00000447367 1641 ntTSL 5 BASIC26.42■■□□□ 1.82
USP31Q70CQ4 ME3-202ENST00000393324 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
USP31Q70CQ4 UBE2Q1-201ENST00000292211 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
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