Protein–RNA interactions for Protein: Q6X4T0

C12orf54, Uncharacterized protein C12orf54, humanhuman

Predictions only

Length 127 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C12orf54Q6X4T0 LHFPL3-202ENST00000424859 1852 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
C12orf54Q6X4T0 BOLA3-202ENST00000327428 639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
C12orf54Q6X4T0 SULT1A1-202ENST00000350842 1282 ntTSL 3 BASIC15.85■□□□□ 0.13
C12orf54Q6X4T0 ABHD14B-208ENST00000525795 980 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.85■□□□□ 0.13
C12orf54Q6X4T0 ARHGDIA-207ENST00000580685 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
C12orf54Q6X4T0 FXYD1-204ENST00000588081 645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
C12orf54Q6X4T0 AL121894.2-201ENST00000602977 491 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
C12orf54Q6X4T0 AC010947.1-201ENST00000623454 693 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
C12orf54Q6X4T0 PTENP1-AS-201ENST00000627688 873 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
C12orf54Q6X4T0 PRMT8-202ENST00000382622 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
C12orf54Q6X4T0 NPTX1-201ENST00000306773 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
C12orf54Q6X4T0 APIP-201ENST00000395787 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
C12orf54Q6X4T0 BAG5-201ENST00000299204 4848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
C12orf54Q6X4T0 PAQR6-202ENST00000335852 2117 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
C12orf54Q6X4T0 FBXO27-202ENST00000509137 2130 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
C12orf54Q6X4T0 FAM99A-201ENST00000382167 1432 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
C12orf54Q6X4T0 EML3-217ENST00000531557 2509 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
C12orf54Q6X4T0 BTBD11-201ENST00000280758 5767 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
C12orf54Q6X4T0 EGLN2-202ENST00000406058 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
C12orf54Q6X4T0 CD55-205ENST00000367067 1843 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
C12orf54Q6X4T0 CCDC7-201ENST00000277657 1899 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
C12orf54Q6X4T0 AC069431.1-201ENST00000488882 1877 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
C12orf54Q6X4T0 PHACTR2-203ENST00000367584 2490 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
C12orf54Q6X4T0 GUCA1B-201ENST00000230361 1113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
C12orf54Q6X4T0 TRMT2A-201ENST00000252136 2964 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
C12orf54Q6X4T0 DAPK3-201ENST00000301264 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
C12orf54Q6X4T0 COX5A-201ENST00000322347 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
C12orf54Q6X4T0 ID1-202ENST00000376112 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
C12orf54Q6X4T0 GPSM1-203ENST00000392944 1111 ntTSL 3 BASIC15.84■□□□□ 0.13
C12orf54Q6X4T0 KRT18P56-201ENST00000507275 550 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
C12orf54Q6X4T0 LY6E-214ENST00000522971 857 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
C12orf54Q6X4T0 AC069185.1-201ENST00000531395 811 ntTSL 3 BASIC15.84■□□□□ 0.13
C12orf54Q6X4T0 KRT126P-201ENST00000549467 1181 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
C12orf54Q6X4T0 PSMD8-202ENST00000585598 541 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
C12orf54Q6X4T0 AL356652.1-201ENST00000615962 565 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
C12orf54Q6X4T0 RPS27A-211ENST00000639844 606 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
C12orf54Q6X4T0 AC087742.1-201ENST00000575880 1738 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
C12orf54Q6X4T0 PTPRE-201ENST00000254667 5331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
C12orf54Q6X4T0 TXNRD2-203ENST00000400519 3155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
C12orf54Q6X4T0 CIZ1-206ENST00000372954 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
C12orf54Q6X4T0 HSD11B1L-204ENST00000411793 1362 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
C12orf54Q6X4T0 MRGPRE-201ENST00000389832 1409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
C12orf54Q6X4T0 TSSC4-207ENST00000451491 1423 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
C12orf54Q6X4T0 RNF149-201ENST00000295317 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
C12orf54Q6X4T0 MATR3-206ENST00000503811 2518 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
C12orf54Q6X4T0 DOC2A-201ENST00000350119 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
C12orf54Q6X4T0 STX5-203ENST00000394690 1568 ntTSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.13
C12orf54Q6X4T0 BCAT2-207ENST00000597011 1579 ntTSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.13
C12orf54Q6X4T0 SNX11-203ENST00000452859 1601 ntTSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.13
C12orf54Q6X4T0 SNX21-212ENST00000491381 1607 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
C12orf54Q6X4T0 UBE2I-205ENST00000402301 1708 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
C12orf54Q6X4T0 C7orf49-213ENST00000617987 1727 ntTSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.13
C12orf54Q6X4T0 CPEB1-218ENST00000620182 2422 ntTSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
C12orf54Q6X4T0 RFT1-202ENST00000394738 1800 ntTSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
C12orf54Q6X4T0 TSPO2-202ENST00000373161 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
C12orf54Q6X4T0 HES2-203ENST00000377837 1222 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
C12orf54Q6X4T0 TSPY8-202ENST00000383000 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
C12orf54Q6X4T0 TSPY2-202ENST00000383042 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
C12orf54Q6X4T0 TSPY1-201ENST00000423647 1171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
C12orf54Q6X4T0 TSPY3-201ENST00000424594 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
C12orf54Q6X4T0 HAGLROS-201ENST00000426615 1121 ntTSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
C12orf54Q6X4T0 TSPY10-202ENST00000444056 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
C12orf54Q6X4T0 IMMP2L-207ENST00000452895 833 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
C12orf54Q6X4T0 TSPO2-203ENST00000470917 699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
C12orf54Q6X4T0 SURF4-206ENST00000485435 1206 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
C12orf54Q6X4T0 AC068987.1-201ENST00000562996 427 ntTSL 3 BASIC15.83■□□□□ 0.12
C12orf54Q6X4T0 TGIF1-222ENST00000577543 729 ntTSL 3 BASIC15.83■□□□□ 0.12
C12orf54Q6X4T0 METRNL-203ENST00000571814 1900 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
C12orf54Q6X4T0 ZNF48-201ENST00000320159 3234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
C12orf54Q6X4T0 KLHL36-201ENST00000258157 1974 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
C12orf54Q6X4T0 NDUFB9-206ENST00000522532 1319 ntTSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
C12orf54Q6X4T0 P2RX3-204ENST00000616487 1346 ntTSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
C12orf54Q6X4T0 AL034417.2-201ENST00000445300 2044 ntTSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
C12orf54Q6X4T0 NYAP1-202ENST00000454988 2777 ntTSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
C12orf54Q6X4T0 GNS-208ENST00000543646 2164 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
C12orf54Q6X4T0 FPGS-204ENST00000393706 2230 ntTSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
C12orf54Q6X4T0 DISC1-213ENST00000537876 2349 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
C12orf54Q6X4T0 ECE2-203ENST00000359140 3147 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
C12orf54Q6X4T0 DTWD1-202ENST00000403028 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
C12orf54Q6X4T0 DACT1-204ENST00000541264 2610 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
C12orf54Q6X4T0 NARF-205ENST00000412079 1760 ntTSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
C12orf54Q6X4T0 RETREG2-203ENST00000430297 4618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
C12orf54Q6X4T0 CREB1-205ENST00000430624 2005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
C12orf54Q6X4T0 IER2-201ENST00000292433 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
C12orf54Q6X4T0 MEN1-202ENST00000315422 3148 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
C12orf54Q6X4T0 WWC3-201ENST00000380861 6647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
C12orf54Q6X4T0 MAP4K4-210ENST00000425019 4403 ntTSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
C12orf54Q6X4T0 GJC2-201ENST00000366714 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
C12orf54Q6X4T0 ARHGAP35-201ENST00000404338 8889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
C12orf54Q6X4T0 DNAJC4-201ENST00000321460 1015 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
C12orf54Q6X4T0 TMEM88B-201ENST00000378821 492 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
C12orf54Q6X4T0 YBEY-205ENST00000397694 534 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
C12orf54Q6X4T0 AL731557.1-201ENST00000425264 744 ntTSL 3 BASIC15.82■□□□□ 0.12
C12orf54Q6X4T0 FAM53C-211ENST00000513056 923 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
C12orf54Q6X4T0 NDUFS3-213ENST00000534716 1263 ntTSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
C12orf54Q6X4T0 MCRIP1-203ENST00000538396 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
C12orf54Q6X4T0 CR392000.1-201ENST00000624770 1228 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
C12orf54Q6X4T0 AL358472.4-201ENST00000633140 710 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
C12orf54Q6X4T0 FNBP1-203ENST00000443566 5227 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
C12orf54Q6X4T0 COMMD7-202ENST00000446419 1343 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.1 ms