Protein–RNA interactions for Protein: Q6UXN2

TREML4, Trem-like transcript 4 protein, humanhuman

Predictions only

Length 200 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TREML4Q6UXN2 SRCIN1-213ENST00000617146 7058 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
TREML4Q6UXN2 KRT16P2-201ENST00000414673 1423 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
TREML4Q6UXN2 KRT1-201ENST00000252244 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
TREML4Q6UXN2 COQ10A-201ENST00000308197 1652 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
TREML4Q6UXN2 ITPKB-203ENST00000429204 6162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
TREML4Q6UXN2 PCDHB11-202ENST00000624887 1973 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
TREML4Q6UXN2 CLIP3-206ENST00000593074 2080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
TREML4Q6UXN2 CDC42EP1-201ENST00000249014 2181 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
TREML4Q6UXN2 NFE2L1-204ENST00000536222 2172 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
TREML4Q6UXN2 DDX59-201ENST00000331314 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
TREML4Q6UXN2 FOXC2-201ENST00000320354 2478 ntAPPRIS P1 BASIC16.07■□□□□ 0.16
TREML4Q6UXN2 GIT1-201ENST00000225394 3768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
TREML4Q6UXN2 UNC50-201ENST00000357765 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
TREML4Q6UXN2 HYAL3-203ENST00000415204 959 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
TREML4Q6UXN2 HAGHL-213ENST00000564545 663 ntTSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
TREML4Q6UXN2 ANAPC11-212ENST00000577425 603 ntTSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
TREML4Q6UXN2 SLC38A8-201ENST00000299709 1308 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
TREML4Q6UXN2 MMP23B-201ENST00000356026 1326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
TREML4Q6UXN2 IGFBP1-203ENST00000468955 1369 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
TREML4Q6UXN2 AC010173.1-201ENST00000549023 1453 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
TREML4Q6UXN2 KRT17P1-201ENST00000399211 1546 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
TREML4Q6UXN2 SCARB1-211ENST00000546215 1597 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
TREML4Q6UXN2 MAP2K5-203ENST00000354498 1783 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
TREML4Q6UXN2 NAE1-201ENST00000290810 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
TREML4Q6UXN2 NSDHL-201ENST00000370274 1929 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
TREML4Q6UXN2 KLF2-201ENST00000248071 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
TREML4Q6UXN2 DALRD3-205ENST00000440857 2014 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
TREML4Q6UXN2 DNAJC1-202ENST00000376980 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
TREML4Q6UXN2 AURKA-202ENST00000347343 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
TREML4Q6UXN2 IMPDH1-214ENST00000496200 2283 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
TREML4Q6UXN2 KMT5C-201ENST00000255613 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
TREML4Q6UXN2 FBXO27-201ENST00000292853 2330 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
TREML4Q6UXN2 S1PR5-201ENST00000333430 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
TREML4Q6UXN2 SCARB1-201ENST00000261693 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
TREML4Q6UXN2 AGAP5-203ENST00000581191 2779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
TREML4Q6UXN2 ZFP69-202ENST00000372706 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
TREML4Q6UXN2 BACE2-202ENST00000330333 2993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
TREML4Q6UXN2 RETREG2-203ENST00000430297 4618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
TREML4Q6UXN2 RAI14-201ENST00000265109 5092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
TREML4Q6UXN2 HIC1-201ENST00000322941 3053 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
TREML4Q6UXN2 MTMR14-201ENST00000296003 2494 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
TREML4Q6UXN2 MFSD1-219ENST00000622669 2361 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
TREML4Q6UXN2 RNF212-202ENST00000382968 2335 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
TREML4Q6UXN2 SNAP91-211ENST00000520213 2168 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
TREML4Q6UXN2 LINC00482-201ENST00000332012 2023 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
TREML4Q6UXN2 BAG4-202ENST00000432471 1943 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
TREML4Q6UXN2 RNF8-204ENST00000469731 1800 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
TREML4Q6UXN2 CLN8-208ENST00000635751 1807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
TREML4Q6UXN2 VCPKMT-202ENST00000395860 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
TREML4Q6UXN2 NIPAL4-202ENST00000435489 1600 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
TREML4Q6UXN2 AC132008.2-203ENST00000418868 1552 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
TREML4Q6UXN2 LINC00605-201ENST00000514902 1558 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
TREML4Q6UXN2 AC092368.3-202ENST00000574180 1591 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
TREML4Q6UXN2 SHISA4-201ENST00000362011 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
TREML4Q6UXN2 FTCDNL1-202ENST00000420128 1021 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
TREML4Q6UXN2 AL133410.2-201ENST00000425499 696 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
TREML4Q6UXN2 WDR86-AS1-203ENST00000480632 704 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
TREML4Q6UXN2 AC009052.1-201ENST00000567090 298 ntTSL 3 BASIC16.06■□□□□ 0.16
TREML4Q6UXN2 AC020913.2-201ENST00000601929 629 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
TREML4Q6UXN2 AL445228.2-201ENST00000605589 952 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
TREML4Q6UXN2 AC243732.1-201ENST00000612648 864 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
TREML4Q6UXN2 SOX11-201ENST00000322002 8719 ntAPPRIS P1 BASIC16.06■□□□□ 0.16
TREML4Q6UXN2 ACTR5-201ENST00000243903 2565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
TREML4Q6UXN2 DMRT2-201ENST00000259622 2459 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
TREML4Q6UXN2 UBXN11-201ENST00000314675 2254 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
TREML4Q6UXN2 CRTC1-204ENST00000601916 1834 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
TREML4Q6UXN2 ADGRA2-201ENST00000315215 6270 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
TREML4Q6UXN2 C5orf47-201ENST00000340147 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
TREML4Q6UXN2 ETV7-203ENST00000373737 1488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
TREML4Q6UXN2 MARK1-203ENST00000402574 5273 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
TREML4Q6UXN2 AC098818.2-201ENST00000564925 2320 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
TREML4Q6UXN2 BPTF-201ENST00000306378 9688 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
TREML4Q6UXN2 TAF5L-201ENST00000258281 3112 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
TREML4Q6UXN2 MEN1-202ENST00000315422 3148 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
TREML4Q6UXN2 MAN2C1-244ENST00000618257 1346 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
TREML4Q6UXN2 TINAGL1-201ENST00000271064 2187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
TREML4Q6UXN2 GGTLC1-203ENST00000335694 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
TREML4Q6UXN2 CNIH4-203ENST00000366858 702 ntTSL 3 BASIC16.05■□□□□ 0.16
TREML4Q6UXN2 ZPBP-203ENST00000419417 1095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
TREML4Q6UXN2 AL355472.2-201ENST00000422958 438 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
TREML4Q6UXN2 TSPY7P-201ENST00000431358 1114 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
TREML4Q6UXN2 TSPY1-202ENST00000451548 1160 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
TREML4Q6UXN2 SPINK2-202ENST00000504762 659 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
TREML4Q6UXN2 RRAS2-203ENST00000526063 970 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
TREML4Q6UXN2 RRAS2-208ENST00000532814 982 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
TREML4Q6UXN2 FAM181A-203ENST00000556222 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
TREML4Q6UXN2 AC233702.5-201ENST00000584107 538 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
TREML4Q6UXN2 MAP3K14-AS1-202ENST00000585351 893 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
TREML4Q6UXN2 AC008750.8-201ENST00000600067 551 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
TREML4Q6UXN2 CLDND2-203ENST00000601435 575 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.05■□□□□ 0.16
TREML4Q6UXN2 AC069544.1-201ENST00000609399 999 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
TREML4Q6UXN2 MIR2861-201ENST00000636310 90 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
TREML4Q6UXN2 RHOBTB2-201ENST00000251822 5451 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
TREML4Q6UXN2 FAM76B-204ENST00000536839 2546 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
TREML4Q6UXN2 FBXL17-205ENST00000542267 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
TREML4Q6UXN2 IL17RC-202ENST00000383812 2384 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
TREML4Q6UXN2 IL17RC-203ENST00000403601 2388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
TREML4Q6UXN2 MKRN1-208ENST00000474576 1661 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
TREML4Q6UXN2 EPN3-216ENST00000537145 2223 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
TREML4Q6UXN2 BEST2-201ENST00000042931 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.2 ms