Protein–RNA interactions for Protein: Q6UX01

LMBR1L, Protein LMBR1L, humanhuman

Predictions only

Length 489 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LMBR1LQ6UX01 STK16-201ENST00000396738 1673 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.43■■□□□ 1.5
LMBR1LQ6UX01 TAF7-201ENST00000313368 2334 ntAPPRIS P1 BASIC24.43■■□□□ 1.5
LMBR1LQ6UX01 CPLX3-201ENST00000395018 2082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
LMBR1LQ6UX01 REV1-201ENST00000258428 4751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
LMBR1LQ6UX01 B4GALT1-202ENST00000535206 1535 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
LMBR1LQ6UX01 TRIM3-202ENST00000359518 3042 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
LMBR1LQ6UX01 ECEL1P3-201ENST00000427961 737 ntBASIC24.42■■□□□ 1.5
LMBR1LQ6UX01 DNAJC27-AS1-204ENST00000428614 780 ntTSL 3 BASIC24.42■■□□□ 1.5
LMBR1LQ6UX01 SMAD7-207ENST00000589634 1278 ntAPPRIS ALT1 TSL 4 BASIC24.42■■□□□ 1.5
LMBR1LQ6UX01 AC011445.1-201ENST00000601911 877 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
LMBR1LQ6UX01 AC016737.2-201ENST00000609273 358 ntTSL 3 BASIC24.42■■□□□ 1.5
LMBR1LQ6UX01 AL590094.1-202ENST00000634619 1131 ntTSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
LMBR1LQ6UX01 PDCD2-204ENST00000453163 2657 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
LMBR1LQ6UX01 GUCY1A3-210ENST00000513574 2656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
LMBR1LQ6UX01 SAE1-201ENST00000270225 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
LMBR1LQ6UX01 CEBPA-201ENST00000498907 2631 ntAPPRIS P1 BASIC24.42■■□□□ 1.5
LMBR1LQ6UX01 LGR4-201ENST00000379214 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
LMBR1LQ6UX01 PLD6-201ENST00000321560 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
LMBR1LQ6UX01 ARFRP1-210ENST00000614942 2554 ntTSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
LMBR1LQ6UX01 CYP21A1P-201ENST00000342991 1971 ntTSL 3 BASIC24.42■■□□□ 1.5
LMBR1LQ6UX01 MATN4-204ENST00000372756 2077 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
LMBR1LQ6UX01 MAN1B1-AS1-201ENST00000596585 1872 ntBASIC24.41■■□□□ 1.5
LMBR1LQ6UX01 SPHK1-203ENST00000545180 2238 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.41■■□□□ 1.5
LMBR1LQ6UX01 PLCD1-201ENST00000334661 2769 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
LMBR1LQ6UX01 METTL21A-201ENST00000272839 1210 ntTSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
LMBR1LQ6UX01 HCRT-201ENST00000293330 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
LMBR1LQ6UX01 PACRGL-207ENST00000502938 810 ntTSL 4 BASIC24.41■■□□□ 1.5
LMBR1LQ6UX01 AC093752.1-201ENST00000511950 605 ntTSL 4 BASIC24.41■■□□□ 1.5
LMBR1LQ6UX01 AC117500.4-201ENST00000542797 617 ntTSL 3 BASIC24.41■■□□□ 1.5
LMBR1LQ6UX01 DECR2-212ENST00000627716 352 ntTSL 2 BASIC24.41■■□□□ 1.5
LMBR1LQ6UX01 CROCCP4-202ENST00000633627 573 ntTSL 3 BASIC24.41■■□□□ 1.5
LMBR1LQ6UX01 PHOSPHO1-202ENST00000413580 2173 ntTSL 2 BASIC24.41■■□□□ 1.5
LMBR1LQ6UX01 ADGRA3-204ENST00000502482 2870 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
LMBR1LQ6UX01 DISC1-213ENST00000537876 2349 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.41■■□□□ 1.5
LMBR1LQ6UX01 PNMA2-204ENST00000522362 4965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
LMBR1LQ6UX01 CLDN14-202ENST00000399135 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
LMBR1LQ6UX01 BCKDK-202ENST00000287507 1907 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
LMBR1LQ6UX01 EMC8-202ENST00000435200 1935 ntTSL 2 BASIC24.41■■□□□ 1.5
LMBR1LQ6UX01 CERKL-205ENST00000409440 2425 ntTSL 2 BASIC24.41■■□□□ 1.5
LMBR1LQ6UX01 GTF3A-201ENST00000381140 1383 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
LMBR1LQ6UX01 PHLPP1-201ENST00000262719 6390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
LMBR1LQ6UX01 CENPH-206ENST00000515001 1305 ntTSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
LMBR1LQ6UX01 BRICD5-201ENST00000328540 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
LMBR1LQ6UX01 DAB1-202ENST00000371230 1150 ntTSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
LMBR1LQ6UX01 AC087499.1-201ENST00000418141 1075 ntBASIC24.4■■□□□ 1.5
LMBR1LQ6UX01 ADCYAP1-202ENST00000450565 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
LMBR1LQ6UX01 KRT8P12-201ENST00000468527 998 ntTSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
LMBR1LQ6UX01 CHCHD10-202ENST00000484558 1171 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
LMBR1LQ6UX01 AL445675.2-201ENST00000620291 557 ntBASIC24.4■■□□□ 1.5
LMBR1LQ6UX01 ABBA01031674.1-201ENST00000635145 728 ntBASIC24.4■■□□□ 1.5
LMBR1LQ6UX01 FAM3C-201ENST00000359943 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
LMBR1LQ6UX01 HDHD5-201ENST00000155674 1735 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
LMBR1LQ6UX01 SSH3-202ENST00000308298 2046 ntTSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
LMBR1LQ6UX01 KIRREL2-202ENST00000347900 2015 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
LMBR1LQ6UX01 USP39-204ENST00000409766 2033 ntTSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
LMBR1LQ6UX01 PILRB-207ENST00000448382 2314 ntTSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
LMBR1LQ6UX01 SNAPC2-201ENST00000221573 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
LMBR1LQ6UX01 MICU2-201ENST00000382374 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
LMBR1LQ6UX01 SUMO3-204ENST00000411651 1921 ntTSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.5
LMBR1LQ6UX01 ASPG-201ENST00000546892 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
LMBR1LQ6UX01 KRT16-201ENST00000301653 1644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
LMBR1LQ6UX01 CLK3-202ENST00000395066 2621 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
LMBR1LQ6UX01 OGG1-202ENST00000302008 2191 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.5
LMBR1LQ6UX01 VSX1-202ENST00000376709 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
LMBR1LQ6UX01 PPP1R14BP5-201ENST00000440334 435 ntBASIC24.39■■□□□ 1.49
LMBR1LQ6UX01 RBM17P1-201ENST00000453646 1190 ntBASIC24.39■■□□□ 1.49
LMBR1LQ6UX01 AC116562.2-201ENST00000507042 360 ntBASIC24.39■■□□□ 1.49
LMBR1LQ6UX01 AC103855.2-201ENST00000533315 573 ntTSL 4 BASIC24.39■■□□□ 1.49
LMBR1LQ6UX01 YPEL3-207ENST00000566134 761 ntTSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.49
LMBR1LQ6UX01 CDKN2A-213ENST00000579122 666 ntTSL 3 BASIC24.39■■□□□ 1.49
LMBR1LQ6UX01 C17orf62-230ENST00000583617 866 ntTSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.49
LMBR1LQ6UX01 PHOSPHO2-206ENST00000616481 1252 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.39■■□□□ 1.49
LMBR1LQ6UX01 PHOSPHO2-208ENST00000617738 1053 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.49
LMBR1LQ6UX01 MAPK15-201ENST00000338033 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
LMBR1LQ6UX01 AC243965.2-201ENST00000612576 2671 ntTSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.49
LMBR1LQ6UX01 MAP2K2-202ENST00000394867 1471 ntTSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
LMBR1LQ6UX01 AC079598.2-202ENST00000546624 1451 ntBASIC24.38■■□□□ 1.49
LMBR1LQ6UX01 FDXR-201ENST00000293195 1875 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
LMBR1LQ6UX01 PTPN11-202ENST00000392597 1876 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
LMBR1LQ6UX01 TRPV6-209ENST00000638686 2298 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
LMBR1LQ6UX01 SMURF1-201ENST00000361125 5737 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
LMBR1LQ6UX01 AC011511.1-201ENST00000452032 1956 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
LMBR1LQ6UX01 FGF16-201ENST00000439435 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
LMBR1LQ6UX01 GLIPR2-203ENST00000396613 1917 ntTSL 4 BASIC24.38■■□□□ 1.49
LMBR1LQ6UX01 GTF2IRD2B-210ENST00000629105 1910 ntTSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
LMBR1LQ6UX01 VKORC1-202ENST00000319788 1077 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
LMBR1LQ6UX01 FAU-207ENST00000529639 847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
LMBR1LQ6UX01 ZNF561-AS1-202ENST00000586614 568 ntTSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
LMBR1LQ6UX01 UBXN11-201ENST00000314675 2254 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
LMBR1LQ6UX01 DBNL-210ENST00000448521 1808 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
LMBR1LQ6UX01 ZNF707-201ENST00000358656 2183 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
LMBR1LQ6UX01 DUSP15-209ENST00000486996 1651 ntTSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
LMBR1LQ6UX01 SRSF4-201ENST00000373795 2387 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
LMBR1LQ6UX01 NDOR1-201ENST00000344894 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
LMBR1LQ6UX01 KIAA0895L-206ENST00000563902 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
LMBR1LQ6UX01 KIAA1522-201ENST00000294521 878 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
LMBR1LQ6UX01 C7orf50-201ENST00000357429 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
LMBR1LQ6UX01 RABL2A-202ENST00000393165 1118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
LMBR1LQ6UX01 HPF1-201ENST00000393381 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
LMBR1LQ6UX01 RAMP1-204ENST00000409726 734 ntTSL 3 BASIC24.37■■□□□ 1.49
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.4 ms