Protein–RNA interactions for Protein: Q6Q0C1

SLC25A47, Solute carrier family 25 member 47, humanhuman

Predictions only

Length 308 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC25A47Q6Q0C1 FGFR1-214ENST00000447712 5900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
SLC25A47Q6Q0C1 HOXA6-201ENST00000222728 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
SLC25A47Q6Q0C1 EGFL7-202ENST00000371698 1282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
SLC25A47Q6Q0C1 MPV17L-202ENST00000396385 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
SLC25A47Q6Q0C1 ZNF295-AS1-201ENST00000412906 952 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
SLC25A47Q6Q0C1 APTR-205ENST00000447009 902 ntTSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
SLC25A47Q6Q0C1 UNC93B4-201ENST00000505679 747 ntBASIC17.35■□□□□ 0.37
SLC25A47Q6Q0C1 CFL1-211ENST00000531407 1062 ntTSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
SLC25A47Q6Q0C1 IGFBP6-203ENST00000548547 1177 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
SLC25A47Q6Q0C1 ANAPC11-223ENST00000612413 964 ntTSL 3 BASIC17.35■□□□□ 0.37
SLC25A47Q6Q0C1 AL121906.2-201ENST00000621597 723 ntBASIC17.35■□□□□ 0.37
SLC25A47Q6Q0C1 INSM1-201ENST00000310227 2829 ntAPPRIS P1 BASIC17.35■□□□□ 0.37
SLC25A47Q6Q0C1 TMEM53-205ENST00000372244 1472 ntTSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
SLC25A47Q6Q0C1 C11orf49-201ENST00000278460 1645 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
SLC25A47Q6Q0C1 TIMP4-201ENST00000287814 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
SLC25A47Q6Q0C1 KCNK4-201ENST00000394525 1673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
SLC25A47Q6Q0C1 AP3S1-201ENST00000316788 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
SLC25A47Q6Q0C1 MAGED2-203ENST00000375053 2066 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
SLC25A47Q6Q0C1 RAVER2-201ENST00000294428 4398 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
SLC25A47Q6Q0C1 TAF4-201ENST00000252996 4628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
SLC25A47Q6Q0C1 CKLF-201ENST00000264001 669 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
SLC25A47Q6Q0C1 SLC38A8-201ENST00000299709 1308 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
SLC25A47Q6Q0C1 SYNE2-201ENST00000341472 1132 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
SLC25A47Q6Q0C1 NDUFV3-202ENST00000354250 1575 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
SLC25A47Q6Q0C1 SLC34A3-201ENST00000361134 2124 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
SLC25A47Q6Q0C1 TMSB4X-203ENST00000380636 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
SLC25A47Q6Q0C1 TRMU-202ENST00000381019 1381 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
SLC25A47Q6Q0C1 MICU2-201ENST00000382374 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
SLC25A47Q6Q0C1 AC114730.1-201ENST00000400768 472 ntTSL 4 BASIC17.34■□□□□ 0.37
SLC25A47Q6Q0C1 AC233280.1-201ENST00000423600 1684 ntTSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
SLC25A47Q6Q0C1 CLINT1-207ENST00000523908 2346 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
SLC25A47Q6Q0C1 FAM76B-204ENST00000536839 2546 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
SLC25A47Q6Q0C1 GNB5-211ENST00000560116 918 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
SLC25A47Q6Q0C1 EML2-AS1-202ENST00000591087 838 ntTSL 3 BASIC17.34■□□□□ 0.37
SLC25A47Q6Q0C1 PFKFB3-219ENST00000640683 2311 ntTSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
SLC25A47Q6Q0C1 AC068987.5-201ENST00000642069 987 ntAPPRIS P1 BASIC17.34■□□□□ 0.37
SLC25A47Q6Q0C1 MAP4K4-210ENST00000425019 4403 ntTSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
SLC25A47Q6Q0C1 ZNF12-201ENST00000342651 2921 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
SLC25A47Q6Q0C1 DBN1-210ENST00000512501 1878 ntTSL 3 BASIC17.33■□□□□ 0.37
SLC25A47Q6Q0C1 DHRS3-204ENST00000616661 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
SLC25A47Q6Q0C1 GPR139-202ENST00000570682 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
SLC25A47Q6Q0C1 SETD7-202ENST00000404104 1590 ntTSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.37
SLC25A47Q6Q0C1 VSTM2B-201ENST00000335523 1488 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.37
SLC25A47Q6Q0C1 PTGER3-203ENST00000354608 1470 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.37
SLC25A47Q6Q0C1 CHAC1-205ENST00000617961 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
SLC25A47Q6Q0C1 THAP7-201ENST00000215742 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
SLC25A47Q6Q0C1 SLC47A1P1-201ENST00000420951 500 ntTSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
SLC25A47Q6Q0C1 HAGLROS-201ENST00000426615 1121 ntTSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.36
SLC25A47Q6Q0C1 UNC93B5-201ENST00000530315 699 ntBASIC17.33■□□□□ 0.36
SLC25A47Q6Q0C1 CIRBP-213ENST00000587323 1092 ntTSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
SLC25A47Q6Q0C1 AL121829.2-201ENST00000620908 328 ntBASIC17.33■□□□□ 0.36
SLC25A47Q6Q0C1 ISLR2-202ENST00000419208 2306 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
SLC25A47Q6Q0C1 CDC42EP1-201ENST00000249014 2181 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
SLC25A47Q6Q0C1 AC093484.2-201ENST00000580996 2166 ntBASIC17.33■□□□□ 0.36
SLC25A47Q6Q0C1 NRL-206ENST00000561028 2103 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.36
SLC25A47Q6Q0C1 HTR1E-201ENST00000305344 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
SLC25A47Q6Q0C1 KLC2-204ENST00000394067 2898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
SLC25A47Q6Q0C1 RBAK-202ENST00000396912 6551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
SLC25A47Q6Q0C1 FAM187A-202ENST00000412523 1748 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
SLC25A47Q6Q0C1 LPAR2-202ENST00000542587 2546 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
SLC25A47Q6Q0C1 OLFM1-205ENST00000371796 2492 ntTSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
SLC25A47Q6Q0C1 MAP3K15-201ENST00000338883 4012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
SLC25A47Q6Q0C1 MRPL2-202ENST00000388752 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
SLC25A47Q6Q0C1 HOXC4-201ENST00000303406 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
SLC25A47Q6Q0C1 TOM1L1-202ENST00000445275 2228 ntTSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
SLC25A47Q6Q0C1 TACO1-201ENST00000258975 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
SLC25A47Q6Q0C1 BCS1L-201ENST00000359273 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
SLC25A47Q6Q0C1 CCAR2-214ENST00000613179 1421 ntTSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
SLC25A47Q6Q0C1 GPR31-201ENST00000366834 2059 ntAPPRIS P1 BASIC17.32■□□□□ 0.36
SLC25A47Q6Q0C1 SNX8-201ENST00000222990 4727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
SLC25A47Q6Q0C1 CSNK1D-203ENST00000392334 2047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
SLC25A47Q6Q0C1 NLRP6-201ENST00000312165 2679 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
SLC25A47Q6Q0C1 PSKH2-201ENST00000276616 1322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
SLC25A47Q6Q0C1 TFEB-211ENST00000420312 1996 ntTSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
SLC25A47Q6Q0C1 ZDHHC20-204ENST00000415724 1296 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
SLC25A47Q6Q0C1 ZNF436-AS1-206ENST00000518821 461 ntTSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
SLC25A47Q6Q0C1 PNN-205ENST00000556530 601 ntTSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
SLC25A47Q6Q0C1 PSME3-210ENST00000590720 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
SLC25A47Q6Q0C1 LRRC4B-201ENST00000389201 2958 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
SLC25A47Q6Q0C1 PRKAG2-203ENST00000418337 2318 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
SLC25A47Q6Q0C1 FBXL12-205ENST00000586651 1736 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
SLC25A47Q6Q0C1 GPR35-201ENST00000319838 2249 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
SLC25A47Q6Q0C1 PVRIG-201ENST00000317271 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
SLC25A47Q6Q0C1 C19orf25-206ENST00000588849 1472 ntTSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
SLC25A47Q6Q0C1 NFS1-214ENST00000541387 1436 ntTSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
SLC25A47Q6Q0C1 ZNF821-221ENST00000611294 1833 ntTSL 3 BASIC17.31■□□□□ 0.36
SLC25A47Q6Q0C1 LGI3-202ENST00000424267 3114 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
SLC25A47Q6Q0C1 DYRK2-202ENST00000344096 8912 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
SLC25A47Q6Q0C1 TSPAN17-202ENST00000310032 2550 ntTSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
SLC25A47Q6Q0C1 GALNT8-202ENST00000433855 5977 ntTSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
SLC25A47Q6Q0C1 GGTLC1-203ENST00000335694 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
SLC25A47Q6Q0C1 TP73-202ENST00000354437 2140 ntTSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
SLC25A47Q6Q0C1 AKNA-205ENST00000374079 2138 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
SLC25A47Q6Q0C1 PDCD10-202ENST00000461494 934 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.31■□□□□ 0.36
SLC25A47Q6Q0C1 TSPAN14-209ENST00000481124 808 ntTSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
SLC25A47Q6Q0C1 AP001458.2-201ENST00000528405 577 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC17.31■□□□□ 0.36
SLC25A47Q6Q0C1 NCBP2-AS2-201ENST00000602845 918 ntAPPRIS P1 BASIC17.31■□□□□ 0.36
SLC25A47Q6Q0C1 YAP1-202ENST00000345877 5284 ntTSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
SLC25A47Q6Q0C1 IQCJ-SCHIP1-204ENST00000485419 2445 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
SLC25A47Q6Q0C1 SDHA-201ENST00000264932 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 47.4 ms