Protein–RNA interactions for Protein: Q6Q0C0

TRAF7, E3 ubiquitin-protein ligase TRAF7, humanhuman

Predictions only

Length 670 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRAF7Q6Q0C0 ATP5G1P1-201ENST00000448724 379 ntBASIC21.49■■□□□ 1.03
TRAF7Q6Q0C0 AC063952.2-201ENST00000498792 1227 ntBASIC21.49■■□□□ 1.03
TRAF7Q6Q0C0 AC012213.1-202ENST00000523422 449 ntTSL 3 BASIC21.49■■□□□ 1.03
TRAF7Q6Q0C0 PSMD9-208ENST00000542602 516 ntTSL 3 BASIC21.49■■□□□ 1.03
TRAF7Q6Q0C0 AL138966.2-201ENST00000621997 464 ntBASIC21.49■■□□□ 1.03
TRAF7Q6Q0C0 ADCK2-201ENST00000072869 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
TRAF7Q6Q0C0 LCK-214ENST00000619559 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
TRAF7Q6Q0C0 SYT15-205ENST00000503753 1331 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
TRAF7Q6Q0C0 AKR7A3-201ENST00000361640 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
TRAF7Q6Q0C0 GLT8D1-213ENST00000491606 1577 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
TRAF7Q6Q0C0 FAM72A-202ENST00000367128 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
TRAF7Q6Q0C0 FAM72D-201ENST00000400889 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
TRAF7Q6Q0C0 NXN-201ENST00000336868 3036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
TRAF7Q6Q0C0 TTLL7-214ENST00000610996 2028 ntTSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
TRAF7Q6Q0C0 CAMK4-210ENST00000512453 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
TRAF7Q6Q0C0 MRGPRF-203ENST00000441623 2282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
TRAF7Q6Q0C0 GPRIN2-201ENST00000374314 1696 ntAPPRIS P1 BASIC21.48■■□□□ 1.03
TRAF7Q6Q0C0 DXO-202ENST00000375349 1667 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
TRAF7Q6Q0C0 RHEBL1-201ENST00000301068 1210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
TRAF7Q6Q0C0 PRICKLE4-202ENST00000394260 1035 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
TRAF7Q6Q0C0 PRICKLE4-203ENST00000394263 1155 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
TRAF7Q6Q0C0 GPM6B-204ENST00000398361 1033 ntTSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
TRAF7Q6Q0C0 CDKN2AIPNL-202ENST00000458198 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
TRAF7Q6Q0C0 C1orf52-203ENST00000471115 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
TRAF7Q6Q0C0 AC128688.1-201ENST00000487626 519 ntBASIC21.48■■□□□ 1.03
TRAF7Q6Q0C0 AL929554.1-201ENST00000568665 460 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.48■■□□□ 1.03
TRAF7Q6Q0C0 KAZN-209ENST00000636564 1197 ntTSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
TRAF7Q6Q0C0 CTU2-210ENST00000567949 1905 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
TRAF7Q6Q0C0 KCNT1-201ENST00000263604 5245 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
TRAF7Q6Q0C0 FAM129C-211ENST00000600871 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
TRAF7Q6Q0C0 WDR4-202ENST00000398208 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
TRAF7Q6Q0C0 IRF7-204ENST00000397570 1943 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
TRAF7Q6Q0C0 BRSK2-212ENST00000531197 3163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
TRAF7Q6Q0C0 PMPCA-203ENST00000399219 1987 ntTSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
TRAF7Q6Q0C0 CRHR1-203ENST00000339069 2490 ntTSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
TRAF7Q6Q0C0 FOXD4L3-201ENST00000342833 2039 ntAPPRIS P1 BASIC21.47■■□□□ 1.03
TRAF7Q6Q0C0 USP39-203ENST00000409470 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
TRAF7Q6Q0C0 TMEM268-202ENST00000374049 4578 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
TRAF7Q6Q0C0 CD7-201ENST00000312648 1281 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
TRAF7Q6Q0C0 MAP1LC3A-203ENST00000397709 698 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.47■■□□□ 1.03
TRAF7Q6Q0C0 SHBG-203ENST00000416273 1042 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.47■■□□□ 1.03
TRAF7Q6Q0C0 AC091390.4-202ENST00000476426 537 ntBASIC21.47■■□□□ 1.03
TRAF7Q6Q0C0 AC003982.1-201ENST00000477404 484 ntTSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
TRAF7Q6Q0C0 AC022616.7-201ENST00000525383 220 ntBASIC21.47■■□□□ 1.03
TRAF7Q6Q0C0 RAP1B-229ENST00000543393 874 ntTSL 3 BASIC21.47■■□□□ 1.03
TRAF7Q6Q0C0 SHBG-215ENST00000575903 1196 ntTSL 3 BASIC21.47■■□□□ 1.03
TRAF7Q6Q0C0 C16orf74-207ENST00000602914 761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
TRAF7Q6Q0C0 MYC-208ENST00000641036 567 ntBASIC21.47■■□□□ 1.03
TRAF7Q6Q0C0 AC026310.3-201ENST00000625186 2373 ntBASIC21.47■■□□□ 1.03
TRAF7Q6Q0C0 BRD9-202ENST00000467963 2156 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
TRAF7Q6Q0C0 KLHL31-202ENST00000407079 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
TRAF7Q6Q0C0 MRGBP-201ENST00000370487 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
TRAF7Q6Q0C0 ST3GAL3-239ENST00000545417 1667 ntTSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
TRAF7Q6Q0C0 NPAS3-210ENST00000551492 2817 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
TRAF7Q6Q0C0 DACT1-204ENST00000541264 2610 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
TRAF7Q6Q0C0 LBX2-203ENST00000460508 1452 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
TRAF7Q6Q0C0 HMBS-214ENST00000542729 1469 ntTSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
TRAF7Q6Q0C0 RGS3-232ENST00000620489 1503 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
TRAF7Q6Q0C0 SLC25A29-202ENST00000392908 2242 ntTSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
TRAF7Q6Q0C0 CLDND1-202ENST00000394180 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
TRAF7Q6Q0C0 P4HA3-202ENST00000427714 2248 ntTSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
TRAF7Q6Q0C0 KRT17P2-202ENST00000326333 1174 ntTSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
TRAF7Q6Q0C0 ISCU-202ENST00000392807 1069 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
TRAF7Q6Q0C0 AK4P3-201ENST00000418260 669 ntBASIC21.46■■□□□ 1.03
TRAF7Q6Q0C0 AC004951.3-201ENST00000418645 1148 ntBASIC21.46■■□□□ 1.03
TRAF7Q6Q0C0 ISCU-203ENST00000431221 799 ntTSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
TRAF7Q6Q0C0 SGO1-208ENST00000437051 1187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
TRAF7Q6Q0C0 MFAP1P1-201ENST00000442257 1255 ntBASIC21.46■■□□□ 1.03
TRAF7Q6Q0C0 Z85996.1-201ENST00000494644 937 ntBASIC21.46■■□□□ 1.03
TRAF7Q6Q0C0 AC091153.3-201ENST00000497885 472 ntTSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
TRAF7Q6Q0C0 AC087498.1-201ENST00000572493 945 ntAPPRIS P1 BASIC21.46■■□□□ 1.03
TRAF7Q6Q0C0 CYB561-214ENST00000582034 1193 ntTSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
TRAF7Q6Q0C0 AC006504.5-207ENST00000586220 487 ntTSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
TRAF7Q6Q0C0 COLCA2-205ENST00000614153 1264 ntTSL 3 BASIC21.46■■□□□ 1.03
TRAF7Q6Q0C0 TPGS2-221ENST00000614939 1268 ntTSL 4 BASIC21.46■■□□□ 1.03
TRAF7Q6Q0C0 TMEM114-203ENST00000620492 945 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
TRAF7Q6Q0C0 PTGES2-214ENST00000617202 1344 ntTSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
TRAF7Q6Q0C0 NEIL1-206ENST00000564784 2019 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
TRAF7Q6Q0C0 LETM1-201ENST00000302787 5462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
TRAF7Q6Q0C0 RIOX1-201ENST00000304061 2429 ntAPPRIS P1 BASIC21.46■■□□□ 1.03
TRAF7Q6Q0C0 MSLN-201ENST00000382862 2116 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
TRAF7Q6Q0C0 SCRT2-201ENST00000246104 3577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
TRAF7Q6Q0C0 RLBP1-201ENST00000268125 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.03
TRAF7Q6Q0C0 IRX4-201ENST00000231357 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.03
TRAF7Q6Q0C0 KHDC1-201ENST00000257765 1134 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
TRAF7Q6Q0C0 FGF8-202ENST00000344255 707 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
TRAF7Q6Q0C0 HMGA1P5-201ENST00000412453 271 ntBASIC21.45■■□□□ 1.02
TRAF7Q6Q0C0 WDR45-218ENST00000473974 1077 ntTSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
TRAF7Q6Q0C0 OAZ1-211ENST00000602676 1148 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
TRAF7Q6Q0C0 KHDC1-207ENST00000610435 1101 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
TRAF7Q6Q0C0 ST3GAL4-203ENST00000392669 1724 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
TRAF7Q6Q0C0 LSR-204ENST00000361790 2210 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
TRAF7Q6Q0C0 CACYBP-201ENST00000367679 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
TRAF7Q6Q0C0 AC079834.2-201ENST00000609776 1949 ntBASIC21.45■■□□□ 1.02
TRAF7Q6Q0C0 SRMS-201ENST00000217188 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
TRAF7Q6Q0C0 DBNL-220ENST00000494774 2117 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
TRAF7Q6Q0C0 MINOS1-NBL1-204ENST00000602662 1623 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
TRAF7Q6Q0C0 TMEM179-206ENST00000616017 1645 ntBASIC21.44■■□□□ 1.02
TRAF7Q6Q0C0 ISYNA1-201ENST00000338128 2420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
TRAF7Q6Q0C0 CIRBP-225ENST00000589710 1835 ntTSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.6 ms