Protein–RNA interactions for Protein: Q6PEY1

TMEM88, Transmembrane protein 88, humanhuman

Predictions only

Length 159 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMEM88Q6PEY1 LINC01356-201ENST00000401018 1819 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
TMEM88Q6PEY1 ABHD16B-201ENST00000369916 1491 ntAPPRIS P1 BASIC15.84■□□□□ 0.13
TMEM88Q6PEY1 MYB-205ENST00000367814 3302 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
TMEM88Q6PEY1 MXRA8-202ENST00000342753 2231 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
TMEM88Q6PEY1 C17orf113-201ENST00000587304 3746 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
TMEM88Q6PEY1 EDA-203ENST00000374552 5278 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
TMEM88Q6PEY1 H1FX-201ENST00000333762 1507 ntAPPRIS P1 BASIC15.84■□□□□ 0.13
TMEM88Q6PEY1 VKORC1L1-202ENST00000434382 1541 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
TMEM88Q6PEY1 CPT2-208ENST00000636891 2746 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
TMEM88Q6PEY1 CPT2-210ENST00000637252 2739 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
TMEM88Q6PEY1 ARSI-201ENST00000328668 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
TMEM88Q6PEY1 CHUK-201ENST00000370397 3625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
TMEM88Q6PEY1 NEUROD2-201ENST00000302584 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
TMEM88Q6PEY1 CLK1-205ENST00000434813 2026 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
TMEM88Q6PEY1 SNRNP70-201ENST00000221448 1603 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
TMEM88Q6PEY1 IRF7-203ENST00000397566 2051 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
TMEM88Q6PEY1 C16orf59-201ENST00000361837 1662 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
TMEM88Q6PEY1 AHCYL2-201ENST00000325006 5056 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
TMEM88Q6PEY1 ALDH4A1-201ENST00000290597 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
TMEM88Q6PEY1 BMP2K-201ENST00000335016 3804 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
TMEM88Q6PEY1 YTHDF1-201ENST00000370334 747 ntTSL 3 BASIC15.84■□□□□ 0.13
TMEM88Q6PEY1 POLR2F-211ENST00000488684 564 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
TMEM88Q6PEY1 PBX2P1-201ENST00000493219 1291 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
TMEM88Q6PEY1 TYROBP-203ENST00000544690 522 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
TMEM88Q6PEY1 KRTAP5-4-202ENST00000616115 660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
TMEM88Q6PEY1 ABCB9-207ENST00000442833 2587 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
TMEM88Q6PEY1 SYTL1-211ENST00000618673 1712 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
TMEM88Q6PEY1 TMEM183A-201ENST00000367242 3019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
TMEM88Q6PEY1 CCDC166-201ENST00000542437 1320 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
TMEM88Q6PEY1 OGFOD2-201ENST00000228922 1780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
TMEM88Q6PEY1 MEIS3-202ENST00000441740 1758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
TMEM88Q6PEY1 NRBP2-202ENST00000442628 3587 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
TMEM88Q6PEY1 KBTBD11-201ENST00000320248 6710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
TMEM88Q6PEY1 BCKDK-202ENST00000287507 1907 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
TMEM88Q6PEY1 STK25-205ENST00000405883 1904 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
TMEM88Q6PEY1 ST6GALNAC6-202ENST00000373141 2424 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
TMEM88Q6PEY1 PPP1R3F-202ENST00000376188 2443 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
TMEM88Q6PEY1 ZNF500-202ENST00000545009 2440 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
TMEM88Q6PEY1 C9orf66-201ENST00000382387 2918 ntAPPRIS P1 BASIC15.84■□□□□ 0.13
TMEM88Q6PEY1 RNF169-201ENST00000299563 7823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
TMEM88Q6PEY1 TRIM45-203ENST00000369464 3495 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
TMEM88Q6PEY1 NRG2-205ENST00000361474 3020 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
TMEM88Q6PEY1 TOR1A-201ENST00000351698 2076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
TMEM88Q6PEY1 AC127496.1-202ENST00000573602 2091 ntTSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.13
TMEM88Q6PEY1 CDC25A-202ENST00000351231 3663 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
TMEM88Q6PEY1 FRMD4A-203ENST00000357447 6821 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
TMEM88Q6PEY1 SCNN1D-201ENST00000325425 2679 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
TMEM88Q6PEY1 ELAVL2-208ENST00000544538 3789 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.13
TMEM88Q6PEY1 HSD11B1L-203ENST00000342970 1620 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
TMEM88Q6PEY1 USP45-205ENST00000472914 1617 ntTSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.13
TMEM88Q6PEY1 ACOT2-205ENST00000622407 1604 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
TMEM88Q6PEY1 RNF103-201ENST00000237455 3477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
TMEM88Q6PEY1 ETV7-206ENST00000615781 1776 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
TMEM88Q6PEY1 TREX1-205ENST00000625293 1783 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
TMEM88Q6PEY1 EML3-201ENST00000278845 3017 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
TMEM88Q6PEY1 MSLN-207ENST00000566549 2418 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
TMEM88Q6PEY1 HIBCH-202ENST00000392332 2463 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
TMEM88Q6PEY1 NARFL-218ENST00000568545 2486 ntTSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
TMEM88Q6PEY1 NSMF-203ENST00000371472 1852 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
TMEM88Q6PEY1 PDE9A-206ENST00000380328 1875 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
TMEM88Q6PEY1 DUX4L19-201ENST00000557448 1267 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
TMEM88Q6PEY1 NRL-205ENST00000560550 788 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
TMEM88Q6PEY1 AC099791.2-201ENST00000605725 427 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
TMEM88Q6PEY1 AL136162.1-201ENST00000607711 1078 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
TMEM88Q6PEY1 CCNI2-204ENST00000614847 2642 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
TMEM88Q6PEY1 PIF1-205ENST00000559239 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
TMEM88Q6PEY1 AGAP4-201ENST00000311652 2715 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
TMEM88Q6PEY1 CCDC92-201ENST00000238156 2787 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
TMEM88Q6PEY1 ASXL1-202ENST00000375687 7031 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
TMEM88Q6PEY1 ASB7-203ENST00000558747 2133 ntTSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
TMEM88Q6PEY1 SCUBE2-202ENST00000450649 2912 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
TMEM88Q6PEY1 MAIP1-201ENST00000295079 1495 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
TMEM88Q6PEY1 C14orf80-206ENST00000392527 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
TMEM88Q6PEY1 LBX2-203ENST00000460508 1452 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
TMEM88Q6PEY1 TRMT6-202ENST00000453074 2239 ntTSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
TMEM88Q6PEY1 KDM5C-204ENST00000375401 6031 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
TMEM88Q6PEY1 FBLN1-201ENST00000262722 2251 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
TMEM88Q6PEY1 CROCC2-201ENST00000443866 5382 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
TMEM88Q6PEY1 RANBP9-201ENST00000011619 3113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
TMEM88Q6PEY1 CSRNP1-201ENST00000273153 3148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
TMEM88Q6PEY1 TLE3-216ENST00000559191 1575 ntTSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
TMEM88Q6PEY1 USP49-202ENST00000373010 2446 ntTSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
TMEM88Q6PEY1 PIANP-204ENST00000540656 2432 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
TMEM88Q6PEY1 ST3GAL4-205ENST00000449406 1669 ntTSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
TMEM88Q6PEY1 UBAP1L-203ENST00000559089 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
TMEM88Q6PEY1 HRAT92-201ENST00000452622 3506 ntTSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
TMEM88Q6PEY1 RNF224-201ENST00000445101 1798 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.82■□□□□ 0.12
TMEM88Q6PEY1 HDAC10-201ENST00000216271 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
TMEM88Q6PEY1 PCBP3-203ENST00000400308 1911 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
TMEM88Q6PEY1 NUMBL-202ENST00000540131 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
TMEM88Q6PEY1 LRRC43-201ENST00000339777 2028 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
TMEM88Q6PEY1 AC013275.1-201ENST00000413602 2019 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
TMEM88Q6PEY1 BFSP1-201ENST00000377868 2063 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
TMEM88Q6PEY1 ACAT2-201ENST00000367048 3180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
TMEM88Q6PEY1 CLDND1-201ENST00000341181 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
TMEM88Q6PEY1 MMD2-201ENST00000401401 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
TMEM88Q6PEY1 RECK-201ENST00000377966 4888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
TMEM88Q6PEY1 KCNC2-203ENST00000393288 2485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
TMEM88Q6PEY1 NDUFS3-206ENST00000528192 561 ntTSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
TMEM88Q6PEY1 ARHGDIA-217ENST00000584461 886 ntTSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 13.8 ms