Protein–RNA interactions for Protein: Q6P9F0

CCDC62, Coiled-coil domain-containing protein 62, humanhuman

Predictions only

Length 684 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC62Q6P9F0 TRMT2A-204ENST00000439169 2473 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
CCDC62Q6P9F0 HBA1-201ENST00000320868 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
CCDC62Q6P9F0 UBB-203ENST00000395839 1012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
CCDC62Q6P9F0 CCDC74B-204ENST00000409234 871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
CCDC62Q6P9F0 AL954642.1-201ENST00000428088 538 ntTSL 3 BASIC22.15■■□□□ 1.14
CCDC62Q6P9F0 AC004980.1-204ENST00000429707 299 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
CCDC62Q6P9F0 TUBB8P6-201ENST00000436895 1288 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
CCDC62Q6P9F0 ANKRD54-211ENST00000609454 825 ntTSL 3 BASIC22.15■■□□□ 1.14
CCDC62Q6P9F0 KLC2-207ENST00000421552 2721 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
CCDC62Q6P9F0 GTF3C5-203ENST00000372099 1999 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
CCDC62Q6P9F0 SCLY-201ENST00000254663 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
CCDC62Q6P9F0 ADM-206ENST00000528655 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
CCDC62Q6P9F0 RGMA-208ENST00000556658 1889 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
CCDC62Q6P9F0 WISP2-202ENST00000372865 1518 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
CCDC62Q6P9F0 TINAGL1-211ENST00000537531 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
CCDC62Q6P9F0 CLN8-208ENST00000635751 1807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
CCDC62Q6P9F0 C7orf25-201ENST00000350427 2451 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
CCDC62Q6P9F0 CCDC130-201ENST00000221554 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
CCDC62Q6P9F0 LTK-201ENST00000263800 3046 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
CCDC62Q6P9F0 NSDHL-201ENST00000370274 1929 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
CCDC62Q6P9F0 COX5A-201ENST00000322347 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
CCDC62Q6P9F0 ING1-202ENST00000338450 1189 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
CCDC62Q6P9F0 ATP5S-204ENST00000426751 1171 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
CCDC62Q6P9F0 AC015712.4-203ENST00000559673 630 ntTSL 3 BASIC22.14■■□□□ 1.13
CCDC62Q6P9F0 RN7SL850P-201ENST00000579959 291 ntBASIC22.14■■□□□ 1.13
CCDC62Q6P9F0 CCDC28A-203ENST00000617445 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
CCDC62Q6P9F0 AC097662.2-201ENST00000641359 267 ntAPPRIS P1 BASIC22.14■■□□□ 1.13
CCDC62Q6P9F0 LINC01140-202ENST00000467438 2375 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
CCDC62Q6P9F0 ALKBH6-213ENST00000486389 1525 ntTSL 3 BASIC22.14■■□□□ 1.13
CCDC62Q6P9F0 FSCN1P1-201ENST00000568912 1481 ntBASIC22.14■■□□□ 1.13
CCDC62Q6P9F0 DET1-201ENST00000268148 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
CCDC62Q6P9F0 HOXA11-AS-205ENST00000522863 1723 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
CCDC62Q6P9F0 DYNLT3-201ENST00000378578 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
CCDC62Q6P9F0 MED26-207ENST00000611692 1444 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
CCDC62Q6P9F0 KLHL31-202ENST00000407079 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
CCDC62Q6P9F0 LGALS12-203ENST00000394618 1618 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
CCDC62Q6P9F0 FEZF1-202ENST00000427185 1368 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
CCDC62Q6P9F0 SUMO3-201ENST00000332859 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
CCDC62Q6P9F0 PSKH2-201ENST00000276616 1322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
CCDC62Q6P9F0 EIF2B1-204ENST00000537073 1768 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
CCDC62Q6P9F0 ICAM4-201ENST00000340992 1176 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
CCDC62Q6P9F0 ID1-202ENST00000376112 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
CCDC62Q6P9F0 AC073343.2-202ENST00000430844 532 ntTSL 4 BASIC22.13■■□□□ 1.13
CCDC62Q6P9F0 AC011506.1-201ENST00000474329 610 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
CCDC62Q6P9F0 LRRC75A-AS1-205ENST00000475953 1201 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
CCDC62Q6P9F0 ALKAL1-202ENST00000523939 536 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
CCDC62Q6P9F0 SIVA1-207ENST00000556195 674 ntTSL 3 BASIC22.13■■□□□ 1.13
CCDC62Q6P9F0 P4HB-223ENST00000576390 439 ntTSL 4 BASIC22.13■■□□□ 1.13
CCDC62Q6P9F0 MAP3K14-AS1-202ENST00000585351 893 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
CCDC62Q6P9F0 DEDD2-209ENST00000598727 1037 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
CCDC62Q6P9F0 AC006942.1-201ENST00000600669 520 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
CCDC62Q6P9F0 PCGF3-208ENST00000470161 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
CCDC62Q6P9F0 STK11-205ENST00000586243 2777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
CCDC62Q6P9F0 ZDHHC14-203ENST00000359775 7380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
CCDC62Q6P9F0 PACSIN3-211ENST00000539589 2009 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
CCDC62Q6P9F0 IFNAR2-204ENST00000382264 1389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
CCDC62Q6P9F0 LINC01568-207ENST00000641790 1380 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
CCDC62Q6P9F0 BX119927.1-201ENST00000636596 1552 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
CCDC62Q6P9F0 BCKDK-203ENST00000394950 1997 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
CCDC62Q6P9F0 BID-215ENST00000622694 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
CCDC62Q6P9F0 DNAJB11-202ENST00000439351 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
CCDC62Q6P9F0 CDC42BPB-201ENST00000361246 6758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
CCDC62Q6P9F0 COX7A1-201ENST00000292907 762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
CCDC62Q6P9F0 TMPOP1-202ENST00000424642 1267 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
CCDC62Q6P9F0 B3GAT3P1-201ENST00000471720 806 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
CCDC62Q6P9F0 ASPHD1-203ENST00000483405 1115 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.12■■□□□ 1.13
CCDC62Q6P9F0 RPS27A-211ENST00000639844 606 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
CCDC62Q6P9F0 KRT16-201ENST00000301653 1644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
CCDC62Q6P9F0 PSMD6-201ENST00000295901 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
CCDC62Q6P9F0 ACHE-207ENST00000428317 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
CCDC62Q6P9F0 WWOX-202ENST00000402655 1594 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
CCDC62Q6P9F0 RGMA-210ENST00000557301 1929 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
CCDC62Q6P9F0 ZNF664-207ENST00000539644 5108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
CCDC62Q6P9F0 CTNND2-201ENST00000304623 5481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
CCDC62Q6P9F0 NAT6-201ENST00000354862 1330 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
CCDC62Q6P9F0 SMYD2-201ENST00000366957 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
CCDC62Q6P9F0 EEF1D-204ENST00000423316 2378 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
CCDC62Q6P9F0 TMEM8A-201ENST00000250930 2346 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
CCDC62Q6P9F0 TAF6L-201ENST00000294168 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
CCDC62Q6P9F0 FBXO32-202ENST00000443022 1227 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
CCDC62Q6P9F0 USP46-AS1-201ENST00000503051 1048 ntTSL 3 BASIC22.11■■□□□ 1.13
CCDC62Q6P9F0 MLF2-210ENST00000542154 838 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
CCDC62Q6P9F0 STAC3-202ENST00000546246 1014 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
CCDC62Q6P9F0 DUT-205ENST00000558813 769 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
CCDC62Q6P9F0 NAPSB-206ENST00000562112 1266 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
CCDC62Q6P9F0 AP005263.1-201ENST00000579126 914 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
CCDC62Q6P9F0 AC005363.2-201ENST00000618631 242 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
CCDC62Q6P9F0 SPOCK3-217ENST00000511269 1768 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
CCDC62Q6P9F0 SLC25A3-211ENST00000548847 1369 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
CCDC62Q6P9F0 PABPC1L2B-201ENST00000373521 2197 ntAPPRIS P1 BASIC22.11■■□□□ 1.13
CCDC62Q6P9F0 AUP1-201ENST00000377526 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
CCDC62Q6P9F0 CPNE2-201ENST00000290776 2645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
CCDC62Q6P9F0 CDX1-202ENST00000616154 1343 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
CCDC62Q6P9F0 AVPR2-202ENST00000358927 1763 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
CCDC62Q6P9F0 RXFP4-201ENST00000368318 1240 ntAPPRIS P1 BASIC22.1■■□□□ 1.13
CCDC62Q6P9F0 ZNF534-203ENST00000432303 956 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
CCDC62Q6P9F0 AP001059.1-201ENST00000442785 523 ntTSL 3 BASIC22.1■■□□□ 1.13
CCDC62Q6P9F0 KIF12-202ENST00000468460 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
CCDC62Q6P9F0 AC098829.1-201ENST00000502344 630 ntTSL 3 BASIC22.1■■□□□ 1.13
CCDC62Q6P9F0 AC092865.7-201ENST00000641832 219 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24 ms