Protein–RNA interactions for Protein: Q6NW40

RGMB, RGM domain family member B, humanhuman

Predictions only

Length 437 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RGMBQ6NW40 CKBP1-201ENST00000565489 1086 ntBASIC22.87■■□□□ 1.25
RGMBQ6NW40 KRT8P45-201ENST00000414328 1447 ntBASIC22.87■■□□□ 1.25
RGMBQ6NW40 BSCL2-207ENST00000407022 1516 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
RGMBQ6NW40 HCK-203ENST00000375862 1806 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
RGMBQ6NW40 AC242852.2-201ENST00000615738 1807 ntBASIC22.87■■□□□ 1.25
RGMBQ6NW40 TMEM44-202ENST00000347147 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
RGMBQ6NW40 HLA-G-205ENST00000428701 1578 ntAPPRIS P2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
RGMBQ6NW40 TMEM110-MUSTN1-202ENST00000504329 1405 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
RGMBQ6NW40 Telomerase-vert.1-201ENST00000363312 438 ntBASIC22.86■■□□□ 1.25
RGMBQ6NW40 EFCAB2-203ENST00000366523 1233 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.86■■□□□ 1.25
RGMBQ6NW40 BECN2-201ENST00000419583 1296 ntAPPRIS P1 BASIC22.86■■□□□ 1.25
RGMBQ6NW40 CYHR1-203ENST00000424149 1162 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
RGMBQ6NW40 FAM86C2P-201ENST00000525180 435 ntTSL 4 BASIC22.86■■□□□ 1.25
RGMBQ6NW40 AL513523.10-201ENST00000623024 1186 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
RGMBQ6NW40 ASAH1-251ENST00000637561 929 ntTSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
RGMBQ6NW40 C6orf136-201ENST00000293604 1978 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
RGMBQ6NW40 PYCR1-204ENST00000403172 1811 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
RGMBQ6NW40 DYRK1B-201ENST00000323039 2535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
RGMBQ6NW40 GIT1-210ENST00000579937 2798 ntTSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
RGMBQ6NW40 CABP1-201ENST00000288616 1369 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
RGMBQ6NW40 TUB-203ENST00000534099 1759 ntTSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
RGMBQ6NW40 FANCE-201ENST00000229769 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
RGMBQ6NW40 VLDLR-AS1-205ENST00000599229 1346 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
RGMBQ6NW40 KXD1-203ENST00000540691 1592 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.85■■□□□ 1.25
RGMBQ6NW40 ST3GAL4-204ENST00000444328 1812 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
RGMBQ6NW40 MMD-201ENST00000262065 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
RGMBQ6NW40 HNRNPM-202ENST00000348943 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
RGMBQ6NW40 FIBP-202ENST00000357519 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
RGMBQ6NW40 TIMM17B-201ENST00000376582 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
RGMBQ6NW40 TLCD1-202ENST00000394933 784 ntTSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
RGMBQ6NW40 MRPL53-202ENST00000409710 386 ntTSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
RGMBQ6NW40 FAAHP1-202ENST00000446499 1238 ntBASIC22.85■■□□□ 1.25
RGMBQ6NW40 CCNJL-205ENST00000519673 940 ntTSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
RGMBQ6NW40 TRAF3IP2-AS1-208ENST00000525151 609 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
RGMBQ6NW40 ZSCAN1-203ENST00000601162 813 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
RGMBQ6NW40 AC004263.2-201ENST00000617183 678 ntBASIC22.85■■□□□ 1.25
RGMBQ6NW40 AL732314.6-201ENST00000627721 484 ntTSL 4 BASIC22.85■■□□□ 1.25
RGMBQ6NW40 TBX6-201ENST00000279386 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
RGMBQ6NW40 TBX6-205ENST00000627355 1796 ntTSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
RGMBQ6NW40 CALB2-202ENST00000349553 1373 ntTSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
RGMBQ6NW40 APBB1-210ENST00000530885 1626 ntTSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
RGMBQ6NW40 UBA5-211ENST00000493720 2058 ntTSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
RGMBQ6NW40 ZNF568-208ENST00000586353 1902 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
RGMBQ6NW40 RHOA-202ENST00000418115 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
RGMBQ6NW40 ANKRD2-202ENST00000307518 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
RGMBQ6NW40 ABHD6-205ENST00000478253 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
RGMBQ6NW40 KAT2B-201ENST00000263754 4833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
RGMBQ6NW40 GML-201ENST00000220940 723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
RGMBQ6NW40 Metazoa_SRP.28-201ENST00000366402 260 ntBASIC22.84■■□□□ 1.25
RGMBQ6NW40 SYCE1L-201ENST00000378644 858 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
RGMBQ6NW40 CXCL12-204ENST00000395793 665 ntTSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
RGMBQ6NW40 DGUOK-AS1-203ENST00000453103 601 ntTSL 3 BASIC22.84■■□□□ 1.25
RGMBQ6NW40 ZNF436-AS1-206ENST00000518821 461 ntTSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
RGMBQ6NW40 HOXB8-203ENST00000576562 743 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
RGMBQ6NW40 AC010463.1-201ENST00000596542 1207 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
RGMBQ6NW40 AC092329.2-201ENST00000598402 547 ntBASIC22.84■■□□□ 1.25
RGMBQ6NW40 AC121338.2-201ENST00000622535 1744 ntBASIC22.84■■□□□ 1.25
RGMBQ6NW40 SLC10A3-201ENST00000263512 2161 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
RGMBQ6NW40 FAM129C-207ENST00000599124 1918 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
RGMBQ6NW40 TMEM243-201ENST00000257637 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
RGMBQ6NW40 AP000593.1-201ENST00000393668 712 ntBASIC22.83■■□□□ 1.25
RGMBQ6NW40 AP000721.2-201ENST00000537170 650 ntTSL 4 BASIC22.83■■□□□ 1.25
RGMBQ6NW40 NOL12-207ENST00000611699 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
RGMBQ6NW40 RASSF10-201ENST00000529419 2530 ntAPPRIS P1 BASIC22.83■■□□□ 1.25
RGMBQ6NW40 KRT14-201ENST00000167586 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
RGMBQ6NW40 CRACR2B-207ENST00000528542 1792 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
RGMBQ6NW40 CDKN2C-203ENST00000396148 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
RGMBQ6NW40 C9orf163-202ENST00000624034 2573 ntBASIC22.83■■□□□ 1.24
RGMBQ6NW40 PSMD6-201ENST00000295901 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
RGMBQ6NW40 KRT16P6-202ENST00000425692 1426 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
RGMBQ6NW40 FAM213A-202ENST00000372185 1723 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
RGMBQ6NW40 ETS1-207ENST00000531611 2134 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
RGMBQ6NW40 BUD23-201ENST00000265758 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
RGMBQ6NW40 RASGRP2-208ENST00000394428 444 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
RGMBQ6NW40 CRELD2-204ENST00000407217 1230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
RGMBQ6NW40 PLAC8-202ENST00000411416 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
RGMBQ6NW40 CALM1-205ENST00000553542 877 ntTSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
RGMBQ6NW40 TMEM268-202ENST00000374049 4578 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
RGMBQ6NW40 JUNB-201ENST00000302754 1820 ntAPPRIS P1 BASIC22.82■■□□□ 1.24
RGMBQ6NW40 PPM1D-204ENST00000629650 1525 ntTSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
RGMBQ6NW40 TEAD2-208ENST00000598810 2191 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
RGMBQ6NW40 TMEM230-206ENST00000379283 1660 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.81■■□□□ 1.24
RGMBQ6NW40 GNGT2-201ENST00000300406 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
RGMBQ6NW40 C20orf196-201ENST00000303142 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
RGMBQ6NW40 MRPL24-202ENST00000368211 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
RGMBQ6NW40 UNC93B7-201ENST00000509439 705 ntBASIC22.81■■□□□ 1.24
RGMBQ6NW40 METTL23-215ENST00000615984 1171 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
RGMBQ6NW40 SQSTM1-216ENST00000626660 274 ntTSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
RGMBQ6NW40 DCAF15-201ENST00000254337 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
RGMBQ6NW40 EIF2B4-211ENST00000616081 1754 ntTSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
RGMBQ6NW40 NAPRT-202ENST00000426292 1654 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
RGMBQ6NW40 ANKRD54-201ENST00000215941 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
RGMBQ6NW40 DBNDD2-202ENST00000360981 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
RGMBQ6NW40 MAP1LC3A-203ENST00000397709 698 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.8■■□□□ 1.24
RGMBQ6NW40 MAP3K13-213ENST00000454237 526 ntTSL 3 BASIC22.8■■□□□ 1.24
RGMBQ6NW40 AC010655.4-201ENST00000462662 707 ntTSL 4 BASIC22.8■■□□□ 1.24
RGMBQ6NW40 FOSL1-203ENST00000531493 1200 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
RGMBQ6NW40 IFI27L1-206ENST00000554562 571 ntTSL 3 BASIC22.8■■□□□ 1.24
RGMBQ6NW40 NUDT16L1-203ENST00000586252 922 ntTSL 3 BASIC22.8■■□□□ 1.24
RGMBQ6NW40 SNX3-201ENST00000230085 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.8 ms