Protein–RNA interactions for Protein: Q6NSW7

NANOGP8, Putative homeobox protein NANOGP8, humanhuman

Predictions only

Length 305 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NANOGP8Q6NSW7 STX18-201ENST00000306200 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
NANOGP8Q6NSW7 UBE2D3-201ENST00000321805 1087 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.66■□□□□ 0.58
NANOGP8Q6NSW7 DNTTIP1-201ENST00000372622 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
NANOGP8Q6NSW7 BMP1-204ENST00000397814 836 ntTSL 4 BASIC18.66■□□□□ 0.58
NANOGP8Q6NSW7 AC019068.1-201ENST00000415226 552 ntTSL 4 BASIC18.66■□□□□ 0.58
NANOGP8Q6NSW7 RASGEF1B-208ENST00000510780 539 ntTSL 3 BASIC18.66■□□□□ 0.58
NANOGP8Q6NSW7 RASGEF1B-209ENST00000512343 498 ntTSL 3 BASIC18.66■□□□□ 0.58
NANOGP8Q6NSW7 AC011446.1-201ENST00000591825 458 ntTSL 2 BASIC18.66■□□□□ 0.58
NANOGP8Q6NSW7 ETV2-202ENST00000379026 1571 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.66■□□□□ 0.58
NANOGP8Q6NSW7 MEN1-201ENST00000312049 2761 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
NANOGP8Q6NSW7 B4GALNT1-213ENST00000552350 1649 ntTSL 4 BASIC18.66■□□□□ 0.58
NANOGP8Q6NSW7 TMEM79-203ENST00000405535 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
NANOGP8Q6NSW7 RIMBP3B-201ENST00000620804 6105 ntAPPRIS P1 BASIC18.66■□□□□ 0.58
NANOGP8Q6NSW7 NR1H2-201ENST00000253727 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
NANOGP8Q6NSW7 TRIM7-205ENST00000422067 1954 ntTSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
NANOGP8Q6NSW7 FLCN-203ENST00000389169 1692 ntTSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
NANOGP8Q6NSW7 KDM5C-203ENST00000375383 5122 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.66■□□□□ 0.58
NANOGP8Q6NSW7 MIXL1-201ENST00000366810 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
NANOGP8Q6NSW7 CDK6-202ENST00000424848 1465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
NANOGP8Q6NSW7 APAF1-210ENST00000551964 5444 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
NANOGP8Q6NSW7 SLC7A10-201ENST00000253188 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
NANOGP8Q6NSW7 RFTN1-201ENST00000334133 2982 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
NANOGP8Q6NSW7 ERCC2-203ENST00000391944 2334 ntTSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
NANOGP8Q6NSW7 CASTOR1-202ENST00000407689 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
NANOGP8Q6NSW7 PHGDH-210ENST00000641115 1638 ntBASIC18.65■□□□□ 0.58
NANOGP8Q6NSW7 TM4SF5-201ENST00000270560 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
NANOGP8Q6NSW7 MCRIP2P1-201ENST00000394346 511 ntBASIC18.65■□□□□ 0.58
NANOGP8Q6NSW7 AC007322.4-201ENST00000509611 723 ntBASIC18.65■□□□□ 0.58
NANOGP8Q6NSW7 AC044860.1-203ENST00000560811 844 ntTSL 3 BASIC18.65■□□□□ 0.58
NANOGP8Q6NSW7 AC100791.3-201ENST00000617619 330 ntBASIC18.65■□□□□ 0.58
NANOGP8Q6NSW7 NUDT10-202ENST00000376006 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
NANOGP8Q6NSW7 SUN1-220ENST00000457378 1309 ntTSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
NANOGP8Q6NSW7 UBE2K-203ENST00000445950 2175 ntTSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
NANOGP8Q6NSW7 UBP1-202ENST00000283629 4148 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.58
NANOGP8Q6NSW7 PPFIA1-202ENST00000389547 4133 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.58
NANOGP8Q6NSW7 CCT5-214ENST00000515676 1997 ntTSL 2 BASIC18.64■□□□□ 0.58
NANOGP8Q6NSW7 PVRIG-201ENST00000317271 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.58
NANOGP8Q6NSW7 PCCA-203ENST00000376286 2481 ntTSL 2 BASIC18.64■□□□□ 0.58
NANOGP8Q6NSW7 SORBS3-221ENST00000523965 2028 ntTSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.58
NANOGP8Q6NSW7 RBM26-207ENST00000622611 5230 ntTSL 2 BASIC18.64■□□□□ 0.58
NANOGP8Q6NSW7 WDR45-207ENST00000376372 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
NANOGP8Q6NSW7 SLC36A1-209ENST00000521925 1621 ntTSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
NANOGP8Q6NSW7 TCTA-201ENST00000273590 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
NANOGP8Q6NSW7 LRRC27-203ENST00000368613 2113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
NANOGP8Q6NSW7 ADRA1A-203ENST00000380572 1697 ntTSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
NANOGP8Q6NSW7 FGF16-201ENST00000439435 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
NANOGP8Q6NSW7 CD55-201ENST00000314754 2220 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
NANOGP8Q6NSW7 FLT1-209ENST00000639477 6337 ntTSL 5 BASIC18.64■□□□□ 0.57
NANOGP8Q6NSW7 SLC52A2-209ENST00000530047 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.64■□□□□ 0.57
NANOGP8Q6NSW7 CD58-201ENST00000369487 892 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
NANOGP8Q6NSW7 CD58-202ENST00000369489 1098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
NANOGP8Q6NSW7 CCDC160-201ENST00000370809 1299 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.64■□□□□ 0.57
NANOGP8Q6NSW7 MLLT10-204ENST00000377091 905 ntTSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
NANOGP8Q6NSW7 GDNF-203ENST00000381826 778 ntTSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
NANOGP8Q6NSW7 GDNF-204ENST00000427982 856 ntTSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
NANOGP8Q6NSW7 ATP6V0B-205ENST00000472174 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
NANOGP8Q6NSW7 ORAI3-202ENST00000562699 628 ntTSL 2 BASIC18.64■□□□□ 0.57
NANOGP8Q6NSW7 PLLP-204ENST00000569059 665 ntTSL 3 BASIC18.64■□□□□ 0.57
NANOGP8Q6NSW7 NMRAL1-212ENST00000574425 1240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.64■□□□□ 0.57
NANOGP8Q6NSW7 AL138781.2-201ENST00000617896 1843 ntBASIC18.64■□□□□ 0.57
NANOGP8Q6NSW7 EIF4ENIF1-202ENST00000344710 3115 ntTSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
NANOGP8Q6NSW7 HDAC4-201ENST00000345617 8976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
NANOGP8Q6NSW7 HDAC4-215ENST00000543185 8990 ntTSL 5 BASIC18.64■□□□□ 0.57
NANOGP8Q6NSW7 TSSK6-201ENST00000585580 1467 ntAPPRIS P1 BASIC18.64■□□□□ 0.57
NANOGP8Q6NSW7 ZNF74-203ENST00000403682 2789 ntTSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
NANOGP8Q6NSW7 ISLR2-210ENST00000565540 2780 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC18.64■□□□□ 0.57
NANOGP8Q6NSW7 NOS1AP-206ENST00000530878 2894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
NANOGP8Q6NSW7 ZNF302-214ENST00000613363 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC18.64■□□□□ 0.57
NANOGP8Q6NSW7 GRB10-201ENST00000335866 5032 ntTSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
NANOGP8Q6NSW7 STX6-204ENST00000542060 4809 ntTSL 2 BASIC18.63■□□□□ 0.57
NANOGP8Q6NSW7 POU3F2-201ENST00000328345 4879 ntAPPRIS P1 BASIC18.63■□□□□ 0.57
NANOGP8Q6NSW7 ROR1-201ENST00000371079 5832 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
NANOGP8Q6NSW7 ACD-202ENST00000393919 1974 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
NANOGP8Q6NSW7 AC013268.5-201ENST00000454928 1959 ntTSL 2 BASIC18.63■□□□□ 0.57
NANOGP8Q6NSW7 LEMD2-214ENST00000614475 2883 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.63■□□□□ 0.57
NANOGP8Q6NSW7 MAGED2-203ENST00000375053 2066 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
NANOGP8Q6NSW7 CEACAM4-201ENST00000221954 1205 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
NANOGP8Q6NSW7 TMEM218-201ENST00000279968 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
NANOGP8Q6NSW7 HLA-G-202ENST00000376815 851 ntBASIC18.63■□□□□ 0.57
NANOGP8Q6NSW7 HLA-G-203ENST00000376818 1127 ntBASIC18.63■□□□□ 0.57
NANOGP8Q6NSW7 RASGRP2-203ENST00000377486 667 ntTSL 3 BASIC18.63■□□□□ 0.57
NANOGP8Q6NSW7 TSEN15-207ENST00000533373 618 ntTSL 2 BASIC18.63■□□□□ 0.57
NANOGP8Q6NSW7 HAS1-203ENST00000594621 760 ntTSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
NANOGP8Q6NSW7 CEACAM4-203ENST00000600925 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.63■□□□□ 0.57
NANOGP8Q6NSW7 ATP10A-207ENST00000619904 988 ntTSL 5 BASIC18.63■□□□□ 0.57
NANOGP8Q6NSW7 TNFRSF11A-207ENST00000639222 855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.63■□□□□ 0.57
NANOGP8Q6NSW7 DISC1-224ENST00000639374 1071 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
NANOGP8Q6NSW7 CT47B1-201ENST00000371311 1328 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.63■□□□□ 0.57
NANOGP8Q6NSW7 TBC1D19-201ENST00000264866 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
NANOGP8Q6NSW7 ST3GAL3-201ENST00000262915 2470 ntTSL 5 BASIC18.63■□□□□ 0.57
NANOGP8Q6NSW7 ADGRB1-201ENST00000323289 5527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
NANOGP8Q6NSW7 MZF1-206ENST00000599369 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
NANOGP8Q6NSW7 RAB34-201ENST00000301043 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
NANOGP8Q6NSW7 GRB10-205ENST00000401949 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
NANOGP8Q6NSW7 ZNF623-203ENST00000526926 2612 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.63■□□□□ 0.57
NANOGP8Q6NSW7 UBE2Q2-204ENST00000561851 1582 ntTSL 2 BASIC18.63■□□□□ 0.57
NANOGP8Q6NSW7 MTX1-202ENST00000368376 1632 ntTSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
NANOGP8Q6NSW7 INTS11-209ENST00000450926 1839 ntTSL 5 BASIC18.63■□□□□ 0.57
NANOGP8Q6NSW7 ACTL6A-201ENST00000392662 1899 ntTSL 2 BASIC18.63■□□□□ 0.57
NANOGP8Q6NSW7 FIP1L1-203ENST00000358575 2180 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC18.62■□□□□ 0.57
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.1 ms