Protein–RNA interactions for Protein: Q66K80

RUSC1-AS1, Putative uncharacterized protein RUSC1-AS1, humanhuman

Predictions only

Length 236 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RUSC1-AS1Q66K80 UBE2F-201ENST00000272930 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
RUSC1-AS1Q66K80 ADRA1B-201ENST00000306675 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
RUSC1-AS1Q66K80 TMEM218-213ENST00000531909 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
RUSC1-AS1Q66K80 CPT2-203ENST00000635862 2319 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
RUSC1-AS1Q66K80 IRX3-201ENST00000329734 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
RUSC1-AS1Q66K80 TREX2-206ENST00000370232 1864 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
RUSC1-AS1Q66K80 MEF2D-203ENST00000368240 1905 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
RUSC1-AS1Q66K80 KMT5B-201ENST00000304363 5837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
RUSC1-AS1Q66K80 CD8B-203ENST00000390655 1417 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
RUSC1-AS1Q66K80 AL135905.2-201ENST00000584934 1404 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
RUSC1-AS1Q66K80 DYNLT3-201ENST00000378578 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
RUSC1-AS1Q66K80 SORCS2-203ENST00000507866 6152 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
RUSC1-AS1Q66K80 IRF7-201ENST00000330243 1992 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
RUSC1-AS1Q66K80 ARHGEF7-202ENST00000317133 4361 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
RUSC1-AS1Q66K80 RAD23A-203ENST00000586534 1746 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
RUSC1-AS1Q66K80 YTHDF3-214ENST00000621890 2296 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
RUSC1-AS1Q66K80 YIPF2-201ENST00000253031 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
RUSC1-AS1Q66K80 SMIM10L2A-201ENST00000417443 5230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
RUSC1-AS1Q66K80 ATP5D-201ENST00000215375 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
RUSC1-AS1Q66K80 CTAG2-201ENST00000247306 993 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
RUSC1-AS1Q66K80 RAC3-201ENST00000306897 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
RUSC1-AS1Q66K80 AKR1A1-201ENST00000351829 1166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
RUSC1-AS1Q66K80 GPSM1-203ENST00000392944 1111 ntTSL 3 BASIC16.11■□□□□ 0.17
RUSC1-AS1Q66K80 YBEY-205ENST00000397694 534 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
RUSC1-AS1Q66K80 HOXD12-201ENST00000404162 841 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
RUSC1-AS1Q66K80 AC110769.1-201ENST00000420161 815 ntTSL 3 BASIC16.11■□□□□ 0.17
RUSC1-AS1Q66K80 LTB-210ENST00000429299 897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
RUSC1-AS1Q66K80 KRT16P5-201ENST00000455284 522 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
RUSC1-AS1Q66K80 PENK-204ENST00000518770 863 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
RUSC1-AS1Q66K80 MOK-228ENST00000523231 1114 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
RUSC1-AS1Q66K80 PRKACA-209ENST00000590853 1101 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
RUSC1-AS1Q66K80 FGF2-202ENST00000608478 3880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
RUSC1-AS1Q66K80 UBE2B-201ENST00000265339 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
RUSC1-AS1Q66K80 SRCIN1-213ENST00000617146 7058 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
RUSC1-AS1Q66K80 AP000679.1-202ENST00000319763 2081 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
RUSC1-AS1Q66K80 ZNF282-204ENST00000610704 3722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
RUSC1-AS1Q66K80 C19orf66-201ENST00000253110 2117 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
RUSC1-AS1Q66K80 MAP7D2-203ENST00000443379 2476 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
RUSC1-AS1Q66K80 PHOSPHO1-201ENST00000310544 1816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
RUSC1-AS1Q66K80 NR1H2-211ENST00000599105 1830 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
RUSC1-AS1Q66K80 SCRN2-201ENST00000290216 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
RUSC1-AS1Q66K80 ADM-206ENST00000528655 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
RUSC1-AS1Q66K80 ME3-202ENST00000393324 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
RUSC1-AS1Q66K80 FAM19A4-201ENST00000295569 2292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
RUSC1-AS1Q66K80 AGAP1-205ENST00000409538 6138 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
RUSC1-AS1Q66K80 GTF2IRD2B-208ENST00000619142 1932 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
RUSC1-AS1Q66K80 MTMR12-203ENST00000382142 5187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
RUSC1-AS1Q66K80 CMTM8-201ENST00000307526 1174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
RUSC1-AS1Q66K80 LIME1-205ENST00000480139 819 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.1■□□□□ 0.17
RUSC1-AS1Q66K80 LINC02167-201ENST00000562769 594 ntTSL 3 BASIC16.1■□□□□ 0.17
RUSC1-AS1Q66K80 AP001412.1-201ENST00000608405 714 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
RUSC1-AS1Q66K80 DISC1-215ENST00000602281 2761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
RUSC1-AS1Q66K80 MAMSTR-203ENST00000594582 1693 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
RUSC1-AS1Q66K80 ETV7-206ENST00000615781 1776 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
RUSC1-AS1Q66K80 AL162377.1-201ENST00000618844 1793 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
RUSC1-AS1Q66K80 OGG1-202ENST00000302008 2191 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
RUSC1-AS1Q66K80 EGLN2-202ENST00000406058 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
RUSC1-AS1Q66K80 RIPPLY3-201ENST00000329553 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
RUSC1-AS1Q66K80 ACBD4-201ENST00000321854 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
RUSC1-AS1Q66K80 STAU2-229ENST00000524300 3065 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
RUSC1-AS1Q66K80 PPARG-202ENST00000309576 1870 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
RUSC1-AS1Q66K80 AGER-207ENST00000375076 1492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
RUSC1-AS1Q66K80 SAAL1-204ENST00000529318 1503 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
RUSC1-AS1Q66K80 PFKFB3-202ENST00000360521 1964 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
RUSC1-AS1Q66K80 IRF7-205ENST00000397574 1968 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
RUSC1-AS1Q66K80 EPOR-208ENST00000592375 2086 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
RUSC1-AS1Q66K80 LRCH4-211ENST00000619071 2098 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
RUSC1-AS1Q66K80 FBXL19-207ENST00000565690 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
RUSC1-AS1Q66K80 TMPRSS5-212ENST00000545579 2163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
RUSC1-AS1Q66K80 AL390879.2-201ENST00000424306 2222 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
RUSC1-AS1Q66K80 TREX2-204ENST00000370212 861 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
RUSC1-AS1Q66K80 TREX2-205ENST00000370231 1255 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
RUSC1-AS1Q66K80 TREX2-207ENST00000393862 907 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
RUSC1-AS1Q66K80 BCL7B-206ENST00000455335 985 ntTSL 3 BASIC16.09■□□□□ 0.17
RUSC1-AS1Q66K80 AC004080.6-201ENST00000467897 919 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
RUSC1-AS1Q66K80 IAH1-215ENST00000497473 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
RUSC1-AS1Q66K80 AC019257.1-201ENST00000517676 557 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
RUSC1-AS1Q66K80 DHDH-203ENST00000522614 776 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
RUSC1-AS1Q66K80 C12orf76-208ENST00000551185 496 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
RUSC1-AS1Q66K80 AC005943.1-201ENST00000585937 1002 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.09■□□□□ 0.17
RUSC1-AS1Q66K80 SYNGR4-202ENST00000595322 533 ntTSL 3 BASIC16.09■□□□□ 0.17
RUSC1-AS1Q66K80 AC004264.1-201ENST00000608354 794 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
RUSC1-AS1Q66K80 REST-211ENST00000640168 1268 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
RUSC1-AS1Q66K80 C19orf84-202ENST00000574814 1318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
RUSC1-AS1Q66K80 ANKRD2-202ENST00000307518 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
RUSC1-AS1Q66K80 KRT16P6-202ENST00000425692 1426 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
RUSC1-AS1Q66K80 PCBP4-212ENST00000484633 2009 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
RUSC1-AS1Q66K80 ST6GALNAC6-215ENST00000542456 2018 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
RUSC1-AS1Q66K80 ILKAP-201ENST00000254654 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
RUSC1-AS1Q66K80 POLD2-202ENST00000406581 2158 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
RUSC1-AS1Q66K80 PDZD3-201ENST00000322712 2204 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
RUSC1-AS1Q66K80 SCUBE1-201ENST00000290460 2258 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
RUSC1-AS1Q66K80 DXO-202ENST00000375349 1667 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.17
RUSC1-AS1Q66K80 MAPT-203ENST00000340799 5724 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
RUSC1-AS1Q66K80 JDP2-201ENST00000267569 1700 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
RUSC1-AS1Q66K80 IQCJ-SCHIP1-204ENST00000485419 2445 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.17
RUSC1-AS1Q66K80 Z83844.2-201ENST00000456099 1945 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
RUSC1-AS1Q66K80 CRTAC1-203ENST00000370597 2890 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
RUSC1-AS1Q66K80 NTAN1-201ENST00000287706 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
RUSC1-AS1Q66K80 TCTEX1D2-201ENST00000325318 673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.6 ms