Protein–RNA interactions for Protein: Q5VUD6

FAM69B, Protein FAM69B, humanhuman

Predictions only

Length 431 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FAM69BQ5VUD6 KRAS-201ENST00000256078 1119 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
FAM69BQ5VUD6 TMEM223-201ENST00000307366 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
FAM69BQ5VUD6 IGHV3-73-201ENST00000390636 437 ntAPPRIS P1 BASIC18.51■□□□□ 0.55
FAM69BQ5VUD6 MIR1238-201ENST00000408483 83 ntBASIC18.51■□□□□ 0.55
FAM69BQ5VUD6 ZNF134-203ENST00000600344 483 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
FAM69BQ5VUD6 SLC6A6-208ENST00000621751 1252 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
FAM69BQ5VUD6 AC097493.4-201ENST00000641197 219 ntBASIC18.51■□□□□ 0.55
FAM69BQ5VUD6 NCLN-205ENST00000590671 2070 ntTSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
FAM69BQ5VUD6 TTC39C-202ENST00000317571 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
FAM69BQ5VUD6 TRABD2A-201ENST00000335459 1844 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
FAM69BQ5VUD6 WDSUB1-202ENST00000359774 1912 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
FAM69BQ5VUD6 IRF7-204ENST00000397570 1943 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
FAM69BQ5VUD6 SETD7-202ENST00000404104 1590 ntTSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
FAM69BQ5VUD6 ORAI3-201ENST00000318663 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
FAM69BQ5VUD6 ANKRD2-202ENST00000307518 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
FAM69BQ5VUD6 ARSE-205ENST00000540563 1990 ntTSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
FAM69BQ5VUD6 GPAA1-201ENST00000355091 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
FAM69BQ5VUD6 SNX11-203ENST00000452859 1601 ntTSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
FAM69BQ5VUD6 MMP23A-201ENST00000234610 1017 ntBASIC18.5■□□□□ 0.55
FAM69BQ5VUD6 NIFKP9-201ENST00000419265 221 ntBASIC18.5■□□□□ 0.55
FAM69BQ5VUD6 AC008105.2-201ENST00000420431 579 ntTSL 4 BASIC18.5■□□□□ 0.55
FAM69BQ5VUD6 LINC00636-201ENST00000494231 1264 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
FAM69BQ5VUD6 PDCD5-207ENST00000590247 699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
FAM69BQ5VUD6 AC027682.4-201ENST00000605277 798 ntTSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
FAM69BQ5VUD6 SPINK2-206ENST00000618802 608 ntTSL 3 BASIC18.5■□□□□ 0.55
FAM69BQ5VUD6 GGPS1-206ENST00000488594 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
FAM69BQ5VUD6 KXD1-202ENST00000539106 1496 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.5■□□□□ 0.55
FAM69BQ5VUD6 ATPAF2-206ENST00000474627 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
FAM69BQ5VUD6 TFP1-202ENST00000475455 1573 ntBASIC18.5■□□□□ 0.55
FAM69BQ5VUD6 KRT83-201ENST00000293670 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
FAM69BQ5VUD6 HCG18-235ENST00000426882 4862 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
FAM69BQ5VUD6 THEM6-201ENST00000336138 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
FAM69BQ5VUD6 KRT16P6-202ENST00000425692 1426 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
FAM69BQ5VUD6 PNCK-201ENST00000340888 1508 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
FAM69BQ5VUD6 HSPB2-C11orf52-202ENST00000534100 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
FAM69BQ5VUD6 ARFRP1-214ENST00000622789 2559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
FAM69BQ5VUD6 FGFR3-210ENST00000613647 4438 ntTSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
FAM69BQ5VUD6 IFI6-201ENST00000339145 822 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
FAM69BQ5VUD6 NCAM1-AS1-201ENST00000526229 1081 ntTSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
FAM69BQ5VUD6 PPOX-219ENST00000544598 813 ntTSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
FAM69BQ5VUD6 AC100839.1-201ENST00000559589 577 ntTSL 4 BASIC18.49■□□□□ 0.55
FAM69BQ5VUD6 GNB5-211ENST00000560116 918 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
FAM69BQ5VUD6 AC016582.3-201ENST00000589653 561 ntTSL 4 BASIC18.49■□□□□ 0.55
FAM69BQ5VUD6 MIR6786-201ENST00000616843 113 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
FAM69BQ5VUD6 AC004816.2-201ENST00000622856 284 ntTSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
FAM69BQ5VUD6 CSF1-203ENST00000369801 1364 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
FAM69BQ5VUD6 SLC25A15-201ENST00000338625 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
FAM69BQ5VUD6 METTL1-202ENST00000324871 2066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
FAM69BQ5VUD6 MGAT5B-201ENST00000301618 4486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
FAM69BQ5VUD6 ME3-202ENST00000393324 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
FAM69BQ5VUD6 AC073314.1-201ENST00000568729 2216 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
FAM69BQ5VUD6 PACSIN3-211ENST00000539589 2009 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
FAM69BQ5VUD6 GALNT16-204ENST00000553669 1629 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
FAM69BQ5VUD6 TRIM3-201ENST00000345851 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
FAM69BQ5VUD6 DNAJB11-202ENST00000439351 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
FAM69BQ5VUD6 DLGAP4-204ENST00000373913 5056 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
FAM69BQ5VUD6 B4GALNT1-208ENST00000550764 1967 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
FAM69BQ5VUD6 AC026362.1-201ENST00000540866 5618 ntTSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
FAM69BQ5VUD6 HEMK1-206ENST00000455834 1499 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
FAM69BQ5VUD6 EED-201ENST00000263360 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
FAM69BQ5VUD6 METTL21A-201ENST00000272839 1210 ntTSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
FAM69BQ5VUD6 TAF6L-201ENST00000294168 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
FAM69BQ5VUD6 AL162231.1-203ENST00000416454 465 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
FAM69BQ5VUD6 COL15A1-205ENST00000610452 5422 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
FAM69BQ5VUD6 NSDHL-201ENST00000370274 1929 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
FAM69BQ5VUD6 SMC5-AS1-201ENST00000594708 1818 ntTSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
FAM69BQ5VUD6 HCN1-202ENST00000634658 4738 ntTSL 3 BASIC18.48■□□□□ 0.55
FAM69BQ5VUD6 IL17RC-202ENST00000383812 2384 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
FAM69BQ5VUD6 ACHE-207ENST00000428317 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
FAM69BQ5VUD6 ALKBH6-213ENST00000486389 1525 ntTSL 3 BASIC18.48■□□□□ 0.55
FAM69BQ5VUD6 B4GALT1-202ENST00000535206 1535 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
FAM69BQ5VUD6 ZNF513-202ENST00000407879 2077 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
FAM69BQ5VUD6 KRT16P1-201ENST00000399124 1418 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
FAM69BQ5VUD6 TWF2-203ENST00000499914 1440 ntTSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
FAM69BQ5VUD6 SPON2-201ENST00000290902 1869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
FAM69BQ5VUD6 GSTM4-201ENST00000326729 1321 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
FAM69BQ5VUD6 LINC00094-201ENST00000432807 2300 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
FAM69BQ5VUD6 RIMBP3-201ENST00000619918 6105 ntAPPRIS P1 BASIC18.47■□□□□ 0.55
FAM69BQ5VUD6 CRB2-202ENST00000373631 5550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
FAM69BQ5VUD6 ST3GAL3-239ENST00000545417 1667 ntTSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
FAM69BQ5VUD6 MAMSTR-203ENST00000594582 1693 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
FAM69BQ5VUD6 POLR1D-203ENST00000399697 2036 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
FAM69BQ5VUD6 CYP2D8P-201ENST00000433633 1490 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
FAM69BQ5VUD6 INTS11-209ENST00000450926 1839 ntTSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
FAM69BQ5VUD6 GTF3A-201ENST00000381140 1383 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
FAM69BQ5VUD6 HSD11B1L-204ENST00000411793 1362 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
FAM69BQ5VUD6 CEMP1-202ENST00000567119 1374 ntAPPRIS P2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
FAM69BQ5VUD6 NDUFB10-201ENST00000268668 705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
FAM69BQ5VUD6 SNAPIN-201ENST00000368685 1030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
FAM69BQ5VUD6 ATP6V0E1-204ENST00000519911 718 ntTSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
FAM69BQ5VUD6 AC103855.2-201ENST00000533315 573 ntTSL 4 BASIC18.47■□□□□ 0.55
FAM69BQ5VUD6 AC004803.1-203ENST00000539259 501 ntTSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
FAM69BQ5VUD6 ANAPC4-201ENST00000315368 2685 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
FAM69BQ5VUD6 ACOT2-201ENST00000238651 1774 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
FAM69BQ5VUD6 EIF2B1-204ENST00000537073 1768 ntTSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
FAM69BQ5VUD6 GIPR-202ENST00000304207 1432 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
FAM69BQ5VUD6 TEAD1-206ENST00000527636 2544 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
FAM69BQ5VUD6 LBX2-203ENST00000460508 1452 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
FAM69BQ5VUD6 C19orf25-206ENST00000588849 1472 ntTSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
FAM69BQ5VUD6 KMT5B-204ENST00000402185 1881 ntTSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.1 ms