Protein–RNA interactions for Protein: Q5VTH9

WDR78, WD repeat-containing protein 78, humanhuman

Predictions only

Length 848 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
WDR78Q5VTH9 POMZP3-201ENST00000275569 1259 ntTSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
WDR78Q5VTH9 COX7A1-201ENST00000292907 762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
WDR78Q5VTH9 TMEM53-201ENST00000372235 890 ntTSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
WDR78Q5VTH9 TMEM88B-201ENST00000378821 492 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
WDR78Q5VTH9 PHYHD1-207ENST00000421063 1182 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
WDR78Q5VTH9 CYB561D2-204ENST00000424512 1212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
WDR78Q5VTH9 AL133410.2-201ENST00000425499 696 ntTSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
WDR78Q5VTH9 AC004980.1-204ENST00000429707 299 ntBASIC22.57■■□□□ 1.2
WDR78Q5VTH9 NCF1B-202ENST00000432102 930 ntTSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
WDR78Q5VTH9 TMEM185A-204ENST00000507237 903 ntTSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
WDR78Q5VTH9 AMN1-211ENST00000541931 880 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
WDR78Q5VTH9 WWOX-216ENST00000569818 525 ntBASIC22.57■■□□□ 1.2
WDR78Q5VTH9 SAAL1-202ENST00000524803 1582 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
WDR78Q5VTH9 AC006128.1-201ENST00000624704 1661 ntBASIC22.57■■□□□ 1.2
WDR78Q5VTH9 LHX8-202ENST00000356261 1764 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
WDR78Q5VTH9 CCDC38-201ENST00000344280 2277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
WDR78Q5VTH9 SEC61A2-205ENST00000379033 2462 ntTSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
WDR78Q5VTH9 NR1H2-204ENST00000593926 1828 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
WDR78Q5VTH9 CRHR1-203ENST00000339069 2490 ntTSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
WDR78Q5VTH9 VGLL3-201ENST00000383698 2475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
WDR78Q5VTH9 LAYN-204ENST00000525126 1763 ntTSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
WDR78Q5VTH9 DACT1-204ENST00000541264 2610 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
WDR78Q5VTH9 PLCG1-AS1-201ENST00000454626 1462 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
WDR78Q5VTH9 HSD17B1-202ENST00000585807 4982 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
WDR78Q5VTH9 NT5C1A-201ENST00000235628 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
WDR78Q5VTH9 TRIM28-201ENST00000253024 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
WDR78Q5VTH9 NUDT8-201ENST00000301490 809 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
WDR78Q5VTH9 LRRC23-202ENST00000323702 1208 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
WDR78Q5VTH9 UBL5-201ENST00000358666 513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
WDR78Q5VTH9 PRR31-201ENST00000371629 978 ntTSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
WDR78Q5VTH9 TSPO2-202ENST00000373161 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
WDR78Q5VTH9 TSPO2-203ENST00000470917 699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
WDR78Q5VTH9 FDX2-206ENST00000492239 773 ntTSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
WDR78Q5VTH9 EGLN1P1-201ENST00000531623 762 ntBASIC22.56■■□□□ 1.2
WDR78Q5VTH9 AP005242.2-201ENST00000580065 1175 ntBASIC22.56■■□□□ 1.2
WDR78Q5VTH9 DGCR10-201ENST00000609839 495 ntBASIC22.56■■□□□ 1.2
WDR78Q5VTH9 AC103746.1-201ENST00000617440 1133 ntTSL 3 BASIC22.56■■□□□ 1.2
WDR78Q5VTH9 CROCCP4-202ENST00000633627 573 ntTSL 3 BASIC22.56■■□□□ 1.2
WDR78Q5VTH9 TRABD2A-201ENST00000335459 1844 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
WDR78Q5VTH9 RAD23A-203ENST00000586534 1746 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
WDR78Q5VTH9 TMEM98-206ENST00000579849 4434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
WDR78Q5VTH9 HOXD11-201ENST00000249504 1533 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.56■■□□□ 1.2
WDR78Q5VTH9 PSMD8-210ENST00000620216 1538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
WDR78Q5VTH9 UBE2B-201ENST00000265339 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
WDR78Q5VTH9 ISYNA1-201ENST00000338128 2420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
WDR78Q5VTH9 GOLGA6L3-201ENST00000507199 1679 ntBASIC22.55■■□□□ 1.2
WDR78Q5VTH9 FBXO27-202ENST00000509137 2130 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
WDR78Q5VTH9 ARHGEF7-202ENST00000317133 4361 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
WDR78Q5VTH9 MRGPRF-203ENST00000441623 2282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
WDR78Q5VTH9 SOX15-201ENST00000250055 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
WDR78Q5VTH9 POMGNT2-202ENST00000441964 2531 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.55■■□□□ 1.2
WDR78Q5VTH9 SNCB-202ENST00000393693 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
WDR78Q5VTH9 NME6-209ENST00000442597 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
WDR78Q5VTH9 AC128688.1-201ENST00000487626 519 ntBASIC22.55■■□□□ 1.2
WDR78Q5VTH9 KRT18P16-201ENST00000510337 1294 ntBASIC22.55■■□□□ 1.2
WDR78Q5VTH9 CYGB-204ENST00000589342 815 ntTSL 3 BASIC22.55■■□□□ 1.2
WDR78Q5VTH9 SCPEP1-216ENST00000631024 444 ntTSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
WDR78Q5VTH9 IRX4-201ENST00000231357 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
WDR78Q5VTH9 ART5-203ENST00000397068 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
WDR78Q5VTH9 IMMP2L-202ENST00000405709 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
WDR78Q5VTH9 SLC2A8-215ENST00000610552 1763 ntTSL 3 BASIC22.55■■□□□ 1.2
WDR78Q5VTH9 CDIPT-201ENST00000219789 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
WDR78Q5VTH9 ACD-203ENST00000602320 1408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
WDR78Q5VTH9 RASGRP2-210ENST00000394430 2174 ntTSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
WDR78Q5VTH9 RTN4-207ENST00000402434 1456 ntTSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
WDR78Q5VTH9 SEPT5-209ENST00000438754 2241 ntTSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
WDR78Q5VTH9 ORAI1-202ENST00000617316 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
WDR78Q5VTH9 RARRES2-205ENST00000482669 563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
WDR78Q5VTH9 AC012213.1-202ENST00000523422 449 ntTSL 3 BASIC22.54■■□□□ 1.2
WDR78Q5VTH9 NDUFS3-213ENST00000534716 1263 ntTSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
WDR78Q5VTH9 SLC39A2-203ENST00000554422 1259 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
WDR78Q5VTH9 AC006011.2-201ENST00000621313 1158 ntBASIC22.54■■□□□ 1.2
WDR78Q5VTH9 DXO-202ENST00000375349 1667 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
WDR78Q5VTH9 AC092720.2-201ENST00000602388 1665 ntBASIC22.54■■□□□ 1.2
WDR78Q5VTH9 TRAK2-202ENST00000430254 1436 ntTSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
WDR78Q5VTH9 AC007225.1-201ENST00000566331 1836 ntBASIC22.54■■□□□ 1.2
WDR78Q5VTH9 MON1A-201ENST00000296473 2370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
WDR78Q5VTH9 DBNL-220ENST00000494774 2117 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
WDR78Q5VTH9 PCSK6-215ENST00000611967 3336 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
WDR78Q5VTH9 EDA-208ENST00000524573 1381 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
WDR78Q5VTH9 PEX11G-201ENST00000221480 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
WDR78Q5VTH9 EXOC3L2-201ENST00000252482 1230 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
WDR78Q5VTH9 LRRC75A-AS1-205ENST00000475953 1201 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
WDR78Q5VTH9 GNA11-201ENST00000078429 4147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
WDR78Q5VTH9 ARHGAP23-222ENST00000622683 5964 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
WDR78Q5VTH9 CLN3-205ENST00000359984 1876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
WDR78Q5VTH9 USP39-203ENST00000409470 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
WDR78Q5VTH9 AKT2-234ENST00000579047 2029 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
WDR78Q5VTH9 BRD9-202ENST00000467963 2156 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
WDR78Q5VTH9 ARFIP2-204ENST00000445086 1300 ntTSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
WDR78Q5VTH9 MINOS1-NBL1-204ENST00000602662 1623 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
WDR78Q5VTH9 HS2ST1-202ENST00000370551 1585 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
WDR78Q5VTH9 CCAR2-214ENST00000613179 1421 ntTSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
WDR78Q5VTH9 TSPY14P-201ENST00000303979 915 ntBASIC22.52■■□□□ 1.2
WDR78Q5VTH9 BOLA3-202ENST00000327428 639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
WDR78Q5VTH9 INGX-201ENST00000359239 846 ntBASIC22.52■■□□□ 1.2
WDR78Q5VTH9 GLRX2-201ENST00000367439 701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
WDR78Q5VTH9 HMGB3P22-201ENST00000442010 597 ntTSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
WDR78Q5VTH9 ASH1L-AS1-202ENST00000456633 911 ntTSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
WDR78Q5VTH9 C1orf52-203ENST00000471115 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 43.5 ms