Protein–RNA interactions for Protein: Q5T9A4

ATAD3B, ATPase family AAA domain-containing protein 3B, humanhuman

Predictions only

Length 648 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATAD3BQ5T9A4 RAX2-201ENST00000555633 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
ATAD3BQ5T9A4 LEMD2-201ENST00000293760 2958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
ATAD3BQ5T9A4 ZNF451-202ENST00000370702 458 ntTSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
ATAD3BQ5T9A4 CLDN3-201ENST00000395145 1274 ntAPPRIS P1 BASIC18.57■□□□□ 0.56
ATAD3BQ5T9A4 SMIM20-201ENST00000506197 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
ATAD3BQ5T9A4 AC243773.2-201ENST00000616341 490 ntTSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
ATAD3BQ5T9A4 AC092437.1-201ENST00000624794 1048 ntBASIC18.57■□□□□ 0.56
ATAD3BQ5T9A4 SSR1-204ENST00000474597 1808 ntTSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
ATAD3BQ5T9A4 LHX3-202ENST00000371748 2365 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
ATAD3BQ5T9A4 CHST11-205ENST00000549260 5696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
ATAD3BQ5T9A4 CGRRF1-201ENST00000216420 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
ATAD3BQ5T9A4 PPM1B-201ENST00000282412 2606 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
ATAD3BQ5T9A4 AATK-203ENST00000417379 5081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
ATAD3BQ5T9A4 CASR-204ENST00000638421 5088 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
ATAD3BQ5T9A4 TNFRSF14-201ENST00000355716 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
ATAD3BQ5T9A4 PLSCR3-212ENST00000576201 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
ATAD3BQ5T9A4 DPH1-201ENST00000263083 2221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
ATAD3BQ5T9A4 SMYD2-201ENST00000366957 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
ATAD3BQ5T9A4 TRAK1-209ENST00000487159 5536 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
ATAD3BQ5T9A4 ARHGAP11A-208ENST00000567348 2422 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
ATAD3BQ5T9A4 HSD11B1L-204ENST00000411793 1362 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
ATAD3BQ5T9A4 PI4KB-213ENST00000529142 2603 ntTSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
ATAD3BQ5T9A4 AHCYL1-203ENST00000393614 4313 ntTSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
ATAD3BQ5T9A4 EGFR-204ENST00000420316 1570 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
ATAD3BQ5T9A4 PTPN12-201ENST00000248594 3406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
ATAD3BQ5T9A4 UBE2C-203ENST00000352551 665 ntTSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
ATAD3BQ5T9A4 DNTTIP1-201ENST00000372622 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
ATAD3BQ5T9A4 FBXL8-203ENST00000518148 1054 ntTSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
ATAD3BQ5T9A4 HAGHL-213ENST00000564545 663 ntTSL 3 BASIC18.56■□□□□ 0.56
ATAD3BQ5T9A4 ANAPC11-208ENST00000572851 686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
ATAD3BQ5T9A4 IKBKGP1-201ENST00000612193 1073 ntBASIC18.56■□□□□ 0.56
ATAD3BQ5T9A4 TSSK6-201ENST00000585580 1467 ntAPPRIS P1 BASIC18.56■□□□□ 0.56
ATAD3BQ5T9A4 ST3GAL4-217ENST00000534083 1919 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
ATAD3BQ5T9A4 AGTR1-209ENST00000497524 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
ATAD3BQ5T9A4 FAM213B-201ENST00000378424 2765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
ATAD3BQ5T9A4 HTRA3-201ENST00000307358 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
ATAD3BQ5T9A4 ANKRD2-202ENST00000307518 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
ATAD3BQ5T9A4 GPRC5C-204ENST00000392629 1419 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
ATAD3BQ5T9A4 PLEKHG5-206ENST00000377748 5221 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
ATAD3BQ5T9A4 FOXC1-201ENST00000380874 3926 ntAPPRIS P1 BASIC18.55■□□□□ 0.56
ATAD3BQ5T9A4 DTD1-201ENST00000377452 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
ATAD3BQ5T9A4 TMEM109-202ENST00000536171 1959 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
ATAD3BQ5T9A4 RAC1-201ENST00000348035 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
ATAD3BQ5T9A4 SULF2-201ENST00000359930 4915 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
ATAD3BQ5T9A4 SYBU-201ENST00000276646 2870 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
ATAD3BQ5T9A4 DGKZ-203ENST00000421244 2862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
ATAD3BQ5T9A4 RCCD1-201ENST00000394258 2689 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
ATAD3BQ5T9A4 RALGPS1-204ENST00000373436 1667 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
ATAD3BQ5T9A4 MLNR-201ENST00000218721 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
ATAD3BQ5T9A4 AC026185.1-201ENST00000445748 174 ntBASIC18.55■□□□□ 0.56
ATAD3BQ5T9A4 AF201337.1-201ENST00000520239 748 ntBASIC18.55■□□□□ 0.56
ATAD3BQ5T9A4 AL161421.1-201ENST00000619666 1101 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
ATAD3BQ5T9A4 WNT7B-204ENST00000410089 2202 ntTSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
ATAD3BQ5T9A4 TNFRSF25-203ENST00000351959 1441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
ATAD3BQ5T9A4 ARNTL2-204ENST00000395901 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
ATAD3BQ5T9A4 SNX4-201ENST00000251775 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
ATAD3BQ5T9A4 RBM6-204ENST00000422955 2324 ntTSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
ATAD3BQ5T9A4 OGG1-217ENST00000449570 1948 ntTSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
ATAD3BQ5T9A4 KRT17P1-201ENST00000399211 1546 ntBASIC18.54■□□□□ 0.56
ATAD3BQ5T9A4 MKRN4P-201ENST00000444706 1521 ntBASIC18.54■□□□□ 0.56
ATAD3BQ5T9A4 KCNA2-206ENST00000638477 1524 ntTSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
ATAD3BQ5T9A4 C17orf62-204ENST00000437807 2242 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
ATAD3BQ5T9A4 UCHL5-204ENST00000367451 1346 ntTSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
ATAD3BQ5T9A4 FBXO41-205ENST00000521871 7336 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
ATAD3BQ5T9A4 ACBD4-204ENST00000431281 2026 ntTSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
ATAD3BQ5T9A4 FBLN1-204ENST00000402984 2355 ntTSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
ATAD3BQ5T9A4 GIT1-201ENST00000225394 3768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
ATAD3BQ5T9A4 BAG5-201ENST00000299204 4848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
ATAD3BQ5T9A4 ARHGAP22-204ENST00000417247 2340 ntTSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
ATAD3BQ5T9A4 SNRPA-201ENST00000243563 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
ATAD3BQ5T9A4 PRTN3-201ENST00000234347 1026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
ATAD3BQ5T9A4 FAM46A-203ENST00000369756 5537 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
ATAD3BQ5T9A4 DNAJC1-202ENST00000376980 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
ATAD3BQ5T9A4 AC023632.3-201ENST00000521633 145 ntBASIC18.54■□□□□ 0.56
ATAD3BQ5T9A4 AC105036.2-201ENST00000569468 176 ntBASIC18.54■□□□□ 0.56
ATAD3BQ5T9A4 ZNF263-205ENST00000574253 1139 ntTSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
ATAD3BQ5T9A4 MFSD14C-203ENST00000602917 786 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
ATAD3BQ5T9A4 PTCD3-220ENST00000627371 210 ntTSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
ATAD3BQ5T9A4 AC000035.1-201ENST00000634116 343 ntTSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
ATAD3BQ5T9A4 ETV7-206ENST00000615781 1776 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
ATAD3BQ5T9A4 SLC6A11-202ENST00000454147 2794 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
ATAD3BQ5T9A4 SPESP1-201ENST00000310673 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
ATAD3BQ5T9A4 MED26-207ENST00000611692 1444 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
ATAD3BQ5T9A4 ARMC6-202ENST00000392335 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
ATAD3BQ5T9A4 SNN-201ENST00000329565 3312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
ATAD3BQ5T9A4 BACE2-202ENST00000330333 2993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
ATAD3BQ5T9A4 DMAP1-202ENST00000361745 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
ATAD3BQ5T9A4 RNF212-202ENST00000382968 2335 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
ATAD3BQ5T9A4 KLHL2-201ENST00000226725 3134 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
ATAD3BQ5T9A4 GABRD-201ENST00000378585 1961 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
ATAD3BQ5T9A4 LRFN4-201ENST00000309602 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
ATAD3BQ5T9A4 SPEG-203ENST00000396688 1457 ntTSL 3 BASIC18.53■□□□□ 0.56
ATAD3BQ5T9A4 VIL1-204ENST00000440053 1454 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
ATAD3BQ5T9A4 COL13A1-201ENST00000354547 3027 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
ATAD3BQ5T9A4 STX6-201ENST00000258301 4851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
ATAD3BQ5T9A4 ASPHD2-201ENST00000215906 3357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
ATAD3BQ5T9A4 ADAMTS17-201ENST00000268070 6207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
ATAD3BQ5T9A4 GCC2-AS1-201ENST00000322353 558 ntTSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
ATAD3BQ5T9A4 P3H4-201ENST00000355468 2791 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
ATAD3BQ5T9A4 AKR7A3-201ENST00000361640 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 43.1 ms