Protein–RNA interactions for Protein: Q5SYB0

FRMPD1, FERM and PDZ domain-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,578 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FRMPD1Q5SYB0 EIF2B4-211ENST00000616081 1754 ntTSL 5 BASIC29.66■■■□□ 2.34
FRMPD1Q5SYB0 AC079385.1-201ENST00000551505 570 ntTSL 4 BASIC29.66■■■□□ 2.34
FRMPD1Q5SYB0 RPS15A-205ENST00000565420 802 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.66■■■□□ 2.34
FRMPD1Q5SYB0 AC092119.3-201ENST00000612618 583 ntBASIC29.66■■■□□ 2.34
FRMPD1Q5SYB0 ZDHHC20-201ENST00000320220 1351 ntTSL 1 (best) BASIC29.66■■■□□ 2.34
FRMPD1Q5SYB0 TMEM230-206ENST00000379283 1660 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC29.66■■■□□ 2.34
FRMPD1Q5SYB0 UBA5-211ENST00000493720 2058 ntTSL 5 BASIC29.66■■■□□ 2.34
FRMPD1Q5SYB0 PPP5C-201ENST00000012443 2109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.65■■■□□ 2.34
FRMPD1Q5SYB0 C21orf91-202ENST00000400558 1090 ntTSL 1 (best) BASIC29.65■■■□□ 2.34
FRMPD1Q5SYB0 ZNF436-AS1-206ENST00000518821 461 ntTSL 2 BASIC29.65■■■□□ 2.34
FRMPD1Q5SYB0 PRELID1P1-202ENST00000567272 903 ntBASIC29.65■■■□□ 2.34
FRMPD1Q5SYB0 TACC3-213ENST00000617535 1693 ntTSL 5 BASIC29.65■■■□□ 2.34
FRMPD1Q5SYB0 RHOA-202ENST00000418115 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.65■■■□□ 2.34
FRMPD1Q5SYB0 GALC-202ENST00000393568 2054 ntTSL 2 BASIC29.65■■■□□ 2.34
FRMPD1Q5SYB0 NHLRC4-201ENST00000424439 2097 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC29.65■■■□□ 2.34
FRMPD1Q5SYB0 FLCN-203ENST00000389169 1692 ntTSL 1 (best) BASIC29.65■■■□□ 2.34
FRMPD1Q5SYB0 TYROBP-205ENST00000585901 620 ntTSL 3 BASIC29.64■■■□□ 2.34
FRMPD1Q5SYB0 DTNBP1-203ENST00000355917 1359 ntTSL 5 BASIC29.64■■■□□ 2.34
FRMPD1Q5SYB0 CCNC-207ENST00000518714 1426 ntTSL 5 BASIC29.64■■■□□ 2.34
FRMPD1Q5SYB0 CAMKK2-206ENST00000402834 2051 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC29.64■■■□□ 2.33
FRMPD1Q5SYB0 C14orf79-207ENST00000550614 1912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.63■■■□□ 2.33
FRMPD1Q5SYB0 KREMEN2-204ENST00000572045 2339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.63■■■□□ 2.33
FRMPD1Q5SYB0 EPHX3-204ENST00000602233 1805 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.63■■■□□ 2.33
FRMPD1Q5SYB0 AP2S1-202ENST00000352203 793 ntTSL 2 BASIC29.63■■■□□ 2.33
FRMPD1Q5SYB0 DBNDD2-202ENST00000360981 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.63■■■□□ 2.33
FRMPD1Q5SYB0 LAMTOR4-205ENST00000468582 621 ntTSL 2 BASIC29.63■■■□□ 2.33
FRMPD1Q5SYB0 GLRB-205ENST00000512619 728 ntTSL 3 BASIC29.63■■■□□ 2.33
FRMPD1Q5SYB0 AP2S1-204ENST00000597020 707 ntTSL 1 (best) BASIC29.63■■■□□ 2.33
FRMPD1Q5SYB0 GDI1-204ENST00000447750 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.63■■■□□ 2.33
FRMPD1Q5SYB0 MDFI-203ENST00000373051 1622 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.62■■■□□ 2.33
FRMPD1Q5SYB0 RNF39-201ENST00000244360 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.62■■■□□ 2.33
FRMPD1Q5SYB0 ZNF354A-201ENST00000335815 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.62■■■□□ 2.33
FRMPD1Q5SYB0 NAPA-210ENST00000595227 1460 ntTSL 3 BASIC29.62■■■□□ 2.33
FRMPD1Q5SYB0 CYB561D2-201ENST00000232508 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.62■■■□□ 2.33
FRMPD1Q5SYB0 SUMF2-203ENST00000395435 1287 ntTSL 2 BASIC29.62■■■□□ 2.33
FRMPD1Q5SYB0 AP000523.1-201ENST00000398242 1049 ntBASIC29.62■■■□□ 2.33
FRMPD1Q5SYB0 CYHR1-203ENST00000424149 1162 ntTSL 1 (best) BASIC29.62■■■□□ 2.33
FRMPD1Q5SYB0 SNHG15-203ENST00000578968 982 ntTSL 1 (best) BASIC29.62■■■□□ 2.33
FRMPD1Q5SYB0 BCL2L12-208ENST00000600947 633 ntTSL 1 (best) BASIC29.62■■■□□ 2.33
FRMPD1Q5SYB0 NOL12-207ENST00000611699 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.62■■■□□ 2.33
FRMPD1Q5SYB0 NCK2-201ENST00000233154 2683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.62■■■□□ 2.33
FRMPD1Q5SYB0 UBE2Q2-204ENST00000561851 1582 ntTSL 2 BASIC29.61■■■□□ 2.33
FRMPD1Q5SYB0 RFLNA-201ENST00000324038 2148 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC29.61■■■□□ 2.33
FRMPD1Q5SYB0 LGALS9C-209ENST00000581545 1378 ntTSL 5 BASIC29.61■■■□□ 2.33
FRMPD1Q5SYB0 MRPL20-201ENST00000344843 721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.61■■■□□ 2.33
FRMPD1Q5SYB0 RASGRP2-208ENST00000394428 444 ntTSL 2 BASIC29.61■■■□□ 2.33
FRMPD1Q5SYB0 LINC01237-203ENST00000430555 843 ntTSL 4 BASIC29.61■■■□□ 2.33
FRMPD1Q5SYB0 UNC93B7-201ENST00000509439 705 ntBASIC29.61■■■□□ 2.33
FRMPD1Q5SYB0 BARHL1-202ENST00000542090 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.61■■■□□ 2.33
FRMPD1Q5SYB0 METTL23-215ENST00000615984 1171 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.61■■■□□ 2.33
FRMPD1Q5SYB0 VLDLR-AS1-205ENST00000599229 1346 ntTSL 1 (best) BASIC29.61■■■□□ 2.33
FRMPD1Q5SYB0 SLC25A46-202ENST00000447245 1575 ntTSL 2 BASIC29.61■■■□□ 2.33
FRMPD1Q5SYB0 TMEM235-205ENST00000586400 2272 ntTSL 1 (best) BASIC29.61■■■□□ 2.33
FRMPD1Q5SYB0 RAB28-202ENST00000330852 1715 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.61■■■□□ 2.33
FRMPD1Q5SYB0 DONSON-210ENST00000453626 2332 ntTSL 5 BASIC29.61■■■□□ 2.33
FRMPD1Q5SYB0 CHRDL2-203ENST00000376332 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.6■■■□□ 2.33
FRMPD1Q5SYB0 MRPL54-201ENST00000330133 626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.6■■■□□ 2.33
FRMPD1Q5SYB0 YPEL3-204ENST00000563788 730 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC29.6■■■□□ 2.33
FRMPD1Q5SYB0 RNPS1-224ENST00000569598 918 ntTSL 5 BASIC29.6■■■□□ 2.33
FRMPD1Q5SYB0 IFNL4P1-201ENST00000607083 540 ntBASIC29.6■■■□□ 2.33
FRMPD1Q5SYB0 AC124016.1-202ENST00000609575 619 ntTSL 2 BASIC29.6■■■□□ 2.33
FRMPD1Q5SYB0 GPALPP1-207ENST00000611650 899 ntBASIC29.6■■■□□ 2.33
FRMPD1Q5SYB0 LINC01311-201ENST00000565162 1445 ntBASIC29.6■■■□□ 2.33
FRMPD1Q5SYB0 AC004870.1-201ENST00000315132 882 ntBASIC29.6■■■□□ 2.33
FRMPD1Q5SYB0 HEBP2-201ENST00000367697 844 ntTSL 2 BASIC29.6■■■□□ 2.33
FRMPD1Q5SYB0 DERL1-203ENST00000419562 918 ntTSL 2 BASIC29.6■■■□□ 2.33
FRMPD1Q5SYB0 BECN2-201ENST00000419583 1296 ntAPPRIS P1 BASIC29.6■■■□□ 2.33
FRMPD1Q5SYB0 AC068134.1-202ENST00000439072 356 ntTSL 5 BASIC29.6■■■□□ 2.33
FRMPD1Q5SYB0 MIR3180-1-201ENST00000580374 94 ntBASIC29.6■■■□□ 2.33
FRMPD1Q5SYB0 MIR3180-3-201ENST00000584616 94 ntBASIC29.6■■■□□ 2.33
FRMPD1Q5SYB0 ASAH1-251ENST00000637561 929 ntTSL 2 BASIC29.6■■■□□ 2.33
FRMPD1Q5SYB0 WDSUB1-203ENST00000392796 1812 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.6■■■□□ 2.33
FRMPD1Q5SYB0 ETS1-207ENST00000531611 2134 ntTSL 1 (best) BASIC29.59■■■□□ 2.33
FRMPD1Q5SYB0 DTX3-201ENST00000337737 2029 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC29.59■■■□□ 2.33
FRMPD1Q5SYB0 RASSF1-203ENST00000359365 1923 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.59■■■□□ 2.33
FRMPD1Q5SYB0 PLK5-202ENST00000454744 1930 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC29.59■■■□□ 2.33
FRMPD1Q5SYB0 KCNH1-214ENST00000640566 1365 ntTSL 1 (best) BASIC29.59■■■□□ 2.33
FRMPD1Q5SYB0 TMEM243-201ENST00000257637 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.59■■■□□ 2.33
FRMPD1Q5SYB0 NUBP2-201ENST00000262302 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.59■■■□□ 2.33
FRMPD1Q5SYB0 Telomerase-vert.1-201ENST00000363312 438 ntBASIC29.59■■■□□ 2.33
FRMPD1Q5SYB0 GNG5-202ENST00000370645 790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.59■■■□□ 2.33
FRMPD1Q5SYB0 C1orf52-203ENST00000471115 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.59■■■□□ 2.33
FRMPD1Q5SYB0 WIPI1-202ENST00000546360 1575 ntTSL 2 BASIC29.59■■■□□ 2.33
FRMPD1Q5SYB0 NTF4-201ENST00000593537 932 ntAPPRIS P1 BASIC29.59■■■□□ 2.33
FRMPD1Q5SYB0 PRKRA-203ENST00000432031 1344 ntTSL 1 (best) BASIC29.59■■■□□ 2.33
FRMPD1Q5SYB0 TPM4-201ENST00000300933 2666 ntTSL 1 (best) BASIC29.58■■■□□ 2.33
FRMPD1Q5SYB0 HDDC3-202ENST00000394272 1880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.58■■■□□ 2.33
FRMPD1Q5SYB0 TRAPPC3-202ENST00000373162 1056 ntTSL 2 BASIC29.58■■■□□ 2.33
FRMPD1Q5SYB0 AL022342.1-201ENST00000400363 863 ntBASIC29.58■■■□□ 2.33
FRMPD1Q5SYB0 SELENOH-204ENST00000534355 818 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.58■■■□□ 2.33
FRMPD1Q5SYB0 AC004771.4-201ENST00000576752 474 ntTSL 5 BASIC29.58■■■□□ 2.33
FRMPD1Q5SYB0 ST3GAL3-207ENST00000353126 1969 ntTSL 5 BASIC29.58■■■□□ 2.33
FRMPD1Q5SYB0 DBNL-210ENST00000448521 1808 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.58■■■□□ 2.33
FRMPD1Q5SYB0 ECEL1P1-201ENST00000373592 1742 ntBASIC29.58■■■□□ 2.33
FRMPD1Q5SYB0 SPHK1-201ENST00000323374 2138 ntTSL 1 (best) BASIC29.58■■■□□ 2.33
FRMPD1Q5SYB0 AC009078.2-202ENST00000463353 338 ntBASIC29.57■■■□□ 2.32
FRMPD1Q5SYB0 ZNF554-204ENST00000591265 1148 ntTSL 5 BASIC29.57■■■□□ 2.32
FRMPD1Q5SYB0 AL031008.1-201ENST00000619963 541 ntBASIC29.57■■■□□ 2.32
FRMPD1Q5SYB0 TREX2-206ENST00000370232 1864 ntTSL 1 (best) BASIC29.57■■■□□ 2.32
FRMPD1Q5SYB0 ARL2BP-201ENST00000219204 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.57■■■□□ 2.32
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.9 ms