Protein–RNA interactions for Protein: Q5SW96

LDLRAP1, Low density lipoprotein receptor adapter protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 308 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LDLRAP1Q5SW96 SEMA6B-202ENST00000586965 2034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
LDLRAP1Q5SW96 FAM212B-203ENST00000444059 1423 ntTSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
LDLRAP1Q5SW96 AC011511.1-201ENST00000452032 1956 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.57■□□□□ 0.72
LDLRAP1Q5SW96 DTX2-212ENST00000446820 1770 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
LDLRAP1Q5SW96 ASPG-201ENST00000546892 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
LDLRAP1Q5SW96 ZFP69-202ENST00000372706 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
LDLRAP1Q5SW96 TFP1-202ENST00000475455 1573 ntBASIC19.57■□□□□ 0.72
LDLRAP1Q5SW96 SCARF2-202ENST00000622235 3232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
LDLRAP1Q5SW96 SENP5-204ENST00000445299 2491 ntTSL 2 BASIC19.57■□□□□ 0.72
LDLRAP1Q5SW96 CPLX3-201ENST00000395018 2082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
LDLRAP1Q5SW96 PDZD3-201ENST00000322712 2204 ntTSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
LDLRAP1Q5SW96 LAYN-203ENST00000436913 2590 ntTSL 2 BASIC19.56■□□□□ 0.72
LDLRAP1Q5SW96 IRF7-201ENST00000330243 1992 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC19.56■□□□□ 0.72
LDLRAP1Q5SW96 ABHD14A-201ENST00000273596 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
LDLRAP1Q5SW96 PUSL1-201ENST00000379031 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
LDLRAP1Q5SW96 FLYWCH2-202ENST00000396958 1036 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
LDLRAP1Q5SW96 AC009052.1-201ENST00000567090 298 ntTSL 3 BASIC19.56■□□□□ 0.72
LDLRAP1Q5SW96 CD24-208ENST00000622315 825 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.56■□□□□ 0.72
LDLRAP1Q5SW96 MPV17L2-204ENST00000599612 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
LDLRAP1Q5SW96 RAB34-203ENST00000395243 1597 ntTSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
LDLRAP1Q5SW96 SMARCD1-201ENST00000381513 3237 ntTSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
LDLRAP1Q5SW96 AL390879.2-201ENST00000424306 2222 ntTSL 2 BASIC19.56■□□□□ 0.72
LDLRAP1Q5SW96 NR6A1-202ENST00000373584 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
LDLRAP1Q5SW96 TMPRSS5-212ENST00000545579 2163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
LDLRAP1Q5SW96 IRF7-205ENST00000397574 1968 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
LDLRAP1Q5SW96 R3HCC1-210ENST00000625275 1489 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
LDLRAP1Q5SW96 METRN-204ENST00000568223 3325 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
LDLRAP1Q5SW96 KLHL31-202ENST00000407079 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
LDLRAP1Q5SW96 BLCAP-208ENST00000414542 2205 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.55■□□□□ 0.72
LDLRAP1Q5SW96 DMPK-205ENST00000458663 2548 ntTSL 5 BASIC19.55■□□□□ 0.72
LDLRAP1Q5SW96 KRT83-201ENST00000293670 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
LDLRAP1Q5SW96 MCEMP1-201ENST00000333598 1730 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
LDLRAP1Q5SW96 IFI6-203ENST00000362020 828 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
LDLRAP1Q5SW96 MLST8-202ENST00000382450 1861 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC19.55■□□□□ 0.72
LDLRAP1Q5SW96 HOXB-AS3-204ENST00000466037 522 ntTSL 3 BASIC19.55■□□□□ 0.72
LDLRAP1Q5SW96 LIME1-205ENST00000480139 819 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC19.55■□□□□ 0.72
LDLRAP1Q5SW96 LEF1-AS1-203ENST00000507799 459 ntTSL 3 BASIC19.55■□□□□ 0.72
LDLRAP1Q5SW96 MARK2-208ENST00000508192 2924 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.55■□□□□ 0.72
LDLRAP1Q5SW96 BAALC-AS1-206ENST00000521383 736 ntTSL 3 BASIC19.55■□□□□ 0.72
LDLRAP1Q5SW96 JPT2-204ENST00000561516 1065 ntTSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
LDLRAP1Q5SW96 AC068987.1-201ENST00000562996 427 ntTSL 3 BASIC19.55■□□□□ 0.72
LDLRAP1Q5SW96 MLST8-215ENST00000564088 1861 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.55■□□□□ 0.72
LDLRAP1Q5SW96 CLN6-206ENST00000565471 1075 ntTSL 2 BASIC19.55■□□□□ 0.72
LDLRAP1Q5SW96 AC022211.2-202ENST00000582668 546 ntTSL 4 BASIC19.55■□□□□ 0.72
LDLRAP1Q5SW96 AC009237.14-201ENST00000609975 1594 ntBASIC19.55■□□□□ 0.72
LDLRAP1Q5SW96 POMGNT1-201ENST00000371984 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
LDLRAP1Q5SW96 GRINA-201ENST00000313269 1968 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.55■□□□□ 0.72
LDLRAP1Q5SW96 MAF1-201ENST00000322428 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
LDLRAP1Q5SW96 DLEU7-201ENST00000400393 2092 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
LDLRAP1Q5SW96 B3GAT3-202ENST00000531383 2056 ntTSL 2 BASIC19.55■□□□□ 0.72
LDLRAP1Q5SW96 BRPF3-202ENST00000357641 6052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
LDLRAP1Q5SW96 EIF4E3-201ENST00000295612 2764 ntTSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
LDLRAP1Q5SW96 SOCS2-201ENST00000340600 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
LDLRAP1Q5SW96 CLDN14-202ENST00000399135 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
LDLRAP1Q5SW96 FBXW8-201ENST00000309909 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
LDLRAP1Q5SW96 ANKRD16-203ENST00000380094 2738 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.54■□□□□ 0.72
LDLRAP1Q5SW96 RNF32-208ENST00000432459 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
LDLRAP1Q5SW96 FBXL17-205ENST00000542267 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
LDLRAP1Q5SW96 ZNF707-202ENST00000418203 2661 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.54■□□□□ 0.72
LDLRAP1Q5SW96 ADAP2-201ENST00000330889 2934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
LDLRAP1Q5SW96 SSR1-204ENST00000474597 1808 ntTSL 5 BASIC19.54■□□□□ 0.72
LDLRAP1Q5SW96 PRORSD1P-201ENST00000295112 541 ntBASIC19.54■□□□□ 0.72
LDLRAP1Q5SW96 HOTAIRM1-203ENST00000429611 722 ntTSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
LDLRAP1Q5SW96 ZNF436-AS1-202ENST00000437367 606 ntTSL 2 BASIC19.54■□□□□ 0.72
LDLRAP1Q5SW96 THAP6-213ENST00000514480 1161 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
LDLRAP1Q5SW96 AC069185.1-201ENST00000531395 811 ntTSL 3 BASIC19.54■□□□□ 0.72
LDLRAP1Q5SW96 B3GAT3-205ENST00000534026 1120 ntTSL 2 BASIC19.54■□□□□ 0.72
LDLRAP1Q5SW96 BCL2L10-202ENST00000561198 825 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
LDLRAP1Q5SW96 PRORSD1P-203ENST00000579162 626 ntTSL 5 BASIC19.54■□□□□ 0.72
LDLRAP1Q5SW96 ICAM2-207ENST00000579687 1154 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.54■□□□□ 0.72
LDLRAP1Q5SW96 FXYD1-204ENST00000588081 645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
LDLRAP1Q5SW96 TMEM191A-211ENST00000637163 1067 ntBASIC19.54■□□□□ 0.72
LDLRAP1Q5SW96 FGF16-201ENST00000439435 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
LDLRAP1Q5SW96 C17orf58-204ENST00000580729 2065 ntTSL 5 BASIC19.54■□□□□ 0.72
LDLRAP1Q5SW96 MAP7D2-203ENST00000443379 2476 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.54■□□□□ 0.72
LDLRAP1Q5SW96 PCBP3-203ENST00000400308 1911 ntTSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
LDLRAP1Q5SW96 RNASET2-214ENST00000620173 1391 ntTSL 5 BASIC19.54■□□□□ 0.72
LDLRAP1Q5SW96 HSPA8-202ENST00000453788 2004 ntTSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
LDLRAP1Q5SW96 LRP8-204ENST00000371454 3322 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
LDLRAP1Q5SW96 UBXN11-201ENST00000314675 2254 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.54■□□□□ 0.72
LDLRAP1Q5SW96 EPS8L2-230ENST00000610855 1633 ntTSL 5 BASIC19.54■□□□□ 0.72
LDLRAP1Q5SW96 MGAT5B-201ENST00000301618 4486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.54■□□□□ 0.72
LDLRAP1Q5SW96 MRPL23-AS1-201ENST00000419080 1876 ntTSL 3 BASIC19.54■□□□□ 0.72
LDLRAP1Q5SW96 TPBGL-201ENST00000562197 2793 ntAPPRIS P1 BASIC19.54■□□□□ 0.72
LDLRAP1Q5SW96 MRPL4-202ENST00000307422 1320 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.53■□□□□ 0.72
LDLRAP1Q5SW96 DHRS4-204ENST00000543741 1340 ntTSL 2 BASIC19.53■□□□□ 0.72
LDLRAP1Q5SW96 KCNQ5-201ENST00000342056 6688 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.53■□□□□ 0.72
LDLRAP1Q5SW96 NUTM2D-201ENST00000381697 3290 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
LDLRAP1Q5SW96 DVL1-204ENST00000610709 2268 ntTSL 2 BASIC19.53■□□□□ 0.72
LDLRAP1Q5SW96 TBX6-201ENST00000279386 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
LDLRAP1Q5SW96 TBX6-205ENST00000627355 1796 ntTSL 5 BASIC19.53■□□□□ 0.72
LDLRAP1Q5SW96 BSCL2-207ENST00000407022 1516 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
LDLRAP1Q5SW96 AC239809.2-201ENST00000415381 517 ntBASIC19.53■□□□□ 0.72
LDLRAP1Q5SW96 MAGI2-AS3-211ENST00000451809 707 ntTSL 3 BASIC19.53■□□□□ 0.72
LDLRAP1Q5SW96 AL162258.1-201ENST00000497086 753 ntTSL 2 BASIC19.53■□□□□ 0.72
LDLRAP1Q5SW96 AC035140.1-201ENST00000507957 493 ntTSL 3 BASIC19.53■□□□□ 0.72
LDLRAP1Q5SW96 EXOSC4-202ENST00000525936 606 ntTSL 3 BASIC19.53■□□□□ 0.72
LDLRAP1Q5SW96 GALNT16-204ENST00000553669 1629 ntTSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
LDLRAP1Q5SW96 NFKBIE-204ENST00000619360 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
LDLRAP1Q5SW96 SIMC1-203ENST00000429602 2694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.4 ms