Protein–RNA interactions for Protein: Q53FE4

C4orf17, Uncharacterized protein C4orf17, humanhuman

Predictions only

Length 359 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C4orf17Q53FE4 LINC00636-201ENST00000494231 1264 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
C4orf17Q53FE4 ABHD14B-208ENST00000525795 980 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.7■□□□□ 0.42
C4orf17Q53FE4 EGLN1P1-201ENST00000531623 762 ntBASIC17.7■□□□□ 0.42
C4orf17Q53FE4 GCHFR-205ENST00000559932 695 ntTSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
C4orf17Q53FE4 NDUFV2-AS1-203ENST00000608008 779 ntBASIC17.7■□□□□ 0.42
C4orf17Q53FE4 NSUN2-206ENST00000506139 2619 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
C4orf17Q53FE4 CACNA1B-204ENST00000371357 9642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
C4orf17Q53FE4 GOLGA2P6-201ENST00000340929 2049 ntBASIC17.7■□□□□ 0.42
C4orf17Q53FE4 SNX18-203ENST00000381410 5218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
C4orf17Q53FE4 DAZAP1-211ENST00000592522 2157 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
C4orf17Q53FE4 COMT-202ENST00000361682 2437 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
C4orf17Q53FE4 RNH1-222ENST00000533410 1829 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
C4orf17Q53FE4 H1FNT-201ENST00000335017 1300 ntAPPRIS P1 BASIC17.7■□□□□ 0.42
C4orf17Q53FE4 PATZ1-201ENST00000215919 2516 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
C4orf17Q53FE4 P4HTM-201ENST00000343546 2268 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
C4orf17Q53FE4 C2CD2-202ENST00000380486 6345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
C4orf17Q53FE4 MFSD10-211ENST00000514800 1776 ntTSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
C4orf17Q53FE4 MSL1-203ENST00000577454 2081 ntTSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
C4orf17Q53FE4 TMEM234-201ENST00000309777 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
C4orf17Q53FE4 MPG-203ENST00000397817 1039 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
C4orf17Q53FE4 AL031133.1-201ENST00000406807 723 ntBASIC17.69■□□□□ 0.42
C4orf17Q53FE4 COPS8-203ENST00000409334 794 ntTSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
C4orf17Q53FE4 SLC25A48-202ENST00000412661 1148 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
C4orf17Q53FE4 SLC25A48-204ENST00000433282 1111 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
C4orf17Q53FE4 AC128688.1-201ENST00000487626 519 ntBASIC17.69■□□□□ 0.42
C4orf17Q53FE4 MRPL2-208ENST00000489623 570 ntTSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
C4orf17Q53FE4 BAALC-AS1-207ENST00000522856 594 ntTSL 3 BASIC17.69■□□□□ 0.42
C4orf17Q53FE4 SLC39A2-203ENST00000554422 1259 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
C4orf17Q53FE4 GNB5-211ENST00000560116 918 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
C4orf17Q53FE4 AC026271.3-201ENST00000571884 352 ntBASIC17.69■□□□□ 0.42
C4orf17Q53FE4 AP005242.2-201ENST00000580065 1175 ntBASIC17.69■□□□□ 0.42
C4orf17Q53FE4 SMIM22-203ENST00000588500 525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
C4orf17Q53FE4 AL121832.1-201ENST00000615180 677 ntTSL 3 BASIC17.69■□□□□ 0.42
C4orf17Q53FE4 DISC1-205ENST00000366636 2224 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
C4orf17Q53FE4 ZDHHC8P1-201ENST00000255890 2382 ntTSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
C4orf17Q53FE4 LSR-203ENST00000360798 1963 ntTSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
C4orf17Q53FE4 NFS1-204ENST00000397425 1956 ntTSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
C4orf17Q53FE4 ADGRB1-201ENST00000323289 5527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
C4orf17Q53FE4 INPP4A-201ENST00000074304 6752 ntTSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
C4orf17Q53FE4 ASPHD1-201ENST00000308748 1584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
C4orf17Q53FE4 PPP5C-201ENST00000012443 2109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
C4orf17Q53FE4 TMEM235-205ENST00000586400 2272 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
C4orf17Q53FE4 AC073130.3-201ENST00000624389 2278 ntBASIC17.69■□□□□ 0.42
C4orf17Q53FE4 MCEMP1-201ENST00000333598 1730 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
C4orf17Q53FE4 SOCS2-210ENST00000551556 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
C4orf17Q53FE4 AATK-AS1-203ENST00000637878 1306 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
C4orf17Q53FE4 GOLGA4-208ENST00000444882 1451 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
C4orf17Q53FE4 FFAR1-201ENST00000246553 2311 ntAPPRIS P1 BASIC17.69■□□□□ 0.42
C4orf17Q53FE4 TMEM91-203ENST00000392002 1389 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
C4orf17Q53FE4 STAC-204ENST00000457375 1366 ntTSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
C4orf17Q53FE4 EXOC3L2-202ENST00000413988 2964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
C4orf17Q53FE4 PNCK-201ENST00000340888 1508 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
C4orf17Q53FE4 AC245041.2-204ENST00000610809 1962 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
C4orf17Q53FE4 AC092667.1-201ENST00000434301 2586 ntBASIC17.68■□□□□ 0.42
C4orf17Q53FE4 CTDP1-208ENST00000613122 5866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
C4orf17Q53FE4 EMC6-201ENST00000248378 653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
C4orf17Q53FE4 RFXAP-201ENST00000255476 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
C4orf17Q53FE4 TSPY14P-201ENST00000303979 915 ntBASIC17.68■□□□□ 0.42
C4orf17Q53FE4 INSL3-202ENST00000379695 899 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
C4orf17Q53FE4 SETD7-202ENST00000404104 1590 ntTSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
C4orf17Q53FE4 AL050404.1-201ENST00000424566 802 ntTSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
C4orf17Q53FE4 HMGB3P22-201ENST00000442010 597 ntTSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
C4orf17Q53FE4 AP006284.1-202ENST00000527113 527 ntTSL 4 BASIC17.68■□□□□ 0.42
C4orf17Q53FE4 AC008649.1-201ENST00000589557 516 ntTSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
C4orf17Q53FE4 MIR2861-201ENST00000636310 90 ntBASIC17.68■□□□□ 0.42
C4orf17Q53FE4 DR1-201ENST00000370267 1647 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
C4orf17Q53FE4 NEURL4-203ENST00000570460 4890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
C4orf17Q53FE4 TYMS-201ENST00000323224 1327 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
C4orf17Q53FE4 ULK2-202ENST00000395544 6010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
C4orf17Q53FE4 GPC1-202ENST00000420138 1835 ntTSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
C4orf17Q53FE4 PCGF3-208ENST00000470161 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
C4orf17Q53FE4 PANO1-201ENST00000620120 1680 ntAPPRIS P1 BASIC17.67■□□□□ 0.42
C4orf17Q53FE4 NOTUM-201ENST00000409678 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
C4orf17Q53FE4 LRRC23-207ENST00000433346 1387 ntTSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
C4orf17Q53FE4 WNT10A-201ENST00000258411 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
C4orf17Q53FE4 ENOSF1-201ENST00000251101 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
C4orf17Q53FE4 ADGRG2-210ENST00000379878 4803 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
C4orf17Q53FE4 NRSN1-204ENST00000378491 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
C4orf17Q53FE4 ZNF331-202ENST00000411977 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
C4orf17Q53FE4 SLC25A10-201ENST00000331531 1946 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
C4orf17Q53FE4 BCKDK-201ENST00000219794 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
C4orf17Q53FE4 BCL2L10-201ENST00000260442 1249 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
C4orf17Q53FE4 PDLIM4-202ENST00000379018 1006 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
C4orf17Q53FE4 HCG4P8-203ENST00000443049 980 ntBASIC17.67■□□□□ 0.42
C4orf17Q53FE4 WDR45-218ENST00000473974 1077 ntTSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
C4orf17Q53FE4 SYNGR4-202ENST00000595322 533 ntTSL 3 BASIC17.67■□□□□ 0.42
C4orf17Q53FE4 RPARP-AS1-206ENST00000596366 631 ntTSL 3 BASIC17.67■□□□□ 0.42
C4orf17Q53FE4 CLEC4GP1-201ENST00000596555 870 ntBASIC17.67■□□□□ 0.42
C4orf17Q53FE4 DGCR10-201ENST00000609839 495 ntBASIC17.67■□□□□ 0.42
C4orf17Q53FE4 ASAH1-251ENST00000637561 929 ntTSL 2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
C4orf17Q53FE4 UBE2K-201ENST00000261427 5245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
C4orf17Q53FE4 LINC02361-201ENST00000538731 1484 ntTSL 2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
C4orf17Q53FE4 FMR1-204ENST00000370471 4125 ntTSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
C4orf17Q53FE4 ACVR1C-201ENST00000243349 8994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
C4orf17Q53FE4 SPOP-206ENST00000504102 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
C4orf17Q53FE4 SRCIN1-213ENST00000617146 7058 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
C4orf17Q53FE4 IRX4-207ENST00000613726 2403 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
C4orf17Q53FE4 SUSD1-202ENST00000374263 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
C4orf17Q53FE4 ZDHHC5-201ENST00000287169 4666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
C4orf17Q53FE4 PHKA1-204ENST00000373545 6173 ntTSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.5 ms