Protein–RNA interactions for Protein: Q53EZ4

CEP55, Centrosomal protein of 55 kDa, humanhuman

Predictions only

Length 464 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CEP55Q53EZ4 PENK-204ENST00000518770 863 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
CEP55Q53EZ4 LINC02167-201ENST00000562769 594 ntTSL 3 BASIC22.21■■□□□ 1.15
CEP55Q53EZ4 PHOSPHO1-201ENST00000310544 1816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
CEP55Q53EZ4 AC112907.3-201ENST00000577781 2400 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
CEP55Q53EZ4 GIPR-202ENST00000304207 1432 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
CEP55Q53EZ4 LRRC42-203ENST00000371370 2037 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
CEP55Q53EZ4 RUVBL2-211ENST00000601968 1641 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.15
CEP55Q53EZ4 CPT2-203ENST00000635862 2319 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.15
CEP55Q53EZ4 LINC01123-202ENST00000419296 2436 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
CEP55Q53EZ4 PODNL1-203ENST00000538371 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
CEP55Q53EZ4 PRKG2-207ENST00000628926 2623 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
CEP55Q53EZ4 PCBP3-203ENST00000400308 1911 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
CEP55Q53EZ4 GTF2IRD2B-210ENST00000629105 1910 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
CEP55Q53EZ4 BEST4-201ENST00000372207 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
CEP55Q53EZ4 HAUS1-201ENST00000282058 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
CEP55Q53EZ4 NTAN1-201ENST00000287706 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
CEP55Q53EZ4 NIFKP9-201ENST00000419265 221 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
CEP55Q53EZ4 MFSD4A-206ENST00000489709 1136 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
CEP55Q53EZ4 HLX-AS1-201ENST00000552026 563 ntTSL 4 BASIC22.2■■□□□ 1.14
CEP55Q53EZ4 GRAP-204ENST00000573099 846 ntTSL 3 BASIC22.2■■□□□ 1.14
CEP55Q53EZ4 AC005943.1-201ENST00000585937 1002 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.2■■□□□ 1.14
CEP55Q53EZ4 PRKACA-209ENST00000590853 1101 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
CEP55Q53EZ4 CD177P1-201ENST00000606252 935 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
CEP55Q53EZ4 MAP2K2-202ENST00000394867 1471 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
CEP55Q53EZ4 MTMR14-201ENST00000296003 2494 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
CEP55Q53EZ4 RPUSD2-202ENST00000559271 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
CEP55Q53EZ4 SNX11-203ENST00000452859 1601 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
CEP55Q53EZ4 RDX-202ENST00000405097 2761 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
CEP55Q53EZ4 LINC00511-201ENST00000453722 1716 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
CEP55Q53EZ4 HMOX1-201ENST00000216117 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
CEP55Q53EZ4 KIRREL2-202ENST00000347900 2015 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
CEP55Q53EZ4 ZSCAN1-201ENST00000282326 2054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
CEP55Q53EZ4 STIM2-204ENST00000467087 5154 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
CEP55Q53EZ4 ATP6V0E1-204ENST00000519911 718 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
CEP55Q53EZ4 MIEF2-207ENST00000578621 540 ntTSL 4 BASIC22.19■■□□□ 1.14
CEP55Q53EZ4 RBP4-202ENST00000371467 1314 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
CEP55Q53EZ4 AUP1-201ENST00000377526 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
CEP55Q53EZ4 PYCR1-204ENST00000403172 1811 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
CEP55Q53EZ4 PPP5C-202ENST00000391919 1929 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
CEP55Q53EZ4 PARD3-207ENST00000374788 5996 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
CEP55Q53EZ4 MORF4L2-AS1-201ENST00000435306 2086 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
CEP55Q53EZ4 LINC01547-202ENST00000397841 2303 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
CEP55Q53EZ4 AOC1-202ENST00000416793 2453 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
CEP55Q53EZ4 MAP7D2-203ENST00000443379 2476 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
CEP55Q53EZ4 NPNT-204ENST00000453617 2419 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
CEP55Q53EZ4 ISLR2-202ENST00000419208 2306 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
CEP55Q53EZ4 TAF15-215ENST00000605844 2191 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
CEP55Q53EZ4 TOR1A-201ENST00000351698 2076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
CEP55Q53EZ4 CNR1-203ENST00000369501 6031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
CEP55Q53EZ4 TPST2-202ENST00000398110 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
CEP55Q53EZ4 SLC39A5-209ENST00000454355 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
CEP55Q53EZ4 TMEM109-202ENST00000536171 1959 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
CEP55Q53EZ4 LHX8-202ENST00000356261 1764 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
CEP55Q53EZ4 CEMP1-202ENST00000567119 1374 ntAPPRIS P2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
CEP55Q53EZ4 SRI-203ENST00000419179 1307 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
CEP55Q53EZ4 BIK-201ENST00000216115 953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
CEP55Q53EZ4 CCT7-202ENST00000398422 1234 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
CEP55Q53EZ4 FAM197Y1-201ENST00000421178 764 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
CEP55Q53EZ4 KSR1P1-201ENST00000446298 240 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
CEP55Q53EZ4 AL365295.1-202ENST00000456100 562 ntTSL 4 BASIC22.18■■□□□ 1.14
CEP55Q53EZ4 AC004080.6-201ENST00000467897 919 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
CEP55Q53EZ4 AF131216.3-201ENST00000525867 1099 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
CEP55Q53EZ4 FOSL1-204ENST00000532401 1132 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
CEP55Q53EZ4 MIR4785-201ENST00000585005 73 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
CEP55Q53EZ4 TNNT1-208ENST00000587465 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
CEP55Q53EZ4 PIGQ-206ENST00000422307 2052 ntTSL 3 BASIC22.18■■□□□ 1.14
CEP55Q53EZ4 PDLIM5-205ENST00000380180 2020 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
CEP55Q53EZ4 COL13A1-202ENST00000357811 2991 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
CEP55Q53EZ4 MOB3C-202ENST00000319928 2822 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
CEP55Q53EZ4 SLC25A27-202ENST00000411689 2526 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
CEP55Q53EZ4 COCH-201ENST00000216361 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
CEP55Q53EZ4 ITGA4-202ENST00000339307 1403 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
CEP55Q53EZ4 FEZF1-202ENST00000427185 1368 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
CEP55Q53EZ4 KRT17P2-201ENST00000300992 1314 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
CEP55Q53EZ4 TXNL1-211ENST00000590954 1339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
CEP55Q53EZ4 CLDND2-201ENST00000291715 974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
CEP55Q53EZ4 HDAC11-205ENST00000404548 577 ntTSL 4 BASIC22.17■■□□□ 1.14
CEP55Q53EZ4 CCK-203ENST00000434608 747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
CEP55Q53EZ4 DHDH-203ENST00000522614 776 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
CEP55Q53EZ4 ANAPC11-207ENST00000572639 578 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.17■■□□□ 1.14
CEP55Q53EZ4 NTAN1-211ENST00000622833 1049 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
CEP55Q53EZ4 NTAN1-212ENST00000624579 1115 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
CEP55Q53EZ4 SAXO1-202ENST00000380534 2099 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
CEP55Q53EZ4 MICU2-201ENST00000382374 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
CEP55Q53EZ4 SPATS2L-204ENST00000409140 2463 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
CEP55Q53EZ4 FAM189B-201ENST00000350210 2379 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
CEP55Q53EZ4 KCNMA1-209ENST00000372443 5059 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
CEP55Q53EZ4 FAM131C-201ENST00000375662 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
CEP55Q53EZ4 ABHD5-205ENST00000458276 1690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
CEP55Q53EZ4 TMEM250-205ENST00000561457 2804 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
CEP55Q53EZ4 PQLC2-201ENST00000375153 2153 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
CEP55Q53EZ4 DNAL4-201ENST00000216068 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
CEP55Q53EZ4 DLEU7-201ENST00000400393 2092 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
CEP55Q53EZ4 FAM99A-201ENST00000382167 1432 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
CEP55Q53EZ4 TWF2-203ENST00000499914 1440 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
CEP55Q53EZ4 HGH1-201ENST00000347708 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
CEP55Q53EZ4 TMEM44-204ENST00000392432 2490 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
CEP55Q53EZ4 RPS6KL1-216ENST00000557413 2425 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
CEP55Q53EZ4 ARFGAP3-201ENST00000263245 2857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
CEP55Q53EZ4 SAE1-203ENST00000413379 2313 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.5 ms