Protein–RNA interactions for Protein: Q53EU6

GPAT3, Glycerol-3-phosphate acyltransferase 3, humanhuman

Predictions only

Length 434 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GPAT3Q53EU6 METRN-204ENST00000568223 3325 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
GPAT3Q53EU6 B4GALT2-201ENST00000309519 2004 ntTSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
GPAT3Q53EU6 CSNK1D-203ENST00000392334 2047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
GPAT3Q53EU6 UCHL5-204ENST00000367451 1346 ntTSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
GPAT3Q53EU6 UBE2E3-201ENST00000392415 1347 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.45■□□□□ 0.54
GPAT3Q53EU6 SPEG-203ENST00000396688 1457 ntTSL 3 BASIC18.45■□□□□ 0.54
GPAT3Q53EU6 B4GALNT1-213ENST00000552350 1649 ntTSL 4 BASIC18.45■□□□□ 0.54
GPAT3Q53EU6 ACOT2-205ENST00000622407 1604 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
GPAT3Q53EU6 ZSCAN1-201ENST00000282326 2054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
GPAT3Q53EU6 FAM76B-204ENST00000536839 2546 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
GPAT3Q53EU6 UHRF1-203ENST00000615884 2651 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
GPAT3Q53EU6 RBL2-201ENST00000262133 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
GPAT3Q53EU6 SPHK2-211ENST00000600537 2136 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
GPAT3Q53EU6 DHRS7-201ENST00000216500 2322 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
GPAT3Q53EU6 AC120498.9-201ENST00000339021 3867 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
GPAT3Q53EU6 TINAGL1-201ENST00000271064 2187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
GPAT3Q53EU6 PRR14-202ENST00000300835 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
GPAT3Q53EU6 RCCD1-201ENST00000394258 2689 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
GPAT3Q53EU6 NTSR2-201ENST00000306928 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
GPAT3Q53EU6 ZNF324B-202ENST00000545523 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
GPAT3Q53EU6 SSH1-209ENST00000551165 2354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
GPAT3Q53EU6 MED26-207ENST00000611692 1444 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
GPAT3Q53EU6 SERPINH1P1-201ENST00000419794 1249 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
GPAT3Q53EU6 AL645608.9-201ENST00000442292 829 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
GPAT3Q53EU6 ALDH3A2-224ENST00000626500 995 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
GPAT3Q53EU6 TJP1-208ENST00000495972 2890 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
GPAT3Q53EU6 HIC1-201ENST00000322941 3053 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
GPAT3Q53EU6 STMN4-202ENST00000350889 2288 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
GPAT3Q53EU6 PADI2-201ENST00000375481 1607 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
GPAT3Q53EU6 SCO1-203ENST00000577427 1601 ntTSL 3 BASIC18.44■□□□□ 0.54
GPAT3Q53EU6 KLHDC9-201ENST00000368011 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
GPAT3Q53EU6 PRR16-201ENST00000379551 1826 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
GPAT3Q53EU6 LIMS2-207ENST00000409808 2315 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
GPAT3Q53EU6 MOB3C-202ENST00000319928 2822 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
GPAT3Q53EU6 ST3GAL3-219ENST00000372374 2170 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
GPAT3Q53EU6 FGFRL1-203ENST00000504138 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
GPAT3Q53EU6 TOR2A-203ENST00000373284 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
GPAT3Q53EU6 NETO1-207ENST00000583169 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
GPAT3Q53EU6 FAM57B-204ENST00000564806 1710 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
GPAT3Q53EU6 DLGAP4-206ENST00000475894 3110 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
GPAT3Q53EU6 AMDHD1-201ENST00000266736 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
GPAT3Q53EU6 RBM14-RBM4-201ENST00000412278 1566 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
GPAT3Q53EU6 AP001271.2-201ENST00000624018 1556 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
GPAT3Q53EU6 TSSC4-207ENST00000451491 1423 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
GPAT3Q53EU6 C5orf17-202ENST00000512559 1984 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
GPAT3Q53EU6 RUVBL2-211ENST00000601968 1641 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
GPAT3Q53EU6 CD47-202ENST00000361309 1285 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
GPAT3Q53EU6 ELOVL2-AS1-201ENST00000456190 737 ntTSL 3 BASIC18.43■□□□□ 0.54
GPAT3Q53EU6 DIMT1-202ENST00000506390 1208 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
GPAT3Q53EU6 PLK5-204ENST00000588430 900 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
GPAT3Q53EU6 ATRAID-208ENST00000611786 1256 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
GPAT3Q53EU6 CLN8-208ENST00000635751 1807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
GPAT3Q53EU6 AC093627.4-201ENST00000484550 5008 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
GPAT3Q53EU6 NKX6-1-201ENST00000295886 2628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
GPAT3Q53EU6 TOM1L2-210ENST00000542206 1320 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
GPAT3Q53EU6 SOCS2-210ENST00000551556 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
GPAT3Q53EU6 COL13A1-205ENST00000398978 3093 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
GPAT3Q53EU6 RAB5C-202ENST00000393860 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
GPAT3Q53EU6 SLC35E1-208ENST00000595753 5099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
GPAT3Q53EU6 RAB34-201ENST00000301043 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
GPAT3Q53EU6 FAM216A-201ENST00000377673 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
GPAT3Q53EU6 SDHA-201ENST00000264932 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
GPAT3Q53EU6 SPNS1-201ENST00000311008 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
GPAT3Q53EU6 OGG1-204ENST00000339511 1815 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
GPAT3Q53EU6 RNF8-204ENST00000469731 1800 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
GPAT3Q53EU6 WDR45-207ENST00000376372 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
GPAT3Q53EU6 PHGDH-210ENST00000641115 1638 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
GPAT3Q53EU6 AC044802.1-201ENST00000501143 2894 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
GPAT3Q53EU6 NEU4-201ENST00000325935 2288 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
GPAT3Q53EU6 PWWP2AP1-201ENST00000429776 2273 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
GPAT3Q53EU6 AC008073.3-201ENST00000610442 2281 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
GPAT3Q53EU6 LINC00471-201ENST00000313064 1282 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
GPAT3Q53EU6 LRR1-202ENST00000318317 957 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
GPAT3Q53EU6 AC006970.2-201ENST00000450065 779 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
GPAT3Q53EU6 ZNF467-202ENST00000484747 913 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
GPAT3Q53EU6 C12orf75-205ENST00000549893 719 ntTSL 3 BASIC18.42■□□□□ 0.54
GPAT3Q53EU6 CMTM3-201ENST00000361909 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
GPAT3Q53EU6 DPF1-203ENST00000414789 1960 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
GPAT3Q53EU6 KCNMA1-278ENST00000640141 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
GPAT3Q53EU6 LRRC42-203ENST00000371370 2037 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
GPAT3Q53EU6 HLX-201ENST00000366903 2280 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
GPAT3Q53EU6 FAM110A-204ENST00000381941 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
GPAT3Q53EU6 DOC2A-201ENST00000350119 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
GPAT3Q53EU6 NPAS1-207ENST00000602189 1643 ntTSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
GPAT3Q53EU6 EPS8L2-230ENST00000610855 1633 ntTSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
GPAT3Q53EU6 MAFG-AS1-201ENST00000582106 1895 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
GPAT3Q53EU6 CHRNA4-207ENST00000615287 5643 ntTSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
GPAT3Q53EU6 DBNDD2-203ENST00000372710 1417 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
GPAT3Q53EU6 QSOX2-201ENST00000358701 4530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
GPAT3Q53EU6 PRDM1-202ENST00000369091 2612 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
GPAT3Q53EU6 MOK-201ENST00000361847 1940 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
GPAT3Q53EU6 CBR1-205ENST00000530908 1924 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
GPAT3Q53EU6 ARNTL-203ENST00000403290 2746 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
GPAT3Q53EU6 LSR-214ENST00000621372 2274 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
GPAT3Q53EU6 WIPF1-205ENST00000409415 1772 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
GPAT3Q53EU6 TREX1-205ENST00000625293 1783 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
GPAT3Q53EU6 FNDC11-201ENST00000370097 1119 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
GPAT3Q53EU6 GPX1P1-201ENST00000388829 606 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
GPAT3Q53EU6 CROCCP5-201ENST00000436658 830 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
GPAT3Q53EU6 RRAS2-203ENST00000526063 970 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.6 ms