Protein–RNA interactions for Protein: Q4G0U5

CFAP221, Cilia- and flagella-associated protein 221, humanhuman

Predictions only

Length 840 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CFAP221Q4G0U5 UBE2Z-201ENST00000360943 3122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
CFAP221Q4G0U5 ITPKB-202ENST00000366784 3146 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
CFAP221Q4G0U5 DRD5-201ENST00000304374 2330 ntAPPRIS P1 BASIC21.4■■□□□ 1.02
CFAP221Q4G0U5 MAFF-202ENST00000407965 2325 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
CFAP221Q4G0U5 APAF1-210ENST00000551964 5444 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
CFAP221Q4G0U5 TOR2A-203ENST00000373284 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
CFAP221Q4G0U5 MOK-233ENST00000524214 1539 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
CFAP221Q4G0U5 LBX2-AS1-202ENST00000603175 2083 ntBASIC21.4■■□□□ 1.02
CFAP221Q4G0U5 ASMTL-206ENST00000534940 2048 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
CFAP221Q4G0U5 SLC1A7-201ENST00000371491 1306 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
CFAP221Q4G0U5 MARCH8-201ENST00000319836 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
CFAP221Q4G0U5 ATP6V0A2-201ENST00000330342 6542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
CFAP221Q4G0U5 C6orf48-205ENST00000375640 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
CFAP221Q4G0U5 RGCC-201ENST00000379359 960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
CFAP221Q4G0U5 MCRIP1-203ENST00000538396 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
CFAP221Q4G0U5 AC073912.1-201ENST00000546264 587 ntTSL 3 BASIC21.4■■□□□ 1.02
CFAP221Q4G0U5 RPL17-204ENST00000579248 790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
CFAP221Q4G0U5 MMD2-204ENST00000612910 778 ntTSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
CFAP221Q4G0U5 BRSK1-201ENST00000309383 3079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
CFAP221Q4G0U5 DOK7-206ENST00000515886 2263 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
CFAP221Q4G0U5 SH3BGRL3-201ENST00000270792 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
CFAP221Q4G0U5 RCCD1-201ENST00000394258 2689 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
CFAP221Q4G0U5 RAX-202ENST00000334889 3197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
CFAP221Q4G0U5 PCDHB12-203ENST00000624949 1963 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.02
CFAP221Q4G0U5 PPP1R36-201ENST00000298705 1405 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
CFAP221Q4G0U5 FLT1-207ENST00000615840 6453 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
CFAP221Q4G0U5 TSPAN14-203ENST00000372156 1380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.02
CFAP221Q4G0U5 C17orf62-204ENST00000437807 2242 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
CFAP221Q4G0U5 CDK13-207ENST00000613626 3099 ntTSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
CFAP221Q4G0U5 PPFIA1-201ENST00000253925 5234 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
CFAP221Q4G0U5 GCHFR-201ENST00000260447 777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
CFAP221Q4G0U5 PTPMT1-202ENST00000326674 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
CFAP221Q4G0U5 C15orf48-201ENST00000344300 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
CFAP221Q4G0U5 SLC12A4-202ENST00000422611 4670 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
CFAP221Q4G0U5 AC098590.1-201ENST00000468126 897 ntBASIC21.39■■□□□ 1.01
CFAP221Q4G0U5 COX6C-208ENST00000522940 694 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.39■■□□□ 1.01
CFAP221Q4G0U5 TPD52L1-207ENST00000527711 999 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
CFAP221Q4G0U5 EML2-AS1-202ENST00000591087 838 ntTSL 3 BASIC21.39■■□□□ 1.01
CFAP221Q4G0U5 AL158211.5-201ENST00000623583 2518 ntBASIC21.39■■□□□ 1.01
CFAP221Q4G0U5 B3GALNT1-212ENST00000488170 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
CFAP221Q4G0U5 KRT1-201ENST00000252244 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
CFAP221Q4G0U5 PCDHB11-202ENST00000624887 1973 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
CFAP221Q4G0U5 FBXO27-201ENST00000292853 2330 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
CFAP221Q4G0U5 IMPDH1-214ENST00000496200 2283 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
CFAP221Q4G0U5 BZW1-209ENST00000452790 1473 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
CFAP221Q4G0U5 TSSK6-201ENST00000585580 1467 ntAPPRIS P1 BASIC21.39■■□□□ 1.01
CFAP221Q4G0U5 NAE1-201ENST00000290810 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
CFAP221Q4G0U5 CRTC1-204ENST00000601916 1834 ntTSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
CFAP221Q4G0U5 NFE2L1-204ENST00000536222 2172 ntTSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
CFAP221Q4G0U5 ASB18-201ENST00000409749 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
CFAP221Q4G0U5 MAP2K5-203ENST00000354498 1783 ntTSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
CFAP221Q4G0U5 CLIP3-206ENST00000593074 2080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
CFAP221Q4G0U5 RIMBP3B-201ENST00000620804 6105 ntAPPRIS P1 BASIC21.38■■□□□ 1.01
CFAP221Q4G0U5 LCE2A-201ENST00000368779 592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
CFAP221Q4G0U5 AC226101.2-201ENST00000458252 747 ntTSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
CFAP221Q4G0U5 ZNF688-205ENST00000563707 244 ntTSL 3 BASIC21.38■■□□□ 1.01
CFAP221Q4G0U5 AC127496.6-201ENST00000576215 338 ntTSL 3 BASIC21.38■■□□□ 1.01
CFAP221Q4G0U5 NAT14-204ENST00000591590 1011 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
CFAP221Q4G0U5 KLF2-202ENST00000592003 564 ntTSL 3 BASIC21.38■■□□□ 1.01
CFAP221Q4G0U5 PTCRA-204ENST00000616441 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
CFAP221Q4G0U5 AURKA-202ENST00000347343 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
CFAP221Q4G0U5 TRAPPC12-202ENST00000382110 2483 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
CFAP221Q4G0U5 S1PR5-201ENST00000333430 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
CFAP221Q4G0U5 KLF2-201ENST00000248071 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
CFAP221Q4G0U5 DALRD3-205ENST00000440857 2014 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
CFAP221Q4G0U5 NSDHL-201ENST00000370274 1929 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
CFAP221Q4G0U5 CDC42EP1-201ENST00000249014 2181 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
CFAP221Q4G0U5 SUN1-220ENST00000457378 1309 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
CFAP221Q4G0U5 HOXB2-201ENST00000330070 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
CFAP221Q4G0U5 ZNF582-202ENST00000586929 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
CFAP221Q4G0U5 KMT5C-201ENST00000255613 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
CFAP221Q4G0U5 PMAIP1-201ENST00000269518 1262 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
CFAP221Q4G0U5 OGG1-209ENST00000383826 1069 ntTSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
CFAP221Q4G0U5 KRT17P3-201ENST00000420566 1262 ntBASIC21.37■■□□□ 1.01
CFAP221Q4G0U5 C14orf144-202ENST00000555282 854 ntTSL 3 BASIC21.37■■□□□ 1.01
CFAP221Q4G0U5 COX4I1-202ENST00000561569 716 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
CFAP221Q4G0U5 ANAPC11-223ENST00000612413 964 ntTSL 3 BASIC21.37■■□□□ 1.01
CFAP221Q4G0U5 MORN1-202ENST00000378529 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
CFAP221Q4G0U5 ENPP7-201ENST00000328313 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
CFAP221Q4G0U5 DDX59-201ENST00000331314 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
CFAP221Q4G0U5 FAM91A1-207ENST00000521166 2706 ntTSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
CFAP221Q4G0U5 FOXC2-201ENST00000320354 2478 ntAPPRIS P1 BASIC21.37■■□□□ 1.01
CFAP221Q4G0U5 INTS12-206ENST00000451321 1975 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
CFAP221Q4G0U5 ST3GAL5-202ENST00000377332 2165 ntTSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
CFAP221Q4G0U5 KCNK17-201ENST00000373231 1658 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
CFAP221Q4G0U5 ETV7-205ENST00000538992 1434 ntTSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
CFAP221Q4G0U5 TMCO3-201ENST00000375391 2132 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
CFAP221Q4G0U5 CLN8-208ENST00000635751 1807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
CFAP221Q4G0U5 CD2AP-201ENST00000359314 5412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
CFAP221Q4G0U5 MTMR14-201ENST00000296003 2494 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
CFAP221Q4G0U5 LINC00482-201ENST00000332012 2023 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
CFAP221Q4G0U5 WIPF1-205ENST00000409415 1772 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
CFAP221Q4G0U5 SCARB1-201ENST00000261693 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
CFAP221Q4G0U5 SNAP91-211ENST00000520213 2168 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
CFAP221Q4G0U5 ZDHHC16-202ENST00000352634 1718 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
CFAP221Q4G0U5 MATK-215ENST00000619596 1740 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
CFAP221Q4G0U5 BEST2-201ENST00000042931 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
CFAP221Q4G0U5 FBL-201ENST00000221801 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
CFAP221Q4G0U5 PRDX1-201ENST00000262746 1234 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
CFAP221Q4G0U5 CAVIN3-201ENST00000303927 1174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.1 ms