Protein–RNA interactions for Protein: Q3SY56

SP6, Transcription factor Sp6, humanhuman

Predictions only

Length 376 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SP6Q3SY56 ITGA6-201ENST00000264107 5618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
SP6Q3SY56 PLCL2-204ENST00000615277 4147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
SP6Q3SY56 LINC02228-203ENST00000641970 1355 ntBASIC16.29■□□□□ 0.2
SP6Q3SY56 OGG1-204ENST00000339511 1815 ntTSL 2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
SP6Q3SY56 CA11-201ENST00000084798 1844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
SP6Q3SY56 RBM24-202ENST00000379052 2703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
SP6Q3SY56 PGAP3-206ENST00000579146 2220 ntTSL 2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
SP6Q3SY56 YBX3-201ENST00000228251 1796 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
SP6Q3SY56 PMEPA1-202ENST00000341744 4845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
SP6Q3SY56 MSLN-202ENST00000545450 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
SP6Q3SY56 NDUFS3-201ENST00000263774 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
SP6Q3SY56 TCTA-201ENST00000273590 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
SP6Q3SY56 PGM5P4-201ENST00000421970 445 ntBASIC16.29■□□□□ 0.2
SP6Q3SY56 VMO1-204ENST00000441199 741 ntTSL 2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
SP6Q3SY56 TUSC2-201ENST00000232496 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
SP6Q3SY56 CHMP6-201ENST00000325167 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
SP6Q3SY56 PCCA-203ENST00000376286 2481 ntTSL 2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
SP6Q3SY56 EPS8L2-230ENST00000610855 1633 ntTSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
SP6Q3SY56 TLNRD1-201ENST00000267984 4845 ntAPPRIS P1 BASIC16.29■□□□□ 0.2
SP6Q3SY56 AUH-202ENST00000375731 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
SP6Q3SY56 SLC22A17-211ENST00000637426 1563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
SP6Q3SY56 CPSF3-201ENST00000238112 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
SP6Q3SY56 FAM83E-201ENST00000263266 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
SP6Q3SY56 TAB2-209ENST00000637181 4230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
SP6Q3SY56 GPR137-201ENST00000313074 1485 ntTSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
SP6Q3SY56 GPR137-203ENST00000411458 1495 ntTSL 2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
SP6Q3SY56 FAM124A-202ENST00000322475 4761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
SP6Q3SY56 ADORA1-202ENST00000337894 2919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
SP6Q3SY56 LINC01356-201ENST00000401018 1819 ntTSL 2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
SP6Q3SY56 AL691447.2-201ENST00000454869 2162 ntTSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
SP6Q3SY56 CXorf40A-204ENST00000423421 1403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
SP6Q3SY56 SMIM4-203ENST00000477703 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
SP6Q3SY56 ETV7-206ENST00000615781 1776 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
SP6Q3SY56 SLC22A23-203ENST00000406686 5658 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
SP6Q3SY56 EIF2B1-201ENST00000424014 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
SP6Q3SY56 PRMT5-204ENST00000397441 2418 ntTSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
SP6Q3SY56 TMSB4X-203ENST00000380636 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
SP6Q3SY56 AL645608.1-202ENST00000417705 1389 ntTSL 3 BASIC16.28■□□□□ 0.2
SP6Q3SY56 PKN1-201ENST00000242783 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
SP6Q3SY56 KRT18-207ENST00000550600 1696 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
SP6Q3SY56 TBC1D19-201ENST00000264866 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
SP6Q3SY56 UAP1-204ENST00000367926 2294 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
SP6Q3SY56 USP32-201ENST00000300896 5171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
SP6Q3SY56 PDP1-208ENST00000520728 2554 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
SP6Q3SY56 SLC7A10-201ENST00000253188 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
SP6Q3SY56 KRT81-201ENST00000327741 1929 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
SP6Q3SY56 RPL8-201ENST00000262584 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
SP6Q3SY56 C5orf38-201ENST00000334000 890 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
SP6Q3SY56 BCKDHB-203ENST00000369760 743 ntTSL 3 BASIC16.28■□□□□ 0.2
SP6Q3SY56 EIF6-203ENST00000374450 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
SP6Q3SY56 NMRAL1-202ENST00000404295 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
SP6Q3SY56 CDKN3-207ENST00000543789 610 ntTSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
SP6Q3SY56 AP005205.2-201ENST00000577327 491 ntTSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
SP6Q3SY56 TREX2-206ENST00000370232 1864 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
SP6Q3SY56 SLC25A39-212ENST00000590194 1542 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
SP6Q3SY56 MUTYH-203ENST00000372098 1839 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
SP6Q3SY56 MUTYH-204ENST00000372104 1823 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
SP6Q3SY56 MUTYH-205ENST00000372110 1809 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
SP6Q3SY56 P3H1-204ENST00000397054 2705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
SP6Q3SY56 AVPR1A-201ENST00000299178 5963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
SP6Q3SY56 OGFOD2-201ENST00000228922 1780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
SP6Q3SY56 AC087633.2-202ENST00000565166 1439 ntBASIC16.28■□□□□ 0.2
SP6Q3SY56 TTC34-201ENST00000401095 8814 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
SP6Q3SY56 SLC35E4-201ENST00000343605 2714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
SP6Q3SY56 LONP1-215ENST00000593119 2918 ntTSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.2
SP6Q3SY56 AC019069.1-201ENST00000610008 1333 ntBASIC16.27■□□□□ 0.2
SP6Q3SY56 URI1-202ENST00000392271 3444 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
SP6Q3SY56 GSTM3-202ENST00000361066 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
SP6Q3SY56 AP001626.1-201ENST00000424890 2854 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
SP6Q3SY56 EMX2-203ENST00000553456 2897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
SP6Q3SY56 MB21D2-201ENST00000392452 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
SP6Q3SY56 TMEM54-202ENST00000373463 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
SP6Q3SY56 ZNF292-204ENST00000392985 1096 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
SP6Q3SY56 AC097381.1-201ENST00000429019 1296 ntBASIC16.27■□□□□ 0.2
SP6Q3SY56 NALT1-201ENST00000429224 738 ntTSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
SP6Q3SY56 PAFAH1B2-205ENST00000529887 1056 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
SP6Q3SY56 TRAPPC2L-213ENST00000567895 854 ntTSL 3 BASIC16.27■□□□□ 0.2
SP6Q3SY56 ZNF534-201ENST00000301085 1525 ntTSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.2
SP6Q3SY56 RGS3-232ENST00000620489 1503 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
SP6Q3SY56 RNH1-202ENST00000356187 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
SP6Q3SY56 HLX-201ENST00000366903 2280 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
SP6Q3SY56 WNK2-202ENST00000395477 6834 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
SP6Q3SY56 MSL1-202ENST00000398532 4707 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
SP6Q3SY56 ADK-206ENST00000541550 2222 ntTSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.19
SP6Q3SY56 DCPS-201ENST00000263579 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
SP6Q3SY56 TM9SF1-203ENST00000524835 1938 ntTSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.19
SP6Q3SY56 PLCH2-205ENST00000449969 5450 ntTSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.19
SP6Q3SY56 GALK1-201ENST00000225614 1445 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.19
SP6Q3SY56 KRT8P17-201ENST00000453110 1448 ntBASIC16.27■□□□□ 0.19
SP6Q3SY56 WDR25-201ENST00000335290 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
SP6Q3SY56 PTBP1P-201ENST00000554374 1601 ntBASIC16.27■□□□□ 0.19
SP6Q3SY56 CLMP-201ENST00000448775 5072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
SP6Q3SY56 ADAP1-205ENST00000449296 2093 ntTSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
SP6Q3SY56 UBE2Q2-208ENST00000569423 2969 ntTSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
SP6Q3SY56 ZNF821-221ENST00000611294 1833 ntTSL 3 BASIC16.26■□□□□ 0.19
SP6Q3SY56 SLC9A6-201ENST00000370695 4725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
SP6Q3SY56 NOMO2-212ENST00000622306 4252 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
SP6Q3SY56 ETS1-208ENST00000535549 4594 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
SP6Q3SY56 ACYP2-201ENST00000303536 789 ntTSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
SP6Q3SY56 MAP1LC3A-202ENST00000374837 961 ntTSL 3 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 47.7 ms