Protein–RNA interactions for Protein: Q3BBV0

NBPF1, Neuroblastoma breakpoint family member 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,214 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NBPF1Q3BBV0 DECR2-212ENST00000627716 352 ntTSL 2 BASIC27.78■■■□□ 2.04
NBPF1Q3BBV0 AC097493.4-201ENST00000641197 219 ntBASIC27.78■■■□□ 2.04
NBPF1Q3BBV0 AL158151.1-201ENST00000372490 2047 ntTSL 2 BASIC27.78■■■□□ 2.04
NBPF1Q3BBV0 PLCD1-201ENST00000334661 2769 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
NBPF1Q3BBV0 MAPK15-201ENST00000338033 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
NBPF1Q3BBV0 WIPF2-202ENST00000394103 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.78■■■□□ 2.04
NBPF1Q3BBV0 PRRT4-207ENST00000535159 2897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.78■■■□□ 2.04
NBPF1Q3BBV0 KXD1-203ENST00000540691 1592 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.77■■■□□ 2.04
NBPF1Q3BBV0 EMC8-202ENST00000435200 1935 ntTSL 2 BASIC27.77■■■□□ 2.04
NBPF1Q3BBV0 FDXR-201ENST00000293195 1875 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
NBPF1Q3BBV0 MOB3C-202ENST00000319928 2822 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.77■■■□□ 2.04
NBPF1Q3BBV0 C7orf50-201ENST00000357429 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
NBPF1Q3BBV0 HYAL3-203ENST00000415204 959 ntTSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
NBPF1Q3BBV0 AL390955.1-201ENST00000428694 934 ntBASIC27.77■■■□□ 2.04
NBPF1Q3BBV0 MUC1-211ENST00000438413 927 ntTSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
NBPF1Q3BBV0 FAM181A-203ENST00000556222 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
NBPF1Q3BBV0 AQP4-AS1-204ENST00000582605 525 ntTSL 4 BASIC27.77■■■□□ 2.04
NBPF1Q3BBV0 C17orf62-230ENST00000583617 866 ntTSL 5 BASIC27.77■■■□□ 2.04
NBPF1Q3BBV0 PDCD5-207ENST00000590247 699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
NBPF1Q3BBV0 CLDND2-203ENST00000601435 575 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.77■■■□□ 2.04
NBPF1Q3BBV0 UBXN11-201ENST00000314675 2254 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.77■■■□□ 2.04
NBPF1Q3BBV0 MATN4-204ENST00000372756 2077 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
NBPF1Q3BBV0 NPIPA8-201ENST00000525596 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
NBPF1Q3BBV0 GABRA2-214ENST00000515082 2366 ntTSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
NBPF1Q3BBV0 LPAR2-203ENST00000586703 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.04
NBPF1Q3BBV0 SOCS2-207ENST00000549206 2072 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.76■■■□□ 2.03
NBPF1Q3BBV0 ANK1-206ENST00000348036 622 ntTSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
NBPF1Q3BBV0 RXFP4-201ENST00000368318 1240 ntAPPRIS P1 BASIC27.76■■■□□ 2.03
NBPF1Q3BBV0 AC117500.4-201ENST00000542797 617 ntTSL 3 BASIC27.76■■■□□ 2.03
NBPF1Q3BBV0 AL390879.2-201ENST00000424306 2222 ntTSL 2 BASIC27.76■■■□□ 2.03
NBPF1Q3BBV0 PIGQ-206ENST00000422307 2052 ntTSL 3 BASIC27.76■■■□□ 2.03
NBPF1Q3BBV0 RASD1-201ENST00000225688 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
NBPF1Q3BBV0 FGF17-201ENST00000359441 1714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
NBPF1Q3BBV0 AC007249.2-201ENST00000553181 1737 ntTSL 5 BASIC27.75■■■□□ 2.03
NBPF1Q3BBV0 SSH3-202ENST00000308298 2046 ntTSL 2 BASIC27.75■■■□□ 2.03
NBPF1Q3BBV0 BCKDK-202ENST00000287507 1907 ntTSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
NBPF1Q3BBV0 LGALS12-203ENST00000394618 1618 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
NBPF1Q3BBV0 AP001271.2-201ENST00000624018 1556 ntBASIC27.75■■■□□ 2.03
NBPF1Q3BBV0 MAP1LC3A-203ENST00000397709 698 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.75■■■□□ 2.03
NBPF1Q3BBV0 CACYBP-202ENST00000405362 1059 ntTSL 5 BASIC27.75■■■□□ 2.03
NBPF1Q3BBV0 KCNIP3-205ENST00000468529 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
NBPF1Q3BBV0 SMAD7-207ENST00000589634 1278 ntAPPRIS ALT1 TSL 4 BASIC27.75■■■□□ 2.03
NBPF1Q3BBV0 LINC01023-201ENST00000606054 436 ntBASIC27.75■■■□□ 2.03
NBPF1Q3BBV0 B4GALT1-202ENST00000535206 1535 ntTSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
NBPF1Q3BBV0 TOR1A-201ENST00000351698 2076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
NBPF1Q3BBV0 OPN3-201ENST00000366554 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
NBPF1Q3BBV0 SENP5-204ENST00000445299 2491 ntTSL 2 BASIC27.75■■■□□ 2.03
NBPF1Q3BBV0 ADD1-202ENST00000355842 4743 ntTSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
NBPF1Q3BBV0 CUTC-202ENST00000370476 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
NBPF1Q3BBV0 ZNF326-202ENST00000361911 1538 ntTSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
NBPF1Q3BBV0 AC243965.2-201ENST00000612576 2671 ntTSL 5 BASIC27.74■■■□□ 2.03
NBPF1Q3BBV0 MMP23A-201ENST00000234610 1017 ntBASIC27.74■■■□□ 2.03
NBPF1Q3BBV0 AC008040.2-201ENST00000461049 708 ntBASIC27.74■■■□□ 2.03
NBPF1Q3BBV0 CYB561-214ENST00000582034 1193 ntTSL 2 BASIC27.74■■■□□ 2.03
NBPF1Q3BBV0 FMR1-AS1_2.1-201ENST00000613724 127 ntBASIC27.74■■■□□ 2.03
NBPF1Q3BBV0 CYP2D8P-201ENST00000433633 1490 ntBASIC27.74■■■□□ 2.03
NBPF1Q3BBV0 AC092835.1-201ENST00000425953 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.74■■■□□ 2.03
NBPF1Q3BBV0 MORF4L2-AS1-201ENST00000435306 2086 ntTSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
NBPF1Q3BBV0 ERLEC1-202ENST00000378239 2271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
NBPF1Q3BBV0 NPNT-204ENST00000453617 2419 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC27.73■■■□□ 2.03
NBPF1Q3BBV0 CLDN14-202ENST00000399135 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
NBPF1Q3BBV0 SMIM3-201ENST00000526627 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
NBPF1Q3BBV0 MAN1B1-AS1-201ENST00000596585 1872 ntBASIC27.73■■■□□ 2.03
NBPF1Q3BBV0 DUSP15-209ENST00000486996 1651 ntTSL 2 BASIC27.73■■■□□ 2.03
NBPF1Q3BBV0 BCS1L-201ENST00000359273 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
NBPF1Q3BBV0 PLPP2-201ENST00000269812 1228 ntTSL 3 BASIC27.73■■■□□ 2.03
NBPF1Q3BBV0 KANK3-205ENST00000610351 1191 ntTSL 5 BASIC27.73■■■□□ 2.03
NBPF1Q3BBV0 SPINK2-206ENST00000618802 608 ntTSL 3 BASIC27.73■■■□□ 2.03
NBPF1Q3BBV0 KLF14-201ENST00000583337 2827 ntAPPRIS P1 BASIC27.73■■■□□ 2.03
NBPF1Q3BBV0 VSX1-202ENST00000376709 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
NBPF1Q3BBV0 CYP21A1P-201ENST00000342991 1971 ntTSL 3 BASIC27.73■■■□□ 2.03
NBPF1Q3BBV0 PRMT2-206ENST00000397638 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
NBPF1Q3BBV0 GLIPR2-203ENST00000396613 1917 ntTSL 4 BASIC27.73■■■□□ 2.03
NBPF1Q3BBV0 LRRC23-207ENST00000433346 1387 ntTSL 5 BASIC27.73■■■□□ 2.03
NBPF1Q3BBV0 HDGFL2-208ENST00000616600 2281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
NBPF1Q3BBV0 PTPN11-202ENST00000392597 1876 ntTSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
NBPF1Q3BBV0 LRRC42-203ENST00000371370 2037 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.72■■■□□ 2.03
NBPF1Q3BBV0 CDK5R2-201ENST00000302625 2508 ntAPPRIS P1 BASIC27.72■■■□□ 2.03
NBPF1Q3BBV0 STOML1-209ENST00000564777 1849 ntTSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
NBPF1Q3BBV0 DMKN-207ENST00000419602 1496 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
NBPF1Q3BBV0 CCDC124-201ENST00000445755 938 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.72■■■□□ 2.03
NBPF1Q3BBV0 NCAM1-AS1-201ENST00000526229 1081 ntTSL 2 BASIC27.72■■■□□ 2.03
NBPF1Q3BBV0 KDM2B-217ENST00000543852 1188 ntTSL 5 BASIC27.72■■■□□ 2.03
NBPF1Q3BBV0 CCDC124-203ENST00000597436 1055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
NBPF1Q3BBV0 ATG4B-226ENST00000625810 370 ntTSL 4 BASIC27.72■■■□□ 2.03
NBPF1Q3BBV0 MTMR9LP-204ENST00000441044 2624 ntTSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
NBPF1Q3BBV0 TRPV6-209ENST00000638686 2298 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
NBPF1Q3BBV0 KIAA0895L-206ENST00000563902 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
NBPF1Q3BBV0 RAB5A-201ENST00000273047 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
NBPF1Q3BBV0 TSPAN15-201ENST00000373290 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
NBPF1Q3BBV0 ICAM5-201ENST00000221980 3000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
NBPF1Q3BBV0 SUMO3-204ENST00000411651 1921 ntTSL 2 BASIC27.71■■■□□ 2.03
NBPF1Q3BBV0 MTMR14-201ENST00000296003 2494 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
NBPF1Q3BBV0 TP53RK-201ENST00000372102 2012 ntTSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
NBPF1Q3BBV0 MIR1238-201ENST00000408483 83 ntBASIC27.71■■■□□ 2.03
NBPF1Q3BBV0 RAMP1-204ENST00000409726 734 ntTSL 3 BASIC27.71■■■□□ 2.03
NBPF1Q3BBV0 B3GAT3P1-201ENST00000471720 806 ntBASIC27.71■■■□□ 2.03
NBPF1Q3BBV0 AMACR-206ENST00000502637 1598 ntTSL 5 BASIC27.71■■■□□ 2.03
NBPF1Q3BBV0 PDCD6-206ENST00000507528 1088 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
NBPF1Q3BBV0 DISC1-213ENST00000537876 2349 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.71■■■□□ 2.03
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.3 ms