Protein–RNA interactions for Protein: Q2TBA0

KLHL40, Kelch-like protein 40, humanhuman

Predictions only

Length 621 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KLHL40Q2TBA0 RRN3-205ENST00000563559 2128 ntTSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
KLHL40Q2TBA0 ARNT-212ENST00000515192 2892 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
KLHL40Q2TBA0 ZNF668-208ENST00000538906 2865 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
KLHL40Q2TBA0 FGF2-201ENST00000264498 6775 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
KLHL40Q2TBA0 PNPO-201ENST00000225573 2256 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
KLHL40Q2TBA0 POU3F2-201ENST00000328345 4879 ntAPPRIS P1 BASIC22.56■■□□□ 1.2
KLHL40Q2TBA0 HLX-201ENST00000366903 2280 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
KLHL40Q2TBA0 CRMP1-202ENST00000397890 2911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
KLHL40Q2TBA0 ZNF419-204ENST00000415379 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
KLHL40Q2TBA0 NAPSA-201ENST00000253719 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
KLHL40Q2TBA0 RBM7-201ENST00000375490 2064 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
KLHL40Q2TBA0 CDC42BPB-201ENST00000361246 6758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
KLHL40Q2TBA0 RNF139-201ENST00000303545 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
KLHL40Q2TBA0 CXorf40A-204ENST00000423421 1403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
KLHL40Q2TBA0 SLC47A1-202ENST00000395585 1998 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
KLHL40Q2TBA0 L2HGDH-203ENST00000421284 1958 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
KLHL40Q2TBA0 HERPUD2-202ENST00000396081 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
KLHL40Q2TBA0 ARL6IP4-204ENST00000392435 1339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
KLHL40Q2TBA0 MTSS1L-201ENST00000338779 4992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
KLHL40Q2TBA0 PJA1-202ENST00000374571 2672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
KLHL40Q2TBA0 AATF-208ENST00000619387 2141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
KLHL40Q2TBA0 DOK7-201ENST00000340083 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
KLHL40Q2TBA0 DOK7-203ENST00000507039 2551 ntTSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
KLHL40Q2TBA0 MARCH8-201ENST00000319836 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
KLHL40Q2TBA0 LMNB1-202ENST00000395354 1572 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
KLHL40Q2TBA0 PTTG1IP-204ENST00000445724 2497 ntTSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
KLHL40Q2TBA0 HSPA8-202ENST00000453788 2004 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
KLHL40Q2TBA0 FOXD4L6-201ENST00000622588 2034 ntAPPRIS P1 BASIC22.55■■□□□ 1.2
KLHL40Q2TBA0 TMC6-203ENST00000392467 2833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
KLHL40Q2TBA0 KDM5C-203ENST00000375383 5122 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
KLHL40Q2TBA0 PLCL1-201ENST00000428675 5125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
KLHL40Q2TBA0 NUP50-AS1-201ENST00000426282 2076 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
KLHL40Q2TBA0 ZDHHC16-205ENST00000370846 1280 ntTSL 3 BASIC22.55■■□□□ 1.2
KLHL40Q2TBA0 AC004882.1-201ENST00000416352 590 ntTSL 3 BASIC22.55■■□□□ 1.2
KLHL40Q2TBA0 FEZ1-205ENST00000524435 750 ntTSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
KLHL40Q2TBA0 HTATIP2-208ENST00000532505 595 ntTSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
KLHL40Q2TBA0 KRT18P20-201ENST00000548986 1279 ntBASIC22.55■■□□□ 1.2
KLHL40Q2TBA0 AP001160.3-201ENST00000601484 763 ntBASIC22.55■■□□□ 1.2
KLHL40Q2TBA0 AC005837.3-201ENST00000612163 286 ntBASIC22.55■■□□□ 1.2
KLHL40Q2TBA0 BICD1-207ENST00000551848 1962 ntBASIC22.55■■□□□ 1.2
KLHL40Q2TBA0 IFFO1-204ENST00000396840 2677 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
KLHL40Q2TBA0 RIN1-205ENST00000530056 2122 ntTSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
KLHL40Q2TBA0 C15orf56-202ENST00000623360 2129 ntTSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
KLHL40Q2TBA0 ADORA2A-213ENST00000610595 2736 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
KLHL40Q2TBA0 HNRNPLL-206ENST00000410076 1687 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
KLHL40Q2TBA0 FAM76A-205ENST00000419687 1661 ntTSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
KLHL40Q2TBA0 NOV-201ENST00000259526 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
KLHL40Q2TBA0 BRSK2-215ENST00000544817 1842 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
KLHL40Q2TBA0 MPST-205ENST00000404802 1453 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.54■■□□□ 1.2
KLHL40Q2TBA0 YPEL5-205ENST00000402708 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
KLHL40Q2TBA0 FAM187A-202ENST00000412523 1748 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
KLHL40Q2TBA0 CBSL-210ENST00000624934 1992 ntTSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
KLHL40Q2TBA0 UBE2QL1-201ENST00000399816 4317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
KLHL40Q2TBA0 ANKRD65-204ENST00000520296 1632 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
KLHL40Q2TBA0 SLC36A1-209ENST00000521925 1621 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
KLHL40Q2TBA0 ABCC6-209ENST00000640696 1893 ntTSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
KLHL40Q2TBA0 PRR5-201ENST00000006251 1767 ntTSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
KLHL40Q2TBA0 CDV3P1-201ENST00000471403 739 ntBASIC22.54■■□□□ 1.2
KLHL40Q2TBA0 FAM174B-207ENST00000555748 866 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.54■■□□□ 1.2
KLHL40Q2TBA0 GRAMD4P4-201ENST00000613563 1115 ntBASIC22.54■■□□□ 1.2
KLHL40Q2TBA0 SYNGR3-206ENST00000618464 1213 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
KLHL40Q2TBA0 AC068446.2-201ENST00000500487 2165 ntTSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
KLHL40Q2TBA0 PYCR1-216ENST00000619204 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
KLHL40Q2TBA0 SNX11-201ENST00000359238 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
KLHL40Q2TBA0 AC141586.3-201ENST00000562166 1838 ntBASIC22.54■■□□□ 1.2
KLHL40Q2TBA0 LINC00454-202ENST00000430978 1327 ntTSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
KLHL40Q2TBA0 CHST2-201ENST00000309575 4582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
KLHL40Q2TBA0 FBXL3-201ENST00000355619 3503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
KLHL40Q2TBA0 RASA4CP-201ENST00000424092 1398 ntBASIC22.53■■□□□ 1.2
KLHL40Q2TBA0 GPR35-204ENST00000430267 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
KLHL40Q2TBA0 LAD1-202ENST00000391967 2906 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
KLHL40Q2TBA0 CERKL-201ENST00000339098 1677 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
KLHL40Q2TBA0 ITPKB-203ENST00000429204 6162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
KLHL40Q2TBA0 AC062017.1-203ENST00000413029 455 ntTSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
KLHL40Q2TBA0 AC092468.1-201ENST00000491321 562 ntTSL 4 BASIC22.53■■□□□ 1.2
KLHL40Q2TBA0 AL031963.3-201ENST00000606441 850 ntBASIC22.53■■□□□ 1.2
KLHL40Q2TBA0 AC104187.1-201ENST00000607510 612 ntBASIC22.53■■□□□ 1.2
KLHL40Q2TBA0 DHPS-223ENST00000614126 1124 ntTSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
KLHL40Q2TBA0 GPRC5C-204ENST00000392629 1419 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
KLHL40Q2TBA0 NRM-203ENST00000376421 1734 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
KLHL40Q2TBA0 ASIC3-202ENST00000349064 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
KLHL40Q2TBA0 GCH1-207ENST00000622544 2923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
KLHL40Q2TBA0 SMARCC2-203ENST00000394023 4271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
KLHL40Q2TBA0 ZNF771-202ENST00000434417 1454 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
KLHL40Q2TBA0 ACVR1B-205ENST00000541224 1791 ntTSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
KLHL40Q2TBA0 AC022916.1-201ENST00000590478 2658 ntTSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
KLHL40Q2TBA0 FBLN1-201ENST00000262722 2251 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
KLHL40Q2TBA0 PLK3-201ENST00000372201 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
KLHL40Q2TBA0 AL354751.1-201ENST00000412768 1863 ntBASIC22.52■■□□□ 1.2
KLHL40Q2TBA0 ZNF419-207ENST00000442920 1857 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
KLHL40Q2TBA0 SEPT1-201ENST00000321367 1592 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
KLHL40Q2TBA0 COX5B-201ENST00000258424 712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
KLHL40Q2TBA0 FAM207A-201ENST00000291634 927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
KLHL40Q2TBA0 EBPL-204ENST00000378272 766 ntTSL 3 BASIC22.52■■□□□ 1.2
KLHL40Q2TBA0 CDC37L1-202ENST00000381858 1244 ntTSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
KLHL40Q2TBA0 HIGD1A-204ENST00000452906 585 ntTSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
KLHL40Q2TBA0 LINC02199-202ENST00000510067 1008 ntTSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
KLHL40Q2TBA0 RPL17-204ENST00000579248 790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
KLHL40Q2TBA0 SLC25A3-201ENST00000188376 1909 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
KLHL40Q2TBA0 EMILIN2-201ENST00000254528 5910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.8 ms