Protein–RNA interactions for Protein: Q2NKQ1

SGSM1, Small G protein signaling modulator 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,148 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SGSM1Q2NKQ1 CIRBP-215ENST00000588030 1509 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.16■□□□□ 0.98
SGSM1Q2NKQ1 RABEPK-204ENST00000394125 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
SGSM1Q2NKQ1 MTX1-201ENST00000316721 1441 ntTSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
SGSM1Q2NKQ1 FLYWCH2-202ENST00000396958 1036 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
SGSM1Q2NKQ1 SERTAD4-AS1-201ENST00000437764 726 ntTSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
SGSM1Q2NKQ1 AC068831.2-201ENST00000448987 367 ntTSL 2 BASIC21.16■□□□□ 0.98
SGSM1Q2NKQ1 BAALC-AS1-206ENST00000521383 736 ntTSL 3 BASIC21.16■□□□□ 0.98
SGSM1Q2NKQ1 BCL2L10-202ENST00000561198 825 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
SGSM1Q2NKQ1 CACNA1B-201ENST00000277549 7158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
SGSM1Q2NKQ1 CACNA1B-202ENST00000277551 7158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.16■□□□□ 0.98
SGSM1Q2NKQ1 GFI1-202ENST00000370332 2855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
SGSM1Q2NKQ1 FBXO27-201ENST00000292853 2330 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
SGSM1Q2NKQ1 TH-206ENST00000381178 1910 ntTSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
SGSM1Q2NKQ1 TMEM218-213ENST00000531909 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
SGSM1Q2NKQ1 RAB34-204ENST00000395245 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
SGSM1Q2NKQ1 PAIP1-203ENST00000436644 1734 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
SGSM1Q2NKQ1 SLC25A15-201ENST00000338625 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
SGSM1Q2NKQ1 ALDOA-221ENST00000566897 2448 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.15■□□□□ 0.98
SGSM1Q2NKQ1 CRTC1-203ENST00000594658 2384 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
SGSM1Q2NKQ1 RNASET2-214ENST00000620173 1391 ntTSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
SGSM1Q2NKQ1 MRPL4-202ENST00000307422 1320 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
SGSM1Q2NKQ1 CENPH-206ENST00000515001 1305 ntTSL 2 BASIC21.15■□□□□ 0.98
SGSM1Q2NKQ1 VMO1-201ENST00000328739 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
SGSM1Q2NKQ1 AC007405.3-201ENST00000429172 561 ntTSL 3 BASIC21.15■□□□□ 0.98
SGSM1Q2NKQ1 ZNF436-AS1-202ENST00000437367 606 ntTSL 2 BASIC21.15■□□□□ 0.98
SGSM1Q2NKQ1 HOXB-AS3-204ENST00000466037 522 ntTSL 3 BASIC21.15■□□□□ 0.98
SGSM1Q2NKQ1 JPT2-204ENST00000561516 1065 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
SGSM1Q2NKQ1 CLN6-206ENST00000565471 1075 ntTSL 2 BASIC21.15■□□□□ 0.98
SGSM1Q2NKQ1 Six3os1_6.1-201ENST00000620790 196 ntBASIC21.15■□□□□ 0.98
SGSM1Q2NKQ1 CD24-208ENST00000622315 825 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.15■□□□□ 0.98
SGSM1Q2NKQ1 TARDBP-228ENST00000629725 1031 ntTSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
SGSM1Q2NKQ1 AL023875.1-201ENST00000640777 796 ntBASIC21.15■□□□□ 0.98
SGSM1Q2NKQ1 APTR-204ENST00000440088 2029 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
SGSM1Q2NKQ1 SLC25A22-228ENST00000628067 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
SGSM1Q2NKQ1 KLHDC4-201ENST00000270583 1886 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
SGSM1Q2NKQ1 PML-204ENST00000359928 1726 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
SGSM1Q2NKQ1 KRT87P-201ENST00000529785 1700 ntTSL 2 BASIC21.15■□□□□ 0.98
SGSM1Q2NKQ1 LHX3-202ENST00000371748 2365 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
SGSM1Q2NKQ1 PLEKHH3-201ENST00000293349 2987 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
SGSM1Q2NKQ1 DPH1-201ENST00000263083 2221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
SGSM1Q2NKQ1 RPUSD2-202ENST00000559271 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.14■□□□□ 0.98
SGSM1Q2NKQ1 MSLN-205ENST00000563941 2109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
SGSM1Q2NKQ1 DGKZ-214ENST00000527911 3337 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
SGSM1Q2NKQ1 ZSCAN1-201ENST00000282326 2054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.14■□□□□ 0.98
SGSM1Q2NKQ1 SARDH-201ENST00000298628 1484 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
SGSM1Q2NKQ1 HEMK1-206ENST00000455834 1499 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.98
SGSM1Q2NKQ1 CCAR2-214ENST00000613179 1421 ntTSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.98
SGSM1Q2NKQ1 GDAP1L1-202ENST00000372952 722 ntTSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.97
SGSM1Q2NKQ1 RNF135-204ENST00000443677 1261 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
SGSM1Q2NKQ1 LY6E-205ENST00000519611 635 ntTSL 3 BASIC21.14■□□□□ 0.97
SGSM1Q2NKQ1 LY6E-212ENST00000522024 868 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.97
SGSM1Q2NKQ1 B3GAT3-205ENST00000534026 1120 ntTSL 2 BASIC21.14■□□□□ 0.97
SGSM1Q2NKQ1 IRGQ-205ENST00000602269 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
SGSM1Q2NKQ1 DUT-201ENST00000331200 2147 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
SGSM1Q2NKQ1 KANK4-202ENST00000354381 2103 ntTSL 2 BASIC21.14■□□□□ 0.97
SGSM1Q2NKQ1 EPS8L1-201ENST00000201647 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
SGSM1Q2NKQ1 PPP1R3F-201ENST00000055335 3421 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.14■□□□□ 0.97
SGSM1Q2NKQ1 KLC1-208ENST00000452929 2453 ntTSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.97
SGSM1Q2NKQ1 TTBK1-202ENST00000304139 2449 ntTSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.97
SGSM1Q2NKQ1 SBK1-201ENST00000341901 4992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
SGSM1Q2NKQ1 UAP1-201ENST00000271469 2377 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.97
SGSM1Q2NKQ1 AGER-207ENST00000375076 1492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
SGSM1Q2NKQ1 SMOC2-206ENST00000535039 1875 ntTSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
SGSM1Q2NKQ1 NDOR1-204ENST00000458322 1829 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
SGSM1Q2NKQ1 DHRS4-204ENST00000543741 1340 ntTSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
SGSM1Q2NKQ1 FAM131C-201ENST00000375662 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
SGSM1Q2NKQ1 COX7A2L-201ENST00000234301 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
SGSM1Q2NKQ1 FITM1-201ENST00000267426 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
SGSM1Q2NKQ1 PRSS57-201ENST00000329267 1025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
SGSM1Q2NKQ1 YBX1P10-201ENST00000444752 975 ntBASIC21.13■□□□□ 0.97
SGSM1Q2NKQ1 CAPN5-206ENST00000531028 534 ntTSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
SGSM1Q2NKQ1 OPA3-203ENST00000544371 1146 ntTSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
SGSM1Q2NKQ1 PRSS57-202ENST00000613411 1090 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
SGSM1Q2NKQ1 SAAL1-204ENST00000529318 1503 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
SGSM1Q2NKQ1 MTMR12-203ENST00000382142 5187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
SGSM1Q2NKQ1 FAM110A-204ENST00000381941 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
SGSM1Q2NKQ1 ARHGAP5-203ENST00000396582 5786 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
SGSM1Q2NKQ1 NBPF21P-201ENST00000425093 1451 ntBASIC21.13■□□□□ 0.97
SGSM1Q2NKQ1 CELF6-205ENST00000567083 1496 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
SGSM1Q2NKQ1 KRT18-202ENST00000388837 1420 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
SGSM1Q2NKQ1 ZNF692-202ENST00000366471 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
SGSM1Q2NKQ1 GOLGA6L3-201ENST00000507199 1679 ntBASIC21.12■□□□□ 0.97
SGSM1Q2NKQ1 DVL3-203ENST00000431765 2294 ntTSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
SGSM1Q2NKQ1 NARS2-201ENST00000281038 2519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
SGSM1Q2NKQ1 FAM83A-205ENST00000522648 1604 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
SGSM1Q2NKQ1 TRIM73-202ENST00000430211 1321 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
SGSM1Q2NKQ1 KLC1-219ENST00000555836 2467 ntTSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
SGSM1Q2NKQ1 CCM2-202ENST00000381112 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
SGSM1Q2NKQ1 PRORSD1P-201ENST00000295112 541 ntBASIC21.12■□□□□ 0.97
SGSM1Q2NKQ1 ANG-201ENST00000336811 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
SGSM1Q2NKQ1 ISG20-202ENST00000379224 540 ntTSL 3 BASIC21.12■□□□□ 0.97
SGSM1Q2NKQ1 AC239809.2-201ENST00000415381 517 ntBASIC21.12■□□□□ 0.97
SGSM1Q2NKQ1 HOTAIRM1-203ENST00000429611 722 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
SGSM1Q2NKQ1 AC133681.1-201ENST00000465482 601 ntBASIC21.12■□□□□ 0.97
SGSM1Q2NKQ1 F2R-202ENST00000505600 442 ntTSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
SGSM1Q2NKQ1 NOXO1-205ENST00000566005 1144 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
SGSM1Q2NKQ1 PRORSD1P-203ENST00000579162 626 ntTSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
SGSM1Q2NKQ1 ICAM2-207ENST00000579687 1154 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.12■□□□□ 0.97
SGSM1Q2NKQ1 TMEM191B-203ENST00000613597 366 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
SGSM1Q2NKQ1 RELT-202ENST00000393580 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 64.8 ms