Protein–RNA interactions for Protein: Q2M1V0

ISX, Intestine-specific homeobox, humanhuman

Predictions only

Length 245 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ISXQ2M1V0 SMTNL2-202ENST00000389313 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
ISXQ2M1V0 ABLIM2-204ENST00000407564 2291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
ISXQ2M1V0 AC010616.1-201ENST00000597630 2078 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.86■□□□□ 0.61
ISXQ2M1V0 FOXD4L3-201ENST00000342833 2039 ntAPPRIS P1 BASIC18.86■□□□□ 0.61
ISXQ2M1V0 LINC01521-201ENST00000504184 1943 ntBASIC18.86■□□□□ 0.61
ISXQ2M1V0 ST3GAL4-204ENST00000444328 1812 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.86■□□□□ 0.61
ISXQ2M1V0 KLHDC4-204ENST00000353170 1663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
ISXQ2M1V0 TFP1-202ENST00000475455 1573 ntBASIC18.86■□□□□ 0.61
ISXQ2M1V0 AP001922.1-201ENST00000499390 1504 ntTSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
ISXQ2M1V0 PSMD8-210ENST00000620216 1538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
ISXQ2M1V0 HEMK1-206ENST00000455834 1499 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.86■□□□□ 0.61
ISXQ2M1V0 TMEM234-201ENST00000309777 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
ISXQ2M1V0 DUSP23-203ENST00000368109 729 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.86■□□□□ 0.61
ISXQ2M1V0 TSPO2-202ENST00000373161 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
ISXQ2M1V0 SNCB-202ENST00000393693 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
ISXQ2M1V0 SLC25A48-202ENST00000412661 1148 ntTSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
ISXQ2M1V0 AC004980.1-204ENST00000429707 299 ntBASIC18.86■□□□□ 0.61
ISXQ2M1V0 SLC25A48-204ENST00000433282 1111 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.86■□□□□ 0.61
ISXQ2M1V0 YBX1P10-201ENST00000444752 975 ntBASIC18.86■□□□□ 0.61
ISXQ2M1V0 TSPO2-203ENST00000470917 699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
ISXQ2M1V0 REPIN1-210ENST00000482680 1029 ntTSL 2 BASIC18.86■□□□□ 0.61
ISXQ2M1V0 AC012213.1-202ENST00000523422 449 ntTSL 3 BASIC18.86■□□□□ 0.61
ISXQ2M1V0 AP002807.1-202ENST00000526897 791 ntTSL 2 BASIC18.86■□□□□ 0.61
ISXQ2M1V0 LTBR-211ENST00000543190 785 ntTSL 3 BASIC18.86■□□□□ 0.61
ISXQ2M1V0 AC131212.4-201ENST00000623606 975 ntBASIC18.86■□□□□ 0.61
ISXQ2M1V0 CPNE7-202ENST00000319518 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
ISXQ2M1V0 COCH-201ENST00000216361 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
ISXQ2M1V0 ITGBL1-206ENST00000618057 2368 ntTSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
ISXQ2M1V0 TNIP1-205ENST00000518977 2200 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
ISXQ2M1V0 ACTR8-202ENST00000482349 2091 ntTSL 2 BASIC18.86■□□□□ 0.61
ISXQ2M1V0 PAQR6-215ENST00000623241 1961 ntTSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
ISXQ2M1V0 FDFT1-210ENST00000525954 1890 ntTSL 2 BASIC18.86■□□□□ 0.61
ISXQ2M1V0 NYAP1-202ENST00000454988 2777 ntTSL 5 BASIC18.86■□□□□ 0.61
ISXQ2M1V0 CREB3-201ENST00000353704 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
ISXQ2M1V0 ETV7-206ENST00000615781 1776 ntTSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
ISXQ2M1V0 PAQR4-201ENST00000293978 2644 ntTSL 2 BASIC18.86■□□□□ 0.61
ISXQ2M1V0 RNH1-203ENST00000397604 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
ISXQ2M1V0 DAZAP2-201ENST00000412716 2598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
ISXQ2M1V0 COMT-202ENST00000361682 2437 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
ISXQ2M1V0 SLC22A17-202ENST00000354772 2238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
ISXQ2M1V0 MAFF-204ENST00000426621 2216 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC18.85■□□□□ 0.61
ISXQ2M1V0 PRSS50-202ENST00000315170 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
ISXQ2M1V0 TXNRD3-204ENST00000640433 1932 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
ISXQ2M1V0 INSIG1-202ENST00000342407 1127 ntTSL 2 BASIC18.85■□□□□ 0.61
ISXQ2M1V0 ST8SIA1-202ENST00000381424 1036 ntTSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
ISXQ2M1V0 PHYHD1-207ENST00000421063 1182 ntTSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
ISXQ2M1V0 BX890604.1-205ENST00000425492 856 ntTSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
ISXQ2M1V0 NCF1B-202ENST00000432102 930 ntTSL 2 BASIC18.85■□□□□ 0.61
ISXQ2M1V0 KRT18P16-201ENST00000510337 1294 ntBASIC18.85■□□□□ 0.61
ISXQ2M1V0 LY6E-211ENST00000521699 1256 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.85■□□□□ 0.61
ISXQ2M1V0 AMN1-211ENST00000541931 880 ntTSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
ISXQ2M1V0 VEGFA-204ENST00000372064 2909 ntTSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
ISXQ2M1V0 SLC1A5-203ENST00000542575 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
ISXQ2M1V0 GLG1-214ENST00000627032 2147 ntTSL 5 BASIC18.85■□□□□ 0.61
ISXQ2M1V0 SLC25A15-201ENST00000338625 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
ISXQ2M1V0 HS2ST1-202ENST00000370551 1585 ntTSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
ISXQ2M1V0 CAMKK2-206ENST00000402834 2051 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
ISXQ2M1V0 HSPB2-C11orf52-202ENST00000534100 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.84■□□□□ 0.61
ISXQ2M1V0 PLK5-205ENST00000642079 1969 ntBASIC18.84■□□□□ 0.61
ISXQ2M1V0 AC091230.1-202ENST00000564823 5356 ntTSL 2 BASIC18.84■□□□□ 0.61
ISXQ2M1V0 WHAMM-201ENST00000286760 5101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
ISXQ2M1V0 EDA-208ENST00000524573 1381 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
ISXQ2M1V0 LHX8-202ENST00000356261 1764 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
ISXQ2M1V0 NAT6-201ENST00000354862 1330 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
ISXQ2M1V0 GPR6-201ENST00000275169 1089 ntAPPRIS P1 BASIC18.84■□□□□ 0.61
ISXQ2M1V0 LRRC23-202ENST00000323702 1208 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
ISXQ2M1V0 TPPP3-202ENST00000393957 1058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
ISXQ2M1V0 ZFP69B-202ENST00000411995 2109 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.84■□□□□ 0.61
ISXQ2M1V0 AL513320.1-201ENST00000435049 622 ntTSL 3 BASIC18.84■□□□□ 0.61
ISXQ2M1V0 TUBB8P6-201ENST00000436895 1288 ntBASIC18.84■□□□□ 0.61
ISXQ2M1V0 CENPX-206ENST00000580435 710 ntTSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
ISXQ2M1V0 VRK2-207ENST00000440705 1676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
ISXQ2M1V0 GALNT16-204ENST00000553669 1629 ntTSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
ISXQ2M1V0 POLR1D-203ENST00000399697 2036 ntTSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
ISXQ2M1V0 USP39-203ENST00000409470 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
ISXQ2M1V0 RHOA-202ENST00000418115 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
ISXQ2M1V0 HDAC11-211ENST00000433119 2043 ntTSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
ISXQ2M1V0 ERF-202ENST00000440177 2032 ntTSL 2 BASIC18.84■□□□□ 0.61
ISXQ2M1V0 NKX3-2-201ENST00000382438 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
ISXQ2M1V0 DRD2-202ENST00000362072 2789 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
ISXQ2M1V0 KIRREL2-201ENST00000262625 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
ISXQ2M1V0 SAAL1-202ENST00000524803 1582 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
ISXQ2M1V0 ART5-203ENST00000397068 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
ISXQ2M1V0 IMMP2L-202ENST00000405709 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
ISXQ2M1V0 MRPL23-AS1-201ENST00000419080 1876 ntTSL 3 BASIC18.84■□□□□ 0.61
ISXQ2M1V0 WNT10B-202ENST00000403957 1817 ntTSL 5 BASIC18.84■□□□□ 0.61
ISXQ2M1V0 GIPR-202ENST00000304207 1432 ntTSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
ISXQ2M1V0 EPHX4-201ENST00000370383 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
ISXQ2M1V0 AOC1-202ENST00000416793 2453 ntTSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
ISXQ2M1V0 ANKRD28-201ENST00000399451 6564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
ISXQ2M1V0 LRR1-201ENST00000298288 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
ISXQ2M1V0 FAM213A-202ENST00000372185 1723 ntTSL 2 BASIC18.83■□□□□ 0.61
ISXQ2M1V0 CABLES1-201ENST00000256925 5002 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
ISXQ2M1V0 NEUROG1-201ENST00000314744 1668 ntAPPRIS P1 BASIC18.83■□□□□ 0.61
ISXQ2M1V0 NT5C1A-201ENST00000235628 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
ISXQ2M1V0 COX7A1-201ENST00000292907 762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
ISXQ2M1V0 C1orf50-201ENST00000372525 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
ISXQ2M1V0 LRRC75A-AS1-205ENST00000475953 1201 ntTSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
ISXQ2M1V0 AC106791.1-202ENST00000508281 1148 ntTSL 2 BASIC18.83■□□□□ 0.6
ISXQ2M1V0 RAP1B-229ENST00000543393 874 ntTSL 3 BASIC18.83■□□□□ 0.6
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.4 ms