Protein–RNA interactions for Protein: Q1ED39

KNOP1, Lysine-rich nucleolar protein 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 458 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KNOP1Q1ED39 MAGIX-206ENST00000615626 1057 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
KNOP1Q1ED39 AL121829.2-201ENST00000620908 328 ntBASIC21.6■■□□□ 1.05
KNOP1Q1ED39 ETV7-205ENST00000538992 1434 ntTSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
KNOP1Q1ED39 MICU2-201ENST00000382374 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
KNOP1Q1ED39 HAND2-AS1-237ENST00000616485 2420 ntTSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
KNOP1Q1ED39 TSPAN3-210ENST00000561277 1592 ntTSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
KNOP1Q1ED39 PTGER2-201ENST00000245457 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
KNOP1Q1ED39 LPAR2-202ENST00000542587 2546 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
KNOP1Q1ED39 CCDC47-202ENST00000403162 2195 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
KNOP1Q1ED39 ATP9A-202ENST00000338821 8106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
KNOP1Q1ED39 ZNF331-214ENST00000511154 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
KNOP1Q1ED39 AMDHD1-201ENST00000266736 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
KNOP1Q1ED39 GORASP1-220ENST00000479927 1345 ntTSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
KNOP1Q1ED39 CENPH-206ENST00000515001 1305 ntTSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
KNOP1Q1ED39 JMJD4-202ENST00000438896 2502 ntTSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
KNOP1Q1ED39 ZNF580-201ENST00000325333 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
KNOP1Q1ED39 RDH13-203ENST00000415061 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
KNOP1Q1ED39 TDRP-203ENST00000523656 2622 ntTSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
KNOP1Q1ED39 ZNF580-203ENST00000545125 1025 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.59■■□□□ 1.05
KNOP1Q1ED39 CES1P1-204ENST00000574030 877 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
KNOP1Q1ED39 CDC42BPB-201ENST00000361246 6758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
KNOP1Q1ED39 CRTAC1-203ENST00000370597 2890 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
KNOP1Q1ED39 TBC1D10A-204ENST00000403477 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
KNOP1Q1ED39 PUF60-202ENST00000349157 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
KNOP1Q1ED39 PTAR1-205ENST00000472967 1689 ntTSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
KNOP1Q1ED39 ACD-214ENST00000620338 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
KNOP1Q1ED39 FBXL19-207ENST00000565690 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.05
KNOP1Q1ED39 NEU4-205ENST00000407683 2273 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.05
KNOP1Q1ED39 ZNF12-201ENST00000342651 2921 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.05
KNOP1Q1ED39 C10orf91-201ENST00000321248 1257 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
KNOP1Q1ED39 C6orf48-205ENST00000375640 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
KNOP1Q1ED39 AP003097.1-201ENST00000530657 1135 ntBASIC21.58■■□□□ 1.05
KNOP1Q1ED39 PNN-205ENST00000556530 601 ntTSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.05
KNOP1Q1ED39 ZNF264-205ENST00000599653 705 ntTSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.05
KNOP1Q1ED39 NCBP2-AS2-201ENST00000602845 918 ntAPPRIS P1 BASIC21.58■■□□□ 1.05
KNOP1Q1ED39 AC005225.2-202ENST00000617980 408 ntTSL 4 BASIC21.58■■□□□ 1.05
KNOP1Q1ED39 GNB1-201ENST00000378609 3132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
KNOP1Q1ED39 SLC52A2-209ENST00000530047 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.04
KNOP1Q1ED39 CSNK1D-203ENST00000392334 2047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
KNOP1Q1ED39 NETO1-207ENST00000583169 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
KNOP1Q1ED39 MAP3K15-201ENST00000338883 4012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.04
KNOP1Q1ED39 ZNF302-215ENST00000627982 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.04
KNOP1Q1ED39 BCAT2-208ENST00000598162 1329 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
KNOP1Q1ED39 TMEM218-213ENST00000531909 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
KNOP1Q1ED39 FENDRR-203ENST00000595886 3095 ntTSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
KNOP1Q1ED39 KRT18-207ENST00000550600 1696 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
KNOP1Q1ED39 MPV17L2-204ENST00000599612 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
KNOP1Q1ED39 PELI3-202ENST00000349459 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
KNOP1Q1ED39 THTPA-202ENST00000404535 1779 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
KNOP1Q1ED39 KLC2-204ENST00000394067 2898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
KNOP1Q1ED39 EEF1D-246ENST00000532741 2387 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
KNOP1Q1ED39 CEACAM3-201ENST00000344550 1022 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
KNOP1Q1ED39 H3F3A-204ENST00000366816 799 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.57■■□□□ 1.04
KNOP1Q1ED39 NREP-209ENST00000455559 698 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC21.57■■□□□ 1.04
KNOP1Q1ED39 LEF1-AS1-203ENST00000507799 459 ntTSL 3 BASIC21.57■■□□□ 1.04
KNOP1Q1ED39 EPHA5-AS1-202ENST00000509473 1177 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
KNOP1Q1ED39 SCARA5-203ENST00000518030 1074 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
KNOP1Q1ED39 MAZ-215ENST00000569978 567 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
KNOP1Q1ED39 AC127496.6-201ENST00000576215 338 ntTSL 3 BASIC21.57■■□□□ 1.04
KNOP1Q1ED39 C17orf50-201ENST00000603305 569 ntTSL 3 BASIC21.57■■□□□ 1.04
KNOP1Q1ED39 C17orf50-203ENST00000605587 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
KNOP1Q1ED39 INTS11-250ENST00000620829 1862 ntTSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
KNOP1Q1ED39 PRPS1-203ENST00000372428 1748 ntTSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
KNOP1Q1ED39 TCF7-201ENST00000342854 3045 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
KNOP1Q1ED39 ATOH8-201ENST00000306279 2438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
KNOP1Q1ED39 FAM3A-215ENST00000447601 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
KNOP1Q1ED39 ADAP1-216ENST00000539900 2178 ntTSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
KNOP1Q1ED39 FAM76B-204ENST00000536839 2546 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
KNOP1Q1ED39 CTBP2-205ENST00000411419 2036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
KNOP1Q1ED39 HCK-207ENST00000520553 2101 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
KNOP1Q1ED39 HAUS4-204ENST00000490506 1447 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
KNOP1Q1ED39 CCAR2-214ENST00000613179 1421 ntTSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
KNOP1Q1ED39 MED25-201ENST00000312865 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
KNOP1Q1ED39 AP006587.1-201ENST00000534129 1502 ntBASIC21.56■■□□□ 1.04
KNOP1Q1ED39 MAGED2-203ENST00000375053 2066 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
KNOP1Q1ED39 MAGI2-AS3-202ENST00000422093 762 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
KNOP1Q1ED39 LY6E-202ENST00000429120 1173 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
KNOP1Q1ED39 HIGD1A-204ENST00000452906 585 ntTSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
KNOP1Q1ED39 AC226101.2-201ENST00000458252 747 ntTSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
KNOP1Q1ED39 AC026366.1-201ENST00000488803 879 ntBASIC21.56■■□□□ 1.04
KNOP1Q1ED39 SPI1-204ENST00000533968 1290 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
KNOP1Q1ED39 AC007786.1-201ENST00000587859 709 ntTSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
KNOP1Q1ED39 PSMC3IP-208ENST00000590760 664 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
KNOP1Q1ED39 TBCB-214ENST00000629269 413 ntTSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
KNOP1Q1ED39 ZNF324B-202ENST00000545523 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
KNOP1Q1ED39 SP9-201ENST00000394967 2554 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
KNOP1Q1ED39 RABEPK-204ENST00000394125 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
KNOP1Q1ED39 HEMK1-206ENST00000455834 1499 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
KNOP1Q1ED39 C19orf25-206ENST00000588849 1472 ntTSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
KNOP1Q1ED39 CHAC1-205ENST00000617961 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
KNOP1Q1ED39 NLRP6-201ENST00000312165 2679 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
KNOP1Q1ED39 SLC25A15-201ENST00000338625 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
KNOP1Q1ED39 NKX2-1-202ENST00000498187 2338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
KNOP1Q1ED39 DBN1-210ENST00000512501 1878 ntTSL 3 BASIC21.56■■□□□ 1.04
KNOP1Q1ED39 FAM129C-208ENST00000599164 2073 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
KNOP1Q1ED39 AC005906.2-203ENST00000640962 2091 ntTSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
KNOP1Q1ED39 TNFSF11-203ENST00000398795 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
KNOP1Q1ED39 C19orf84-202ENST00000574814 1318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
KNOP1Q1ED39 NTMT1-210ENST00000613644 1501 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.55■■□□□ 1.04
KNOP1Q1ED39 BICRA-204ENST00000614245 5697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
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