Protein–RNA interactions for Protein: Q16873

LTC4S, Leukotriene C4 synthase, humanhuman

Predictions only

Length 150 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LTC4SQ16873 CD37-204ENST00000535669 1674 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
LTC4SQ16873 AC011511.1-201ENST00000452032 1956 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
LTC4SQ16873 EML2-220ENST00000589876 2364 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
LTC4SQ16873 LRP4-201ENST00000378623 8076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
LTC4SQ16873 FBXO27-201ENST00000292853 2330 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
LTC4SQ16873 C2orf54-201ENST00000307486 2017 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
LTC4SQ16873 OGG1-217ENST00000449570 1948 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
LTC4SQ16873 DND1-201ENST00000542735 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
LTC4SQ16873 AC044802.1-201ENST00000501143 2894 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
LTC4SQ16873 PDE3B-201ENST00000282096 6076 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
LTC4SQ16873 KCNC2-204ENST00000540018 2168 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
LTC4SQ16873 TOR1A-201ENST00000351698 2076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
LTC4SQ16873 CAMKK2-206ENST00000402834 2051 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
LTC4SQ16873 HHIPL1-201ENST00000330710 7390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
LTC4SQ16873 SPOCK3-215ENST00000510741 1963 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
LTC4SQ16873 AC092835.1-201ENST00000425953 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
LTC4SQ16873 SMYD2-201ENST00000366957 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
LTC4SQ16873 FLCN-203ENST00000389169 1692 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
LTC4SQ16873 DISC1-202ENST00000317586 2636 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
LTC4SQ16873 DLK1-202ENST00000341267 4722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
LTC4SQ16873 SERPINB6-204ENST00000380529 1370 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
LTC4SQ16873 RAMP2-201ENST00000253796 780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
LTC4SQ16873 COA6-202ENST00000366613 641 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
LTC4SQ16873 TK2-208ENST00000545043 1120 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
LTC4SQ16873 PLEKHJ1-205ENST00000587394 937 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
LTC4SQ16873 IL17RC-203ENST00000403601 2388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
LTC4SQ16873 HLX-201ENST00000366903 2280 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
LTC4SQ16873 PADI2-201ENST00000375481 1607 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
LTC4SQ16873 CPAMD8-203ENST00000443236 5992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
LTC4SQ16873 PDE4DIP-214ENST00000479408 2746 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
LTC4SQ16873 ITGB5-201ENST00000296181 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
LTC4SQ16873 SPESP1-201ENST00000310673 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
LTC4SQ16873 MTAP-204ENST00000460874 1434 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
LTC4SQ16873 ARNTL2-204ENST00000395901 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
LTC4SQ16873 RASGRP2-211ENST00000394432 2304 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
LTC4SQ16873 SPAG9-202ENST00000357122 4761 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
LTC4SQ16873 FBXL7-202ENST00000504595 4562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
LTC4SQ16873 CACNA1B-204ENST00000371357 9642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
LTC4SQ16873 SDK1-202ENST00000404826 10397 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
LTC4SQ16873 EOMES-202ENST00000449599 2829 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
LTC4SQ16873 AGFG1-201ENST00000310078 8668 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
LTC4SQ16873 DTD1-201ENST00000377452 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
LTC4SQ16873 HSD11B1L-204ENST00000411793 1362 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
LTC4SQ16873 SOCS2-210ENST00000551556 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
LTC4SQ16873 SOCS2-201ENST00000340600 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
LTC4SQ16873 NFS1-201ENST00000306750 738 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
LTC4SQ16873 CNIH4-203ENST00000366858 702 ntTSL 3 BASIC16.43■□□□□ 0.22
LTC4SQ16873 SPATA25-201ENST00000372519 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
LTC4SQ16873 DUSP5P2-201ENST00000426873 1033 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
LTC4SQ16873 GATA3-AS1-204ENST00000438755 675 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
LTC4SQ16873 LINC01962-201ENST00000513771 411 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
LTC4SQ16873 SCO2-203ENST00000535425 1002 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
LTC4SQ16873 GNAO1-211ENST00000570235 568 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
LTC4SQ16873 TNNI3-207ENST00000588882 669 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
LTC4SQ16873 AC027307.1-201ENST00000590252 457 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
LTC4SQ16873 ISCA1-203ENST00000375991 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
LTC4SQ16873 CYB561-213ENST00000581573 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
LTC4SQ16873 UHRF1-203ENST00000615884 2651 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
LTC4SQ16873 RNF32-208ENST00000432459 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
LTC4SQ16873 IGFALS-201ENST00000215539 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
LTC4SQ16873 SEPT8-201ENST00000296873 4394 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
LTC4SQ16873 ANKRD2-202ENST00000307518 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
LTC4SQ16873 FAM170B-201ENST00000311787 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
LTC4SQ16873 TNFRSF25-203ENST00000351959 1441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
LTC4SQ16873 EPS8L1-203ENST00000540810 2360 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
LTC4SQ16873 MRC2-201ENST00000303375 5988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
LTC4SQ16873 BIN2-210ENST00000615107 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
LTC4SQ16873 ITPKB-202ENST00000366784 3146 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
LTC4SQ16873 MBD1-216ENST00000587605 1945 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
LTC4SQ16873 WDR37-203ENST00000381329 1307 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
LTC4SQ16873 AC125437.2-201ENST00000625180 2167 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
LTC4SQ16873 ASPHD1-201ENST00000308748 1584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
LTC4SQ16873 ETV2-202ENST00000379026 1571 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
LTC4SQ16873 NDOR1-204ENST00000458322 1829 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
LTC4SQ16873 GABRD-201ENST00000378585 1961 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
LTC4SQ16873 SLC9A6-201ENST00000370695 4725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
LTC4SQ16873 KLHL2-201ENST00000226725 3134 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
LTC4SQ16873 FAM76B-204ENST00000536839 2546 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
LTC4SQ16873 SOWAHC-201ENST00000356454 4657 ntAPPRIS P1 BASIC16.42■□□□□ 0.22
LTC4SQ16873 MSANTD1-203ENST00000507492 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
LTC4SQ16873 ETV7-206ENST00000615781 1776 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
LTC4SQ16873 RCCD1-201ENST00000394258 2689 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
LTC4SQ16873 XBP1-202ENST00000344347 1131 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
LTC4SQ16873 CSF1-205ENST00000420111 1083 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
LTC4SQ16873 MAP2K4P1-201ENST00000438453 1195 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
LTC4SQ16873 CAMTA1-216ENST00000557126 486 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
LTC4SQ16873 AC091138.1-202ENST00000578967 457 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
LTC4SQ16873 ATRAID-208ENST00000611786 1256 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
LTC4SQ16873 CORO1B-202ENST00000393893 1931 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
LTC4SQ16873 KRT16P3-203ENST00000580621 1939 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
LTC4SQ16873 TRABD2A-201ENST00000335459 1844 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
LTC4SQ16873 CBLC-201ENST00000270279 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
LTC4SQ16873 TOM1L2-210ENST00000542206 1320 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
LTC4SQ16873 ZNF692-202ENST00000366471 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
LTC4SQ16873 JMJD4-202ENST00000438896 2502 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
LTC4SQ16873 DVL1-204ENST00000610709 2268 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
LTC4SQ16873 PARP2-202ENST00000429687 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
LTC4SQ16873 FOXC2-201ENST00000320354 2478 ntAPPRIS P1 BASIC16.41■□□□□ 0.22
LTC4SQ16873 AC107959.1-202ENST00000502083 1945 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
LTC4SQ16873 ZSCAN1-201ENST00000282326 2054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.6 ms