Protein–RNA interactions for Protein: Q16798

ME3, NADP-dependent malic enzyme, mitochondrial, humanhuman

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Length 604 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ME3Q16798 EIF2B1-201ENST00000424014 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
ME3Q16798 PTGES2-AS1-201ENST00000443493 2100 ntBASIC23.06■■□□□ 1.28
ME3Q16798 PLD4-204ENST00000540372 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
ME3Q16798 SLC39A4-201ENST00000276833 2297 ntTSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
ME3Q16798 ZNF582-207ENST00000619584 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
ME3Q16798 ZFYVE9-201ENST00000287727 5194 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
ME3Q16798 FAM239A-202ENST00000438107 2155 ntTSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
ME3Q16798 AC129492.1-201ENST00000399413 1804 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
ME3Q16798 CAMKK1-202ENST00000348335 3563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
ME3Q16798 STXBP6-203ENST00000419632 1970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
ME3Q16798 ACOT4-201ENST00000326303 2362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
ME3Q16798 UBE2Z-201ENST00000360943 3122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
ME3Q16798 ALDOA-212ENST00000564546 2104 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
ME3Q16798 PAFAH1B2-202ENST00000419197 2517 ntTSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
ME3Q16798 MIXL1-201ENST00000366810 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
ME3Q16798 LCE2A-201ENST00000368779 592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
ME3Q16798 PACRGL-206ENST00000502374 1034 ntTSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
ME3Q16798 ZNF302-209ENST00000507959 854 ntTSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
ME3Q16798 SNHG6-203ENST00000520944 638 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
ME3Q16798 AC090527.2-201ENST00000564080 1060 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.05■■□□□ 1.28
ME3Q16798 AC007216.1-201ENST00000570197 601 ntTSL 4 BASIC23.05■■□□□ 1.28
ME3Q16798 VIM-AS1-202ENST00000605833 918 ntTSL 3 BASIC23.05■■□□□ 1.28
ME3Q16798 AC083880.1-201ENST00000608266 535 ntBASIC23.05■■□□□ 1.28
ME3Q16798 CD24-202ENST00000610952 802 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
ME3Q16798 TM9SF1-203ENST00000524835 1938 ntTSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
ME3Q16798 BIRC2-206ENST00000530675 1927 ntTSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
ME3Q16798 ADORA2A-201ENST00000337539 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
ME3Q16798 PCDHA4-201ENST00000378125 2328 ntTSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
ME3Q16798 AC074212.1-201ENST00000559756 1402 ntTSL 3 BASIC23.05■■□□□ 1.28
ME3Q16798 MED15P9-202ENST00000427638 1841 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
ME3Q16798 ERMP1-202ENST00000339450 5376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
ME3Q16798 GPR146-201ENST00000397095 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
ME3Q16798 GFI1-201ENST00000294702 2784 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
ME3Q16798 KCNC3-203ENST00000477616 3176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
ME3Q16798 MXD3-202ENST00000427908 2269 ntTSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
ME3Q16798 DBN1-210ENST00000512501 1878 ntTSL 3 BASIC23.05■■□□□ 1.28
ME3Q16798 MTX1-202ENST00000368376 1632 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
ME3Q16798 KRT78-201ENST00000304620 1778 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
ME3Q16798 SMIM4-203ENST00000477703 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
ME3Q16798 TMEM91-203ENST00000392002 1389 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
ME3Q16798 PIK3R1-201ENST00000320694 2625 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
ME3Q16798 DDR1-228ENST00000376575 732 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
ME3Q16798 HAGLR-207ENST00000452365 661 ntTSL 4 BASIC23.04■■□□□ 1.28
ME3Q16798 AC092171.1-201ENST00000455866 753 ntTSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
ME3Q16798 SLC29A4P2-201ENST00000504749 1089 ntBASIC23.04■■□□□ 1.28
ME3Q16798 CTBP1-AS2-203ENST00000507044 739 ntTSL 3 BASIC23.04■■□□□ 1.28
ME3Q16798 CKLF-CMTM1-204ENST00000532838 587 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC23.04■■□□□ 1.28
ME3Q16798 PFKL-212ENST00000628044 129 ntTSL 3 BASIC23.04■■□□□ 1.28
ME3Q16798 MRPL2-202ENST00000388752 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
ME3Q16798 ZFP69-202ENST00000372706 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
ME3Q16798 TJP1-208ENST00000495972 2890 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
ME3Q16798 EFCAB11-202ENST00000538485 1870 ntTSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
ME3Q16798 PIGQ-204ENST00000409527 1915 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
ME3Q16798 MAF1-201ENST00000322428 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
ME3Q16798 PFKFB3-204ENST00000379785 2181 ntTSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
ME3Q16798 LDHAL6A-202ENST00000396213 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
ME3Q16798 ABHD1-201ENST00000316470 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
ME3Q16798 IFI27L2-201ENST00000238609 511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
ME3Q16798 NENF-201ENST00000366988 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
ME3Q16798 FAM160B1-201ENST00000369246 666 ntTSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
ME3Q16798 AC097658.1-201ENST00000475555 843 ntBASIC23.03■■□□□ 1.28
ME3Q16798 TMEM191C-212ENST00000536718 480 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
ME3Q16798 AL356020.1-201ENST00000554235 1076 ntTSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
ME3Q16798 AL049874.3-201ENST00000557618 868 ntTSL 3 BASIC23.03■■□□□ 1.28
ME3Q16798 AC138028.5-201ENST00000566114 558 ntTSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
ME3Q16798 AC006435.1-201ENST00000571775 1065 ntTSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
ME3Q16798 BX323043.1-201ENST00000641006 1765 ntBASIC23.03■■□□□ 1.28
ME3Q16798 DENND4B-201ENST00000361217 5706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
ME3Q16798 BCS1L-201ENST00000359273 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
ME3Q16798 PSKH2-201ENST00000276616 1322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
ME3Q16798 TMEM91-209ENST00000539627 1843 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
ME3Q16798 USP21-201ENST00000289865 2195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
ME3Q16798 SYTL1-210ENST00000616558 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
ME3Q16798 BABAM1-213ENST00000601043 1366 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
ME3Q16798 MCEMP1-201ENST00000333598 1730 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
ME3Q16798 OSR2-202ENST00000435298 1736 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
ME3Q16798 NUDT15-201ENST00000258662 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
ME3Q16798 STX17-212ENST00000534052 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
ME3Q16798 KLHL2-201ENST00000226725 3134 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
ME3Q16798 GIT1-201ENST00000225394 3768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
ME3Q16798 HIC1-201ENST00000322941 3053 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
ME3Q16798 HCFC1R1-202ENST00000354679 765 ntTSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
ME3Q16798 AC007285.1-201ENST00000422239 893 ntTSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
ME3Q16798 METTL21A-207ENST00000442521 1003 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
ME3Q16798 OCIAD2-205ENST00000508632 1163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
ME3Q16798 ARMC6-220ENST00000546344 1814 ntTSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
ME3Q16798 R3HCC1-210ENST00000625275 1489 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
ME3Q16798 SLC6A7-203ENST00000524041 2431 ntTSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
ME3Q16798 SLC27A3-214ENST00000624995 2413 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
ME3Q16798 NAAA-206ENST00000507956 1300 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
ME3Q16798 TCIRG1-213ENST00000532635 2457 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
ME3Q16798 MID2-201ENST00000262843 2876 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
ME3Q16798 ONECUT3-201ENST00000382349 8318 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
ME3Q16798 WWOX-202ENST00000402655 1594 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
ME3Q16798 MORF4L1-201ENST00000331268 2359 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
ME3Q16798 ARMC6-202ENST00000392335 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
ME3Q16798 ADORA2A-215ENST00000618076 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
ME3Q16798 CDK17-203ENST00000543119 2442 ntTSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
ME3Q16798 FARSA-207ENST00000588025 2057 ntTSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
ME3Q16798 FAM91A1-207ENST00000521166 2706 ntTSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
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