Protein–RNA interactions for Protein: Q16790

CA9, Carbonic anhydrase 9, humanhuman

Predictions only

Length 459 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CA9Q16790 ADAP1-216ENST00000539900 2178 ntTSL 2 BASIC20.39■□□□□ 0.86
CA9Q16790 KRT87P-201ENST00000529785 1700 ntTSL 2 BASIC20.39■□□□□ 0.86
CA9Q16790 FBXL12-205ENST00000586651 1736 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
CA9Q16790 SCO1-203ENST00000577427 1601 ntTSL 3 BASIC20.39■□□□□ 0.86
CA9Q16790 ETV7-205ENST00000538992 1434 ntTSL 2 BASIC20.39■□□□□ 0.85
CA9Q16790 RCCD1-201ENST00000394258 2689 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
CA9Q16790 PSKH2-201ENST00000276616 1322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
CA9Q16790 TTC9B-201ENST00000311308 843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
CA9Q16790 PNN-205ENST00000556530 601 ntTSL 2 BASIC20.39■□□□□ 0.85
CA9Q16790 CLN6-207ENST00000566347 981 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
CA9Q16790 NDUFB10-204ENST00000569148 628 ntTSL 2 BASIC20.39■□□□□ 0.85
CA9Q16790 DCAKD-205ENST00000588499 990 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.39■□□□□ 0.85
CA9Q16790 ZNF264-205ENST00000599653 705 ntTSL 2 BASIC20.39■□□□□ 0.85
CA9Q16790 EEF1D-246ENST00000532741 2387 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
CA9Q16790 AC116562.4-201ENST00000641316 2276 ntBASIC20.39■□□□□ 0.85
CA9Q16790 KLRG2-201ENST00000340940 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
CA9Q16790 COL13A1-201ENST00000354547 3027 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.85
CA9Q16790 EARS2-206ENST00000563232 1709 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
CA9Q16790 TUBA4A-202ENST00000392088 2499 ntTSL 2 BASIC20.38■□□□□ 0.85
CA9Q16790 WWOX-202ENST00000402655 1594 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
CA9Q16790 HNRNPUL2-201ENST00000301785 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
CA9Q16790 MTX1-201ENST00000316721 1441 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
CA9Q16790 ANXA2-201ENST00000332680 1444 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
CA9Q16790 THEM4-205ENST00000489410 643 ntTSL 2 BASIC20.38■□□□□ 0.85
CA9Q16790 LEF1-AS1-203ENST00000507799 459 ntTSL 3 BASIC20.38■□□□□ 0.85
CA9Q16790 THAP6-213ENST00000514480 1161 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
CA9Q16790 AP003097.1-201ENST00000530657 1135 ntBASIC20.38■□□□□ 0.85
CA9Q16790 AC127496.6-201ENST00000576215 338 ntTSL 3 BASIC20.38■□□□□ 0.85
CA9Q16790 AC233263.1-201ENST00000578059 224 ntBASIC20.38■□□□□ 0.85
CA9Q16790 CRTC1-204ENST00000601916 1834 ntTSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
CA9Q16790 SDHA-201ENST00000264932 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
CA9Q16790 THTPA-202ENST00000404535 1779 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.38■□□□□ 0.85
CA9Q16790 AC044802.1-201ENST00000501143 2894 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
CA9Q16790 TMC6-201ENST00000306591 1681 ntTSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
CA9Q16790 FAM131C-201ENST00000375662 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
CA9Q16790 FGFR2-208ENST00000360144 3001 ntTSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
CA9Q16790 TBC1D10A-204ENST00000403477 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
CA9Q16790 C14orf79-202ENST00000547315 2370 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
CA9Q16790 NETO1-207ENST00000583169 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
CA9Q16790 YTHDF3-213ENST00000621820 2363 ntTSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
CA9Q16790 CSPG5-201ENST00000264723 4080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
CA9Q16790 PEX6-201ENST00000244546 2696 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
CA9Q16790 LRRC29-209ENST00000629962 1303 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
CA9Q16790 CDC42EP1-201ENST00000249014 2181 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
CA9Q16790 HSD3B7-202ENST00000297679 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
CA9Q16790 C10orf91-201ENST00000321248 1257 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
CA9Q16790 BID-202ENST00000342111 854 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
CA9Q16790 MCHR1-202ENST00000381433 1219 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
CA9Q16790 POM121L13P-201ENST00000422362 380 ntBASIC20.37■□□□□ 0.85
CA9Q16790 TMEM9-209ENST00000485839 938 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
CA9Q16790 MAZ-215ENST00000569978 567 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
CA9Q16790 MIR4651-201ENST00000582622 73 ntBASIC20.37■□□□□ 0.85
CA9Q16790 DEDD2-205ENST00000596251 1183 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
CA9Q16790 NCBP2-AS2-201ENST00000602845 918 ntAPPRIS P1 BASIC20.37■□□□□ 0.85
CA9Q16790 SLC16A5-206ENST00000580123 2019 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
CA9Q16790 MFSD1-219ENST00000622669 2361 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
CA9Q16790 PPM1L-204ENST00000497343 1589 ntTSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
CA9Q16790 ZNF346-209ENST00000512315 1575 ntTSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
CA9Q16790 CNEP1R1-203ENST00000458059 2965 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
CA9Q16790 PDLIM2-207ENST00000409417 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
CA9Q16790 ST3GAL3-204ENST00000335430 1805 ntTSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
CA9Q16790 MPV17L2-204ENST00000599612 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
CA9Q16790 AKNA-205ENST00000374079 2138 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
CA9Q16790 SLC6A11-202ENST00000454147 2794 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
CA9Q16790 CELF6-202ENST00000395258 1741 ntTSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
CA9Q16790 DHRS3-204ENST00000616661 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
CA9Q16790 SYT7-206ENST00000540677 2013 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
CA9Q16790 GORASP1-220ENST00000479927 1345 ntTSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
CA9Q16790 NKX6-1-201ENST00000295886 2628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
CA9Q16790 SH3RF3-201ENST00000309415 5803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
CA9Q16790 EP300-AS1-201ENST00000420537 457 ntTSL 3 BASIC20.36■□□□□ 0.85
CA9Q16790 MAGI2-AS3-202ENST00000422093 762 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
CA9Q16790 AC226101.2-201ENST00000458252 747 ntTSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
CA9Q16790 AC026366.1-201ENST00000488803 879 ntBASIC20.36■□□□□ 0.85
CA9Q16790 AC073912.1-201ENST00000546264 587 ntTSL 3 BASIC20.36■□□□□ 0.85
CA9Q16790 AC068987.1-201ENST00000562996 427 ntTSL 3 BASIC20.36■□□□□ 0.85
CA9Q16790 AL121906.2-201ENST00000621597 723 ntBASIC20.36■□□□□ 0.85
CA9Q16790 GRK2-201ENST00000308595 3466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
CA9Q16790 NTMT1-210ENST00000613644 1501 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.36■□□□□ 0.85
CA9Q16790 CA11-201ENST00000084798 1844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
CA9Q16790 C16orf70-201ENST00000219139 2865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
CA9Q16790 MAP3K15-201ENST00000338883 4012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
CA9Q16790 COL13A1-205ENST00000398978 3093 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
CA9Q16790 PTAR1-205ENST00000472967 1689 ntTSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
CA9Q16790 AC007952.6-201ENST00000573168 2673 ntBASIC20.35■□□□□ 0.85
CA9Q16790 AC003957.1-201ENST00000625108 2673 ntBASIC20.35■□□□□ 0.85
CA9Q16790 DMRT2-205ENST00000382255 2367 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
CA9Q16790 PFKFB3-219ENST00000640683 2311 ntTSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
CA9Q16790 PARL-201ENST00000311101 1240 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
CA9Q16790 PTPMT1-202ENST00000326674 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
CA9Q16790 C6orf48-205ENST00000375640 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
CA9Q16790 CD99-203ENST00000381184 918 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
CA9Q16790 AP001458.2-201ENST00000528405 577 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC20.35■□□□□ 0.85
CA9Q16790 MMAB-206ENST00000540016 945 ntTSL 3 BASIC20.35■□□□□ 0.85
CA9Q16790 ASPSCR1-211ENST00000581647 720 ntTSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
CA9Q16790 CIRBP-213ENST00000587323 1092 ntTSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
CA9Q16790 LHX8-202ENST00000356261 1764 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
CA9Q16790 RABEPK-204ENST00000394125 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
CA9Q16790 GAS2L1-208ENST00000616432 2925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
CA9Q16790 CCAR2-214ENST00000613179 1421 ntTSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22 ms