Protein–RNA interactions for Protein: Q16695

HIST3H3, Histone H3.1t, humanhuman

Predictions only

Length 136 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HIST3H3Q16695 TSPAN14-209ENST00000481124 808 ntTSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
HIST3H3Q16695 AC016065.1-203ENST00000523225 1017 ntTSL 3 BASIC17.38■□□□□ 0.37
HIST3H3Q16695 GNB5-211ENST00000560116 918 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
HIST3H3Q16695 CES1P1-204ENST00000574030 877 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
HIST3H3Q16695 AC007786.1-201ENST00000587859 709 ntTSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
HIST3H3Q16695 EPHA10-202ENST00000373048 5425 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
HIST3H3Q16695 YTHDF3-214ENST00000621890 2296 ntTSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
HIST3H3Q16695 TBC1D10A-204ENST00000403477 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
HIST3H3Q16695 CENPH-206ENST00000515001 1305 ntTSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
HIST3H3Q16695 FBXW7-202ENST00000281708 4976 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
HIST3H3Q16695 PTGER2-201ENST00000245457 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
HIST3H3Q16695 MEF2A-202ENST00000354410 5824 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
HIST3H3Q16695 MGAT5B-209ENST00000569840 4492 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
HIST3H3Q16695 FAM129C-208ENST00000599164 2073 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
HIST3H3Q16695 PQLC2-202ENST00000375155 1805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
HIST3H3Q16695 C19orf25-206ENST00000588849 1472 ntTSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
HIST3H3Q16695 NYX-202ENST00000378220 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
HIST3H3Q16695 CMTM4-201ENST00000330687 3414 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
HIST3H3Q16695 CYB561-213ENST00000581573 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
HIST3H3Q16695 TTC9B-201ENST00000311308 843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
HIST3H3Q16695 MRPS24-201ENST00000317534 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
HIST3H3Q16695 ZNF580-201ENST00000325333 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
HIST3H3Q16695 TREX2-204ENST00000370212 861 ntTSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
HIST3H3Q16695 TREX2-205ENST00000370231 1255 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
HIST3H3Q16695 GDAP1L1-202ENST00000372952 722 ntTSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
HIST3H3Q16695 TREX2-207ENST00000393862 907 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
HIST3H3Q16695 POM121L13P-201ENST00000422362 380 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
HIST3H3Q16695 HAGLROS-201ENST00000426615 1121 ntTSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
HIST3H3Q16695 LIME1-205ENST00000480139 819 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.37■□□□□ 0.37
HIST3H3Q16695 KRT18P6-201ENST00000555540 1265 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
HIST3H3Q16695 CLN6-207ENST00000566347 981 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
HIST3H3Q16695 CIRBP-213ENST00000587323 1092 ntTSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
HIST3H3Q16695 TMSB4X-203ENST00000380636 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
HIST3H3Q16695 NEU4-205ENST00000407683 2273 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
HIST3H3Q16695 FAM3A-215ENST00000447601 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
HIST3H3Q16695 RDH13-203ENST00000415061 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
HIST3H3Q16695 KLHL11-201ENST00000319121 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
HIST3H3Q16695 EEF1D-246ENST00000532741 2387 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
HIST3H3Q16695 NFS1-214ENST00000541387 1436 ntTSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
HIST3H3Q16695 CCAR2-214ENST00000613179 1421 ntTSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
HIST3H3Q16695 IGFBP3-210ENST00000613132 2412 ntTSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
HIST3H3Q16695 MAGED2-203ENST00000375053 2066 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
HIST3H3Q16695 SETD7-202ENST00000404104 1590 ntTSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
HIST3H3Q16695 FGF14-IT1-202ENST00000607251 2123 ntTSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
HIST3H3Q16695 CBLN2-201ENST00000269503 2945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
HIST3H3Q16695 KDM2A-202ENST00000398645 6511 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
HIST3H3Q16695 C14orf28-204ENST00000557112 1097 ntTSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
HIST3H3Q16695 AC005225.2-202ENST00000617980 408 ntTSL 4 BASIC17.36■□□□□ 0.37
HIST3H3Q16695 MICU2-201ENST00000382374 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
HIST3H3Q16695 PHLDA3-202ENST00000367311 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
HIST3H3Q16695 PSKH2-201ENST00000276616 1322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
HIST3H3Q16695 MPV17L2-204ENST00000599612 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
HIST3H3Q16695 TNFSF11-203ENST00000398795 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
HIST3H3Q16695 ANXA8-208ENST00000611843 2174 ntTSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
HIST3H3Q16695 RABEPK-204ENST00000394125 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
HIST3H3Q16695 ZIM2-208ENST00000629319 2253 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
HIST3H3Q16695 TSPAN3-210ENST00000561277 1592 ntTSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
HIST3H3Q16695 C11orf49-201ENST00000278460 1645 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
HIST3H3Q16695 AKIRIN2-201ENST00000257787 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
HIST3H3Q16695 AC233280.1-201ENST00000423600 1684 ntTSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
HIST3H3Q16695 JMJD4-202ENST00000438896 2502 ntTSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
HIST3H3Q16695 FLT1-209ENST00000639477 6337 ntTSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
HIST3H3Q16695 DBN1-210ENST00000512501 1878 ntTSL 3 BASIC17.35■□□□□ 0.37
HIST3H3Q16695 CTBP2-205ENST00000411419 2036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
HIST3H3Q16695 ACD-201ENST00000219251 2052 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
HIST3H3Q16695 ACD-214ENST00000620338 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
HIST3H3Q16695 HCK-207ENST00000520553 2101 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
HIST3H3Q16695 SPNS1-201ENST00000311008 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
HIST3H3Q16695 DHRS7-201ENST00000216500 2322 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
HIST3H3Q16695 ISLR2-202ENST00000419208 2306 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
HIST3H3Q16695 NETO1-207ENST00000583169 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
HIST3H3Q16695 KRT1-201ENST00000252244 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
HIST3H3Q16695 DUSP23-201ENST00000368107 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
HIST3H3Q16695 C6orf48-205ENST00000375640 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
HIST3H3Q16695 AC079145.1-201ENST00000416575 541 ntTSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
HIST3H3Q16695 RNA5SP413-201ENST00000516373 109 ntBASIC17.35■□□□□ 0.37
HIST3H3Q16695 MAZ-215ENST00000569978 567 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
HIST3H3Q16695 AC127496.6-201ENST00000576215 338 ntTSL 3 BASIC17.35■□□□□ 0.37
HIST3H3Q16695 TRAPPC5-203ENST00000595985 411 ntTSL 3 BASIC17.35■□□□□ 0.37
HIST3H3Q16695 NCBP2-AS2-201ENST00000602845 918 ntAPPRIS P1 BASIC17.35■□□□□ 0.37
HIST3H3Q16695 MAGIX-206ENST00000615626 1057 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
HIST3H3Q16695 SLC35A3-218ENST00000639994 1114 ntTSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
HIST3H3Q16695 SMIM10L2A-201ENST00000417443 5230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
HIST3H3Q16695 ARRB2-216ENST00000574954 1348 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
HIST3H3Q16695 VSTM2B-201ENST00000335523 1488 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
HIST3H3Q16695 BCS1L-201ENST00000359273 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
HIST3H3Q16695 HEMK1-206ENST00000455834 1499 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
HIST3H3Q16695 DENND6A-201ENST00000311128 4655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
HIST3H3Q16695 PVRIG-201ENST00000317271 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
HIST3H3Q16695 DLGAP4-204ENST00000373913 5056 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
HIST3H3Q16695 CYP21A2-222ENST00000435122 1914 ntTSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
HIST3H3Q16695 ST3GAL4-217ENST00000534083 1919 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
HIST3H3Q16695 CDH5-204ENST00000563425 1932 ntTSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
HIST3H3Q16695 AC005906.2-203ENST00000640962 2091 ntTSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
HIST3H3Q16695 ADAP1-216ENST00000539900 2178 ntTSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
HIST3H3Q16695 AMDHD1-201ENST00000266736 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
HIST3H3Q16695 MED25-201ENST00000312865 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
HIST3H3Q16695 MSANTD2-202ENST00000374979 2349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
HIST3H3Q16695 ZNF324B-202ENST00000545523 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
HIST3H3Q16695 ZNF664-207ENST00000539644 5108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.3 ms