Protein–RNA interactions for Protein: Q16620

NTRK2, BDNF/NT-3 growth factors receptor, humanhuman

Predictions only

Length 822 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NTRK2Q16620 PIF1-202ENST00000333425 2278 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
NTRK2Q16620 MEN1-202ENST00000315422 3148 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
NTRK2Q16620 GPAA1-201ENST00000355091 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
NTRK2Q16620 VEGFB-201ENST00000309422 1380 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
NTRK2Q16620 HSD11B1L-204ENST00000411793 1362 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
NTRK2Q16620 AC138696.1-201ENST00000522452 2897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
NTRK2Q16620 RALGPS1-204ENST00000373436 1667 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
NTRK2Q16620 FLCN-203ENST00000389169 1692 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
NTRK2Q16620 TMPRSS5-212ENST00000545579 2163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
NTRK2Q16620 AC087289.5-201ENST00000586076 3175 ntBASIC18.28■□□□□ 0.52
NTRK2Q16620 NAE1-201ENST00000290810 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
NTRK2Q16620 NFIX-202ENST00000360105 5459 ntTSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
NTRK2Q16620 CDKN2B-AS1-217ENST00000585267 1337 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
NTRK2Q16620 PCDH8-202ENST00000377942 5088 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
NTRK2Q16620 ABHD14A-201ENST00000273596 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
NTRK2Q16620 GCSHP5-201ENST00000443090 522 ntBASIC18.28■□□□□ 0.52
NTRK2Q16620 AC073111.3-201ENST00000478789 635 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.28■□□□□ 0.52
NTRK2Q16620 AL162258.1-201ENST00000497086 753 ntTSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
NTRK2Q16620 THAP6-213ENST00000514480 1161 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
NTRK2Q16620 AL121906.2-201ENST00000621597 723 ntBASIC18.28■□□□□ 0.52
NTRK2Q16620 FAM66B-201ENST00000529456 1432 ntTSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
NTRK2Q16620 RFC2-202ENST00000352131 1576 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
NTRK2Q16620 ZDHHC18-202ENST00000374142 5020 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
NTRK2Q16620 PMPCB-202ENST00000428154 1714 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
NTRK2Q16620 FNIP1-204ENST00000511848 1720 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
NTRK2Q16620 ZNF280B-203ENST00000626650 5721 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
NTRK2Q16620 ZFP92-201ENST00000338647 6105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
NTRK2Q16620 RNASET2-214ENST00000620173 1391 ntTSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
NTRK2Q16620 WISP2-202ENST00000372865 1518 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
NTRK2Q16620 ST3GAL3-239ENST00000545417 1667 ntTSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
NTRK2Q16620 SET-201ENST00000322030 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
NTRK2Q16620 FAM53A-202ENST00000461064 2159 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
NTRK2Q16620 AL512408.1-201ENST00000569378 2000 ntBASIC18.27■□□□□ 0.52
NTRK2Q16620 TREX2-206ENST00000370232 1864 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
NTRK2Q16620 RAD23A-203ENST00000586534 1746 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
NTRK2Q16620 BX119927.1-201ENST00000636596 1552 ntBASIC18.27■□□□□ 0.52
NTRK2Q16620 ZDHHC24-203ENST00000526986 1424 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
NTRK2Q16620 MRPS24-201ENST00000317534 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
NTRK2Q16620 NPY-202ENST00000405982 565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
NTRK2Q16620 TTTY14-205ENST00000454875 544 ntTSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
NTRK2Q16620 AC026427.1-201ENST00000508993 555 ntTSL 3 BASIC18.27■□□□□ 0.52
NTRK2Q16620 COX6C-208ENST00000522940 694 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.27■□□□□ 0.52
NTRK2Q16620 LINC01301-204ENST00000530725 577 ntTSL 4 BASIC18.27■□□□□ 0.52
NTRK2Q16620 FAM213B-215ENST00000537325 1096 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
NTRK2Q16620 OTUB1-210ENST00000541478 1803 ntTSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
NTRK2Q16620 GYG1-202ENST00000345003 2052 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
NTRK2Q16620 AL162377.1-201ENST00000618844 1793 ntBASIC18.27■□□□□ 0.51
NTRK2Q16620 GNS-208ENST00000543646 2164 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.51
NTRK2Q16620 TAF15-215ENST00000605844 2191 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
NTRK2Q16620 WDR45-207ENST00000376372 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
NTRK2Q16620 C19orf66-201ENST00000253110 2117 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
NTRK2Q16620 CCDC34-202ENST00000328697 2103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
NTRK2Q16620 CEACAM3-202ENST00000357396 1316 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
NTRK2Q16620 AC245041.2-204ENST00000610809 1962 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
NTRK2Q16620 AP2M1-203ENST00000411763 1577 ntTSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
NTRK2Q16620 TINAGL1-211ENST00000537531 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
NTRK2Q16620 PYCR3-207ENST00000495276 2332 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
NTRK2Q16620 PDZRN3-202ENST00000308537 1136 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
NTRK2Q16620 CCDC74B-203ENST00000409128 789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
NTRK2Q16620 RNF121-214ENST00000533380 870 ntTSL 3 BASIC18.26■□□□□ 0.51
NTRK2Q16620 AC142381.4-202ENST00000563973 229 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
NTRK2Q16620 MARK2-208ENST00000508192 2924 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
NTRK2Q16620 FSTL3-201ENST00000166139 2542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
NTRK2Q16620 PLCD1-201ENST00000334661 2769 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
NTRK2Q16620 MON1A-203ENST00000455683 1617 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
NTRK2Q16620 FBXL12-205ENST00000586651 1736 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
NTRK2Q16620 BRSK1-201ENST00000309383 3079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
NTRK2Q16620 AL020996.1-203ENST00000536896 2307 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
NTRK2Q16620 KIF26A-202ENST00000423312 5649 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
NTRK2Q16620 PHOSPHO1-201ENST00000310544 1816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
NTRK2Q16620 TANGO2-217ENST00000456048 2439 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
NTRK2Q16620 DNASE1L2-203ENST00000564065 2194 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
NTRK2Q16620 REM2-201ENST00000267396 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
NTRK2Q16620 LENG9-203ENST00000611161 1916 ntAPPRIS P1 BASIC18.25■□□□□ 0.51
NTRK2Q16620 MARCH8-201ENST00000319836 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
NTRK2Q16620 DXO-202ENST00000375349 1667 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
NTRK2Q16620 BYSL-201ENST00000230340 2029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
NTRK2Q16620 PLCB2-204ENST00000557821 4517 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
NTRK2Q16620 ATP6V0E2-203ENST00000456496 2722 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
NTRK2Q16620 ATP6V0E2-213ENST00000615196 2727 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
NTRK2Q16620 PRDX1-201ENST00000262746 1234 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
NTRK2Q16620 BOLA1-203ENST00000369153 1096 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.25■□□□□ 0.51
NTRK2Q16620 F8A2-201ENST00000369505 1116 ntAPPRIS P1 BASIC18.25■□□□□ 0.51
NTRK2Q16620 CALM3-202ENST00000391918 702 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
NTRK2Q16620 HAGLROS-201ENST00000426615 1121 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
NTRK2Q16620 FAM131A-208ENST00000453072 1038 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
NTRK2Q16620 CENPS-CORT-202ENST00000465026 494 ntTSL 3 BASIC18.25■□□□□ 0.51
NTRK2Q16620 CENPS-CORT-203ENST00000470413 626 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
NTRK2Q16620 RPPH1-201ENST00000516869 333 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
NTRK2Q16620 CA3-AS1-201ENST00000517697 559 ntTSL 4 BASIC18.25■□□□□ 0.51
NTRK2Q16620 BAALC-AS1-206ENST00000521383 736 ntTSL 3 BASIC18.25■□□□□ 0.51
NTRK2Q16620 C1QBPP2-201ENST00000528754 825 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
NTRK2Q16620 PRKY-204ENST00000533551 1019 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
NTRK2Q16620 BCL2L10-202ENST00000561198 825 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
NTRK2Q16620 AC100835.1-201ENST00000565737 498 ntTSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
NTRK2Q16620 AC022211.2-202ENST00000582668 546 ntTSL 4 BASIC18.25■□□□□ 0.51
NTRK2Q16620 BX649632.1-201ENST00000610187 819 ntTSL 3 BASIC18.25■□□□□ 0.51
NTRK2Q16620 AL359736.2-201ENST00000621992 437 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
NTRK2Q16620 SLC35A2-213ENST00000635015 1008 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
NTRK2Q16620 NMRAL1-213ENST00000574733 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.5 ms