Protein–RNA interactions for Protein: Q16586

SGCA, Alpha-sarcoglycan, humanhuman

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Length 387 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SGCAQ16586 AC104771.1-201ENST00000603335 964 ntBASIC17.52■□□□□ 0.4
SGCAQ16586 PTMS-207ENST00000619580 1150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
SGCAQ16586 DBNDD2-203ENST00000372710 1417 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
SGCAQ16586 SLC16A5-202ENST00000450736 2051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
SGCAQ16586 RAB34-201ENST00000301043 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
SGCAQ16586 CDKN1C-203ENST00000430149 1570 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
SGCAQ16586 GPR35-201ENST00000319838 2249 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.52■□□□□ 0.39
SGCAQ16586 C17orf62-204ENST00000437807 2242 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.52■□□□□ 0.39
SGCAQ16586 TMEM131-201ENST00000186436 6640 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.39
SGCAQ16586 RNF32-208ENST00000432459 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
SGCAQ16586 SOX2-201ENST00000325404 2513 ntAPPRIS P1 BASIC17.52■□□□□ 0.39
SGCAQ16586 RGS3-232ENST00000620489 1503 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
SGCAQ16586 DVL1-204ENST00000610709 2268 ntTSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
SGCAQ16586 C16orf70-201ENST00000219139 2865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
SGCAQ16586 TPD52-209ENST00000518937 2856 ntTSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
SGCAQ16586 STK25-204ENST00000405585 1643 ntTSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
SGCAQ16586 PSPN-201ENST00000245810 471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
SGCAQ16586 GLB1-201ENST00000307363 2616 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
SGCAQ16586 NENF-201ENST00000366988 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
SGCAQ16586 NOXO1-203ENST00000397280 1147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
SGCAQ16586 LINC01637-201ENST00000444039 684 ntTSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
SGCAQ16586 HAGLR-207ENST00000452365 661 ntTSL 4 BASIC17.51■□□□□ 0.39
SGCAQ16586 GATS-209ENST00000454084 1030 ntTSL 3 BASIC17.51■□□□□ 0.39
SGCAQ16586 C5orf38-206ENST00000505778 509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
SGCAQ16586 AC007216.1-201ENST00000570197 601 ntTSL 4 BASIC17.51■□□□□ 0.39
SGCAQ16586 PAQR4-205ENST00000576565 842 ntTSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
SGCAQ16586 ANAPC11-219ENST00000583839 499 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
SGCAQ16586 RUVBL2-206ENST00000595090 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
SGCAQ16586 ACTR5-201ENST00000243903 2565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
SGCAQ16586 DALRD3-201ENST00000313778 1968 ntTSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
SGCAQ16586 CD247-202ENST00000392122 1678 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
SGCAQ16586 KLHL31-202ENST00000407079 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
SGCAQ16586 OGG1-217ENST00000449570 1948 ntTSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
SGCAQ16586 FBXO27-201ENST00000292853 2330 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
SGCAQ16586 PITX2-201ENST00000306732 2320 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
SGCAQ16586 TSNAXIP1-202ENST00000415766 2338 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
SGCAQ16586 KCNE5-201ENST00000372101 1473 ntAPPRIS P1 BASIC17.5■□□□□ 0.39
SGCAQ16586 NFIX-205ENST00000585575 1485 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
SGCAQ16586 ZNF692-202ENST00000366471 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
SGCAQ16586 ACOT2-204ENST00000613168 1553 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
SGCAQ16586 CACNA1A-227ENST00000636549 6792 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
SGCAQ16586 CBLN2-201ENST00000269503 2945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
SGCAQ16586 CHP2-201ENST00000300113 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
SGCAQ16586 SOCS2-201ENST00000340600 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
SGCAQ16586 IL17RE-206ENST00000454190 2757 ntTSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
SGCAQ16586 NDOR1-204ENST00000458322 1829 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
SGCAQ16586 N4BP2L1-203ENST00000380133 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
SGCAQ16586 AL356020.1-201ENST00000554235 1076 ntTSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
SGCAQ16586 TOR1A-201ENST00000351698 2076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
SGCAQ16586 LINC01505-207ENST00000637185 1540 ntTSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
SGCAQ16586 WDR45-207ENST00000376372 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
SGCAQ16586 MCUR1-201ENST00000379170 5471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
SGCAQ16586 RHBDL1-202ENST00000352681 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
SGCAQ16586 DBNDD2-206ENST00000372720 1481 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
SGCAQ16586 BABAM1-208ENST00000598188 1470 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
SGCAQ16586 KDELR3-201ENST00000216014 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
SGCAQ16586 SPOCK3-215ENST00000510741 1963 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
SGCAQ16586 C5orf17-202ENST00000512559 1984 ntTSL 2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
SGCAQ16586 TMEM109-202ENST00000536171 1959 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
SGCAQ16586 GRK2-201ENST00000308595 3466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
SGCAQ16586 RBM42-204ENST00000589559 1328 ntTSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
SGCAQ16586 CAMKK2-206ENST00000402834 2051 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
SGCAQ16586 RAC1-201ENST00000348035 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
SGCAQ16586 SMARCD2-212ENST00000613943 2342 ntTSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
SGCAQ16586 GRB10-208ENST00000403097 5432 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
SGCAQ16586 AGPAT5-201ENST00000285518 3685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
SGCAQ16586 KCNC2-204ENST00000540018 2168 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
SGCAQ16586 LYNX1-204ENST00000614491 4708 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
SGCAQ16586 LCE2A-201ENST00000368779 592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
SGCAQ16586 GGT1-206ENST00000404223 952 ntTSL 2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
SGCAQ16586 HLA-L-209ENST00000420110 1011 ntBASIC17.49■□□□□ 0.39
SGCAQ16586 TPD52L1-207ENST00000527711 999 ntTSL 2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
SGCAQ16586 AC005410.1-201ENST00000579522 462 ntTSL 3 BASIC17.49■□□□□ 0.39
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SGCAQ16586 PRKAR2A-201ENST00000265563 6471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
SGCAQ16586 ZNF213-201ENST00000396878 3313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
SGCAQ16586 PAIP1-203ENST00000436644 1734 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
SGCAQ16586 RNF8-204ENST00000469731 1800 ntTSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
SGCAQ16586 SLC39A4-201ENST00000276833 2297 ntTSL 2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
SGCAQ16586 KRT16P3-203ENST00000580621 1939 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
SGCAQ16586 RBL2-201ENST00000262133 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
SGCAQ16586 KCNK17-201ENST00000373231 1658 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
SGCAQ16586 ACY1-215ENST00000636358 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
SGCAQ16586 HSPD1-202ENST00000388968 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
SGCAQ16586 BHLHE22-201ENST00000321870 3262 ntAPPRIS P1 BASIC17.48■□□□□ 0.39
SGCAQ16586 IRGQ-205ENST00000602269 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
SGCAQ16586 SCAMP3-201ENST00000302631 1446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
SGCAQ16586 ABHD1-201ENST00000316470 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
SGCAQ16586 PLSCR3-212ENST00000576201 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
SGCAQ16586 SAXO1-202ENST00000380534 2099 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
SGCAQ16586 LEFTY2-202ENST00000420304 2085 ntTSL 2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
SGCAQ16586 SLC35E1-208ENST00000595753 5099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
SGCAQ16586 JAK2-201ENST00000381652 5285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
SGCAQ16586 AL355802.2-201ENST00000402069 882 ntBASIC17.48■□□□□ 0.39
SGCAQ16586 AKAIN1-201ENST00000434239 575 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
SGCAQ16586 RPH3AL-203ENST00000536489 1235 ntTSL 2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
SGCAQ16586 MCRIP1-203ENST00000538396 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
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