Protein–RNA interactions for Protein: Q16534

HLF, Hepatic leukemia factor, humanhuman

Predictions only

Length 295 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HLFQ16534 HS2ST1-202ENST00000370551 1585 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
HLFQ16534 GPRIN2-201ENST00000374314 1696 ntAPPRIS P1 BASIC24.75■■□□□ 1.55
HLFQ16534 KRAS-203ENST00000556131 1696 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
HLFQ16534 YWHAZ-205ENST00000395956 2974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
HLFQ16534 BRSK2-215ENST00000544817 1842 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
HLFQ16534 TUBA1A-201ENST00000295766 1887 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.75■■□□□ 1.55
HLFQ16534 NDUFAF3-202ENST00000326925 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
HLFQ16534 BID-215ENST00000622694 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
HLFQ16534 HRAS-201ENST00000311189 894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
HLFQ16534 AC003982.1-201ENST00000477404 484 ntTSL 2 BASIC24.74■■□□□ 1.55
HLFQ16534 AC006504.5-207ENST00000586220 487 ntTSL 2 BASIC24.74■■□□□ 1.55
HLFQ16534 TYMS-201ENST00000323224 1327 ntTSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
HLFQ16534 SOX15-201ENST00000250055 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
HLFQ16534 ACD-203ENST00000602320 1408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.74■■□□□ 1.55
HLFQ16534 HMBS-214ENST00000542729 1469 ntTSL 2 BASIC24.74■■□□□ 1.55
HLFQ16534 OGFOD2-222ENST00000545317 1481 ntTSL 2 BASIC24.74■■□□□ 1.55
HLFQ16534 FGF17-201ENST00000359441 1714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
HLFQ16534 ACBD4-203ENST00000398322 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
HLFQ16534 B4GALNT1-208ENST00000550764 1967 ntTSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
HLFQ16534 ME3-212ENST00000543262 2311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
HLFQ16534 KIF2A-202ENST00000401507 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
HLFQ16534 ISLR2-202ENST00000419208 2306 ntTSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
HLFQ16534 ARNTL2-204ENST00000395901 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
HLFQ16534 CENPA-201ENST00000233505 1299 ntTSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
HLFQ16534 HAGLR-204ENST00000425005 623 ntTSL 3 BASIC24.73■■□□□ 1.55
HLFQ16534 HRASLS5-205ENST00000539221 1167 ntTSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
HLFQ16534 AC087498.1-201ENST00000572493 945 ntAPPRIS P1 BASIC24.73■■□□□ 1.55
HLFQ16534 KAZN-209ENST00000636564 1197 ntTSL 5 BASIC24.73■■□□□ 1.55
HLFQ16534 EEF1D-204ENST00000423316 2378 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC24.73■■□□□ 1.55
HLFQ16534 TAF6L-201ENST00000294168 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
HLFQ16534 DBNL-210ENST00000448521 1808 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
HLFQ16534 AVPR2-202ENST00000358927 1763 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
HLFQ16534 ACTR3B-203ENST00000397282 1692 ntTSL 2 BASIC24.72■■□□□ 1.55
HLFQ16534 SLC25A39-202ENST00000377095 1565 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
HLFQ16534 EPOR-201ENST00000222139 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
HLFQ16534 AC007375.3-201ENST00000600936 2314 ntBASIC24.72■■□□□ 1.55
HLFQ16534 ME3-202ENST00000393324 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
HLFQ16534 KAT2B-201ENST00000263754 4833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
HLFQ16534 GNA15-201ENST00000262958 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
HLFQ16534 LRRC23-202ENST00000323702 1208 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
HLFQ16534 ST8SIA1-202ENST00000381424 1036 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
HLFQ16534 AL050404.1-201ENST00000424566 802 ntTSL 2 BASIC24.72■■□□□ 1.55
HLFQ16534 ZNF706-204ENST00000518336 501 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC24.72■■□□□ 1.55
HLFQ16534 RMI2-205ENST00000576027 818 ntTSL 2 BASIC24.72■■□□□ 1.55
HLFQ16534 POC1A-202ENST00000394970 1999 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
HLFQ16534 RGMA-210ENST00000557301 1929 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.72■■□□□ 1.55
HLFQ16534 SLC25A29-215ENST00000556505 1540 ntTSL 2 BASIC24.71■■□□□ 1.55
HLFQ16534 LGALS8-AS1-201ENST00000487567 1457 ntBASIC24.71■■□□□ 1.55
HLFQ16534 MED26-207ENST00000611692 1444 ntTSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
HLFQ16534 COMMD1-201ENST00000311832 911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
HLFQ16534 MIEN1-201ENST00000394231 1006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
HLFQ16534 AC004951.3-201ENST00000418645 1148 ntBASIC24.71■■□□□ 1.55
HLFQ16534 AC004540.1-203ENST00000421862 907 ntTSL 5 BASIC24.71■■□□□ 1.55
HLFQ16534 PTPA-216ENST00000432651 857 ntTSL 2 BASIC24.71■■□□□ 1.55
HLFQ16534 RNF146-204ENST00000476956 884 ntTSL 2 BASIC24.71■■□□□ 1.55
HLFQ16534 BAALC-205ENST00000438105 2662 ntTSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
HLFQ16534 AFDN-201ENST00000344191 5249 ntTSL 5 BASIC24.71■■□□□ 1.55
HLFQ16534 KLHDC4-201ENST00000270583 1886 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.55
HLFQ16534 KMT5B-204ENST00000402185 1881 ntTSL 2 BASIC24.7■■□□□ 1.55
HLFQ16534 HYLS1-203ENST00000526028 1803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.7■■□□□ 1.55
HLFQ16534 AP006284.1-201ENST00000527620 2210 ntTSL 2 BASIC24.7■■□□□ 1.55
HLFQ16534 CALM2-201ENST00000272298 1302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
HLFQ16534 GPAA1-201ENST00000355091 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
HLFQ16534 TPPP3-201ENST00000290942 1116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.7■■□□□ 1.54
HLFQ16534 TPPP3-202ENST00000393957 1058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
HLFQ16534 ICAM1-202ENST00000423829 1296 ntTSL 2 BASIC24.7■■□□□ 1.54
HLFQ16534 AL513320.1-201ENST00000435049 622 ntTSL 3 BASIC24.7■■□□□ 1.54
HLFQ16534 AC091390.4-202ENST00000476426 537 ntBASIC24.7■■□□□ 1.54
HLFQ16534 Z85996.1-201ENST00000494644 937 ntBASIC24.7■■□□□ 1.54
HLFQ16534 CCDC88B-203ENST00000359902 2326 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
HLFQ16534 RYK-208ENST00000620660 2942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
HLFQ16534 SRMS-201ENST00000217188 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
HLFQ16534 RLBP1-201ENST00000268125 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
HLFQ16534 KLHDC4-203ENST00000347925 1821 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
HLFQ16534 MAP2K2-202ENST00000394867 1471 ntTSL 5 BASIC24.7■■□□□ 1.54
HLFQ16534 GPR27-201ENST00000304411 2447 ntAPPRIS P1 BASIC24.7■■□□□ 1.54
HLFQ16534 MTX1-201ENST00000316721 1441 ntTSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
HLFQ16534 IL11RA-201ENST00000318041 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
HLFQ16534 WDSUB1-202ENST00000359774 1912 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.69■■□□□ 1.54
HLFQ16534 BIRC2-206ENST00000530675 1927 ntTSL 2 BASIC24.69■■□□□ 1.54
HLFQ16534 MINOS1-NBL1-204ENST00000602662 1623 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.69■■□□□ 1.54
HLFQ16534 RTBDN-201ENST00000322912 1328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
HLFQ16534 SPAG16-209ENST00000447990 1330 ntTSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
HLFQ16534 SPON2-201ENST00000290902 1869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
HLFQ16534 EXOC3L2-201ENST00000252482 1230 ntTSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
HLFQ16534 GPR6-201ENST00000275169 1089 ntAPPRIS P1 BASIC24.69■■□□□ 1.54
HLFQ16534 MDK-201ENST00000359803 985 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.69■■□□□ 1.54
HLFQ16534 LIN28AP1-201ENST00000429574 405 ntBASIC24.69■■□□□ 1.54
HLFQ16534 SELENOS-203ENST00000526049 1188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
HLFQ16534 RAB2A-211ENST00000531289 1058 ntTSL 2 BASIC24.69■■□□□ 1.54
HLFQ16534 FN3KRP-201ENST00000269373 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
HLFQ16534 CAMK2B-216ENST00000440254 2097 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
HLFQ16534 NCLN-205ENST00000590671 2070 ntTSL 2 BASIC24.69■■□□□ 1.54
HLFQ16534 C14orf180-201ENST00000331952 1455 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.69■■□□□ 1.54
HLFQ16534 DMKN-207ENST00000419602 1496 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
HLFQ16534 EED-201ENST00000263360 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
HLFQ16534 DPF1-206ENST00000420980 2227 ntTSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
HLFQ16534 SPPL2B-212ENST00000618220 2459 ntTSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
HLFQ16534 CIZ1-206ENST00000372954 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
HLFQ16534 ZCCHC2-201ENST00000269499 5959 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.68■■□□□ 1.54
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.4 ms