Protein–RNA interactions for Protein: Q15853

USF2, Upstream stimulatory factor 2, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 346 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USF2Q15853 KIAA1324L-207ENST00000444627 3527 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
USF2Q15853 GNA15-201ENST00000262958 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
USF2Q15853 VSTM2A-203ENST00000404951 2521 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
USF2Q15853 SNAP91-201ENST00000195649 4434 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
USF2Q15853 SNAP91-204ENST00000369694 4449 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
USF2Q15853 F11R-202ENST00000368026 4835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
USF2Q15853 TAP1-201ENST00000354258 2959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
USF2Q15853 ATPIF1-202ENST00000465645 1855 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
USF2Q15853 ZNF668-202ENST00000394983 2717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
USF2Q15853 ULK2-201ENST00000361658 3908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
USF2Q15853 BZW1-202ENST00000409226 2455 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
USF2Q15853 HTRA4-201ENST00000302495 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
USF2Q15853 ATG4B-204ENST00000402096 1685 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
USF2Q15853 LARP6-202ENST00000344870 527 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
USF2Q15853 ASPDH-202ENST00000389208 1040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
USF2Q15853 C19orf12-205ENST00000392278 895 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
USF2Q15853 YBX1P1-201ENST00000445822 960 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
USF2Q15853 AC093627.4-202ENST00000479592 591 ntTSL 4 BASIC15.84■□□□□ 0.13
USF2Q15853 FEZ1-205ENST00000524435 750 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
USF2Q15853 SLC7A5P2-201ENST00000553010 536 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
USF2Q15853 PPP1R14A-205ENST00000591585 949 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
USF2Q15853 AP001160.3-201ENST00000601484 763 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
USF2Q15853 SP2-202ENST00000613139 908 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
USF2Q15853 CLUH-202ENST00000570628 5244 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
USF2Q15853 RASL12-201ENST00000220062 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
USF2Q15853 PCNX3-201ENST00000355703 7105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
USF2Q15853 AK3-202ENST00000381809 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
USF2Q15853 PPP1R18-201ENST00000274853 4599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
USF2Q15853 PPP1R18-205ENST00000615527 4597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
USF2Q15853 CARD10-202ENST00000403299 4113 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
USF2Q15853 ZBTB45-201ENST00000354590 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
USF2Q15853 ZBTB42-202ENST00000555360 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
USF2Q15853 CRHR1-214ENST00000619154 2370 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
USF2Q15853 LINC01979-201ENST00000576738 5271 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
USF2Q15853 ST3GAL4-217ENST00000534083 1919 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
USF2Q15853 TANGO2-217ENST00000456048 2439 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
USF2Q15853 TPD52L1-201ENST00000304877 1468 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
USF2Q15853 CASTOR1-201ENST00000404953 1460 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
USF2Q15853 TREX2-202ENST00000334497 1982 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
USF2Q15853 GAS2L1-210ENST00000621062 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
USF2Q15853 KLF1-201ENST00000264834 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
USF2Q15853 JRK-210ENST00000614134 8932 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
USF2Q15853 SENP5-201ENST00000323460 6308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
USF2Q15853 RIN1-201ENST00000311320 2693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
USF2Q15853 FAM222A-202ENST00000538780 3294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
USF2Q15853 ZFP91-201ENST00000316059 5220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
USF2Q15853 OXER1-201ENST00000378661 1781 ntAPPRIS P1 BASIC15.83■□□□□ 0.12
USF2Q15853 SAMD3-202ENST00000368134 2377 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
USF2Q15853 ACBD4-201ENST00000321854 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
USF2Q15853 PKMYT1-216ENST00000574730 1806 ntTSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
USF2Q15853 PACSIN2-203ENST00000402229 1883 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
USF2Q15853 NFATC2-206ENST00000609943 5690 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
USF2Q15853 CYC1-201ENST00000318911 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
USF2Q15853 MRPL14-201ENST00000372014 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
USF2Q15853 FAM219A-205ENST00000379084 893 ntTSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
USF2Q15853 RAMP1-203ENST00000404910 857 ntTSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
USF2Q15853 UMAD1-202ENST00000463725 559 ntTSL 4 BASIC15.83■□□□□ 0.12
USF2Q15853 BCAP29-209ENST00000465919 942 ntTSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
USF2Q15853 ATP10A-207ENST00000619904 988 ntTSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
USF2Q15853 BCL7A-201ENST00000261822 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
USF2Q15853 ILF3-203ENST00000449870 6119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
USF2Q15853 ZNF331-214ENST00000511154 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
USF2Q15853 NOXO1-202ENST00000356120 1539 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
USF2Q15853 MAFF-202ENST00000407965 2325 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
USF2Q15853 OTUB1-211ENST00000543004 1647 ntTSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
USF2Q15853 REPS1-203ENST00000409812 2511 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
USF2Q15853 CDH23-205ENST00000398809 4533 ntTSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
USF2Q15853 HCK-203ENST00000375862 1806 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
USF2Q15853 PARP2-202ENST00000429687 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
USF2Q15853 MIB2-203ENST00000378712 2890 ntTSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
USF2Q15853 SPNS1-204ENST00000352260 1948 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
USF2Q15853 B4GALT2-204ENST00000434555 1923 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
USF2Q15853 DAPK1-202ENST00000408954 5892 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
USF2Q15853 FGFR2-208ENST00000360144 3001 ntTSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
USF2Q15853 UBE2F-201ENST00000272930 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
USF2Q15853 ADRA1B-201ENST00000306675 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
USF2Q15853 AL512408.1-201ENST00000569378 2000 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
USF2Q15853 ME3-202ENST00000393324 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
USF2Q15853 AHRR-204ENST00000506456 2350 ntTSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
USF2Q15853 LINC01816-201ENST00000414141 662 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
USF2Q15853 AC093817.1-201ENST00000507296 812 ntTSL 3 BASIC15.82■□□□□ 0.12
USF2Q15853 C1QTNF5-203ENST00000530681 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
USF2Q15853 LRRC37A17P-202ENST00000570478 572 ntTSL 4 BASIC15.82■□□□□ 0.12
USF2Q15853 CCDC92B-201ENST00000575506 885 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
USF2Q15853 AC004528.2-201ENST00000610701 440 ntTSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
USF2Q15853 SHISA4-201ENST00000362011 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
USF2Q15853 ELMSAN1-201ENST00000286523 8091 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
USF2Q15853 SLC6A11-202ENST00000454147 2794 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
USF2Q15853 SNED1-204ENST00000401884 4538 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
USF2Q15853 CHRDL2-210ENST00000622063 1691 ntTSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
USF2Q15853 HNRNPA3-204ENST00000435711 1731 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
USF2Q15853 OTUB1-209ENST00000538426 1729 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
USF2Q15853 COPS7A-222ENST00000626119 1768 ntTSL 3 BASIC15.82■□□□□ 0.12
USF2Q15853 ZGPAT-203ENST00000357119 1896 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
USF2Q15853 CCKBR-203ENST00000525462 2138 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
USF2Q15853 GABBR1-205ENST00000377034 4527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
USF2Q15853 GRB14-201ENST00000263915 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
USF2Q15853 AGTR1-201ENST00000349243 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
USF2Q15853 CYTH2-204ENST00000452733 4780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
USF2Q15853 TIMM50-202ENST00000544017 2572 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
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