Protein–RNA interactions for Protein: Q15477

SKIV2L, Helicase SKI2W, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,246 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SKIV2LQ15477 SLC22A23-205ENST00000436008 6641 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.9■□□□□ 0.94
SKIV2LQ15477 INS-201ENST00000250971 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
SKIV2LQ15477 HMGN1-203ENST00000380748 829 ntTSL 3 BASIC20.9■□□□□ 0.94
SKIV2LQ15477 AP002433.1-201ENST00000525548 964 ntTSL 3 BASIC20.9■□□□□ 0.94
SKIV2LQ15477 TXNDC12-205ENST00000610127 806 ntTSL 2 BASIC20.9■□□□□ 0.94
SKIV2LQ15477 AL031432.5-201ENST00000641059 760 ntBASIC20.9■□□□□ 0.94
SKIV2LQ15477 RALB-201ENST00000272519 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
SKIV2LQ15477 ORAI1-202ENST00000617316 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
SKIV2LQ15477 PRRC2A-201ENST00000376007 6861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
SKIV2LQ15477 TSGA10IP-203ENST00000532620 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
SKIV2LQ15477 VKORC1L1-202ENST00000434382 1541 ntTSL 2 BASIC20.89■□□□□ 0.94
SKIV2LQ15477 PTGER3-202ENST00000351052 1404 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.89■□□□□ 0.94
SKIV2LQ15477 TPST1-201ENST00000304842 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.94
SKIV2LQ15477 TPST2-203ENST00000403880 2084 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.89■□□□□ 0.93
SKIV2LQ15477 GGT1-205ENST00000403838 1033 ntTSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
SKIV2LQ15477 AL162258.2-202ENST00000469931 831 ntTSL 5 BASIC20.89■□□□□ 0.93
SKIV2LQ15477 AC003982.1-201ENST00000477404 484 ntTSL 2 BASIC20.89■□□□□ 0.93
SKIV2LQ15477 ACP6-203ENST00000487562 1258 ntTSL 5 BASIC20.89■□□□□ 0.93
SKIV2LQ15477 LINC01385-201ENST00000512310 780 ntTSL 4 BASIC20.89■□□□□ 0.93
SKIV2LQ15477 YIPF2-209ENST00000590329 958 ntTSL 5 BASIC20.89■□□□□ 0.93
SKIV2LQ15477 SLC6A6-208ENST00000621751 1252 ntTSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
SKIV2LQ15477 LINC01140-202ENST00000467438 2375 ntTSL 2 BASIC20.89■□□□□ 0.93
SKIV2LQ15477 DAZAP1-211ENST00000592522 2157 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.89■□□□□ 0.93
SKIV2LQ15477 TMCO3-201ENST00000375391 2132 ntTSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
SKIV2LQ15477 VGLL3-201ENST00000383698 2475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
SKIV2LQ15477 TBC1D10C-201ENST00000312390 1497 ntTSL 5 BASIC20.88■□□□□ 0.93
SKIV2LQ15477 GOLGA4-208ENST00000444882 1451 ntTSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
SKIV2LQ15477 RHCE-204ENST00000349320 1810 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.88■□□□□ 0.93
SKIV2LQ15477 AC092384.1-201ENST00000378347 1812 ntTSL 2 BASIC20.88■□□□□ 0.93
SKIV2LQ15477 KIF12-202ENST00000468460 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.88■□□□□ 0.93
SKIV2LQ15477 YBX3-202ENST00000279550 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
SKIV2LQ15477 MRPL43-205ENST00000370234 798 ntTSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
SKIV2LQ15477 IFT27-205ENST00000433985 1095 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
SKIV2LQ15477 RPL39L-203ENST00000455270 653 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.88■□□□□ 0.93
SKIV2LQ15477 VENTXP5-201ENST00000523979 775 ntBASIC20.88■□□□□ 0.93
SKIV2LQ15477 AC133065.2-201ENST00000573379 2147 ntTSL 2 BASIC20.88■□□□□ 0.93
SKIV2LQ15477 C17orf62-221ENST00000581196 668 ntTSL 4 BASIC20.88■□□□□ 0.93
SKIV2LQ15477 AC008738.3-201ENST00000589932 659 ntTSL 2 BASIC20.88■□□□□ 0.93
SKIV2LQ15477 AC130371.2-201ENST00000619443 611 ntBASIC20.88■□□□□ 0.93
SKIV2LQ15477 AC116407.4-201ENST00000623319 1061 ntBASIC20.88■□□□□ 0.93
SKIV2LQ15477 TRAM2-AS1-204ENST00000606714 2453 ntTSL 2 BASIC20.88■□□□□ 0.93
SKIV2LQ15477 TRIM3-214ENST00000536344 2704 ntTSL 2 BASIC20.88■□□□□ 0.93
SKIV2LQ15477 MORN1-202ENST00000378529 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
SKIV2LQ15477 SLC35F5-203ENST00000409342 2284 ntTSL 2 BASIC20.88■□□□□ 0.93
SKIV2LQ15477 STARD4-203ENST00000502322 1467 ntTSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
SKIV2LQ15477 SLC18A3-201ENST00000374115 2420 ntAPPRIS P1 BASIC20.87■□□□□ 0.93
SKIV2LQ15477 PLPP7-202ENST00000372264 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
SKIV2LQ15477 SHISA7-201ENST00000376325 6033 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.87■□□□□ 0.93
SKIV2LQ15477 TREX2-202ENST00000334497 1982 ntTSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
SKIV2LQ15477 TMIGD2-201ENST00000301272 1262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
SKIV2LQ15477 CALM3-202ENST00000391918 702 ntTSL 2 BASIC20.87■□□□□ 0.93
SKIV2LQ15477 MALL-203ENST00000427178 1070 ntTSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
SKIV2LQ15477 AC004980.1-204ENST00000429707 299 ntBASIC20.87■□□□□ 0.93
SKIV2LQ15477 DAP-202ENST00000432074 1048 ntTSL 2 BASIC20.87■□□□□ 0.93
SKIV2LQ15477 MFAP1P1-201ENST00000442257 1255 ntBASIC20.87■□□□□ 0.93
SKIV2LQ15477 HIGD1A-204ENST00000452906 585 ntTSL 2 BASIC20.87■□□□□ 0.93
SKIV2LQ15477 MUC1-212ENST00000457295 1161 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.87■□□□□ 0.93
SKIV2LQ15477 AC007128.1-201ENST00000424460 1853 ntTSL 5 BASIC20.87■□□□□ 0.93
SKIV2LQ15477 AP006587.1-201ENST00000534129 1502 ntBASIC20.87■□□□□ 0.93
SKIV2LQ15477 PPT2-244ENST00000324816 2053 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
SKIV2LQ15477 GPSM1-204ENST00000429455 2057 ntTSL 3 BASIC20.87■□□□□ 0.93
SKIV2LQ15477 NPAS1-202ENST00000449844 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
SKIV2LQ15477 CRADD-202ENST00000542893 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
SKIV2LQ15477 SLC25A51-202ENST00000377716 1691 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.86■□□□□ 0.93
SKIV2LQ15477 DNAJC28-201ENST00000314399 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
SKIV2LQ15477 ETV2-202ENST00000379026 1571 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.86■□□□□ 0.93
SKIV2LQ15477 IRX2-202ENST00000382611 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
SKIV2LQ15477 OSBPL10-204ENST00000438237 2624 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.86■□□□□ 0.93
SKIV2LQ15477 COX7A1-201ENST00000292907 762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
SKIV2LQ15477 PYDC1-201ENST00000302964 813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
SKIV2LQ15477 NMRK1-202ENST00000376808 1121 ntTSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
SKIV2LQ15477 TMEM243-203ENST00000433078 1273 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.86■□□□□ 0.93
SKIV2LQ15477 NDUFV2-207ENST00000497577 868 ntTSL 2 BASIC20.86■□□□□ 0.93
SKIV2LQ15477 NR2F2-201ENST00000394166 5275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
SKIV2LQ15477 RASD1-201ENST00000225688 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
SKIV2LQ15477 PIP5KL1-202ENST00000388747 2198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.86■□□□□ 0.93
SKIV2LQ15477 DCTD-201ENST00000357067 1931 ntTSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
SKIV2LQ15477 MAF1-201ENST00000322428 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
SKIV2LQ15477 FAM66B-201ENST00000529456 1432 ntTSL 2 BASIC20.86■□□□□ 0.93
SKIV2LQ15477 VRK2-201ENST00000340157 1888 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
SKIV2LQ15477 HNRNPM-202ENST00000348943 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
SKIV2LQ15477 NAA50-209ENST00000497525 1385 ntTSL 2 BASIC20.85■□□□□ 0.93
SKIV2LQ15477 PRKRA-201ENST00000325748 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
SKIV2LQ15477 GRINA-202ENST00000395068 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
SKIV2LQ15477 NOL3-204ENST00000564053 1592 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.85■□□□□ 0.93
SKIV2LQ15477 AKIRIN1-201ENST00000372984 1330 ntTSL 2 BASIC20.85■□□□□ 0.93
SKIV2LQ15477 H2AFY2-201ENST00000373255 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
SKIV2LQ15477 PLPP5-209ENST00000529359 2185 ntTSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
SKIV2LQ15477 TMEM160-201ENST00000253047 663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
SKIV2LQ15477 OCIAD2-201ENST00000273860 636 ntTSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
SKIV2LQ15477 TCEAL2-201ENST00000329035 1080 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.85■□□□□ 0.93
SKIV2LQ15477 SMYD3-204ENST00000403792 1209 ntTSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
SKIV2LQ15477 MCFD2-203ENST00000409147 671 ntTSL 2 BASIC20.85■□□□□ 0.93
SKIV2LQ15477 PHYHD1-207ENST00000421063 1182 ntTSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
SKIV2LQ15477 UBA52-210ENST00000598780 668 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.85■□□□□ 0.93
SKIV2LQ15477 AP000692.2-201ENST00000608391 879 ntBASIC20.85■□□□□ 0.93
SKIV2LQ15477 OCIAD2-210ENST00000620187 697 ntTSL 3 BASIC20.85■□□□□ 0.93
SKIV2LQ15477 KXD1-202ENST00000539106 1496 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.85■□□□□ 0.93
SKIV2LQ15477 FAM76A-205ENST00000419687 1661 ntTSL 2 BASIC20.85■□□□□ 0.93
SKIV2LQ15477 MAEA-208ENST00000505839 1444 ntTSL 2 BASIC20.85■□□□□ 0.93
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