Protein–RNA interactions for Protein: Q15413

RYR3, Ryanodine receptor 3, humanhuman

Predictions only

Length 4,870 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RYR3Q15413 UBE2C-201ENST00000243893 476 ntTSL 2 BASIC13.31□□□□□ -0.28
RYR3Q15413 AC022494.1-201ENST00000466044 728 ntBASIC13.31□□□□□ -0.28
RYR3Q15413 SWI5-205ENST00000495313 466 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC13.31□□□□□ -0.28
RYR3Q15413 AL049840.3-201ENST00000602669 611 ntBASIC13.31□□□□□ -0.28
RYR3Q15413 PHB2-203ENST00000535923 1515 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.31□□□□□ -0.28
RYR3Q15413 MOK-226ENST00000522874 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.3□□□□□ -0.28
RYR3Q15413 CCDC134-201ENST00000255784 1270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
RYR3Q15413 IGF2-202ENST00000381392 1005 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
RYR3Q15413 AP003041.3-201ENST00000527151 707 ntBASIC13.3□□□□□ -0.28
RYR3Q15413 AP005901.3-202ENST00000581653 237 ntBASIC13.3□□□□□ -0.28
RYR3Q15413 RNF38-205ENST00000377877 1974 ntTSL 2 BASIC13.3□□□□□ -0.28
RYR3Q15413 ALDH5A1-204ENST00000491546 1699 ntTSL 5 BASIC13.3□□□□□ -0.28
RYR3Q15413 BBC3-203ENST00000439096 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
RYR3Q15413 GABRG3-206ENST00000555083 1405 ntTSL 2 BASIC13.3□□□□□ -0.28
RYR3Q15413 HSD11B1L-218ENST00000581773 1687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
RYR3Q15413 FMR1-AS1-201ENST00000594922 2005 ntTSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
RYR3Q15413 AP000802.1-201ENST00000500537 1934 ntTSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
RYR3Q15413 RBCK1-206ENST00000400247 790 ntTSL 2 BASIC13.3□□□□□ -0.28
RYR3Q15413 CNOT8-225ENST00000524105 904 ntTSL 2 BASIC13.3□□□□□ -0.28
RYR3Q15413 AC136475.3-203ENST00000525217 617 ntTSL 2 BASIC13.3□□□□□ -0.28
RYR3Q15413 CIB2-208ENST00000560618 804 ntTSL 2 BASIC13.3□□□□□ -0.28
RYR3Q15413 AC138894.3-201ENST00000603787 634 ntBASIC13.3□□□□□ -0.28
RYR3Q15413 KRT8P36-201ENST00000489121 1440 ntBASIC13.3□□□□□ -0.28
RYR3Q15413 GPRIN2-201ENST00000374314 1696 ntAPPRIS P1 BASIC13.3□□□□□ -0.28
RYR3Q15413 PDK3-201ENST00000379162 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
RYR3Q15413 AL162741.1-201ENST00000565563 1558 ntBASIC13.3□□□□□ -0.28
RYR3Q15413 HSPB1-201ENST00000248553 909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
RYR3Q15413 DDT-203ENST00000403754 569 ntTSL 3 BASIC13.3□□□□□ -0.28
RYR3Q15413 SLC9A3R1-202ENST00000413388 1285 ntTSL 2 BASIC13.3□□□□□ -0.28
RYR3Q15413 AC009567.1-201ENST00000515071 525 ntTSL 4 BASIC13.3□□□□□ -0.28
RYR3Q15413 FAM220A-205ENST00000578372 207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
RYR3Q15413 VSTM4-201ENST00000298454 2170 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.3□□□□□ -0.28
RYR3Q15413 CHCHD2P8-201ENST00000429873 447 ntBASIC13.29□□□□□ -0.28
RYR3Q15413 RNASE10-202ENST00000430083 1172 ntTSL 2 BASIC13.29□□□□□ -0.28
RYR3Q15413 NCAM1-AS1-202ENST00000533638 618 ntTSL 4 BASIC13.29□□□□□ -0.28
RYR3Q15413 REXO2-206ENST00000539275 710 ntTSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
RYR3Q15413 C1QTNF1-212ENST00000583904 1129 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC13.29□□□□□ -0.28
RYR3Q15413 KRT18P28-201ENST00000453838 1332 ntBASIC13.29□□□□□ -0.28
RYR3Q15413 NXPH3-201ENST00000328741 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
RYR3Q15413 DBX1-201ENST00000524983 1380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.29□□□□□ -0.28
RYR3Q15413 TPTEP1-205ENST00000558085 1738 ntTSL 2 BASIC13.29□□□□□ -0.28
RYR3Q15413 RNASEH2A-201ENST00000221486 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
RYR3Q15413 AL451069.1-201ENST00000455414 634 ntTSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
RYR3Q15413 SFTPC-210ENST00000524255 681 ntTSL 2 BASIC13.29□□□□□ -0.28
RYR3Q15413 LINC01842-201ENST00000588275 768 ntTSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
RYR3Q15413 AL035252.4-201ENST00000624174 288 ntBASIC13.29□□□□□ -0.28
RYR3Q15413 RPS8P6-201ENST00000426177 609 ntBASIC13.29□□□□□ -0.28
RYR3Q15413 IER2-202ENST00000587885 1291 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.29□□□□□ -0.28
RYR3Q15413 AL162497.1-201ENST00000615635 518 ntTSL 4 BASIC13.29□□□□□ -0.28
RYR3Q15413 BCAT2-207ENST00000597011 1579 ntTSL 5 BASIC13.29□□□□□ -0.28
RYR3Q15413 ABCB10P4-201ENST00000566803 2184 ntBASIC13.29□□□□□ -0.28
RYR3Q15413 LINC01128-207ENST00000449005 874 ntTSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
RYR3Q15413 MUTYH-237ENST00000531105 501 ntTSL 5 BASIC13.29□□□□□ -0.28
RYR3Q15413 ADGRD1-AS1-202ENST00000542980 1277 ntTSL 4 BASIC13.29□□□□□ -0.28
RYR3Q15413 NUBP2-214ENST00000568706 913 ntTSL 2 BASIC13.29□□□□□ -0.28
RYR3Q15413 MCCC2-209ENST00000629193 1128 ntTSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
RYR3Q15413 RABEPK-201ENST00000259460 1313 ntTSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
RYR3Q15413 UBE2L6-202ENST00000340573 1573 ntTSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
RYR3Q15413 IFNL4-203ENST00000634680 1421 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
RYR3Q15413 HOXD13-201ENST00000392539 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
RYR3Q15413 ST7-205ENST00000393446 2114 ntTSL 5 BASIC13.28□□□□□ -0.28
RYR3Q15413 ABR-204ENST00000543210 1049 ntTSL 2 BASIC13.28□□□□□ -0.28
RYR3Q15413 RBM7-207ENST00000544582 692 ntTSL 3 BASIC13.28□□□□□ -0.28
RYR3Q15413 YPEL3-209ENST00000566595 796 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.28□□□□□ -0.28
RYR3Q15413 MAF1-201ENST00000322428 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
RYR3Q15413 RASSF7-205ENST00000454668 1450 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
RYR3Q15413 MED22-202ENST00000371999 987 ntTSL 3 BASIC13.28□□□□□ -0.28
RYR3Q15413 SMIM27-204ENST00000453396 1003 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC13.28□□□□□ -0.28
RYR3Q15413 RASA4DP-201ENST00000460726 1199 ntBASIC13.28□□□□□ -0.28
RYR3Q15413 AL596442.2-201ENST00000610240 980 ntBASIC13.28□□□□□ -0.28
RYR3Q15413 AP003733.4-201ENST00000623785 1697 ntBASIC13.28□□□□□ -0.28
RYR3Q15413 MEIS2-204ENST00000397620 2295 ntTSL 2 BASIC13.28□□□□□ -0.28
RYR3Q15413 AC026471.6-201ENST00000622954 1905 ntBASIC13.28□□□□□ -0.28
RYR3Q15413 FAM19A5-204ENST00000406880 833 ntTSL 3 BASIC13.28□□□□□ -0.28
RYR3Q15413 LINC02242-201ENST00000507298 641 ntTSL 5 BASIC13.28□□□□□ -0.28
RYR3Q15413 STMN4-207ENST00000523048 1224 ntTSL 2 BASIC13.28□□□□□ -0.28
RYR3Q15413 TMED4-205ENST00000481238 1755 ntTSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
RYR3Q15413 PIN1-201ENST00000247970 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
RYR3Q15413 CRELD2-202ENST00000403427 1242 ntTSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
RYR3Q15413 DMKN-208ENST00000424570 1293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
RYR3Q15413 ZNF692-201ENST00000306601 1931 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.28
RYR3Q15413 AC021739.3-201ENST00000557908 855 ntTSL 2 BASIC13.27□□□□□ -0.28
RYR3Q15413 AC007220.1-201ENST00000572466 1055 ntTSL 3 BASIC13.27□□□□□ -0.28
RYR3Q15413 PANO1-201ENST00000620120 1680 ntAPPRIS P1 BASIC13.27□□□□□ -0.28
RYR3Q15413 ZNF800-208ENST00000619291 2099 ntTSL 5 BASIC13.27□□□□□ -0.28
RYR3Q15413 PRDM13-202ENST00000369215 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.28
RYR3Q15413 ISCA2-201ENST00000298818 851 ntTSL 5 BASIC13.27□□□□□ -0.29
RYR3Q15413 MRPL54-201ENST00000330133 626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
RYR3Q15413 SDCBP2-203ENST00000381808 1261 ntTSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
RYR3Q15413 LINC01413-201ENST00000564843 772 ntTSL 3 BASIC13.27□□□□□ -0.29
RYR3Q15413 NT5C-210ENST00000582160 860 ntTSL 2 BASIC13.27□□□□□ -0.29
RYR3Q15413 ACTR3B-203ENST00000397282 1692 ntTSL 2 BASIC13.27□□□□□ -0.29
RYR3Q15413 THOC3-201ENST00000265097 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
RYR3Q15413 CYB561D2-201ENST00000232508 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
RYR3Q15413 BLOC1S2-202ENST00000370372 1249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
RYR3Q15413 MRPS24-203ENST00000418740 743 ntTSL 2 BASIC13.27□□□□□ -0.29
RYR3Q15413 OST4-202ENST00000447619 458 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.27□□□□□ -0.29
RYR3Q15413 GPR6-202ENST00000414000 1945 ntTSL 2 BASIC13.27□□□□□ -0.29
RYR3Q15413 PLLP-201ENST00000219207 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
RYR3Q15413 NECAB3-201ENST00000246190 1989 ntTSL 5 BASIC13.27□□□□□ -0.29
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.6 ms