Protein–RNA interactions for Protein: Q15306

IRF4, Interferon regulatory factor 4, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IRF4Q15306 AUP1-201ENST00000377526 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
IRF4Q15306 C7orf43-201ENST00000316937 2520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
IRF4Q15306 FUOM-203ENST00000368552 762 ntTSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
IRF4Q15306 RAMP1-204ENST00000409726 734 ntTSL 3 BASIC19.44■□□□□ 0.7
IRF4Q15306 KRT8P12-201ENST00000468527 998 ntTSL 2 BASIC19.44■□□□□ 0.7
IRF4Q15306 C17orf62-230ENST00000583617 866 ntTSL 5 BASIC19.44■□□□□ 0.7
IRF4Q15306 AC016582.3-201ENST00000589653 561 ntTSL 4 BASIC19.44■□□□□ 0.7
IRF4Q15306 AL158152.2-201ENST00000602703 235 ntTSL 3 BASIC19.44■□□□□ 0.7
IRF4Q15306 REXO1L10P-201ENST00000615707 1290 ntBASIC19.44■□□□□ 0.7
IRF4Q15306 AL590094.1-202ENST00000634619 1131 ntTSL 5 BASIC19.44■□□□□ 0.7
IRF4Q15306 FAM20C-201ENST00000313766 2751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
IRF4Q15306 DOK2-201ENST00000276420 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
IRF4Q15306 RTN1-202ENST00000342503 1703 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
IRF4Q15306 EGLN2-202ENST00000406058 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
IRF4Q15306 MAG-201ENST00000361922 2426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
IRF4Q15306 CENPH-206ENST00000515001 1305 ntTSL 2 BASIC19.44■□□□□ 0.7
IRF4Q15306 LHX8-202ENST00000356261 1764 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
IRF4Q15306 AL158151.1-201ENST00000372490 2047 ntTSL 2 BASIC19.44■□□□□ 0.7
IRF4Q15306 TUBGCP3-204ENST00000464139 2461 ntTSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
IRF4Q15306 T-202ENST00000366871 2250 ntTSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
IRF4Q15306 OGG1-204ENST00000339511 1815 ntTSL 2 BASIC19.44■□□□□ 0.7
IRF4Q15306 GTF3A-201ENST00000381140 1383 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
IRF4Q15306 SLC16A10-202ENST00000368851 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
IRF4Q15306 SLC16A5-201ENST00000329783 1934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
IRF4Q15306 CPNE7-202ENST00000319518 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
IRF4Q15306 C7orf50-201ENST00000357429 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
IRF4Q15306 DAB1-202ENST00000371230 1150 ntTSL 5 BASIC19.43■□□□□ 0.7
IRF4Q15306 PACRGL-207ENST00000502938 810 ntTSL 4 BASIC19.43■□□□□ 0.7
IRF4Q15306 BAALC-AS1-207ENST00000522856 594 ntTSL 3 BASIC19.43■□□□□ 0.7
IRF4Q15306 CROCCP2-205ENST00000639481 1296 ntTSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
IRF4Q15306 TRABD2A-201ENST00000335459 1844 ntTSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
IRF4Q15306 HOMEZ-201ENST00000357460 4971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
IRF4Q15306 CSNK1G2-201ENST00000255641 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
IRF4Q15306 MAN1B1-AS1-201ENST00000596585 1872 ntBASIC19.43■□□□□ 0.7
IRF4Q15306 DCK-201ENST00000286648 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
IRF4Q15306 RENBP-202ENST00000393700 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
IRF4Q15306 AL157384.1-201ENST00000445995 2473 ntBASIC19.43■□□□□ 0.7
IRF4Q15306 FGF16-201ENST00000439435 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
IRF4Q15306 DVL1-204ENST00000610709 2268 ntTSL 2 BASIC19.42■□□□□ 0.7
IRF4Q15306 MTX1-201ENST00000316721 1441 ntTSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
IRF4Q15306 BCL7A-201ENST00000261822 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
IRF4Q15306 C19orf35-201ENST00000342063 2574 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.42■□□□□ 0.7
IRF4Q15306 UBE2F-201ENST00000272930 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
IRF4Q15306 PRSS33-204ENST00000576886 1755 ntTSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
IRF4Q15306 METTL21A-201ENST00000272839 1210 ntTSL 5 BASIC19.42■□□□□ 0.7
IRF4Q15306 C1orf50-201ENST00000372525 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
IRF4Q15306 HYAL3-203ENST00000415204 959 ntTSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
IRF4Q15306 AC211429.1-201ENST00000415277 523 ntBASIC19.42■□□□□ 0.7
IRF4Q15306 AC087499.1-201ENST00000418141 1075 ntBASIC19.42■□□□□ 0.7
IRF4Q15306 ECEL1P3-201ENST00000427961 737 ntBASIC19.42■□□□□ 0.7
IRF4Q15306 ANK1-211ENST00000522231 1060 ntTSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
IRF4Q15306 ANK1-212ENST00000522543 1160 ntTSL 2 BASIC19.42■□□□□ 0.7
IRF4Q15306 AC018521.5-202ENST00000577279 374 ntTSL 3 BASIC19.42■□□□□ 0.7
IRF4Q15306 AC018521.5-201ENST00000582787 496 ntTSL 2 BASIC19.42■□□□□ 0.7
IRF4Q15306 CD209-209ENST00000601256 994 ntTSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
IRF4Q15306 AC016737.2-201ENST00000609273 358 ntTSL 3 BASIC19.42■□□□□ 0.7
IRF4Q15306 PHOSPHO2-206ENST00000616481 1252 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.42■□□□□ 0.7
IRF4Q15306 PHOSPHO2-208ENST00000617738 1053 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.42■□□□□ 0.7
IRF4Q15306 AL445675.2-201ENST00000620291 557 ntBASIC19.42■□□□□ 0.7
IRF4Q15306 LINC01006-201ENST00000333319 2292 ntBASIC19.42■□□□□ 0.7
IRF4Q15306 PCMT1-205ENST00000464889 1984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
IRF4Q15306 DUSP7-202ENST00000495880 3340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
IRF4Q15306 STK16-201ENST00000396738 1673 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.42■□□□□ 0.7
IRF4Q15306 HNRNPUL2-201ENST00000301785 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
IRF4Q15306 KRT87P-201ENST00000529785 1700 ntTSL 2 BASIC19.42■□□□□ 0.7
IRF4Q15306 CLDN14-202ENST00000399135 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
IRF4Q15306 ZNF497-202ENST00000425453 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
IRF4Q15306 IDH1-205ENST00000446179 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
IRF4Q15306 EMC8-202ENST00000435200 1935 ntTSL 2 BASIC19.41■□□□□ 0.7
IRF4Q15306 DNAJA4-202ENST00000394852 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
IRF4Q15306 ENTPD6-203ENST00000376652 2750 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
IRF4Q15306 BRD4-202ENST00000360016 3240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
IRF4Q15306 SAE1-201ENST00000270225 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
IRF4Q15306 VKORC1-202ENST00000319788 1077 ntTSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
IRF4Q15306 ADCYAP1-202ENST00000450565 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
IRF4Q15306 RBM17P1-201ENST00000453646 1190 ntBASIC19.41■□□□□ 0.7
IRF4Q15306 FAU-207ENST00000529639 847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
IRF4Q15306 KDM2B-217ENST00000543852 1188 ntTSL 5 BASIC19.41■□□□□ 0.7
IRF4Q15306 CDKN2A-213ENST00000579122 666 ntTSL 3 BASIC19.41■□□□□ 0.7
IRF4Q15306 AC011445.1-201ENST00000601911 877 ntTSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
IRF4Q15306 FAM212B-203ENST00000444059 1423 ntTSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
IRF4Q15306 AC099778.1-201ENST00000568593 1911 ntBASIC19.41■□□□□ 0.7
IRF4Q15306 MAP2K2-202ENST00000394867 1471 ntTSL 5 BASIC19.41■□□□□ 0.7
IRF4Q15306 FUT5-202ENST00000588525 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
IRF4Q15306 FAM129C-203ENST00000449408 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.41■□□□□ 0.7
IRF4Q15306 SNAPC2-201ENST00000221573 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
IRF4Q15306 CPLX3-201ENST00000395018 2082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
IRF4Q15306 FAM171A2-201ENST00000293443 3160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
IRF4Q15306 NKX6-1-202ENST00000515820 2194 ntTSL 3 BASIC19.4■□□□□ 0.7
IRF4Q15306 USP48-205ENST00000421625 2818 ntTSL 2 BASIC19.4■□□□□ 0.7
IRF4Q15306 AC007249.2-201ENST00000553181 1737 ntTSL 5 BASIC19.4■□□□□ 0.7
IRF4Q15306 ISLR2-202ENST00000419208 2306 ntTSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
IRF4Q15306 AOC3-207ENST00000617500 2392 ntTSL 4 BASIC19.4■□□□□ 0.7
IRF4Q15306 DISC1-212ENST00000535983 2505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
IRF4Q15306 HCRT-201ENST00000293330 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
IRF4Q15306 LINC01122-201ENST00000422723 675 ntTSL 3 BASIC19.4■□□□□ 0.7
IRF4Q15306 CHCHD10-202ENST00000484558 1171 ntTSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
IRF4Q15306 CROCCP4-202ENST00000633627 573 ntTSL 3 BASIC19.4■□□□□ 0.7
IRF4Q15306 ABBA01031674.1-201ENST00000635145 728 ntBASIC19.4■□□□□ 0.7
IRF4Q15306 HABP4-201ENST00000375249 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
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