Protein–RNA interactions for Protein: Q15270

NKX1-1, NK1 transcription factor-related protein 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 411 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NKX1-1Q15270 FO681492.1-203ENST00000622861 1362 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.5■■□□□ 1.67
NKX1-1Q15270 AL358472.4-201ENST00000633140 710 ntBASIC25.5■■□□□ 1.67
NKX1-1Q15270 MRGPRF-203ENST00000441623 2282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.49■■□□□ 1.67
NKX1-1Q15270 MSLN-201ENST00000382862 2116 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.49■■□□□ 1.67
NKX1-1Q15270 TXNRD2-202ENST00000400518 2025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
NKX1-1Q15270 BCKDK-203ENST00000394950 1997 ntTSL 2 BASIC25.49■■□□□ 1.67
NKX1-1Q15270 FAM151B-201ENST00000282226 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
NKX1-1Q15270 GRM6-202ENST00000517717 2673 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.49■■□□□ 1.67
NKX1-1Q15270 UQCRQ-201ENST00000378665 586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
NKX1-1Q15270 PSEN1-203ENST00000394157 1249 ntTSL 2 BASIC25.49■■□□□ 1.67
NKX1-1Q15270 TRPT1-203ENST00000394547 865 ntTSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
NKX1-1Q15270 NME1-207ENST00000480143 964 ntTSL 2 BASIC25.49■■□□□ 1.67
NKX1-1Q15270 SSSCA1-206ENST00000531405 879 ntTSL 2 BASIC25.49■■□□□ 1.67
NKX1-1Q15270 AC091076.1-201ENST00000610741 619 ntBASIC25.49■■□□□ 1.67
NKX1-1Q15270 PRLHR-202ENST00000636925 1275 ntAPPRIS P1 BASIC25.49■■□□□ 1.67
NKX1-1Q15270 PITX1-201ENST00000265340 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
NKX1-1Q15270 SACM1L-202ENST00000418611 2164 ntTSL 2 BASIC25.49■■□□□ 1.67
NKX1-1Q15270 NEIL1-206ENST00000564784 2019 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.49■■□□□ 1.67
NKX1-1Q15270 LAYN-202ENST00000375615 1836 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
NKX1-1Q15270 EIF2B1-204ENST00000537073 1768 ntTSL 2 BASIC25.49■■□□□ 1.67
NKX1-1Q15270 EPHX1-201ENST00000272167 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
NKX1-1Q15270 SMN1-209ENST00000514951 1308 ntTSL 2 BASIC25.48■■□□□ 1.67
NKX1-1Q15270 CENPH-206ENST00000515001 1305 ntTSL 2 BASIC25.48■■□□□ 1.67
NKX1-1Q15270 BIRC2-206ENST00000530675 1927 ntTSL 2 BASIC25.48■■□□□ 1.67
NKX1-1Q15270 NDUFA1-201ENST00000371437 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
NKX1-1Q15270 DERL1-203ENST00000419562 918 ntTSL 2 BASIC25.48■■□□□ 1.67
NKX1-1Q15270 TSPY5P-201ENST00000426936 936 ntBASIC25.48■■□□□ 1.67
NKX1-1Q15270 AC007563.2-201ENST00000447289 552 ntTSL 5 BASIC25.48■■□□□ 1.67
NKX1-1Q15270 LY6E-210ENST00000521182 1079 ntTSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
NKX1-1Q15270 AKTIP-212ENST00000570004 1162 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
NKX1-1Q15270 GPX4-207ENST00000589115 812 ntTSL 2 BASIC25.48■■□□□ 1.67
NKX1-1Q15270 TXNL4A-211ENST00000592837 611 ntTSL 2 BASIC25.48■■□□□ 1.67
NKX1-1Q15270 RASSF7-204ENST00000431809 1745 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.48■■□□□ 1.67
NKX1-1Q15270 ACTR3B-203ENST00000397282 1692 ntTSL 2 BASIC25.48■■□□□ 1.67
NKX1-1Q15270 SLC25A29-202ENST00000392908 2242 ntTSL 2 BASIC25.48■■□□□ 1.67
NKX1-1Q15270 SAMD10-201ENST00000369886 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
NKX1-1Q15270 MFSD10-205ENST00000507555 1573 ntTSL 5 BASIC25.48■■□□□ 1.67
NKX1-1Q15270 MTMR9LP-202ENST00000423995 1878 ntTSL 2 BASIC25.47■■□□□ 1.67
NKX1-1Q15270 SUMO3-201ENST00000332859 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
NKX1-1Q15270 SMG8-203ENST00000578922 2178 ntBASIC25.47■■□□□ 1.67
NKX1-1Q15270 POLR2D-202ENST00000409698 806 ntTSL 2 BASIC25.47■■□□□ 1.67
NKX1-1Q15270 AC012618.3-202ENST00000440004 472 ntTSL 4 BASIC25.47■■□□□ 1.67
NKX1-1Q15270 DBNL-220ENST00000494774 2117 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
NKX1-1Q15270 BNIP3L-206ENST00000523515 915 ntTSL 2 BASIC25.47■■□□□ 1.67
NKX1-1Q15270 AP006284.1-202ENST00000527113 527 ntTSL 4 BASIC25.47■■□□□ 1.67
NKX1-1Q15270 CLN6-204ENST00000564752 900 ntTSL 3 BASIC25.47■■□□□ 1.67
NKX1-1Q15270 AL353719.1-201ENST00000566847 864 ntBASIC25.47■■□□□ 1.67
NKX1-1Q15270 SLC25A51-202ENST00000377716 1691 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.47■■□□□ 1.67
NKX1-1Q15270 ARSE-205ENST00000540563 1990 ntTSL 2 BASIC25.47■■□□□ 1.67
NKX1-1Q15270 BX119927.1-201ENST00000636596 1552 ntBASIC25.47■■□□□ 1.67
NKX1-1Q15270 BPIFB3-201ENST00000375494 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
NKX1-1Q15270 DMKN-207ENST00000419602 1496 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
NKX1-1Q15270 ZIC4-209ENST00000473123 1481 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.47■■□□□ 1.67
NKX1-1Q15270 RABL2B-206ENST00000395598 2169 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
NKX1-1Q15270 HOXB6-201ENST00000225648 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
NKX1-1Q15270 ASNS-206ENST00000437628 1638 ntTSL 2 BASIC25.46■■□□□ 1.67
NKX1-1Q15270 CCK-201ENST00000334681 830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
NKX1-1Q15270 SURF4-206ENST00000485435 1206 ntTSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
NKX1-1Q15270 AC009185.1-201ENST00000517634 911 ntTSL 3 BASIC25.46■■□□□ 1.67
NKX1-1Q15270 AC011498.2-201ENST00000588798 540 ntTSL 3 BASIC25.46■■□□□ 1.67
NKX1-1Q15270 NBPF14-202ENST00000593495 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
NKX1-1Q15270 AC141257.4-201ENST00000634557 245 ntBASIC25.46■■□□□ 1.67
NKX1-1Q15270 AC136944.6-201ENST00000634818 245 ntBASIC25.46■■□□□ 1.67
NKX1-1Q15270 TINAGL1-211ENST00000537531 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.46■■□□□ 1.67
NKX1-1Q15270 DACT1-204ENST00000541264 2610 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.46■■□□□ 1.67
NKX1-1Q15270 SLC29A1-207ENST00000393841 2485 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.45■■□□□ 1.67
NKX1-1Q15270 MLF2-202ENST00000435120 1379 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.45■■□□□ 1.67
NKX1-1Q15270 ISYNA1-201ENST00000338128 2420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.67
NKX1-1Q15270 KLHDC4-201ENST00000270583 1886 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.67
NKX1-1Q15270 AC110285.2-201ENST00000571724 1565 ntTSL 2 BASIC25.45■■□□□ 1.66
NKX1-1Q15270 ARX-201ENST00000379044 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
NKX1-1Q15270 FN3KRP-201ENST00000269373 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
NKX1-1Q15270 FAM86B2-202ENST00000309608 806 ntTSL 3 BASIC25.45■■□□□ 1.66
NKX1-1Q15270 ZCCHC24-201ENST00000372333 906 ntTSL 2 BASIC25.45■■□□□ 1.66
NKX1-1Q15270 TSPY17P-201ENST00000450329 467 ntBASIC25.45■■□□□ 1.66
NKX1-1Q15270 AC002467.1-201ENST00000457510 657 ntTSL 3 BASIC25.45■■□□□ 1.66
NKX1-1Q15270 COX11P1-201ENST00000489116 835 ntBASIC25.45■■□□□ 1.66
NKX1-1Q15270 SNCB-205ENST00000510387 730 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.45■■□□□ 1.66
NKX1-1Q15270 LINC01385-201ENST00000512310 780 ntTSL 4 BASIC25.45■■□□□ 1.66
NKX1-1Q15270 PITPNB-211ENST00000634017 1017 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC25.45■■□□□ 1.66
NKX1-1Q15270 SNX3-201ENST00000230085 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
NKX1-1Q15270 PACSIN3-211ENST00000539589 2009 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.45■■□□□ 1.66
NKX1-1Q15270 CRHR1-203ENST00000339069 2490 ntTSL 2 BASIC25.45■■□□□ 1.66
NKX1-1Q15270 IRX4-201ENST00000231357 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
NKX1-1Q15270 RIPPLY3-201ENST00000329553 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
NKX1-1Q15270 KRT87P-201ENST00000529785 1700 ntTSL 2 BASIC25.45■■□□□ 1.66
NKX1-1Q15270 FAM66C-208ENST00000541558 2087 ntTSL 2 BASIC25.44■■□□□ 1.66
NKX1-1Q15270 DAPK3-202ENST00000545797 2257 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.44■■□□□ 1.66
NKX1-1Q15270 CCDC71-201ENST00000321895 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
NKX1-1Q15270 PPHLN1-213ENST00000549190 1777 ntTSL 5 BASIC25.44■■□□□ 1.66
NKX1-1Q15270 FGF8-201ENST00000320185 799 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
NKX1-1Q15270 COPE-203ENST00000351079 907 ntTSL 2 BASIC25.44■■□□□ 1.66
NKX1-1Q15270 ABCD1-202ENST00000370129 1016 ntTSL 2 BASIC25.44■■□□□ 1.66
NKX1-1Q15270 CD70-202ENST00000423145 881 ntTSL 2 BASIC25.44■■□□□ 1.66
NKX1-1Q15270 AC008771.1-201ENST00000508000 1151 ntTSL 2 BASIC25.44■■□□□ 1.66
NKX1-1Q15270 AC018521.5-202ENST00000577279 374 ntTSL 3 BASIC25.44■■□□□ 1.66
NKX1-1Q15270 AC018521.5-201ENST00000582787 496 ntTSL 2 BASIC25.44■■□□□ 1.66
NKX1-1Q15270 USF2-205ENST00000594064 1179 ntTSL 2 BASIC25.44■■□□□ 1.66
NKX1-1Q15270 AC009542.2-201ENST00000637483 1189 ntTSL 5 BASIC25.44■■□□□ 1.66
NKX1-1Q15270 POC1A-202ENST00000394970 1999 ntTSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
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